Analysis of glycosaminoglycans by electrophoretic approach

Current Pharmaceutical Analysis

Volumn 4, Issue 2, 2008, Pages 78-89

  Karousou, Evgenia G ^a   Viola, Manuela ^a   Vigetti, Davide ^a   Genasetti, Anna ^a   Rizzi, Manuela ^a   Clerici, Moira ^a   Bartolini, Barbara ^a   De Luca, Giancarlo ^a   Passi, Alberto ^a  

^a UNIVERSITY OF INSUBRIA   (Italy)

Author keywords

Capillary electrophoresis; Derivatization; Fluorophore; Glycosaminoglycans; High performance liquid chromatography; Polyacrylamide gel electrophoresis

Indexed keywords

CARBOHYDRATE DERIVATIVE; DISACCHARIDE; GLYCOSAMINOGLYCAN; HYALURONIC ACID; HYDROXYL GROUP; LOW MOLECULAR WEIGHT HEPARIN; OLIGOSACCHARIDE; POLYMER; POLYSACCHARIDE; PROTEOGLYCAN; REAGENT;

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; CAPILLARY ZONE ELECTROPHORESIS; CARBOHYDRATE ANALYSIS; CHEMICAL STRUCTURE; CONSENSUS SEQUENCE; CROSS LINKING; DERIVATIZATION; DISEASE MARKER; DRUG DETERMINATION; ELECTROPHORESIS; ELECTROPHORETIC MOBILITY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; EXTRACELLULAR MATRIX; FLUORESCENCE ANALYSIS; GEL ELECTROPHORESIS; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HUMAN; HYDROPHOBICITY; INTERMETHOD COMPARISON; ION EXCHANGE CHROMATOGRAPHY; ION PAIR CHROMATOGRAPHY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MICELLAR ELECTROKINETIC CHROMATOGRAPHY; MICROEMULSION ELECTROKINETIC CHROMATOGRAPHY; NONHUMAN; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN SECRETION; PURIFICATION; QUANTITATIVE ANALYSIS; RADIATION DETECTION; REVIEW; SEPARATION TECHNIQUE; STRUCTURE ANALYSIS; THROMBOEMBOLISM; TISSUE SPECIFICITY; ULTRAVIOLET RADIATION;

EID: 47749137385     PISSN: 15734129     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/157341208784246260     Document Type: Review

References (96)

