Comparative time-dependent analysis of potential inflammation biomarkers in lymphoma-bearing SJL mice

Journal of Proteome Research

Volumn 6, Issue 5, 2007, Pages 1735-1744

  Kristiansson, Monica H ^a   Bhat, Vadiraja B ^b   Babu, I Ramesh ^c   Wishnok, John S ^c   Tannenbaum, Steven R ^c  

^a LUND UNIVERSITY HOSPITAL   (Sweden)

^b Building 205   (United States)

^c MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

Acute phase proteins; Biomarker; Cluster analysis; Inflammation; iTRAQ; Lymphoma; SJL mouse; Tumor progression

Indexed keywords

ALBUMIN; ALPHA 2 MACROGLOBULIN; AMYLOID A PROTEIN; ARYLDIALKYLPHOSPHATASE; BIOLOGICAL MARKER; ESTERASE; HAPTOGLOBIN; IMMUNOGLOBULIN; NITRIC OXIDE; PLASMA PROTEIN;

ANIMAL EXPERIMENT; ANIMAL MODEL; ARTICLE; CELL MOTILITY; CELL TRANSPORT; COMPUTER PROGRAM; CONTROLLED STUDY; DOWN REGULATION; GEL ELECTROPHORESIS; INFLAMMATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; LYMPHOMA; MALE; MASS SPECTROMETRY; MOUSE; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN DEPLETION; PROTEIN EXPRESSION; PROTEOMICS; UPREGULATION; WESTERN BLOTTING;

ANIMALS; BIOLOGICAL MARKERS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; CLUSTER ANALYSIS; ELECTROPHORESIS, POLYACRYLAMIDE GEL; INFLAMMATION; LYMPHOMA; MASS SPECTROMETRY; MICE; MICE, INBRED STRAINS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEOME; TIME FACTORS;

MUS;

EID: 34249314688     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr060497x     Document Type: Article

References (48)

