Nucleic acid biosensors for environmental pollution monitoring

Analyst

Volumn 133, Issue 7, 2008, Pages 846-854

  Palchetti, Ilaria ^a   Mascini, Marco ^a  

^a UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

APTAMER; AROMATIC AMINE; DEOXYRIBOZYME; DNA; NUCLEIC ACID; PESTICIDE; RIBOZYME; RNA;

ANALYTIC METHOD; BASE PAIRING; BINDING AFFINITY; BIOSENSOR; DNA BINDING; DNA DAMAGE; DNA STRUCTURE; ENZYME ANALYSIS; FLUORESCENCE; HYBRIDIZATION; MOLECULAR INTERACTION; NUCLEIC ACID BIOSENSOR; OLIGONUCLEOTIDE PROBE; POLLUTION MONITORING; POLYMERASE CHAIN REACTION; REVIEW; RNA STRUCTURE;

EID: 48249107119     PISSN: 00032654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b802920m     Document Type: Review

References (96)

1. K. R. Rogers Anal. Chim. Acta 2006 568 222 231
2. S. Rodriguez-Mozaz M. J. Lopez de Alda D. Barceló Anal. Bioanal. Chem. 2006 386 1025 1041
3. D. R. Thevenot K. Toth R. A. Durst G. S. Wilson Biosens. Bioelectron. 2001 16 121 131
4. J. Castillo S. Gáspár S. Leth M. Niculescu A. Mortari I. Bontidean V. Soukharev S. A. Dorneanu A. D. Ryabov E. Csöregi Sens. Actuators, B 2004 102 179 194
5. A. J. Baeumner 'Biosensors for environmental pollutants and food contaminants' Anal. Bioanal. Chem. 2003 377 434 445
6. M. Tudorache C. Bala Anal. Bioanal. Chem. 2007 388 565 578
7. A. Amine H. Mohammadi I. Bourais G. Palleschi Biosens. Bioelectron. 2006 21 1405 1423
8. S. Rodriguez-Mozaz M. J. Lopez de Alda M. P. Marco D. Barcelo Talanta 2005 65 291 297
9. E. Z. Ron Curr. Opin. Biotechnol. 2007 18 252 256
10. S. Rodriguez-Mozaz M. J. Lopez de Alda D. Barcelo J. Chromatogr., A 2007 1152 97 115
11. S. Andreescu O. A. Sadik Pure Appl. Chem. 2004 76 861 878
12. K. R. Rogers C. L. Gerlach Environ. Sci. Technol. 1999 33 500A 506A
13. K. R. Rogers M. Mascini Field Anal. Chem. Technol. 1999 3 1 55 66
14. G. Bagni D. Osella E. Sturchio M. Mascini Anal. Chim. Acta 2006 573-574 81 89
15. J. Wang G. Rivas X. Cai E. Palecek P. Nielsen H. Shiraish N. Dontha D. Luo C. Parrado M. Chicharro P. A. M. Farias E. S. Valera D. H. Grant M. Ozsoz M. N. Flair Anal. Chim. Acta 1997 347 1 8
16. Y. Lu J. Liu Curr. Opin. Biotechnol. 2006 17 580 588
17. Y. Ito E. Fukusaki J. Mol. Catal. B: Enzym. 2004 28 155 166
18. D. Sen C. R. Geyert Curr. Opin. Chem. Biol. 1998 2 680 687
19. S. Tombelli M. Minunni M. Mascini Biomol. Eng. 2007 24 191 200
20. A. D. Ellington J. W. Szostak Nature 1990 346 818 822
21. C. Tuerk L. Gold Science 1990 249 505 510
22. R. R. Breaker G. F. Joyce Chem. Biol. 1994 1 223 229
23. W. Vercoutere M. Akeson Curr. Opin. Chem. Biol. 2002 6 816 822
24. J. Wang Nucleic Acids Res. 2000 28 3011 3016
25. P. S. Waggoner H. G. Craighead Lab Chip 2007 7 1238 1255
26. J. Watterson P. A. E. Piunno U. J. Krull Anal. Chim. Acta 2002 469 115 127
27. R. Levicky A. Horgan Trends Biotechnol. 2005 23 143 149
