Can the nonadiabatic photodynamics of aminopyrimidine be a model for the ultrafast deactivation of adenine?

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 111, Issue 15, 2007, Pages 2852-2858

  Barbatti, Mario ^a   Lischka, Hans ^a  

^a UNIVERSITY OF VIENNA   (Austria)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVATION ENERGY; CRYSTALLINE MATERIALS; DEFORMATION; ELECTRONIC STRUCTURE; ULTRAFAST PHENOMENA;

IMIDAZOLE RING; RING DEFORMATION; SURFACE HOPPING DYNAMICS; ULTRAFAST TIME SCALE;

AROMATIC COMPOUNDS;

EID: 34247582809     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp070089w     Document Type: Article

References (66)

1. Kang, H.; Lee, K. T.; Jung, B.; Ko, Y. J.; Kim, S. K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12958.
2. Kang, H.; Jung, B.; Kim, S. K. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6717.
3. Ullrich, S.; Schultz, T.; Zgierski, M. Z.; Stolow, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2262.
4. Crespo-Hernandez, C. E.; Cohen, B.; Hare, P. M.; Kohler, B. Chem. Rev. 2004, 104, 1977.
5. Canuel, C.; Mons, M.; Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Dimicoli, I.; Elhanine, M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 074316.
6. Broo, A. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 526.
7. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. J. A. Chem. Soc. 2005, 127, 6257.
8. Chen, H.; Li. S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8443.
9. Marian, C. J. Chem. Phys. 2005, 122, 104314.
10. Nielsen, S. B.; Sølling, T. I. Chem. Phys. Chem. 2005, 6, 1276.
11. Serrano-Andrés, L.; Merchán, M.; Borin, A. C. Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 2006, 103, 8691.
12. Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Eur. J. Phys. D 2002, 20, 369.
13. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Chem. Phys. 2005, 313, 107.
14. Douhal, A.; Kim, S. K.: Zewail, A. H. Nature 1995, 378, 260.
15. Fiebig, T.; Chachisvilis, M.; Manger, M.; Zewail, A. H.; Douhal, A.; Garcia-Ochoa, I.; de La Hoz Ayuso, A. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 7419.
16. Schultz, T.; Samoylova, E.; Radloff, W.; Hertel, I. V.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Science 2004, 306, 1765.
17. Müller, A.; Talbot, F.; Leutwyler, S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14486.
18. Frey, J. A.; Müller, A.; Frey, H.-M.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 2004, 121, 8237.
19. Lagoja, I. M. Chem. Biodiv. 2005, 2, 1.
20. Zgierski, M. Z.; Patchkovskii, S.; Fujiwara, T.; Lim, E. C. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9384.
21. Lin, M.-F.; Dyakov, Y. A.; Tseng, C.-M.; Mebel, A. M.; Lin, S. H.; Lee, Y. T.; Ni, C.-K. J. Chem. Phys. 2006, 124, 084303.
22. (a) Vreven, T.; Bernardi, F.; Garavelli, M.; Olivucci, M.; Robb, M. A.; Schlegel, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12687.
23. (b) Ciminelli, C.; Granucci, G.; Persico, M. Chem. - Eur. J. 2004, 10, 2327.
24. (c) Jasper, A. W.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2005, 122, 044101.
25. (d) Mitrić, R.; Bonačić-Koutecký, V.; Pittner, J.; Lischka, H. J. Chem. Phys. 2006, 125, 024303.
26. Barbatti, M.; Granucci, G.; Persico, M.; Ruckenbauer, M.; Vazdar, M.; Eckert-Maksiae, M.; Lischka, H. J. Photochem. Photobiol. A 2007, in press, doi: 10.1016/j.jphotochem.2006.12.008.
27. Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1990, 93, 1061.
28. Swope, W. C.; Andersen, H. C.; Berens, P. H.; Wilson, K. R. J. Chem. Phys. 1982, 76, 637.
29. Ferretti, A.; Granucci, G.; Lami, A.; Persico, M.; Villani, G. J. Chem. Phys. 1996, 104, 5517.
30. Butcher, J. J. Assoc. Comput. Mach. 1965, 12, 124.
31. Hammes-Schiffer, S.; Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4657.
32. Shepard, R. In Modern Electronic Structure Theory Part I; Yarkony, D. R., Ed.; World Scientific: Singapore, 1995; p 345.
33. (a) Shepard, R.; Lischka, H.; Szalay, P. G.; Kovar, T.; Ernzerhof, M. J. Chem. Phys. 1992, 96, 2085.
34. (b) Lischka, H.; Dallos, M.; Shepard, R. Mol. Phys. 2002, 100, 1647.
