A stroboscopic approach for fast photoactivation-localization microscopy with Dronpa mutants

Journal of the American Chemical Society

Volumn 129, Issue 45, 2007, Pages 13970-13977

  Flors, Cristina ^a   Hotta, Jun Ichi ^a   Uji i, Hiroshi ^a   Dedecker, Peter ^a   Ando, Ryoko ^b   Mizuno, Hideaki ^b   Miyawaki, Atsushi ^b   Hofkens, Johan ^a  

^a UNIVERSITY OF LEUVEN   (Belgium)

^b RIKEN BRAIN SCIENCE INSTITUTE   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENT PROTEINS; PHOTOACTIVATION; PHOTOACTIVATION-LOCALIZATION MICROSCOPY; PHOTOPHYSICAL PROPERTIES; STROBOSCOPIC APPROACH;

CONFORMATIONS; DIFFRACTION; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; MUTAGENESIS; OPTIMIZATION; PARAMETER ESTIMATION;

PROTEINS;

GREEN FLUORESCENT PROTEIN; PROTEIN DRONPA2; PROTEIN DRONPA3; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; BINDING SITE; CHROMATOPHORE; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; GEOMETRY; ILLUMINATION; MICROSCOPY; MOLECULE; MUTANT; PHOTOACTIVATION; PHOTOACTIVATION LOCALIZATION MICROSCOPY; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN LOCALIZATION; STROBOSCOPY;

GREEN FLUORESCENT PROTEINS; MICROSCOPY, CONFOCAL; MODELS, MOLECULAR; MUTATION; PHOTOCHEMISTRY; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE; TIME FACTORS;

EID: 36148939818     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja074704l     Document Type: Article

References (44)