28. F. Lucarelli G. Marrazza A. P. F. Turner M. Mascini Biosens. Bioelectron. 2004 19 515 530
29. K. Kerman M. Kobayashi E. Tamiya Meas. Sci. Technol. 2004 15 R1 R11
30. E. Palecek Talanta 2002 56 809 819
31. E. Palecek M. Fojta Anal. Chem. 2001 73 74A 83A
32. J. Wang Anal. Chim. Acta 2002 469 63 71
33. T. G. Drummond M. G. Hill J. K. Barton Nat. Biotechnol. 2003 21 1192
34. R. Moeller W. Fritzsche IEEE Proc. Nanobiotechnol. 2005 15247
35. J. Wang Biosens. Bioelectron. 2006 21 1887
36. M. Mascini I. Palchetti G. Marrazza Fresenius' J. Anal. Chem. 2001 369 15 22
37. S. S. Babkina G. K. Budnikov J. Anal. Chem. 2006 61 728 739
38. F. Ricci R. Y. Lai A. J. Heeger K. W. Plaxco J. J. Sumner Langmuir 2007 23 6827
39. H. Kaur A. Arora J. Wengel S. Maiti Biochemistry 2006 45 7347 7355
40. K. E. Nelson M. Levy S. L. Miller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 3868 3871
41. T. Kievits B. Van Gemen D. Van Strijp R. Schukkink M. Dircks H. Adriaanse L. Malek R. Sooknanan P. Lens J. Virol. Methods 1991 35 273 286
42. X.-T. Mo Y.-P. Zhou H. Lei L. Deng Enzyme Microb. Technol. 2002 30 583 589
43. S. Tombelli M. Mascini C. Sacco A. P. F. Turner Anal. Chim. Acta 2000 418 1 9
44. F. Farabullini F. Lucarelli I. Palchetti G. Marrazza M. Mascini Biosens. Bioelectron. 2007 22 1544 1549
45. A. Lermo S. Campoy J. Barbe S. Hernandez S. Alegret M. I. Pividori Biosens. Bioelectron. 2007 22 2010 2017
46. M. J. LaGier J. W. Fell K. D. Goodwin Marine Pollut. Bull. 2007 54 757 770
47. A. J. Baeumner R. N. Cohen V. Miksic J. Min Biosens. Bioelectron. 2003 18 405 413
48. M. B. Esch A. J. Baeumner R. A. Durst Anal. Chem. 2001 73 3162 3167
49. S. Kwakye V. N. Goral A. J. Baeumner Biosens. Bioelectron. 2006 2 2217 2223
50. S. Kwakye A. Baeumner Anal. Bioanal. Chem. 2003 376 1062 1068
51. N. V. Zaytseva R. A. Montagna A. J. Baeumner Anal. Chem. 2005 77 7520 7527
52. B. Elsholz R. Wörl L. Blohm J. Albers H. Feucht T. Grunwald B. Jürgen T. Schweder R. Hintsche Anal. Chem. 2006 78 4794 4802
53. G. Feriotto M. Borgatti C. Mischiati N. Bianchi R. Gambari J. Agric. Food Chem. 2002 50 955 962
54. I. Mannelli M. Minunni S. Tombelli M. Mascini Biosens. Bioelectron. 2003 18 129 140
55. B. Meric K. Kerman G. Marrazza I. Palchetti M. Mascini M. Ozsoz Food Control 2004 15 621 626
56. C. G. Bruno Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997 234 117 120
57. U. Brockstedt A. Uzarowska A. Montpetit W. Pfau D. Lauda Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 313 1004 1008
58. K. D. Gu M. Famulok Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi 2004 38 369 373
59. Y. S. Kim H. S. Jung T. Matsuura H. Y. Lee T. Kawai M. B. Gu Biosens. Bioelectron. 2007 22 2525 2531
60. Q. Pan X. L. Zhang H. Y. Wu Antimicrob. Agents Chemother. 2006 49 4052 4060
