Water channel of horseradish peroxidase studied by the charge-transfer absorption band of ferric heme

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 29, 2004, Pages 10317-10324

  Zelent, B ^a   Kaposi, A D ^b   Nucci, N V ^a   Sharp, K A ^a   Dalosto, S D ^a   Wright, W W ^a   Vanderkooi, J M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^b SEMMELWEIS UNIVERSITY OF MEDICINE   (Hungary)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION BANDS; FERRIC HEME; HORSERADISH PEROXIDASE; WATER CHANNELS;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; CARRIER CONCENTRATION; CHARGE TRANSFER; GLASS TRANSITION; GLYCEROL; HYDRATES; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; SOLUTIONS; SUGAR (SUCROSE); WATER;

ENZYMES;

EID: 3442886232     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp037664q     Document Type: Article

References (43)

1. Gajhede, M. Biochem. Soc. Trans. 2001, 29, 91.
2. Gajhede, M.; Schuller, D. J.; Henriksen, A.; Smith, A. T.; Poulos, T. L. Nature Struct. Biol. 1997, 4, 1032.
3. Aitken, S. M.; Turnbull, J. L.; Percival, M. D.; English, A. M. Biochemistry 2001, 40, 13980.
4. Schonbaum, G., R. J. Biol. Chem. 1973, 248, 502.
5. Henriksen, A.; Schuller, D. J.; Meno, K.; Welinder, K. G.; Smith, A. T.; Gajhede, M. Biochemistry 1998, 37, 8054.
6. Khajehpour, M.; Rietveld, I.; Vinogradov, S.; Prabhu, N. V.; Sharp, K. A.; Vanderkooi, J. M. Proteins 2003, 53, 656.
7. Gouterman, M. J. Mol. Spectrosc. 1961, 6, 138.
8. Eaton, W. E.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 1967, 46, 2533.
9. Makinen, M. W.; Churg, A. K. Structural and analytical aspects of the electronic spectra of hemeproteins. In Iron Porphyrins; Lever, A. B. P., Gray, H. B., Eds.; Addison-Wesley: Reading MA, 1983; p 141.
10. Jentzen, W.; Ma, J. G.; Shelnutt, J. A. Biophys. J. 1998, 74, 753.
11. Kaposi, A. D.; Wright, W. W.; Fidy, J.; Stavrov, S. S.; Vanderkooi, J. M.; Rasnik, I. Biochemistry 2001, 40, 3483.
12. Manas, E. S.; Vanderkooi, J. M.; Sharp, K. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6334.
13. Manas, E. S.; Wright, W. W.; Sharp, K. A.; Friedrich, J.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 6932.
14. Prabhu, N. V.; Dalosto, S. D.; Sharp, K. A.; Wright, W. W.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5561.
15. Stavrov, S. S. Chem. Phys. 2001, 271, 145.
16. Leone, M.; Cupane, A.; Vitrano, E.; Cordone, L. Biophys. Chem. 1992, 42, 111; Huang, Q.; Szigeti, K.; Fidy, J.; Schweitzer-Stenner, R. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 2822.
17. Leone, M.; Cupane, A.; Vitrano, E.; Cordone, L. Biophys. Chem. 1992, 42, 111; Huang, Q.; Szigeti, K.; Fidy, J.; Schweitzer-Stenner, R. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 2822.
18. Srajer, V.; Champion, P. M. Biochemistry 1991, 30, 7390.
19. Douzou, P. Cryobiochemistry. An Introduction; Academic Press: London, 1977.
20. Crowe, J. H.; Hoekstra, F. A.; Crowe, L. M. Annu. Rev. Physiol. 1992, 54, 579.
21. Gottfried, D. S.; Peterson, E. S.; Sheikh, A. G.; Wang, J.; Yang, M.; Friedman, J. M. J. Phys. Chem. B 1996, 100, 12034.
22. Cordone, L.; Galajda, P.; Vitrano, E.; Gassmann, A.; Ostermann, A.; Parak, F. Eur. Biophys. J. 1998, 27, 173.
23. Khajehpour, M.; Troxler, T.; Vanderkooi, J. M. Biochemistry 2003, 42, 2672.
24. Ponkratov, V. V.; Friedrich, J.; Vanderkooi, J. M. J. Chem. Phys. 2002, 117, 4594.
25. Wright, W. W.; Guffanti, G.; Vanderkooi, J. M. Biophys. J. 2003, 85, 1980.
26. Paul, K. G. Acta Chem. Scand. B 1958, 12, 1312.
27. Wright, W. W.; Baez, C. J.; Vanderkooi, J. M. Anal. Biochem. 2002, 307, 167.
28. Gilson, M.; Sharp, K. A.; Honig, B. J. Comput. Chem. 1988, 327.
29. Jayaram, B.; Sharp, K. A.; Honig, B. Biopolymers 1989, 28, 975.
30. Nicholls, A.; Honig, B. 1991, 12, 435. Au: give title of journal for ref 29
31. Nicholls, A.; Sharp, K. A.; Honig, B. Proteins 1991, 11, 281.
32. Philipp, D. M.; Friesner, R. A. J. Comput. Chem. 1999, 20, 1468.
33. Indiani, C.; Feis, A.; Howes, B. D.; Marzocchi, M. P.; Smulevich, G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7368.
34. Teraoka, J.; Kitagawa, T. J. Biol. Chem. 1981, 256, 3939.
35. Kitagawa, T.; Hashimoto, S.; Teraoka, J.; Nakamura, H.; Yajima, H.; Hosoya, T. Biochemistry 1983, 22, 2788.
36. Smulevich, G.; English, A. M.; Mantini, A. R.; Marzocchi, M. P. Biochemistry 1991, 30, 772.
37. Sutherland, J. C.; Klein, M. P. J. Chem. Phys. 1972, 51, 75.
38. Huang, Q.; Szigeti, K.; Fidy, J.; Schweitzer-Stenner, R. J. Phys. Chem. B. 2003, 107, 2822.
39. Perng, J.-H.; Duchowski, J. K.; Bocian, D. F. J. Phys. Chem. 1990, 94, 6684.
40. Fidy, J.; Laberge, M.; Kaposi, A. D.; Vanderkooi, J. M. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1386, 331.
41. Kaposi, A. D.; Wright, W. W.; Vanderkooi, J. M. J. Fluorescence 2003, 13, 59.
42. Kaposi, A. D.; Fidy, J.; Manas, E. S.; Vanderkooi, J. M.; Wright, W. W. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1435, 41.
43. Manas, E. S.; Getahun, Z.; Wright, W. W.; DeGrado, W. F.; Vanderkooi, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9883.