Understanding the activity of small molecules in the genomics context

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 46, Issue 20, 2007, Pages 3616-3618

  Lee, Jun Seok ^a   Chang, Young Tae ^a  

^a NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Analytical methods; Connectivity map; Gene expression; Genomics; Molecular profiling

Indexed keywords

DATA STRUCTURES; DISEASES; DRUG PRODUCTS; GENE EXPRESSION;

CONNECTIVITY MAPS; GENOMICS CONTEXT; MOLECULAR PROFILING;

MOLECULAR DYNAMICS;

DRUG SCREENING; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETIC DATABASE; GENOMICS; HUMAN; METHODOLOGY; SHORT SURVEY; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; TUMOR CELL LINE;

CELL LINE, TUMOR; DATABASES, GENETIC; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; GENE EXPRESSION PROFILING; GENOMICS; HUMANS; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 34250793319     PISSN: 14337851     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.200604972     Document Type: Short Survey

References (13)

1. J. Lamb, E. D. Crawford, D. Peck, J. W. Modell, I. C. Blat, M. J. Wrobel, J. Lerner, J. P. Brunet, A. Subramanian, K. N. Ross, M. Reich, H. Hieronymus, G. Wei, S. A. Armstrong, S. J. Haggarty, P. A. Clemons, R. Wei, S. A. Carr, E. S. Lander, T. R. Golub, Science 2006, 313, 1929-1935.
2. H. Hieronymus, J. Lamb, K. N. Ross, X. P. Peng, C. Clement, A. Rodina, M. Nieto, J. Du, K. Stegmaier, S. M. Raj, K. N. Maloney, J. Clardy, W. C. Hahn, G. Chiosis, T. R. Golub, Cancer Cell 2006, 10, 321-330.
3. G. Wei, D. Twomey, J. Lamb, K. Schlis, J. Agarwal, R. W. Stam, J. T. Opferman, S. E. Sallan, M. L. den Boer, R. Pieters, T. R. Golub, S. A. Armstrong, Cancer Cell 2006, 10, 331-342.
4. K. D. Paull, R. H. Shoemaker, L. Hodes, A. Monks, D. A. Scudiero, L. Rubinstein, J. Plowman, M. R. Boyd, J. Natl. Cancer Inst. 1989, 81, 1088-1092.
5. J. N. Weinstein, K. W. Kohn, M. R. Grever, V. N. Viswanadhan, L. V. Rubinstein, A. P. Monks, D. A. Scudiero, L. Welch, A. D. Koutsoukos, A. J. Chiausa, K. D. Paull, Science 1992, 258, 447-451.
6. J. N. Weinstein, T. G. Myers, P. M. O'Connor, S. H. Friend, A. J. Fornace, Jr., K. W. Kohn, T. Fojo, S. E. Bates, L. V. Rubinstein, N. L. Anderson, J. K. Buolamwini, W. W. van Osdol, A. P. Monks, D. A. Scudiero, E. A. Sausville, D. W. Zaharevitz, B. Bunow, V. N. Viswanadhan, G. S. Johnson, R. E. Wittes, K. D. Paull, Science 1997, 275, 343-349.
7. T. R. Hughes, M. J. Marton, A. R. Jones, C. J. Roberts, R. Stoughton, C. D. Armour, H. A. Bennett, E. Coffey, H. Dai, Y. D. He, M. J. Kidd, A. M. King, M. R. Meyer, D. Slade, P. Y. Lum, S. B. Stepaniants, D. D. Shoemaker, D. Gachotte, K. Chakraburtty, J. Simon, M. Bard, S. H. Friend, Cell 2000, 102, 109-126.
8. D. E. Bassett, Jr., M. B. Eisen, M. S. Boguski, Nat. Genet. 1999, 21, 51-55.
9. A. Subramanian, P. Tamayo, V. K. Mootha, S. Mukherjee, B. L. Ebert, M. A. Gillette, A. Paulovich, S. L. Pomeroy, T. R. Golub, E. S. Lander, J. P. Mesirov, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 15 545-15 550.
10. D. K. Slonim, Nat. Genet. 2002, 32 Suppl, 502-508.
11. Y. Zhou, F. G. Gwadry, W. C. Reinhold, L. D. Miller, L. H. Smith, U. Scherf, E. T. Liu, K. W. Kohn, Y. Pommier, J. N. Weinstein, Cancer Res. 2002, 62, 1688-1695.
12. J. N. Weinstein, Y. Pommier, Nat. Bio technol. 2006, 24, 1365-1366.
13. B. J. Blanchard, A. Chen, L. M. Rozeboom, K. A. Stafford, P. Weigele, V. M. Ingram, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 14 326-14 332.