Electronic coupling between azurin and gold at different protein/substrate orientations

Small

Volumn 3, Issue 8, 2007, Pages 1431-1437

  Venkat, Anurag Setty ^a   Corni, Stefano ^a   Felice, Rosa Di ^a  

^a CNR   (Italy)

Author keywords

Azurin; Metal surfaces; Molecular dynamics; Proteins; Scanning probe microscopy

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; ELECTRON TUNNELING; GOLD; MOLECULAR DYNAMICS; SCANNING PROBE MICROSCOPY;

ANGULAR VARIATION; AZURIN; ELECTRONIC COUPLING;

PROTEINS;

AZURIN; BIOMATERIAL; GOLD; NANOMATERIAL;

ANISOTROPY; ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; ELECTRICITY; ELECTRONICS; MACROMOLECULE; PARTICLE SIZE; PROTEIN BINDING; SURFACE PROPERTY; ULTRASTRUCTURE;

ANISOTROPY; AZURIN; COATED MATERIALS, BIOCOMPATIBLE; COMPUTER SIMULATION; ELECTRONICS; ELECTROSTATICS; GOLD; MACROMOLECULAR SUBSTANCES; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; NANOSTRUCTURES; PARTICLE SIZE; PROTEIN BINDING; SURFACE PROPERTIES;

EID: 34547838173     PISSN: 16136810     EISSN: 16136829     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/smll.200700001     Document Type: Article

References (42)

1. a) R. Rinaldi, A. Biasco, G. Maruccio, R. Cingolani, D. Alliata, L. Andolfi, P. Facci, F. De Rienzo, R. Di Felice, E. Molinari, Adv. Mater. 2002, 14, 1449;
2. b) G. Maruccio, A. Biasco, P. Visconti, A. Bramanti, P. P. Pompa, F. Calabi, R. Cingolani, R. Rinaldi, S. Corni, R. Di Felice, E. Molinari, M. P. Verbeet, G. W. Canters, Adv. Mater. 2005, 17, 816-822.
3. A. Alessandrini, S. Corni, P. Facci, Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 4383-4397.
4. E. P. Friis, J. E. T. Andersen, Y. I. Kharkats, A. M. Kutznetsov, R. J. Nichols, J.-D. Zhang, J. Ulstrup, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 1379-1384.
5. Q. Chi, J. Zhang, J. U. Nielsen, E. P. Friis, I. Chorkendorff, G. W. Canters, J. E. T. Andersen, J. Ulstrup, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4047-4055.
6. Q. Chi, J. Zhang, J. E. T. Andersen, J. Ulstrup, J. Phys. Chem. B 2001, 105, 4669-4679.
7. Q. Chi, O. Farver, J. Ulstrup, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 16203-16208.
8. a) P. Facci, D. Alliata, S. Cannistraro, Ultramicroscopy 2001, 89, 291-298;
9. b) A. Alessandrini, M. Gerunda, G. W. Canters, M. P. Verbeet, P. Facci, Chem. Phys. Lett. 2003, 376, 625-630.
10. L. Andolfi, A. R. Bizzarri, S. Cannistraro, Thin Solid Films 2005, 515, 212-219.
11. a) J. Zhao, J. J. Davis, Nanotechnology 2003, 14, 1023-1028;
12. b) J. Zhao, J. J. Davis, M. S. P. Sansom, A. Hung, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5601-5609.
13. J. J. Davis, C. L. Wrathmel, J. Zhao, J. Fletcher, J. Mol. Recognit. 2004, 17, 167-173.
14. a) A. R. Bizzarri, G. Costantini, S. Cannistraro, Biophys. Chem. 2003, 106, 111-123;
15. b) A. R. Bizzarri, Biophys. Chem. 2006, 122, 206-214.
16. A. M. Kuznetsov, W. Schmickler, Chem. Phys. 2002, 282, 371-377.
17. J. Zhang, Q. Chi, A. M. Kuznetsov, A. G. Hansen, H. Wackerbath, H. E. M. Christensen, J. E. T. Andersen, J. Ulstrup, J. Phys. Chem. B 2002, 106, 1131-1152.
18. E. P. Friis, Y. I. Kharkats, A. M. Kuznetsov, J. Ulstrup, J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7851-7859.
19. A. Migliore, S. Corni, R. Di Felice, E. Molinari, J. Chem. Phys. 2006, 124, 064 501.
20. T. R. Prytkova, I. V. Kurnikov, D. N. Beratan, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 1618-1625.
21. S. S. Skourtis, D. N. Beratan, Adv. Chem. Phys. 1999, 106, 377-452.
22. C. Kobayashi, K. Baldridge, J. N. Onuchic, J. Chem. Phys. 2003, 119, 3550-3558.
23. C. P. Page, C. C. Moser, X. Chen, P. L. Dutton, Nature 1999, 402, 47-52.
24. M. L. Jones, I.V. Kurnikov, D. N. Beratan, J. Phys. Chem. A 2002, 106, 2002-2006.
25. X. Y. Xiao, B. Q. Xu, N. J. Tao, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5370-5371.
26. J. N. Betts, D. N. Beratan, J. N. Onuchic, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4043-4046.
27. I.V. Kurnikov, HARLEM code available at http://www.kurnikov.org/.
28. I. M. C. van Amsterdam, M. Ubbink, O. Einsle, A. Messerschmidt, A. Merli, D. Cavazzini, G. L. Rossi, G. W. Canters, Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 48-52.
29. S. Corni, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 3423-3430.
30. L. Kalé, R. Skeel, M. Bhandarkar, R. Brunner, A. Gursoy, N. Krawetz, J. Phillips, A. Shinozaki, K. Varadarajan, K. Schulten, J. Comput. Phys. 1999, 151, 283-312.
31. W. Humphrey, A. Dalke, K. Schulten, J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38.
32. J. J. Davis, N. Wang, A. Morgan, T. Zhang, J. Zhao, Faraday Discuss. 2006, 131, 167-180.
33. A. Alessandrini, P. Facci, Meas. Sci. Technol. 2005, 16, R65-R92.
34. J. M. Fernandez, H. Li, Science 2004, 303, 1674-1678.
35. K. Kessler, K. E. Gottschalk, H. Janovjak, D. J. Muller, H. E. Gaub, J. Mol. Biol. 2006, 357, 644-654.
36. O. Farver, I. Pecht, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 6968-6972.
37. a) S. Corni, F. De Rienzo, R. Di Felice, E. Molinari, Int. J. Quantum Chem. 2005, 202, 328-342;
38. b) S. Corni, R. Di Felice, E. Molinari, Chem. Phys. Lett. 2004, 393, 118-123.
39. W. D. Cornell, P. Cieplak, C. I. Bayly, I. R. Gould, K. M. Merz, D. M. Ferguson, D. C. Spellmeyer, T. Fox, J. W. Caldwell, P. A. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
40. R. Di Felice, A. Selloni, E. Molinari, J. Phys. Chem. B 2003, 107, 1151-1156.
41. J. Qian, R. Hentschke, W. Knoll, Langmuir 1997, 13,7092-7098.
42. R. Braun, M. Sarikaya, K. Schulten, J. Biomater. Sci. 2002, 13, 747-758.