1. Hardingham, T. E.; Fosang, A. J. FASEB J., 1992, 6, 861-870.
2. Gesslbauer, B.; Rek, A.; Falsone, F.; Rajkovic, E.; Kungl, A. J. Proteomics, 2007, 7,2870-80.
3. Funderburgh, J. L. Glycobiology, 2000, 10, 951-958.
4. Iozzo, R. V. J. Biol. Chem., 1999, 274, 18843-6.
5. Vigetti, D.; Ori, M.; Viola, M.; Genasetti, A.; Karousou, E.; Rizzi, M.; Pallotti, F.; Nardi, I.; Hascall, V. C.; De Luca, G.; Passi, A. J. Biol. Chem., 2006, 281, 8254-63.
6. Lin, X.; Perrimon, N. Matrix Biol., 2000, 19, 303-307.
7. Whitelock, J. M.; Iozzo, R. V. Chem. Rev., 2005, 105, 2745-64.
8. Silbert, J. E.; Sugumaran, G. IUBMB life, 2002, 54, 177-86.
9. Esko, J. D.; Selleck, S. B. Annu. Rev. Biochem., 2002, 71, 435-71.
10. Weigel, P. H.; DeAngelis, P. L. J. Biol. Chem., 2007, 282, 36777-36781.
11. Vigetti, D.; Viola, M.; Karousou, E.; Rizzi, M.; Moretto, P.; Genasetti, A.; Clerici, M.; Hascall, V. C.; De Luca, G.; Passi, A. J. Biol. Chem., 2008, 283, 4448-58.
12. Tovar, A. M. F.; Cesar, D. C. F.; Leta, G. C.; Mourao, P. A. S. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol., 1998, 18, 604-614.
13. Plaas, A. H.; Wong-Palms, S.; Roughley, P. J.; Midura, R. J.; Hascall, V. C. J. Biol. Chem., 1997, 272, 20603-10.
14. Theocharis, A. D.; Theocharis, D. A.; De Luca, G.; Hjerpe, A.; Karamanos, N. K. Biochimie, 2002, 84, 667-74.
15. Theocharis, A. D.; Tsolakis, I.; Tsegenidis, T.; Karamanos, N. K. Atherosclerosis, 1999, 145, 359-68.
16. Albertini, R.; Ramos, P.; Giessauf, A.; Passi, A.; De Luca, G.; Esterbauer, H. FEBS Lett., 1997, 403, 154-8.
17. Lamari, F. N.; Militsopoulou, M.; Mitropoulou, T. N.; Hjerpe, A.; Karamanos, N. K. Biomed. Chromatogr., 2002, 16, 95-102.
18. Oonuki, Y.; Yoshida, Y.; Uchiyama, Y.; Asari, A. Anal. Biochem., 2005, 343,21 2-22.
19. Kreuger, J.; Spillmann, D.; Li, J. P.; Lindahl, U. J. Cell Biol., 2006, 174, 323-7.
20. Tenni, R.; Viola, M.; Weiser, F.; Sini, P.; Giudici, C.; Rossi, A.; Tira, M. E. Eur. J. Biochem./FEBS, 2002, 269, 1428-37.
21. Costell, M.; Manni, K.; Yamada, Y.; Timpl, R. Eur. J. Biochem, 1997, 243, 115-121.
22. Bourdon, M. A.; Krusius, T.; Campbell, S.; Schwartz, N. B.; Ruoslahti, E. P. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84, 3194-8.
23. Almond, A. Cell. Mol. Life Sci. (CMLS), 2007, 64, 1591-1596.
24. Toole, B. P.; Wight, T. N.; Tammi, M. I. J. Biol. Chem., 2002, 277, 4593-4596.
25. Lee, J. Y.; Spicer, A. P. Curr. Opin. Cell Biol., 2000, 12, 581-586.
26. Lauer, M. E.; Hascall, V. C.; Wang, A. J. Biol. Chem., 2007, 282, 843-52.
27. Raio, L.; Cromi, A.; Ghezzi, F.; Passi, A.; Karousou, E.; Viola, M.; Vigetti, D.; De Luca, G.; Bolis, P. Matrix Biol., 2005, 24, 166-74.
28. Karousou, E. G.; Viola, M.; Genasetti, A.; Vigetti, D.; Luca, G. D.; Karamanos, N. K.; Passi, A. Biomed. Chromatogr., 2005, 19, 761-5.
29. Viola, M.; Karousou, E. G.; Vigetti, D.; Genasetti, A.; Pallotti, F.; Guidetti, G. F.; Tira, E.; De Luca, G.; Passi, A. J. Pharmaceut. Biomed., 2006, 41, 36-42.
30. Jackson, D. G.; Bell, J. I.; Dickinson, R.; Timans, J.; Shields, J.; Whittle, N. J. Cell Biol., 1995, 128, 673-85.
31. Font, B.; Eichenberger, D.; Goldschmidt, D.; Boutillon, M. M.; Hulmes, D. J. Eur. J. Biochem./FEBS, 1998, 254, 580-7.
32. Monzo, A.; Bonn, G. K.; Guttman, A. Trends Anal. Chem., 2007, 26, 423-432.
