Universal colorimetric detection of nucleic acids based on polydiacetylene (PDA) liposomes

Advanced Functional Materials

Volumn 18, Issue 5, 2008, Pages 701-708

  Jung, Yun Kyung ^a   Kim, Tae Won ^a   Kim, Jumi ^b   Kim, Jong Man ^b   Park, Hyun Gyu ^a  

^a Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

^b Hanyang University   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINES; COLORIMETRIC ANALYSIS; LIPOSOMES; MOLECULAR INTERACTIONS; ORGANIC POLYMERS;

COLORIMETRIC DETECTION; DNA DIAGNOSIS; IONIC INTERACTIONS; POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR);

NUCLEIC ACIDS;

EID: 41149098618     PISSN: 1616301X     EISSN: 16163028     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/adfm.200700929     Document Type: Article

References (74)

1. a) J. Wang, Nucleic Acids Res. 2000, 28, 3011.
2. b) H. Berney, J. West, E. Haefele, J. Alderman, W. Lane, J. K. Collins, Sens. Actuators B 2000, 65, 100.
3. c) Z. Junhui, C. Hong, Y. Ruifu, Biotechnol. Adv. 1997, 15, 43.
4. d) S. G. Skuridin, Y. M. Yevdokimov, Biosens. Bioelectron. 1996, 11, 903.
5. a) R. K. Saiki, S. Scharf, F. Faloona, K. B. Mullis, G. T. Horn, H. A. Erlich, N. Arnheim, Science 1985, 230, 1350.
6. b) R. K. Saiki, D. H. Gelfand, S. Stoffel, S. J. Scharf, R. Higuchi, G. T. Horn, K. B. Mullis, H. A. Erlich, Science 1988, 239, 487.
7. c) K. Mullis, F. Faloona, F., S. Scharf, R. Saiki, G. Horn, H. Erlich, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1986, 51, 263.
8. d) D. J. Kemp, D. B. Smith, S. J. Foote, N. Samaras, M. G. Peterson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 2423.
9. e) L. Stryer, Biochemistry, Freeman, New York 1995, Ch. 6.
10. a) G. H. Dixon, O. Smithies, Biochim. Biophys. Acta 1957, 23, 198.
11. b) O. Smithies, Genetics 1995, 139, 1.
12. c) N. Stellwagen, C. Gelfi, P. G. Righetti, Electrophoresis 2002, 23, 167.
13. d) D. H. Van Winkle, A. Beheshti, R. L. Rill, Electrophoresis 2002, 23, 15.
14. a) B. Pertl, A. Sekizawa, O. Samura, I. Orescovic, P. T. Rahaim, D. W. Bianchi, Hum. Genet. 2000, 106, 45.
15. b) J. B. Randolph, A. S. Waggoner, Nucleic Acids Res. 1997, 25, 2923.
16. c) H. G. Park, J. Y. Song, K. H. Park, M. H. Kim, Chem. Eng. Sci. 2006, 61, 954.
17. a) D. H. Lee, S. Y. Kim, J.-I. Hong, Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 4777.
18. b) Y. J. Jang, E. J. Jun, Y. J. Lee, Y. S. Kim, J. S. Kim, J. Yoon, J. Org. Chem. 2005, 70, 9603.
19. c) S. K. Kim, N. J. Singh, S. J. Kim, K. M. K. Swamy, S. H. Kim, K.-H. Lee, K. S. Kim, J. Yoon, Tetrahedron 2005, 61, 4545.
20. d) A. A. Killeen, Microchem. J. 1995, 52, 333.
21. e) L. J. Passmore, A. A. Killeen, Mol. Diagn. 1996, 1, 329.
22. f) K. M. Gattás- Asfura, D. M. Naistat, R. M. Leblanc, Colloids Surf. A 2006, 282-283, 471.
23. g) E. S. Mansfield, J. M. Worley, S. E. McKenzie, S. Surrey, E. Rappaport, P. Fortina, Mol. Cell. Probes 1995, 9, 145.
24. h) A. Dekonenko, M. S. Ibrahim, C. S. Schmaljohn, Clin. Diagn. Virol. 1997, 33, 113.
25. i) R. D. Prete, M. Quaranta, A. Lippolis, V. Giannuzzi, A. Mosca, E. Jirillo, G. Miragliotta, J. Microbiol. Methods 1998, 33, 105.
26. j) M. Rola, J. Kuzmak, J. Virol. Methods 2002, 99, 33.
27. k) J. Jean, B. Biais, A. Darveau, I. Fliss, FEMS Microbiol. Lett. 2002, 210, 143.
28. l) X. Wu, Y. Zhou, S. Xu, Clin. Chim. Acta 2002, 323, 103.
29. m) L. M. Elandalloussi, R. M. Leite, R. Afonso, P. A. Nunes, J. A. F. Robledo, G. R. Vasta, M. L. Cancela, Mol. Cell. Probes 2004, 18, 89.
30. n) C. A. Mirkin, R. L. Letsinger, R. C. Mucic, J. J. Storhoff, Nature 1996, 382, 607.
31. o) K. Sato, K. Hosokawa, M. Maeda, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8102.
32. p) P. Baptista, G. Doria, D. Henriques, E. Pereira, R. Franco, J. Biotechnol. 2005, 119, 111.
33. q) K. Sato, K. Hosokawa, M. Maeda, Nucleic Acids Res. 2005, 33, e4.
