Structure and dynamics of β-cyclodextrin in aqueous solution at the density-functional tight binding level

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 111, Issue 26, 2007, Pages 5648-5654

  Heine, Thomas ^a   Dos Santos, Hélio F ^b   Patchkovskii, Serguei ^c   Duarte, Hélio A ^d  

^a DRESDEN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Germany)

^b FEDERAL UNIVERSITY OF JUIZ DE FORA   (Brazil)

^c NATIONAL RESEARCH COUNCIL CANADA   (Canada)

^d FEDERAL UNIVERSITY OF MINAS GERAIS   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOACTIVITY; COMPUTATIONAL METHODS; COMPUTER SIMULATION; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; MOLECULAR DYNAMICS; SOLUTIONS;

COMPUTATIONAL PROTOCOLS; DENSITY FUNCTIONAL TIGHT BINDING LEVELS; INCLUSION COMPOUNDS; STRUCTURE FRAMEWORKS;

CYCLODEXTRINS;

BETA CYCLODEXTRIN DERIVATIVE; OXYGEN; WATER;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFERENCE PAPER; CONFORMATION; GAS; HYDROGEN BOND; SOLUTION AND SOLUBILITY;

BETA-CYCLODEXTRINS; GASES; HYDROGEN BONDING; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; OXYGEN; SOLUTIONS; WATER;

EID: 34547460099     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp068988s     Document Type: Conference Paper

References (55)

