Oxygen reactivity of the biferrous site in the de novo designed four helix bundle peptide DFsc: Nature of the "intermediate" and reaction mechanism

Journal of the American Chemical Society

Volumn 130, Issue 29, 2008, Pages 9188-9189

  Calhoun, Jennifer R ^a   Bell III, Caleb B ^d   Smith, Thomas J ^b   Thamann, Thomas J ^c   DeGrado, William F ^a   Solomon, Edward I ^e  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^b KALAMAZOO COLLEGE   (United States)

^c PFIZER INC   (United States)

^d STANFORD UNIVERSITY   (United States)

^e NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; FERRITIN; FERROUS ION; IRON COMPLEX; METHANE MONOOXYGENASE; OXYGEN; PEPTIDE; PROTEIN; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE;

ARTICLE; CHEMICAL REACTION; DNA SYNTHESIS; ENZYME MECHANISM; KINETICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; RAMAN SPECTROMETRY;

BIOMIMETIC MATERIALS; CERULOPLASMIN; FERRIC COMPOUNDS; FERRITINS; FERROUS COMPOUNDS; KINETICS; NONHEME IRON PROTEINS; OXIDATION-REDUCTION; OXYGEN; PHENOLS; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; TYROSINE;

EID: 47749146974     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja801657y     Document Type: Article

References (29)

1. Solomon, E. I.; Brunold, T. C.; Davis, M. I.; Kemsley, J. N.; Lee, S. K.; Lehnert, N.; Neese, F.; Skulan, A. J.; Yang, Y. S.; Zhou, J. Chem. Rev. 2000, 100, 235-350.
2. Merkx, M.; Kopp, D. A.; Sazinsky, M. H.; Blazyk, J. L.; Muller, J.; Lippard, S. J. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 2782-807.
3. Strand, K. R.; Karlsen, S.; Kolberg, M.; Rohr, A. K.; Gorbitz, C. H.; Andersson, K. K. J. Biol. Chem. 2004, 279, 46794-801.
4. Lindqvist, Y.; Huang, W.; Schneider, G.; Shanklin, J. EMBO J. 1996, 15, 4081-92.
5. Fox, B. G.; Lyle, K. S.; Rogge, C. E. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 421-9.
6. Rinaldo, D.; Philipp, D. M.; Lippard, S. J.; Friesner, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 3135-47.
7. Murray, L. J.; Garcia-Serres, R.; Naik, S.; Huynh, B. H.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7458-9.
8. Krebs, C.; Galonic Fujimori, D.; Walsh, C. T.; Bollinger, J. M., Jr Acc. Chem. Res. 2007, 40, 484-92.
9. Lear, J. D.; DeGrado, W. F.; Calhoun, J. R. Proc Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 14772-7.
10. Pasternak, A.; Kaplan, J.; Lear, J. D.; Degrado, W. F. Protein Sci. 2001, 10, 958-69.
11. Di Costanzo, L.; Wade, H.; Geremia, S.; Randaccio, L.; Pavone, V.; DeGrado, W. F.; Lombardi, A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12749-57.
12. Calhoun, J. R.; Kono, H.; Lahr, S.; Wang, W.; DeGrado, W. F.; Saven, J. G. J. Mol. Biol. 2003, 334, 1101-15.
13. Cochran, F. V.; Wu, S. P.; Wang, W.; Nanda, V.; Saven, J. G.; Therien, M. J.; Degrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1346-7.
14. Calhoun, J. R.; Nastri, F.; Maglio, O.; Pavone, V.; Lombardi, A.; Degrado, W. F. Biopolymers 2005, 264-78.
15. Wei, P. P.; Skulan, A. J.; Wade, H.; DeGrado, W. F.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 16098-106.
16. Wade, H.; Stayrook, S. E.; Degrado, W. F. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2006, 45, 4951-4.
17. Kaplan, J.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 11566-70.
18. Yang, Y. S.; Baldwin, J.; Ley, B. A.; Bollinger, J. M., Jr.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 8495-510.
19. Yang, Y.-S.; Broadwater, J. A.; Pulver, S. C.; Fox, B. G.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2770-83.
20. Bollinger, J. M., Jr.; Tong, W. H.; Ravi, N.; Huynh, B. H.; Edmondson, D. E.; Stubbe, J. A. Methods Enzymol. 1995, 258, 278-303.
21. Fox, B. G.; Shanklin, J.; Ai, J.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. Biochemistry 1994, 33, 12776-86.
22. Marsh, E. N.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 5150-4.
23. Bell, C. B., 3rd; Calhoun, J. R.; Slonkina, E.; Wei, P. P.; Hedman, B.; Hodgson, K. O.; DeGrado, W. F.; Solomon, E. I. Unpublished results.
24. Summa, C. M.; Rosenblatt, M. M.; Hong, J. K.; Lear, J. D.; DeGrado, W. F. J. Mol. Biol. 2002, 321, 923-38.
25. Tong, W. H.; Chen, S.; Lloyd, S. G.; Edmondson, D. E.; Huynh, B. H.; Stubbe, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2107-8.
26. Waldo, G. S.; Theil, E. C. Biochemistry 1993, 32, 13262-9.
27. Antanaitis, B. C.; Strekas, T.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1982, 257, 3766-70.
28. Gaber, B. P.; Sheridan, J. P.; Bazer, F. W.; Roberts, R. M. J. Biol. Chem. 1979, 254, 8340-2.
29. Calhoun, J. R.; Liu, W.; Spiegel, K.; Dal Peraro, M.; Klein, M. L.; Valentine, K. G.; Wand, A. J.; DeGrado, W. F. Structure 2008, 16, 210-5.