1. Hu, Y.; Malone, J. P.; Fagan, A. M.; Townsend, R. R.; Holtzman, D. M. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 2000-2009.
2. Qian, W. J.; Jacobs, J. M.; Camp, D. G.; Monroe, M. E.; Moore, R. J.; Gritsenko, M. A.; Calvano, S. E.; Lowry, S. F.; Xiao, W.; Moldawer, L. L.; Davis, R. W.; Tompkins, R. G.; Smith, R. D. Proteomics 2005, 5, 572-584.
3. Nelsestuen, G. L.; Zhang, Y.; Martinez, M. B.; Key, N. S.; Jilma, B.; Verneris, M.; Sinaiko, A.; Kasthuri, R. S. Proteomics 2005, 5, 4012-4024.
4. Murphy, E. D. Proc. Am. Assoc. Cancer Res. 1963, 4, 46.
5. Tsiagbe, V. K.; Thorbecke, G. J. Cell. Immunol. 1990, 129, 494-502.
6. Weller, A. H.; Magliato, S. A.; Bell, K. P.; Rosenberg, N. L. Muscle Nerve 1997, 20, 72-82.
7. Kostek, C. A.; Dominov, J. A.; Miller, J. B. Am. J Pathol. 2002, 160, 833-839.
8. Bhat, V. B.; Choi, Wishnok, J. S.; Tannenbaum, S. R. J. Proteome Res. 2004, 4, 1814-1825.
9. Tsiagbe, V. K.; Yoshimoto, T.; Asakawa, J.; Cho, S. Y.; Meruelo, D.; Thorbecke, G. J. EMBO J. 1993, 12, 2313-2320.
10. Ponzio, N. M.; Hayama, T.; Nagler, C.; Katz, I. R.; Hoffmann, M. K.; Gilbert, K.; Vilcek, J.; Thorbecke, G. J. J. Natl. Cancer Inst. 1984, 72, 311-320.
11. Lasky, J. L.; Ponzio, N. M.; Thorbecke, G. J. J. Immunol. 1988, 140, 679-687.
12. Katz, I. R.; Chapman-Alexander, J.; Jacobson, E. B.; Lerman, S. P.; Thorbeck, G. J. Cell. Immunol. 1981, 65, 84-92.
13. Gal, A.; Tamir, S.; Tannenbaum, S. R.; Wogan, G. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 11499-11503.
14. Dedon, P. C.; Tannenbaum, S. R. Arch. Biochem. Biophys. 2004, 423, 12-22.
15. Gal, A.; Tamir, S.; Kennedy, L. J.; Tannenbaum, S. R.; Wogan, G. N. Cancer Res. 1997, 57, 1823-1828.
16. Duan, X.; Yarmush, D.; Berthiaume, F.; Jayaraman, A.; Yarmush, M. L. Proteomics 2005, 5, 3991-4000.
17. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 850-858.
18. Nikov, G.; Bhat, V.; Wishnok, J. S.; Tannenbaum, S. R. Anal. Biochem. 2003, 320, 214-222.
19. Unwin, R. D.; Pierce, A.; Watson, R. B.; Sternberg, D. W.; Whetton, A. D. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 924-935.
20. Ross, P. L.; Huang, Y. N.; Marchese, J. N.; Williamson, B.; Parker, K.; Hattan, S.; Khainovski, N.; Pillai, S.; Dey, S.; Daniels, S.; Purkayastha, S.; Juhasz, P.; Martin, S.; Bartlet-Jones, M.; He, F.; Jacobson, A.; Pappin, D. J. Mol. Cell. Proteomics 2004, 3, 1154-1169.
21. Anderson, N. L.; Anderson, N. G. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 845-867.
22. Sachon, E.; Mohammed, S.; Bache, N.; Jensen, O. N. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 20, 1127-1134.
23. Qian, W. J.; Monroe, M. E.; Liu, T.; Jacobs, J. M.; Anderson, G. A.; Shen, Y.; Moore, R. J.; Anderson, D. J.; Zhang, R.; Calvano, S. E.; Lowry, S. F.; Xiao, W.; Moldawer, L. L.; Davis, R. W.; Tompkins, R. G.; Camp, D. G.; Smith, R. D. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 700-709.
24. Anderson, N. L.; Polanski, M.; Pieper, R.; Gatlin, T.; Tirumalai, R. S.; Conrads, T. P.; Veenstra, T. D.; Adkins, J. N.; Pounds, J. G.; Fagan, R.; Lobley, A. Mol. Cell. Proteomics 2004, 3, 311-326.
25. Ebersole, J. L.; Cappelli, D. Periodontal. 2000 2000, 23, 19-49.
26. Qian, W. J.; Jacobs, J. M.; Liu, T.; Camp, D. G.; Smith, R. D. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 1727-1744.
27. Colten, H. R. J Appl. Physiol. 1992, 72, 1-7.
28. Sheth, K.; Bankey, P. Curr. Opin. Crit Care 2001, 7, 99-104.
29. Parker, G. A.; Picut, C. A. Toxicol. Pathol. 2005, 33, 52-62.
30. Baumann, H.; Gauldie, J. Immunol. Today 1994, 15, 74-80.
31. Gearing, D. P.; Thut, C. J.; VandeBos, T.; Gimpel, S. D.; Delaney, P. B.; King, J.; Price, V.; Cosman, D.; Beckmann, M. P. EMBO J. 1991, 10, 2839-2848.
32. Tomida, M.; Yamamoto-Yamaguchi, Y.; Hozumi, M. J. Biochem. (Tokyo) 1994, 115, 557-562.
33. Tomida, M.; Yamamoto-Yamaguchi, Y.; Hozumi, M. FEBS Lett. 1993, 334, 193-197.
34. Mayer, P.; Geissler, K.; Ward, M.; Metcalf, D. Blood 1993, 81, 3226-3233.
35. Hilton, D. J.; Gough, N. M. J. Cell. Biochem. 1991, 46, 21-26.
36. Gadient, R. A.; Patterson, P. H. Stem Cells 1999, 17, 127-137.
37. Layton, M. J.; Cross, B. A.; Metcalf, D.; Ward, L. D.; Simpson, R. J.; Nicola, N. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 8616-8620.
38. Fagoonee, S.; Di Cunto, F.; Vozzi, D.; Volinia, S.; Pellegrino, M.; Gasparini, P.; Silengo, L.; Altruda, F.; Tolosano, E. DNA Cell Biol. 2006, 25, 323-330.
39. Wagener, F. A.; Volk, H. D.; Willis, D.; Abraham, N. G.; Soares, M. P.; Adema, G. J.; Figdor, C. G. Pharmacol. Rev. 2003, 55, 551-571.
40. Wait, R.; Chiesa, G.; Parolini, C.; Miller, I.; Begum, S.; Brambilla, D.; Galluccio, L.; Ballerio, R.; Eberini, I.; Gianazza, E. Proteomics 2005, 5, 4245-4253.
41. Duan, X.; Yarmush, D. M.; Berthiaume, F.; Jayaraman, A.; Yarmush, M. L. Electrophoresis 2004, 25, 3055-3065.
42. Zhou, L.; Salustri, A.; Kimata, K. Glycoconjugate J. 2003, 19, 241-247.
43. Levo, Y.; Shalit, M.; Tur-Kaspa, R. Am. J. Gastroenterol. 1982, 77, 427-430.
44. Pepys, M. B.; Dash, A. C.; Markham, R. E.; Thomas, H. C.; Williams, B. D.; Petrie, A. Clin. Exp. Immunol. 1978, 32, 119-124.
45. Kwak, M. K.; Wakabayashi, N.; Itoh, K.; Motohashi, H.; Yamamoto, M.; Kensler, T. W. J. Biol. Chem. 2003, 278, 8135-8145.
46. Spaulding, H. L.; Saijo, F.; Turnage, R. H.; Alexander, J. S.; Aw, T. Y.; Kalogeris, T. J. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2006, 290, C95-C103.
47. Kadner, S. S.; Katz, J.; Levitz, M.; Finlay, T. H. J. Biol. Chem. 1985, 260, 15604-15609.
48. Genetta, T. L.; D'Eustachio, P.; Kadner, S. S.; Finlay, T. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1988, 151, 1364-1370.