Investigation of the phase behavior of an embedded charge protein model through molecular simulation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 43, 2007, Pages 12591-12598

  Rosch, Thomas W ^a   Errington, Jeffrey R ^a  

^a the State University of New York   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

APPROXIMATION THEORY; COMPUTER SIMULATION; IONIC STRENGTH; PH EFFECTS; PHASE BEHAVIOR; PHASE DIAGRAMS;

CANONICAL TRANSITIONS; EMBEDDED CHARGE PROTEINS;

ENZYME KINETICS;

EID: 36148939558     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp075455q     Document Type: Article

References (52)

1. Lansbury, P. T.; Lashuel, H. A. Nature 2006, 443, 774-779.
2. Benedek, G. B.; Pande, J.; Thurston, G. M.; Clark, J. I. Progress in Retinal Eye Res. 1999, 18, 391-402.
3. Dickson, D. W.; Crystal, H. A.; Mattiace, L. A.; Masur, D. M.; Blau, A. D.; Davies, P.; Yen, S. H.; Aronson, M. K. Neurobiol. Aging 1992, 13, 179-189.
4. Terry, R. D.; Masliah, E.; Salmon, D. P.; Butters, N.; Deteresa, R.; Hill, R.; Hansen, L. A.; Katzman, R. Ann. Neurol. 1991, 30, 572-580.
5. Lemere, C. A.; Blusztajn, J. K.; Yamaguchi, H.; Wisniewski, T.; Saido, T. C.; Selkoe, D. J. Neurobiol. Dis. 1996, 3, 16-32.
6. Banh, A.; Sivak, J. Mol. Vision 2004, 10, 144-147.
7. Skoulidas, A. I.; Sholl, D. S.; Johnson, J. K. J. Chem. Phys. 2006, 124, 054708:1-7.
8. Sun, L.; Wick, C. D.; Siepmann, J. I.; Schure, M. R. J. Phys. Chem. B2005, 109, 15118-15125.
9. Colina, C. M.; Galindo, A.; Blas, F. J.; Gubbins, K. E. Fluid Phase Equilib. 2004, 222, 77-85.
10. Cadena, C.; Zhao, Q.; Snurr, R. Q.; Maginn, E. J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 2821-2832.
11. Carlsson, F.; Linse, P.; Malmsten, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 9040-9049.
12. Carlsson, F.; Malmsten, M.; Linse, P. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 12189-12195.
13. Asherie, N.; Lomakin, A.; Benedek, G. B. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 4832-4835.
14. Cheung, J. K.; Truskett, T. M. Biophys. J. 2005, 89, 2372-2384.
15. Lomakin, A.; Asherie, N.; Benedek, G. B. J. Chem. Phys. 1996, 104, 1646-1656.
16. tenWolde, P. R.; Frenkel, D. Science 1997, 277, 1975-1978.
17. Hagen, M. H. J.; Frenkel, D. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4093-4097.
18. Rosenbaum, D.; Zamora, P. C.; Zukoski, C. F. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 150-153.
19. George, A.; Wilson, W. W. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1994, 50, 361-365.
20. Shen, V. K.; Cheung, J. K.; Errington, J. R.; Truskett, T. M. Biophys. J. 2006, 90, 1949-1960.
21. Weber, G. Protein Interactions; Chapman and Hall: New York, 1992.
22. Lomakin, A.; Asherie, N.; Benedek, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9465-9468.
23. Hloucha, M.; Lodge, J. F. M.; Lenhoff, A. M.; Sandler, S. I. J. Cryst. Growth 2001, 232, 195-203.
24. Kern, N.; Frenkel, D. J. Chem. Phys. 2003, 118, 9882-9889.
25. Lund, M.; Jonsson, B. Biophys. J. 2003, 85, 2940-2947.
26. Sear, R. P. J. Chem. Phys. 1999, 111, 4800-4806.
27. Zhang, Z. L.; Glotzer, S. C. Nano Lett. 2004, 4, 1407-1413.
28. Allahyarov, E.; Lowen, H.; Louis, A. A.; Hansen, J. P. Europhys. Lett. 2002, 57, 731-737.
29. Cheung, J. K.; Shen, V. K.; Errington, J. R.; Truskett, T. M. Biophys. J. 2007, 92, 4316-4324.
30. Carlsson, F.; Hyltner, E.; Arnebrant, T.; Malmsten, M.; Linse, P. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9871-9881.
31. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 86th ed.; Lide, D. R., Ed.; Knovel: New York, 2001.
32. Ramanadham, M.; Sieker, L. C.; Jensen, L. H. Acta Crystallogr. Sect. B: Struct. Sci. 1990, 46, 63-69.
33. Hedoux, A.; Ionov, R.; Willart, J. F.; Lerbret, A.; Affouard, F.; Guinet, Y.; Descamps, M.; Prevost, D.; Paccou, L.; Danede, F. J. Chem. Phys. 2006, 124, 014703:1-7.
34. Norde, W.; Anusiem, A. C. I. Colloids Surf. 1992, 66, 73-80.
35. Errington, J. R. J. Chem. Phys. 2003, 118, 9915-9925.
36. Singh, J. K.; Errington, J. R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1369-1376.
37. Errington, J. R. Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 2003, 67, 012102:1-4.
38. Norman, G. E.; Filinov, V. S. High Temp. 1969, 7, 216-222.
39. Fitzgerald, M.; Picard, R. R.; Silver, R. N. Europhys. Lett. 1999, 46, 282-287.
40. Fitzgerald, M.; Picard, R. R.; Silver, R. N. J. Stat. Phys. 2000, 98, 321-345.
41. Ferrenberg, A. M.; Swendsen, R. H. Phys. Rev. Lett. 1988, 61, 2635-2638.
42. Moghaddam, S.; Panagiotopoulos, A. Z. Fluid Phase Equilib. 2004, 222, 221-224.
43. Singh, J. K.; Kofke, D. A. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 220601:1-4.
44. Torrie, G. M.; Valleau, J. P. J. Comput. Phys. 1977, 23, 187-199.
45. Torrie, G. M.; Valleau, J. P. J. Chem. Phys. 1977, 66, 1402-1408.
46. Velev, O. D.; Kaler, E. W.; Lenhoff, A. M. Biophys. J. 1998, 75, 2682-2697.
47. Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2569-2577.
48. Camp, P. J. Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 2003, 67, 011503:1-3.
49. Muschol, M.; Rosenberger, F. J. Chem. Phys. 1997, 107, 1953-1962.
50. Taratuta, V. G.; Holschbach, A.; Thurston, G. M.; Blankschtein, D.; Benedek, G. B. J. Phys. Chem. 1990, 94, 2140-2144.
51. Grigsby, J. J.; Blanch, H. W.; Prausnitz, J. M. Biophys. Chem. 2001, 97, 231-243.
52. Vliegenthart, G. A.; Lekkerkerker, H. N. W. J. Chem. Phys. 2000, 112, 5364-5369.