1. Lippincott-Schwartz, J.; Patterson, G. H. Science 2003, 300, 87-91.
2. Chudakov, D. M.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Trends Biotechnol. 2005, 23, 605-613.
3. Miyawaki, A.; Sawano, A.; Kogure, T. Nat. Cell. Biol. 2003, Suppl., S1-S7.
4. Shaner, N. C.; Steinbach, P. A.; Tsien, R. Y. Nat. Methods 2005, 2, 905-909.
5. Remington, S. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 714-721.
6. Wiedenmann, J.; Nienhaus, G. U. Expert Rev. Proteomics 2006, 3, 361-374.
7. Lukyanov, K. A.; Chudakov, D. M.; Lukyanov, S.; Verkhusha, V. V. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005, 6, 885-891.
8. Chapman, S.; Oparka, K. J.; Roberts, A. G. Curr. Opin. Plant Biol. 2005, 8, 565-573.
9. Andresen, M.; Wahl, M. C.; Stiel, A. C.; Grater, F.; Schafer, L. V.; Trowitzsch, S.; Weber, G.; Eggeling, C.; Grubmuller, H.; Hell, S. W.; Jakobs, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 13070-13074.
10. Chudakov, D. M.; Belousov, V. V.; Zaraisky, A. G.; Novoselov, V. V.; Staroverov, D. B.; Zorov, D. B.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 191-194.
11. Lukyanov, K.; Fradkov, A.; Gurskaya, N.; Matz, M.; Labas, Y.; Savitsky, A.; Markelov, M.; Zaraisky, A.; Zhao, X.; Fang, Y.; Tan, W.; Lukyanov, S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25879-25882.
12. Ando, R.; Mizuno, H.; Miyawaki, A. Science 2004, 306, 1370-1373.
13. Fron, E.; Flors, C.; Schweitzer, G.; Habuchi, S.; Mizuno, H.; Ando, R.; Miyawaki, A.; de Schryver, F. C.; Hofkens, J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4870-4871.
14. Andresen, M.; Stiel, A. C.; Trowitzsch, S.; Weber, G.; Eggeling, C.; Wahl, M. C.; Hell, S. W.; Jakobs, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 13005-13009.
15. Stiel, A. C.; Trowitzsch, S.; Weber, G.; Andresen, M.; Eggeling, C.; Hell, S. W.; Jakobs, S.; Wahl, M. C. Biochem. J. 2007, 402, 35-42.
16. Ando, R.; Flors, C.; Mizuno, H.; Hofkens, J.; Miyawaki, A. Biophys. J. 2007, 92, L97-L99.
17. Habuchi, S.; Ando, R.; Dedecker, P.; Verheijen, W.; Mizuno, H.; Miyawaki, A.; Hofkens, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9511-9516.
18. Habuchi, S.; Dedecker, P.; Hotta, J.; Flors, C.; Ando, R.; Mizuno, H.; Miyawaki, A.; Hofkens, J. Photochem. Photobiol. Sci. 2006, 5, 567-576.
19. Sauer, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9433-9434.
20. Gustafsson, M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 13081-13086.
21. Irie, M.; Fukaminato, T.; Sasaki, T.; Tamai, N.; Kawai, T. Nature 2002, 420, 759-760.
22. Enderlein, J. Appl. Phys. Lett. 2005, 87, 097105.
23. Hell, S. W. Science 2007, 316, 1153-1158.
24. Hofmann, M.; Eggeling, C.; Jakobs, S.; Hell, S. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 17565-17569.
25. Betzig, E.; Patterson, G. H.; Sougrat, R.; Lindwasser, O. W.; Olenych, S.; Bonifacino, J. S.; Davidson, M. W.; Lippincott-Schwartz, J.; Hess, H. F. Science 2006, 313, 1642-1645.
26. Hess, S. T.; Girirajan, T. P. K.; Mason, M. D. Biophys. J. 2006, 91, 4258-4272.
27. Rust, M. J.; Bates, M.; Zhuang, X. W. Nat. Methods 2006, 3, 793-795.
28. Bock, H.; Geisler, C.; Wurm, C. A.; von Middendorff, C.; Jakobs, S.; Schonle, A.; Egner, A.; Hell, S. W.; Eggeling, C. Appl. Phys. B 2007, 88, 161-165.
29. Allen, N. W.; Thompson, N. L. Cytometry 2006, 69A, 524-532.
30. Maus, M.; Rousseau, E.; Cotlet, M.; Schweitzer, G.; Hofkens, J.; Van der Auweraer, M.; De Schryver, F.; Krueger, A. Rev. Sci. Instrum. 2001, 72, 36-40.
31. Cotlet, M.; Hofkens, J.; Habuchi, S.; Dirix, G.; Van Guyse, M.; Michiels, J.; Vanderleyden, J.; De Schryver, F. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 14398-14403.
32. Muls, B.; Uji-i, H.; Melnikov, S.; Moussa, A.; Verheijen, W.; Soumillion, J. P.; Josemon, J.; Mullen, K.; Hofkens, J. ChemPhysChem 2005, 6, 2286-2294.
33. Follenius-Wund, A.; Bourotte, M.; Schmitt, M.; Iyice, F.; Lami, H.; Bourguignon, J. J.; Haiech, J.; Pigault, C. Biophys. J. 2003, 85, 1839-1850.
34. Jung, G.; Wiehler, J.; Zumbusch, A. Biophys. J. 2005, 88, 1932-1947.
35. Habuchi, S.; Cotlet, M.; Gensch, T.; Bednarz, T.; Haber-Pohlmeier, S.; Rozenski, J.; Dirix, G.; Michiels, J.; Vanderleyden, J.; Heberle, J.; De Schryver, F.; Hofkens, J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8977-8984.
36. Loos, D. C.; Habuchi, S.; Flors, C.; Hotta, J.; Wiedenmann, J. R.; Nienhaus, G. U.; Hofkens, J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6270-6271.
37. Cotlet, M.; Hofkens, J.; Maus, M.; Gensch, T.; Van der Auweraer, M.; Michiels, J.; Dirix, G.; Van Guyse, M.; Vanderleyden, J.; Visser, A. J. W. G.; De Schryver, F. C. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 4999-5006.
38. Hyun Bae, J.; Rubini, M.; Jung, G.; Wiegand, G.; Seifert, M. H.; Azim, M. K.; Kim, J. S.; Zumbusch, A.; Holak, T. A.; Moroder, L.; Huber, R.; Budisa, N. J. Mol. Biol. 2003, 328, 1071-1081.
39. Seifert, M. H.; Ksiazek, D.; Azim, M. K.; Smialowski, P.; Budisa, N.; Holak, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 7932-4792.
40. Rizzo, M. A.; Springer, G. H.; Granada, B.; Piston, D. W. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 445-449.
41. Wilmann, P. G.; Turcic, K.; Battad, J. M.; Wilce, M. C. J.; Devenish, R. J.; Prescott, M.; Rossjohn, J. J. Mol. Biol. 2006, 364, 213-224.
42. Elf, J.; Li, G. W.; Xie, X. S. Science 2007, 316, 1191-1194.
43. Geisler, C.; Schönle, A.; von Middendorff, C.; Bock, H.; Eggeling, C.; Egner, A.; Hell, S. W. Appl. Phys. A: Mater. 2007, 88, 223-226.
44. Folling, J.; Belov, V.; Kunetsky, R.; Medda, R.; Schonle, A.; Egner, A.; Eggeling, C.; Bossi, M.; Hell, S. W. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 6266-6270.