33. Kon, A.; Takagaki, K.; Kawasaki, H.; Nakamura, T.; Endo, M. J. Biochem., 1991, 110, 132-5.
34. Cheng, M. C.; Lin, S. L.; Wu, S. H.; Inoue, S.; Inoue, Y. Anal. Biochem., 1998, 260, 154-9.
35. Seyfried, N. T.; Blundell, C. D.; Day, A. J.; Almond, A. Glycobiology, 2005, 15, 303-12.
36. Matsuno, Y. K.; Yamada, K.; Tanabe, A.; Kinoshita, M.; Maruyama, S. Z.; Osaka, Y. S.; Masuko, T.; Kakehi, K. Anal. Biochem., 2007, 362, 245-57.
37. Stefansson, M.; Novotny, M. Carbohyd. Res., 1994, 258, 1-9.
38. Calabro, A.; Benavides, M.; Tammi, M.; Hascall, V. C.; Midura, R. J. Glycobiology, 2000, 10, 273-281.
39. Karousou, E. G.; Militsopoulou, M.; Porta, G.; De Luca, G.; Hascall, V. C.; Passi, A. Electrophoresis, 2004, 25, 2919-25.
40. Karousou, E. G.; Porta, G.; De Luca, G.; Passi, A. J. Pharmaceut. Biomed., 2004, 34, 791-5.
41. Mitropoulou, T. N.; Lamari, F.; Syrokou, A.; Hjerpe, A.; Karamanos, N. K. Electrophoresis, 2001, 22, 2458-63.
42. Zinellu, A.; Pisanu, S.; Zinellu, E.; Lepedda, A. J.; Cherchi, G. M.; Sotgia, S.; Carru, C.; Deiana, L.; Formato, M. Electrophoresis, 2007, 28, 2439-47.
43. Militsopoulou, M.; Lamari, F. N.; Iljerpe, A.; Karamanos, N. K. Electrophoresis, 2002, 23, 1104-9.
44. Okafo, G.; Langridge, J.; North, S.; Organ, A.; West, A.; Morris, M.; Camilleri, P. Anal. Chem., 1997, 69, 4985-93.
45. Anumula, K. R.; Dhume, S. T. Glycobiology, 1998, 8, 685-94.
46. Anumula, K. R.; Du, P. Anal. Biochem., 1999, 275, 236-42.
47. Bigge, J. C.; Patel, T. P.; Bruce, J. A.; Goulding, P. N.; Charles, S. M.; Parekh, R. B. Anal. Biochem., 1995, 230, 229-38.
48. Huang, Z.; Prickett, T.; Potts, M.; Helm, R. F. Carbohyd. Res., 2000, 328, 77-83.
49. Neville, D. C.; Coquard, V.; Priestman, D. A.; te Vruchte, D. J.; Sillence, D. J.; Dwek, R. A.; Platt, F. M.; Butters, T. D. Anal. Biochem., 2004, 331, 275-82.
50. Sato, K.; Sato, K.; Okubo, A.; Yamazaki, S. Anal. Biochem., 1997, 251, 119-21.
51. Anumula, K. R. Anal. Biochem., 1994, 220,2 75-83.
52. Gershkovich, A. A.; Kholodovych, V. V. J. Biochem. Bioph. Meth., 1996, 33, 135-62.
53. Hilborn, J. C.; Anastassiadis, P. A. Anal. Biochem., 1969, 31, 51-8.
54. Jackson, P. Mol. Biotechnol., 1996, 5, 101-23.
55. Goubet, F.; Jackson, P.; Deery, M. J.; Dupree, P. Anal. Biochem., 2002, 300, 53-68.
56. Masuoka, J.; Hazen, K. C. Electrophoresis, 2006, 27, 365-72.
57. Calabro, A.; Hascall, V. C.; Midura, R. J. Glycobiology, 2000, 10, 283-93.
58. Calabro, A.; Midura, R.; Wang, A.; West, L.; Plaas, A.; Hascall, V. C. Osteoarthr. Cartilage, 2001, 9 Suppl. A, S16-22.
59. Turnbull, J. E.; Gallagher, J. T. Biochem. J., 1988, 251, 597-608.
60. Lamari, F.; Karamanos, N. K. J. Liquid Chromat. Rel. Technol., 1999, 22, 1295-1317.
61. Volpi, N.; Maccari, F. Clin. Chim. Acta, 2005, 356,1 25-33.
62. Lindahl, U.; Backstrom, G.; Thunberg, L.; Leder, I. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1980, 77, 6551-5.
63. Jin, L.; Abrahams, J. P.; Skinner, R.; Petitou, M.; Pike, R. N.; Carrell, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1997, 94, 14683-8.
64. Koopman, M. M.; Prandoni, P.; Novella, F.; Ockelford, P. A.; Brandjes, D. P.; van der Meer, J.; Gallus, A. S.; Simonneau, G.; Chesterman, C. H.; Prins, M. H. New Engl. J. Med., 1996, 334, 682-7.
65. Mousa, S. A.; Zhang, F.; Aljada, A.; Chaturvedi, S.; Takieddin, M.; Zhang, H.; Chi, L.; Castelli, M. C.; Friedman, K.; Goldberg, M. M.; Linhardt, R. J. J. Clin. Pharmacol., 2007, 47, 1508-20.