61. S. McMasters and D. N. Stratis-Cullum, in Smart Medical and Biomedical Sensor Technology IV, ed., B. M. Cullum, and, J. C. Carter,, SPIE Press, Bellingham, WA, 2006, vol. 6380, p. 63800B
62. J. Vivekananda J. L. Kiel Lab. Invest. 2006 86 610 618
63. R. Fiammengo A. Jaschke Curr. Opin. Biotechnol. 2005 16 614 621
64. N. K. Navani Y. Li Curr. Opin. Chem. Biol. 2006 10 272 281
65. J. Li Y. Lu J. Am. Chem. Soc. 2000 122 10466 10467
66. J. Liu Y. Lu J. Am. Chem. Soc. 2003 125 6642 6643
67. T.-J. Yim J. Liu Y. Lu R. S. Kane J. S. Dordick J. Am. Chem. Soc. 2005 127 12200 12201
68. Y. Xiao A. A. Rowe K. W. Plaxco J. Am. Chem. Soc. 2007 129 262 263
69. D. P. Wernette C. B. Swearingen D. M. Cropek Y. Lu J. V. Sweedler P. W. Bohn Analyst 2006 131 41 47
70. K. A. Shaikh K. S. Ryu E. D. Goluch J.-M. Nam J. Liu C. S. Thaxton T. N. Chiesl A. E. Barron Y. Lu C. A. Mirkin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 9745 9750
71. I. H. Chang J. Tulock J. Liu W. S. Kim D. Cannon J. R. Y. Lu P. W. Bohn J. Sweedler D. Cropek Environ. Sci. Technol. 2005 39 3756 3761
72. S. W. Santoro G. F. Joyce K. Sakthivel S. Gramatikova C. F. Barbas J. Am. Chem. Soc. 2000 122 2433 2439
73. A. V. Garibotti S. M. Knudsen A. D. Ellington N. C. Seeman Nano Lett. 2006 6 1505 1507
74. J. Liu Y. Lu Anal. Chem. 2004 76 1627 1632
75. S. Seetharaman M. Zivartis N. Sudarsan R. R. Breaker Nat. Biotechnol. 2001 19 336 341
76. G. Chiti G. Marrazza M. Mascini Anal. Chim. Acta 2001 427 155
77. J. F. Rusting Biosens. Bioelectron. 2004 20 1022
78. E. Palecek M. Fojta Anal. Chem. 2001 73 74A 83A
79. F. Lucareli I. Palchetti G. Marrazza M. Mascini Talanta 2002 56 949 957
80. B. Wang J. F. Rusling Anal. Chem. 2003 75 4229 4235
81. M. Fojta T. Kubicarova E. Palecek Biosens. Bioelectron. 2000 15 107
82. J. Wang G. Rivas M. Ozsoz D. H. Grant X. Cai C. Parrado Anal. Chem. 1997 69 1457 1460
83. B. Wang I. Jansson J. B. Schenkman J. F. Rusling Anal. Chem. 2005 77 1361
84. J. Wang M. Chicharro G. Rivas X. Cai N. Dontha Percio A. M. Farias H. Shiraishi Anal. Chem. 1996 68 2251 2254
85. A. M. Oliveira-Brett L. A. da Silva Anal. Bioanal. Chem. 2002 373 717 723
86. S. S. Babkina N. A. Ulakhovich Anal. Chem. 2005 77 5678 5685
87. G. Cosa A. L. Vinette J. R. N. McLean J. C. Scaiano Anal. Chem. 2002 74 6163
88. N. M. Grubor R. Shinar R. Jankowiak M. D. Porter G. J. Small Biosens. Bioelectron. 2004 19 547
89. K. Ramanathan R. K. Gary A. Apostol K. R. Rogers Curr. Appl. Phys. 2003 3 99
90. K. Ramanathan K. Rogers Sens. Actuators, B 2003 9 1205
91. S. Kailasam K. R. Rogers Chemosphere 2007 66 165 171
92. Y. Liu B. Danielsson Anal. Chem. 2005 77 2450 2454
93. T. Hianik X. Wang S. Andreev N. Dolinnaya T. Oretskaya M. Thompson Analyst 2006 131 1161 1166
94. A. Erdem Talanta 2007 74 318 325
95. M. Pumera S. Sanchez I. Ichinose J. Tang Sens. Actuators, B 2007 123 1195 1205
96. C. Zhang D. Xing Nucleic Acids Res. 2007 35 4223 4237