Diffractive micro bar codes for encoding of biomolecules in multiplexed assays

Analytical Chemistry

Volumn 80, Issue 6, 2008, Pages 1902-1909

  Broder, Graham R ^a   Ranasinghe, Rohan T ^a   She, Joseph K ^a   Banu, Shahanara ^a   Birtwell, Sam W ^a   Cavalli, Gabriel ^a   Galitonov, Gerasim S ^a   Holmes, David ^a   Martins, Hugo F P ^a   MacDonald, Kevin F ^a   Neylon, Cameron ^a,b   Zheludev, Kikolay ^a   Roach, Peter L ^a   Morgan, Hywel ^a  

^a UNIVERSITY OF SOUTHAMPTON   (United Kingdom)

^b RUTHERFORD APPLETON LABORATORY   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ASSAYS; BAR CODES; MICROMETERS; OLIGONUCLEOTIDES; PHOTOLITHOGRAPHY;

DIFFRACTIVE MICRO BAR CODES; MULTIPLEXED ASSAYS;

BIOMOLECULES;

EPOXIDE; IMMUNOGLOBULIN G; OLIGONUCLEOTIDE;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; BIOASSAY; BIOTECHNOLOGY; CHEMICAL REACTION KINETICS; DATA ANALYSIS; DNA HYBRIDIZATION; DNA SEQUENCE; GENETIC CODE; GENOMICS; HIGH THROUGHPUT SCREENING; IMMUNOASSAY; MOLECULAR INTERACTION; MOLECULAR PROBE; PARTICLE SIZE; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY; SENSITIVITY ANALYSIS;

AUTOMATIC DATA PROCESSING; BASE SEQUENCE; DNA; HUMANS; IMMUNOASSAY; IMMUNOGLOBULIN G; IMMUNOGLOBULIN M; KINETICS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 41449089418     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac7018574     Document Type: Article

References (34)