66. Edens, R. E.; al-Hakim, A.; Weiler, J. M.; Rethwisch, D. G.; Fareed, J.; Linhardt, R. J. J. Pharm. Sci- US, 1992, 81, 823-7.
67. Zhang, F.; Sun, P.; Munoz, E.; Chi, L.; Sakai, S.; Toida, T.; Zhang, H.; Mousa, S.; Linhardt, R. J. Anal. Biochem., 2006, 353, 284-286.
68. Mao, W.; Thanawiroon, C.; Linhardt, R. J. Biomed. Chromatogr., 2002, 16, 77-94.
69. Lehmann, R.; Huber, M.; Beck, A.; Schindera, T.; Rinkler, T.; Houdah, B.; Weigert, C.; Haring, H. U.; Voelter, W.; Schleicher, E. D. Electrophoresis, 2000, 21, 3010-5.
70. Vynios, D. H.; Karamanos, N. K.; Tsiganos, C. P. J. Chromatogr., 2002, 781, 21-38.
71. Volpi, N.; Maccari, F. J. Chromatogr., 2006, 834, 1-13.
72. Payan, E.; Presle, N.; Lapicque, F.; Jouzeau, J. Y.; Bordji, K.; Oerther, S.; Miralles, G.; Mainard, D.; Netter, P. Anal. Chem., 1998, 70, 4780-6.
73. Hayase, S.; Oda, Y.; Honda, S.; Kakehi, K. J. Chromatogr., 1997, 768, 295-305.
74. Scapol, L.; Marchi, E.; Viscomi, G. C. J. Chromatogr., 1996, 735, 367-74.
75. Desai, U. R.; Wang, H.; Ampofo, S. A.; Linhardt, R. J. Anal. Biochem., 1993, 213, 120-7.
76. Carney, S. L.; Osborne, D. J. Anal. Biochem., 1991, 195, 132-40.
77. Karamanos, N. K.; Axelsson, S., Vanky, P.; Tzanakakis, G. N.; Hjerpe, A. J. Chromatogr., 1995, 696, 295-305.
78. Karamanos, N. K.; Vanky, P.; Tzanakakis, G. N.; Hjerpe, A. Electrophoresis, 1996, 17, 391-5.
79. Malavaki, C. J.; Asimakopoulou, A. P.; Lamari, F. N.; Theocharis, A. D.; Tzanakakis, G. N.; Karamanos, N. K., Anal. Biochem., 2008, 374, 213-20.
80. Militsopoulou, M.; Lecomte, C.; Bayle, C.; Couderc, F.; Karamanos, N. K. Biomed. Chromatogr., 2003, 17, 39-41.
81. Karamanos, N. K.; Vanky, P.; Tzanakakis, G. N.; Tsegenidis, T.; Hjerpe, A. J. Chromatogr., 1997, 765, 169-79.
82. Ampofo, S. A.; Wang, H. M.; Linhardt, R. J. Anal. Biochem., 1991, 199, 249-55.
83. Karamanos, N. K.; Syrokou, A.; Vanky, P.; Nurminen, M.; Hjerpe, A. Anal. Biochem., 1994, 221, 189-99.
84. Kitagawa, H.; Kinoshita, A.; Sugahara, K. Anal. Biachem., 1995, 232, 114-21.
85. Plaas, A. H.; Hascall, V. C.; Midura, R. J. Glycobiology, 1996, 6, 823-9.
86. Kinoshita, A.; Sugahara, K. Anal. Biochem., 1999, 269, 367-78.
87. Toyoda, H.; Nagashima, T.; Hirata, R.; Toida, T.; Imanari, T. J. Chromatogr., 1997, 704, 19-24.
88. Kariya, Y.; Herrmann, J.; Suzuki, K., Isomura, T.; Ishihara, M. J. Biochem., 1998, 123, 240-6.
89. Kreuger, J.; Salmivirta, M.; Sturiale, L.; Gimenez-Gallego, G.; Lindahl, U. J. Biol. Chem., 2001, 276, 30744-30752.
90. Vives, R. R.; Pye, D. A.; Salmivirta, M.; Hopwood, J. J.; Lindahl, U.; Gallagher, J. T. J. Biol. Chem., 1999, 339 (Pt 3), 767-73.
91. Merry, C. L. R.; Lyon, M.; Deakin, J. A.; Hopwood, R. J.; Gallagher, J. T. J. Biol. Chem., 1999, 274, 18455-18462.
92. Thanawiroon, C.; Rice, K. G.; Toida, T.; Linhardt, R. J. J. Biol. Chem., 2004, 279, 2608-2615.
93. Skidmore, M. A.; Guimond, S. E.; Dumax-Vorzet, A. F.; Atrih, A.; Yates, E. A.; Turnbull, J. E. J. Chromatogr., 2006, 1135, 52-6.
94. Spicer, A. P.; Tien, J. L.; Joo, A.; Bowling Jr, R. A. Glycoconjugate J., 2002, 19, 341-5.
95. Heldin, P.; Laurent, T. C.; Heldin, C. H. Biochem. J., 1989, 258, 919-22.
96. Nurminen, M.; Dejmek, A.; Martensson, G.; Thylen, A.; Hjerpe, A. Clin. Chem., 1994, 40, 777-80.