Conical intersections in thymine

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 110, Issue 49, 2006, Pages 13238-13244

  Perun, Serhiy ^a   Sobolewski, Andrzej L ^a   Domcke, Wolfgang ^b  

^a INSTITUTE OF PHYSICS   (Poland)

^b TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTATIONAL GEOMETRY; EXCITONS; GROUND STATE; PERTURBATION TECHNIQUES; QUENCHING; SUPERSONIC AIRCRAFT;

AB INITIO METHODS; CONICAL INTERSECTIONS; SINGLET STATES; THYMINE;

AMINO ACIDS;

THYMINE;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; CONFORMATION; QUANTUM THEORY;

COMPUTER SIMULATION; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; QUANTUM THEORY; THYMINE;

EID: 33846152961     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0633897     Document Type: Article

References (50)

1. Cadet, J.; Vigny, P. In Bioorganic Photochemistry; Morrison, H., Ed.; Wiley: New York, 1990; Vol. 1, p 1.
2. Crespo-Hernandez, C. E.; Cohen, B.; Hare, P. M.; Kohler, B. Chem. Rev. 2004, 104, 1977.
3. Brady, B. B.; Peteanu, L. A.; Levy, D. H. Chem. Phys. Lett. 1988. 147, 538.
4. Kim, N. J.; Jeong, G.; Kim, Y. S.; Sung, J.: Kim, S. K.; Park, Y. D. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10051.
5. Nir, E.; Kleinermanns, K.; Grace, L.; de Vries, M. S. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 5106.
6. Nir, E.: Plützer, C.; Kleinermanns, K.; de Vries, M. S. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 317.
7. Nir, E.; Kleinermanns, K.; de Vries, M. S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003. 5, 4780.
8. Pecourt, J.-M. L.; Peon, J.: Kohler, B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 10370.
9. Reuther, A.; Nikogosyan, D. N.; Laubereau, A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5570.
10. Peon, J.; Zewail, A. H. Chem. Phys. Lett. 2001, 348, 255.
11. Gustavsson, T.; Sharonov, A.; Markovitsi, D. Chem. Phys. Lett. 2002, 351, 195.
12. Pancur, T.; Schwalb, N. K.; Renth, F.; Temps, F. Chem. Phys. 2005, 313, 199.
13. Kang, H.; Lee, K. T.; Jung, B.; Ko, Y. J.: Kim, S. K. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12958.
14. Ullrich, S.; Schultz, T.; Zgierski, M. Z.; Stolow, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2796.
15. He, Y.; Wu, C.; Kong, W. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5145.
16. Canuel, C.; Mons, M.: Piuzzi, F.; Tardivel, B.; Dimicoli, L.: Elhanine, M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 074316.
17. Ismail, N.; Biancafort, L.; Olivucci, M.; Kohler, B.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6818.
18. Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 369.
19. Merchan, M.; Serrano-Andres, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8108.
20. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7584.
21. Perun, S.: Sobolewski, A. L.: Domcke, W. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6257.
22. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. Chem. Phys. 2005, 313, 107.
23. Marian, C. M. J. Chem. Phys. 2005, 122, 104314.
24. Bronstedt Nielsen, S.; Solling, T. I. ChemPhysChem 2005, 6, 1.
25. Zgierski, M. Z.; Patchkovskii, S.; Fujiwara, T.; Lim, E. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9384.
26. Gustavsson, T.; Bányász. Á.; Lazzaroto, E.; Markovitsi, D.: Scalmani, G.; Frisch, M. J.: Barone, V.; Improta, R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 607.
27. Chen, H.; Li, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8443.
28. Biancafort, L. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 210.
29. Conical Intersections: Electronic Structure, Dynamics and Spectroscopy: Domcke, W., Yarkony, D. R., Koppel, H., Eds.; World Scientific: Singapore, 2004.
30. Lorentzon, J.; Fülscher, M. P.; Roos, B. O. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9265.
31. Shukla, M. K.; Mishra, P. C. Chem. Phys. 1999, 240, 319.
32. Shukla, M. K.; Leszczynski, J. J. Comput. Chem. 2004, 25, 768.
33. Roos, B. O.; Andersson, K. Chem. Phys. Lett. 1995, 245, 215.
34. Christiansen, O.; Koch, H.; Jørgensen, P. Chem. Phys. Lett. 1995, 243, 409.
35. Weigend, F.; Häser, M. Theor. Chem. Acc. 1997, 97, 331.
36. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.
37. Schaefer, A.; Horn, H.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2571.
38. Widmark, P.-O.; Malmqwist, P.-Å.; Roos, B. O. Theor. Chim. Acta 1990, 77, 291.
39. Schaefer, A.; Huber, C.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5829.
40. Bearpark, M. J.; Robb, M. A.; Schlegel, H. B. Chem. Phys. Lett. 1994, 223, 269.
41. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski. J.; Petersson, G. A.; Ayala. P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson. B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, J. L.; Head-Gordon, C. M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. GAUSSIAN 98; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA. 1998; see also http://www.Gaussian.com.
42. Ahlrichs, R.: Bär. M.; Häser, M.; Hörn, H.; Kölmel, C. Chem. Phys. Lett. 1989, 162, 165; see also http://www.cosmologic.de.
43. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, M.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347: see also http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/.
44. MOLCAS, version 5.2, Andersson, K.; Barysz, M.; Bernhardsson, A.; Blomberg, M. R. A.; Carissan, Y.; Cooper, D. L.; Cossi, M.; Devarajan, A.; Fülscher, M. P.; Gaenko, A.; Gagliardi, L.; de Graaf, C.; Hess, B. A.; Hagberg, D.; Karlström, G.; Krogh, J. W.; Lindh, R.; Malmqvist, P.-Å.; Nakajima, T.; Neogrády, P.: Olsen, J.: Pedersen, T. B.; Raab, J.: Roos, B. O.: Ryde, U.; Schimmelpfennig, B.: Schütz, M.: Seijo, L.; Serrano-Andrés, L.; Siegbahn, P. E. M.; Stalling, J.: Thorsteinsson, T.; Veryazov, V.; Widmark P.-O.: see also http://www.teokem.lu.se/molcas/.
45. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7538.
46. Serrano-Andre, L.: Merchan, M. THEOCHEM 2005, 729, 99.
47. Biancafort, L.; Robb, M. A. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10609.
48. He, Y.: Wu, C.; Kong, W. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 943.
49. Marian, C. M.; Schneider, F.: Kleinschmidt, M.; Tatchen, J. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 357.
50. Clark, L. B.: Peschel, G. G.; Tinoco, I., Jr. J. Mol. Biol. 1962, 4, 500.