1. Gresham, D.; Ruderfer, D. M.; Pratt, S. C.; Schacherer, J.; Dunham, M. J.; Botstein, D.; Kruglyak, L. Science 2006, 311, 1932-1936.
2. Abdullah-Sayani, A.; Bueno-de-Mesquita, J. M.; van de Vijver, M. J. Nat. Clin. Pract. Oncol. 2006, 3, 501-516.
3. Becker, K. F.; Metzger, V.; Hipp, S.; Hofler, H. Curr. Med. Chem. 2006, 13, 1831-1837.
4. Balboni, I.; Chan, S. M.; Kattah, M.; Tenenbaum, J. D.; Butte, A. J.; Utz, P. J. Annu. Rev. Immunol. 2006, 24, 391-418.
5. Barbulovic-Nad, I.; Lucente, M.; Sun, Y.; Zhang, M. J.; Wheeler, A. R.; Bussmann, M. Crit. Rev. Biotechnol. 2006, 26, 237-259.
6. Wingren, C.; Borrebaeck, C. A. K. Omics 2006, 10, 411-427.
7. Bentley, D. R. Curr. Opin. Genet. Dev. 2006, 16, 545-552.
8. Meza, M. B. Drug Discovery Today 2000, 38-41.
9. Nolan, J. P.; Mandy, F. Cytometry, Part A 2006, 69A, 318-325.
10. Braeckmans, K.; De Smedt, S. C.; Leblans, M.; Pauwels, R.; Demeester, J. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 447-456.
11. Wilson, R.; Cossins, A. R.; Spiller, D. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 6104-6117.
12. Nicewarner-Pena, S. R.; Freeman, R. G.; Reiss, B. D.; He, L.; Pena, D. J.; Walton, I. D.; Cromer, R.; Keating, C. D.; Natan, M. J. Science 2001, 294, 137-141.
13. Han, M. Y.; Gao, X. H.; Su, J. Z.; Nie, S. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 631-635.
14. Braeckmans, K.; De Smedt, S. C.; Roelant, C.; Leblans, M.; Pauwels, R.; Demeester, J. Nat. Mater. 2003, 2, 169-173.
15. Zhi, Z. L.; Morita, Y.; Yamamura, S.; Tamiya, E. Chem. Commun. 2005, 2448-2450.
16. Jun, B. H.; Kim, J. H.; Park, H.; Kim, J. S.; Yu, K. N.; Lee, S. M.; Choi, H.; Kwak, S. Y.; Kim, Y. K.; Jeong, D. H.; Cho, M. H.; Lee, Y. S. J. Comb. Chem. 2007, 9, 237-244.
17. Vollmer, F.; Arnold, S.; Braun, D.; Teraoka, I.; Libchaber, A. Biophys. J. 2003, 84, 295A-295A.
18. Gunderson, K. L.; Kruglyak, S.; Graige, M. S.; Garcia, F.; Kermani, B. G.; Zhao, C. F.; Che, D. P.; Dickinson, T.; Wickham, E.; Bierle, J.; Doucet, D.; Milewski, M.; Yang, R.; Siegmund, C.; Haas, J.; Zhou, L. X.; Oliphant, A.; Fan, J. B.; Barnard, S.; Chee, M. S. Genome Res. 2004, 14, 870-877.
19. Li, Y. G.; Cu, Y. T. H.; Luo, D. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 885-889.
20. Nam, J. M.; Thaxton, C. S.; Mirkin, C. A. Science 2003, 301, 1884-1886.
21. Pregibon, D. C.; Toner, M.; Doyle, P. S. Science 2007, 315, 1393-1396.
22. Galitonov, G. S.; Birtwell, S. W.; Zheludev, N. I.; Morgan, H. Opt. Express 2006, 14, 1382-1387.
23. Birtwell, S. W.; Galitonov, G. S.; Morgan, H.; Zheludev, N. I. Opt. Commun. In press. Doi:10.1016/j.optcom.2007.04.066.
24. Hermanson, G. T. Bioconjugate Techniques; Academic Press: London, 1996.
25. Cavalli, G.; Banu, S.; Ranasinghe, R. T.; Broder, G. R.; Martins, H. F. P.; Neylon, C.; Morgan, H.; Roach, P. L. J. Comb. Chem. 2007, 462-472.
26. Banu, S.; Birtwell, S. W.; Galitonov, G. S.; Chen, Y.-F.; Zheludev, N. I.; Morgan, H. J. Micromech. Microeng. 2007, 17, S116-S121.
27. Guo, L. J. J. Phys. D 2004, 37, R123-R141.
28. Finkel, N. H.; Lou, X.; Wang, C.; He, L. Anal. Chem. 2004, 76, 352A-359A.
29. Green, N. M. Biochem. J. 1963, 89, 585.
30. Osborne, L.; Santis, G.; Schwarz, M.; Klinger, K.; Dork, T.; McIntosh, I.; Schwartz, M.; Nunes, V.; Macek, M.; Reiss, J.; Highsmith, W. E.; McMahon, R.; Novelli, G.; Malik, N.; Burger, J.; Anvret, M.; Wallace, A.; Williams, C.; Mathew, C.; Rozen, R.; Graham, C.; Gasparini, P.; Bal, J.; Cassiman, J. J.; Balassopoulou, A.; Davidow, L.; Raskin, S.; Kalaydjieva, L.; Kerem, B.; Richards, S.; Simonbouy, B.; Super, M.; Wulbrand, U.; Keston, M.; Estivill, X.; Vavrova, V.; Friedman, K. J.; Barton, D.; Dallapiccola, B.; Stuhrmann, M.; Beards, F.; Hill, A. J. M.; Pignatti, P. F.; Cuppens, H.; Angelicheva, D.; Tummler, B.; Brock, D. J. H.; Casals, T.; Macek, M.; Schmidtke, J.; Magee, A. C.; Bonizzato, A.; Deboeck, C.; Kuffardjieva, A.; Hodson, M.; Knight, R. A. Hum. Genet. 1992, 89, 653-658.
31. de Jager, W.; Rijkers, G. T. Methods 2006, 38, 294-303.
32. Novak, J. P.; Miller, M. C.; Bell, D. A. Biol. Direct In press. DOI 10.1186/1745-6150-1-18.
33. Dunbar, S. A.; Vander Zee, C. A.; Oliver, K. G.; Karem, K. L.; Jacobson, J. W. J. Microbiol. Methods 2003, 53, 245-252.
34. Marie, R.; Schmid, S.; Johansson, A.; Ejsing, L. E.; Nordstrom, M.; Hafliger, D.; Christensen, C. B. V.; Boisen, A.; Dufva, M. Biosens. Bioelectron. 2006, 21, 1327-1332.