1. Douhal, A. Chem. Rev. 2004, 104, 1955.
2. Engeldinger, E.; Armspach, D.; Matt, D. Chem. Rev. 2003, 103, 4147.
3. Lipkowitz, K. B. Chem. Rev. 1998, 98, 1829.
4. Schneider, H. J.; Hacket, F.; Rudiger, V.; Ikeda, H. Chem. Rev. 1998, 98, 1755.
5. Szejtli, J. Chem. Rev. 1998, 98, 1743.
6. Hedges, A. R. Chem. Rev. 1998, 98, 2035.
7. Rekharsky, M. V.; Inoue, Y. Chem. Rev. 1998, 98, 1875.
8. Connors, K. A. Chem. Rev. 1997, 97, 1325.
9. Li, S.; Purdy, W. C. Chem. Rev. 1992, 92, 1457.
10. Uekama, K.; Hirayama, F.; Irie, T. Chem. Rev. 1998, 98, 2045.
11. Liu, L.; Guo, Q. X. Chem. Rev. 2001, 101, 673.
12. Vriezema, D. M.; Aragones, M. C.; Elemans, J.; Cornelissen, J.; Rowan, A. E.; Nolte, R. J. M. Chem. Rev. 2005, 105, 1445.
13. Conn, M. M.; Rebek, J. Chem. Rev. 1997, 97, 1647.
14. Lindner, K.; Saenger, W. Carbohydr. Res. 1982, 99, 103.
15. Steiner, T.; Koellner, G. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 5122.
16. Zabel, V.; Saenger, W.; Mason, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 3664.
17. Steiner, T.; Saenger, W.; Lechner, R. E. Mol. Phys. 1991, 72, 1211.
18. Barr, L.; Dumanski, P. G.; Easton, C. J.; Harper, J. B.; Lee, K.; Lincoln, S. F.; Meyer, A. G.; Simpson, J. S. J. Inclusion Phenom. Macrocyclic Chem. 2004, 50, 19.
19. Dos Santos, H. F.; Duarte, H. A.; Sinisterra, R. D.; Mattos, S. V. D.; De Oliveira, L. F. C.; De Almeida, W. B. Chem. Phys. Lett. 2000, 319, 569.
20. Nascimento, C. S.; Dos Santos, H. F.; De Almeida, W. B. Chem. Phys. Lett. 2004, 397, 422.
21. Bea, I.; Gotsev, M. G.; Ivanov, P. M.; Jaime, C.; Kollman, P. A. J. Org. Chem. 2006, 71, 2056.
22. Burusco, K. K.; Ivanov, P. M.; Jaime, C. Arkivoc 2005, 287.
23. Ivanov, P. M.; Jaime, C. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6261.
24. Ivanov, P. M.; Jaime, C. J. Mol. Struct. 1996, 377, 137.
25. Ivanov, P. M.; Jaime, C. Ann. Quim. 1996, 92, 13.
26. Klepko, V.; Ryabov, S.; Kercha, Y.; Bulavin, L.; Bila, R.; Slisenko, V.; Vasilkevich, O.; Krotenko, V. J. Mol. Liq. 2005, 120, 67.
27. Georg, H. C.; Coutinho, K.; Canuto, S. Chem. Phys. Lett. 2005, 413, 16.
28. Lawtrakul, L.; Viernstein, H.; Wolschann, P. Int. J. Pharm. 2003, 256, 33.
29. Winkler, R. G.; Fioravanti, S.; Ciccotti, G.; Margheritis, C.; Villa, M. J. Comput.-Aided Mol. Des. 2000, 14, 659.
30. Koehler, J. E. H.; Saenger, W.; Vangunsteren, W. F. J. Biomol. Struct. Dyn. 1988, 6, 181.
31. Koehler, J. E. H.; Saenger, W.; Vangunsteren, W. F. Eur. Biophys. J. Biophys. Lett. 1987, 15, 211.
32. Warshel, A.; Levitt, M. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227.
33. Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Eisner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1998, 58, 7260.
34. Cui, Q.; Elstner, M.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 569.
35. Zhechkov, L.; Heine, T.; Patchkovskii, S.; Seifert, G.; Duarte, H. A. J. Chem. Theory Comput. 2005, 7, 841.
36. Elstner, M.; Frauenheim, T.; Kaxiras, E.; Seifert, G.; Suhai, S. Phys. Stát. Solidi B-Basic Res. 2000, 277, 357.
37. Frauenheim, T.; Seifert, G.; Elstner, M.; Hajnal, Z.; Jungnickel, G.; Porezag, D.; Suhai, S.; Scholz, R. Phys. Stat. Solidi B-Basic Res. 2000, 277, 41.
38. Lula, I.; Gomes, M. F.; Piló-Veloso, D.; De Noronha, A. L. O.; Duarte, H. A.; Santos, R. A. S., Sinisterra, R. D. J. Inclusion Phenom. Macrocyclic Chem. 2006, 56, 293.
39. Köster, A. M.; Flores, R.; Geudtner, G.; Goursot, A.; Heine, T.; Patchkovskii, S.; Reveles, J. U.; Vela, A.; Salahub, D. R. deMon; NRC: Canada, 2004.
40. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865.
41. Godbout, N.; Salahub, D. R.; Andzelm, J.; Wimmer, E. Can. J. Chem.-Rev. Can. Chim. 1992, 70, 560.
42. Porezag, D.; Frauenheim, T.; Kohler, T.; Seifert, G.; Kaschner, R. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1995, 51, 12947.
43. Seifert, G.; Porezag, D.; Frauenheim, T. Int. J. Quantum Chem. 1996, 58, 185.
44. Zhou, H. Y.; Tajkhorshid, E.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Elstner, M. Chem. Phys. 2002, 277, 91.
45. Bohr, H. G.; Jalkanen, K. J.; Elstner, M.; Frimand, K.; Suhai, S. Chem. Phys. 1999, 246, 13.
46. Elstner, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S. J. Mol. Struct. 2003, 632, 29.
47. Han, W. G.; Elstner, M.; Jalkanen, K. J.; Frauenheim, T.; Suhai, S. Int. J. Quantum Chem. 2000, 78, 459.
48. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.
49. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
50. Rappe, A. K.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3358.
51. Zheng, J.; Balasundaram, R.; Gehrke, S. H.; Heffelfinger, G. S.; Goddard, W. A.; Jiang, S. Y. J. Chem. Phys. 2003, 118, 5347.
52. Mills, R. J. Phys. Chem. 1973, 77, 685.
53. Price, D. J.; Brooks, C. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10096.
54. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; Vangunsteren, W. F.; Dinola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
55. Britto, M.; Nascimento, C. S.; dos Santos, H. F. Quim. Nova 2004, 27, 882.