34. r) Y. C. Cao, R. Jin, C. S. Thaxton, C. A. Mirkin, Talanta 2005, 67, 449.
35. s) I. Alexandre, S. Hamela, S. Dufour, J. Collet, N. Zammatteo, F. De Longueville, J.-L. Gala, J. Remacle, Anal. Biochem. 2001, 295, 1.
36. t) J.-S. Lee, A. K. R. Lytton-Jean, S. J. Hurst, C. A. Mirkin, Nano Lett. 2007, 7, 2112.
37. a) G. Wegner, Makromol. Chem. 1972, 154, 35.
38. b) M. Wenzel, G. H. Atkinson, J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 6123.
39. c) D. N. Batchelder, S. D. Evans, T. L. Freeman, L. Haussling, H. Ringsdorf, H. Wolf, J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 1050.
40. d) T. Kim, R. M. Crooks, M. Tsen, I., Sun, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 3963.
41. a) A. Singh, R. B. Thompson, J. M. Schnur, J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 2785.
42. b) D. J. Ahn, E. H. Chae, G. S. Lee, H. Y. Shim, T. E. Chang, K. D. Ahn, J.-M. Kim, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8976.
43. c) H. Peng, J. Tang, L. Yang, J. Pang, H. S. Ashbaugh, C. J. Brinker, Z. Yang, Y. Lu, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5304.
44. d) J. Song, Q. Cheng, S. Kopta, R. C. Stevens, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3205.
45. e) U. Jonas, K. Shah, S. Norvez, D. H. Charych, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4580.
46. a) D. H. Charych, J. O. Nagy, W. Spevak, M. D. Bednarski, Science 1993, 261, 585.
47. b) A. Reichert, J. O. Nagy, W. Spevak, D. Charych, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 7301.
48. c) D. Charych, Q. Cheng, A. Reichert, G., Kuziemko, M. Storh, J. O. Nagy, W. Spevak, R. C. Stevens, Chem. Biol. 1996, 3, 113.
49. d) Y. K. Jung, H. G. Park, J.-M. Kim, Biosens. Bioelectron. 2006, 21, 1536.
50. e) S. Kolusheva, R. Kafri, M. Katz, R. Jelinek, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 417.
51. f) Y.-L. Su, J.-R. Li, L. Jiang, Colloids Surf. B 2004, 38, 29.
52. g) S. Kolusheva, L. Boyer, R. Jelinek, Nat. Biotechnol. 2000, 18, 225.
53. h) N. Y. Lee, Y. K. Jung, H. G. Park, Biochem. Eng. J. 2006, 29,103.
54. i) B. Ma, Y. Fan, L. Zhang, X. Kong, Y. Li, J. Li, Colloids Surf. B 2002, 27, 209.
55. j) Y.-L. Su, J.-R. Li, L. Jiang, J. Cao, J. Colloid Interface Sci. 2005, 284, 114.
56. k) J. J. Pan, D. Charych, Langmuir 1997, 13, 1365.
57. l) R. Jelinek, S. Y. Okada, S. Norvez, D. H. Charych, Chem. Biol. 1998, 5, 619.
58. m) S. Y. Okada, R. Jelinek, D. H. Charych, Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 655.
59. n) S. Kolusheva, T. Shahal, R. Jelinek, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 776.
60. o) R. Jelinek, Drug Dev. Res. 2000, 50, 497.
61. p) M. Katz, I. Ben-Shlush, S. Kolusheva, R. Jelinek, Pharm. Res. 2006, 23, 580.
62. q) K. Sadagopan, S. N. Sawant, S. K. Kulshreshtha, G. K. Jarori, Sens. Actuators B 2006, 115, 526.
63. r) Eur. Patent. 0 926 497 (1999), Y. Jo, T. Inoue, K. Takada.
64. s) US Patent 6 306 598 (2001), D. H. Charych, U. Jonas.
65. t) C. Wang, Z. Ma, Anal. Bioanal. Chem. 2005, 382, 1708.
66. u) C. Wang, Z. Ma, Z. Su, Sens. Actuators B 2006, 113, 510.
67. a) J.-M. Kim, Y. B. Lee, S. K. Chae, D. J. Ahn, Adv. Funct. Mater. 2006, 16, 2103.
68. b) J. Yoon, S. K. Chae, J.-M. Kim, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 3038.
69. c) S. K. Chae, H. Park, J. Yoon, C. H. Lee, D. J. Ahn, J.-M. Kim, Adv. Mater. 2007, 19, 521.
70. J. Kim, J.-M. Kim, D. J. Ahn, Macromol. Res. 2006, 14, 478.
71. a) J. D. Watson, The Double Helix: A Personal Account of the Discovery of the Structure of DNA, Weidenfeld and Nicholsin, London 1968.
72. b) W. Saenger, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer, New York 1984, pp. 105-115.
73. a) J. Boyd, Gynecol. Oncol. 2001, 80, 337.
74. b) S.-C. Yim, H. G. Park, H. N. Chang, D.-Y. Cho, Anal. Biochem. 2005, 337, 332.