35. (a) Lischka, H.; Dallos, M.; Szalay, P. G.; Yarkony, D. R.; Shepard, R. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7322.
36. (b) Dallos, M.; Lischka, H.; Shepard, R.; Yarkony, D. R.; Szalay, P. G. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7330.
37. Nakano, H. J. Chem. Phys. 1993, 99, 7983.
38. (a) Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.
39. (b) Hariharan, P. C. Pople, J. A. Theor. Chim. Acta. 1973, 28, 213.
40. Barbatti, M.; Granucci, G.; Lischka, H.; Ruckenbauer, M.; Persico, M. NEWTON-X: a package for Newtonian dynamics close to the crossing seam, version 0.11b, 2006, www.univie.ac.at/newtonx.
41. Lischka, H.; Shepard, R.; Brown, F. B.; Shavitt, I. Int. J. Quantum Chem. 1981, 15, 91.
42. Lischka, H.; Shepard, R.; Shavitt, I.; Pitzer, R. M.; Dallos, M.; Mueller, Th.; Szalay, P. G.; Brown, F. B.; Ahlrichs, R.; Boehm, H. J.; Chang, A.; Comeau, D. C.; Gdanitz, R.; Dachsel, H.; Ehrhardt, C.; Ernzerhof, M.; Hoechtl, P.; Irle, S.; Kedziora, G.; Kovar, T.; Parasuk, V.; Pepper, M. J. M.; Scharf, P.; Schiffer, H.; Schindler, M.; Schueler, M.; Seth, M.; Stahlberg, E. A.; Zhao, J.-G.; Yabushita, S.; Zhang, Z.; Barbatti, M.; Matsika, S.; Schuurmann, M.; Yarkony, D. R.; Brozell, S. R.; Beck, E. V.; Blaudeau, J.-P. COLUMBUS, an ab initio electronic structure program, release 5.9.1, 2006. www.univie.ac.at/columbus
43. (a) Shepard, R.; Shavitt, I.; Pitzer, R. M.; Comeau, D. C.; Pepper, M.; Lischka, H.; Szalay, P. G.; Ahlrichs, R.; Brown, F. B.; Zhao, J. Int. J. Quantum Chem. 1988, 22, 149.
44. (b) Lischka, H.; Shepard, R.; Pitzer, R. M.; Shavitt, I.; Dallos, M.; Müller, Th.; Szalay, P. G.; Seth, M.; Kedziora, G. S.; Yabushita, S.; Zhang, Z. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 664.
45. Helgaker, T.; Jensen, H. J. Aa.; Jørgensen, P.; Olsen, J.; Ruud, K.; Ågren, H.; Andersen, T.; Bak, K. L.; Bakken, V.; Christiansen, O.; Dahle, P.; Dalskov, E. K.; Enevoldsen, T.; Heiberg, H.; Hettema, H.; Jonsson, D.; Kirpekar, S.; Kobayashi, R.; Koch, H.; Mikkelsen, K. V.; Norman, P.; Packer, M. J.; Saue, T.; Taylor, P. R.; Vahtras, O. DALTON, an ab initio electronic structure program, Release 1.0, 1997.
46. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. J.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347.
47. Barbatti, M.; Ruckenbauer, M.; Lischka, H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 174307.
48. Hettema, H.; Yarkony, D. R. J. Chem. Phys, 1995, 102, 8431.
49. Warshel, A. Nature. 1976, 206, 679.
50. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7584.
51. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Mol. Phys. 2006, 104, 1113.
52. Ismail, N.; Blancafort, L.; Olivucci, M.; Kohler, B.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6818.
53. Sobolewski, A. L.; Woywod, C.; Domcke, W. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5627.
54. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 13238.
55. Kato, S. J. Chem. Phys. 1988, 88, 3045.
56. Palmer, I. J.; Ragazos, I. N.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 673.
57. Toniolo, A.; Thompson, A. L.; Martíaez, T. J. Chem. Phys. 2004, 304, 133.
58. Barbatti, M.; Vazdar, M.; Aquino, A. J. A.; Eckert-Maksić, M.; Lischka, H. J. Chem. Phys. 2006, 125, 164323.
59. Michl, J.; Bonačić-Koutecký, V. Electronic Aspects of Organic Photochemistry; Wiley: New York, 1990.
60. Barbatti, M.; Aquino, A. J. A.; Lischka, H. Mol. Phys. 2006, 104, 1053.
61. (a) Barbatti, M.; Aquino, A. J. A.; Lischka, H. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5168.
62. (b) Schreiber, M.; Barbatti, M.; Zilberg, S.; Lischka, H.; and Gonzalez, L. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 238.
63. Zechmann, G.; Barbatti, M.; Lischka, H.; Pittner, J.; Bonačić-Koutecký, V. Chem. Phys. Lett. 2006, 418, 377.
64. Bonačić-Koutecký, V.; Bruckmann, P.; Hiberty, P.; Koutecký, J.; Leforestier, C.; Salem, L. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1975, 14, 575.
65. Ohmine, I. J. Chem. Phys. 1985, 83, 2348.
66. Barbatti, M.; Paier, J.; Lischka, H. J. Chem. Phys. 2004, 121, 11614.