Effect of molecular crowding on the response of an electrochemical DNA sensor

Langmuir

Volumn 23, Issue 12, 2007, Pages 6827-6834

  Ricci, Francesco ^a,b   Lai, Rebecca Y ^b   Heeger, Alan J ^b   Plaxco, Kevin W ^b   Sumner, James J ^c  

^a UNIVERSITY OF ROME TOR VERGATA   (Italy)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c U S ARMY RESEARCH LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROCHEMICAL DNA SENSORS; ELECTRODE SURFACES; PROBE DENSITY; SIGNALING PROPERTIES;

CONFORMATIONS; DNA; MOLECULAR DYNAMICS; OLIGONUCLEOTIDES; OPTIMIZATION; REDOX REACTIONS;

ELECTROCHEMICAL SENSORS;

DNA; FERROCENE; FERROUS ION; METHYLENE BLUE;

ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTROCHEMISTRY; ELECTRODE; ELECTRON;

DNA; ELECTROCHEMISTRY; ELECTRODES; ELECTRONS; FERROUS COMPOUNDS; METHYLENE BLUE;

EID: 34250636332     PISSN: 07437463     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la700328r     Document Type: Article

References (44)

1. Heller, M. J. Anna. Rev. Biomed. Eng. 2002, 4129-153.
2. Balakin, K. V.; Korshun. V. A.; Mikhalev. I.1.; Maleev, G. V.; Malakhov, A. D.; Prokhorenko, I. A.; Berlin, Yu. A. Biosens. Bioelectron. 1998, 13. 771-778.
3. Cao, Y. W. C.; Jin, R. C.; Mirkin, C. A. Science 2002, 2971536-1540.
4. Gaylord, B. S.; Heeger, A. J.; Bazan, G. C. Proc. Nutl Acad. Sci. U.S.A. 2002, 9910954-10957.
5. Peterson, A. W.; Wolf, L. K.; Georgiadis, R. M. J. Am. Chem. Soc: 2002, 12414601-14607.
6. Ahn, S.; Walt. D. R. Anal. Chem. 2005, 77 (15), 5041-5047.
7. Kelley, S. O.; Barton, J. K.; Jackson, N. M.; Hill, M. G. Bioconjugate Chem. 1991, 831-37.
8. Cooper. M. A.; Dultsev, F. N.; Minson, T.; Ostanin, V. P.; Abell, C.; Klenerman, D. Nat. Biotechnol. 2001, 19833-837.
9. Endo, T.; Kerman, K.; Nagatani, N.; Takamura, Y.; Tamiya. E. Anal. Chem. 2005, 77(21)6976-6984.
10. Patolsky, F.; Lichtenstein, A.; Wiliner, I. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122 (2), 418-419.
11. Park, S. J.; Taton, T. A.; Mirkin, C. A. Science 2002, 295. 1503-1506.
12. Boon, E. M.; Ceres, D. M.; Drummond, T. G.; Hill. M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2000. 181096-1100.
13. Fan, C.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 1009134-9137.
14. Immoos, C. E.; Lee, S. J.; Grinstaff, M. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 72610814-10815.
15. Immoos, C. E.; Lee, S. J.; Grinstaff, M. W. ChemBioChem 2004, 51100-1104.
16. Mao, T.; Luo. C.; Ouyang, Q. Nucleic Acids Res. 2003, 31108-172.
17. Du. H.; Disney, M. D.; Miller, B. L.; Krauss, T. D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 7254012-4013.
18. Du, H.; Strohsahl, C. M.; Camera. J.; Miller. B. L.; Krauss, T. D. J. Am. Chem. Soc. 2005. 727. 7932-7940.
19. Wang. H.; Li, J.; Liu. H.; Liu. Q.; Mei. Q.; Wang, Y.; Zhu, J.; He, N.; Lu. Z. Nucleic Acids Res. 2002. 30, e61.
20. Ramachandran, A.; Flinchbauch, J.; Ayoubi, P.; Olah, G. A.; Malayer, J. R. Biosens. Bioelectron. 2004, 19727-736.
21. Palecek. E. Trends Biotechnol. 2004, 2255-58.
22. Thorp, H. H. Trends Biotechnol. 2003, 27 (12), 522-524.
23. Lubin. A. A.; Lai, R. Y.; Baker. B. R.; Heeger. A. J.; Plaxco, K. W. Anal. Chem. 2006. 78 (16). 5671-5677.
24. Lai, R. Y.; Lagally. E. T.; Lee S.-H.; Soh. H. T.; Plaxco. K. W.; Heeger, A. J. Proc. Nail Acad. Sci. U.S.A. 2006, 1034017-4021.
25. Lai, R. Y.; Seferos. D. S.; Heeger. A. J.; Bazan, G. C.; Plaxco, K. W. Langmuir 2006, 2210796-10800.
26. Xiao, Y.; Piorek. B. D.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2005. 72717990-17991.
27. Baker. B. R.; Lai, R. Y.; Wood. M. S.; Doctor, E. H.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2006, 1283138-3139.
28. Lai, R. Y.; Lee, S.-H.; Soh. H. T.; Plaxco, K. W.; Heeger. A. J. Langmuir 2006, 22. 1932-1936.
29. Peterson, A. W.; Heaton, R. J.; Georgiadis, R. M. Nucleic Acids Res. 2001, 29. 5163-5168.
30. Levicky, R.; Herne. T. M.; Tarlov, M. J.; Satija, S. K. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120. 9787-9792.
31. Southern. E.; Mir. K.; Shchepinov, M. Nat. Genet. 1999, 215-9.
32. Steel, A. B.; Herne, T. M.; Tarlov, M. J. Anal. Chum. 1998, 704670-4677.
33. Huang, E.; Satjapipat, M.; Man. S. B.; Zhou, F. M. Langmuir 2001, 17. 6188-6190.
34. O'Connor, S.D.; Olsen, G. T.; Creager, S. E. J. Electroanal. Chem. 1999, 466197-202.
35. Lee, C.-Y.; Gong, P.; Harbers, G. M.; Grainger, D. W.; Castner, D. G.; Gamble, L. J. Anal. Chem. 2006, 78 (10), 3316-3325.
36. Gong, P.; Lee, C.-Y.; Gamble, L. J.; Castner, D. G.; Grainger, D. Vi.Anal. Chem. 2006, 78 (10), 3326-3334.
37. Creager, S. E.; Wooster, T. T. Anal Chem. 1998, 704257-4263.
38. Sumner, J. J.; Weber, K. S.; Hockett, L. A.; Creager, S. E. J. Phys. Chem. B 2000, 1047449-7459.
39. Lee, C.-Y.; Canavan, H. E.; Gamble. L. J.; Castner, D. J. Langmuir 2005, 2l5134-5141.
40. Anne, A.; Demaille, C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128542-557.
41. (41 ) Radi, A.-E.; Acero Sanchez. J. L.; Baldrich, E.; O'Sullivan, C. K. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128 (1), 117-124.
42. Lai, R.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Anal. Chem 2007, 79 (1), 229-233.
43. Xiao, Y.; Rowe, A. A.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129262-263.
44. Radi. A. E.; O'Sullivan, C. K. Chem. Commun. 2006, 32. 3432-3434