Photodynamic action as a basis for relaxati on method of the study of gramicidin channels

Biologicheskie Membrany

Volumn 22, Issue 4, 2005, Pages 275-289

  Antonenko, Y N ^a   Kotova, E A ^a   Rokitskaya, T I ^a  

^a MOSCOW STATE UNIVERSITY   (Russian Federation)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 34247345413     PISSN: 02334755     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (118)

1. Macias F., Starzak M.E. // Biochim. et biophys. acta. 1993. V. 1153. P. 331-334.
2. Borisenko V., Lougheed T., Hesse J., Fureder-Kitzmuller E., Fertig N., Behrends J.C., Woolley G.A., Schutz GJ. // Biophys. J. 2003. V. 84. P. 612-622.
3. Cornell B.A., Braach-Maksvytis V.L., King L.G., Osman P.D., Raguse B., Wieczorek L., Pace R.J. // Nature. 1997. V. 387. P. 580-583.
4. Wright L.S., Harding M.M. // Anal. Biochem. 2000. V. 282. P. 70-79.
5. Hirano A., Wakabayashi M., Matsuno Y., Sugawara M. // Biosens. Bioelectron. 2003. V. 18. P. 973-983.
6. Rokitskaya T.I., Kotova E.A., Antonenko Y.N. // J. Gen. Physiol. 2003. V. 121. P. 463-476.
7. Krylov A.V., Antonenko Y.N., Kotova E.A., Rokitskaya T.I., Yaroslavov A.A. // FEES Lett. 1998. V. 440. P. 235-238.
8. Stark G. // Biochim. et biophys. acta. 1991. V. 1071. P. 103-122.
9. Pooler J.P., Valenzeno D.P. // Med. Phys. 1981. V. 8. P. 614-628.
10. Niedre M., Patterson M.S., Wilson B.C. // Photochem. and Photobiol. 2002. V. 75. P. 382-391.
11. Penning L.C., Dubbelman T.M. // Anticancer Drugs. 1994. V. 5. P. 139-146.
12. Oleinick N.L., Morris R.L., Belichenko I. // Photochem. Photobiol. Sci. 2002. V. 1. P. 1-21.
13. Hladky S.B., Haydon DA. // Nature. 1970. V. 225. P. 451-453.
14. Hladky S.B., Haydon DA. // Biochim. et biophys. acta. 1972. V. 274. P. 294-312.
15. Arseniev A.S., Barsukov I.L., Bystrov V.F., Lomize A.L., Ovchinnikov Yu.A. // FEES Lett. 1985. V. 186. P. 168-174.
16. Ketchem R.R., Hu W., Cross T.A. // Science. 1993. V. 261. P. 1457-1460.
17. Andersen O.S., Apell H.J., Bamberg E., Busath D.D., Koeppe R.E., Sigworth F.J., Szabo G., Urry D.W., Woolley A. // Nat. Struct. Biol. 1999. V. 6. P. 609-612.
18. Cross T.A., Arseniev A., Cornell B A., Davis J.H., Killian J.A., Koeppe R.E., Nicholson L.K., Separovic F., Wallace B A. // Nat. Struct. Biol. 1999. V. 6. P. 610-611.
19. Hu W., Lee K.C., Cross T.A. // Biochemistry. 1993. V. 32. P. 7035-7047.
20. Koeppe R.E., Greathouse D.V., Providence L.L., Shobana S., Andersen O.S. // Novartis. Found. Symp. 1999. V. 225. P. 44-55.
21. Harroun T.A., Heller W.T., Weiss T.M., Yang L., Huang H.W. // Biophys. J. 1999. V. 76. P. 937-945.
22. Langs DA. // Science. 1988. V. 241. P. 188-191.
23. Mobashery N., Nielsen C., Andersen O.S. // FEBS Lett. 1997. V. 412. P. 15-20.
24. Saparov S.M., Antonenko Y.N., Koeppe R.E., Pohl P. // Biophys. J. 2000. V. 79. P. 2526-2534.
25. Bamberg E., Apell H.J., Alpes H., Gross E., Morell J.L., Harbaugh J.F., Janko, K, Lauger P. // Federation Proceedings. 1978. V. 37. P. 2633-2638.
26. Fonseca V., Daumas P., Ranjalahy-Rasoloarijao L., Heitz F., Lazaro R., Trudelle Y., Andersen O.S. // Biochemistry. 1992. V. 31. P. 5340-5350.
27. Grossweiner L.I. // Curr. Top. Radiat. Res. Q. 1976. V. 11. P. 141-199.
28. 2 / Ed. Frimer A.A. Boca Raton, Florida. CRC Press, Inc., 1985. P. 91-143.
29. Valenzeno D.P., Tarr M. // Photochemistry and Photophysics / Ed. Rabek J.F. Boca Raton, Ann Arbor, Boston: CRC Press, 1991. P. 137-191.
30. Foote C.S. // Oxygen and Oxy-radicals in Chemistry and Biology / Eds Rodgers M.A.J., Powers E. L., New York; London; Toronto; Sydney; San Francisco: Academic Press, 1981. P. 425-440.
31. Lavi A., Weitman H., Holmes R.T., Smith K. M., Ehrenberg B. // Biophys. J. 2002. V. 82. P. 2101-2110.
32. Davies M.J. // Photochem. and Photobiol. Sci. 2004. V. 3. P. 17-25.
33. Reddi E., Lambert C.R., Jori G., Rodgers M.A. // Photochem. and Photobiol. 1987. V. 45. P. 345-351.
34. Michaeli A., Feitelson J. // Photochem. and Photobiol. 1997. V. 65. P. 309-315.
35. Silva E., De Landea C., Edwards A.M., Lissi E. // J. Photochem. and Photobiol. B. 2000. V. 55. P. 196-200.
36. Biasutti M.A., Posadaz A., Garcia N.A. // J. Pept. Res. 2003. V. 62. P. 11-18.
37. Russian source
38. Nakagawa M., Watanabe H., Kodato S., Okajima H., Hino T., Flippen J.L., Witkop B. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1977. V. 74. P. 4730-4733.
39. Girotti A.W. // J. Biol. Chem. 1978. V. 253. P. 7186-7193.
40. Verweij H., Dubbelman T.M., van Steveninck J. // Biochim. et biophys. acta. 1981. V. 647. P. 87-94.
41. Dubbelman T.M., de Goeij A.F., van Steveninck J. // Biochim. et biophys. acta. 1978. V. 511. P. 141-151.
42. Shen H.R., Spikes J.D., Kopecekova P., Kopecek J. // J. Photochem. and Photobiol. B. 1996. V. 34. P. 203-210.
43. Pooler J.P., Valenzeno D.P. // Biochim. et biophys. acta. 1979. V. 555. P. 307-315.
44. Rokitskaya T.I., Zakharov S.D., Antonenko Y.N., Kotova E.A., Cramer W.A. // FEBS Lett. 2001. V. 505. P. 147-150.
45. Sobko A.A., Vigasina M.A., Rokitskaya T.J., Kotova E.A., Zakharov S.D., Cramer W.A., Antonenko Y.N. // J. Membr. Biol. 2004. V. 199. P. 51-62.
46. Straessle M., Stark G. // Photochem. and Photobiol. 1992. V. 55. P. 461-463.
47. Rokitskaya T.I., Antonenko Y.N., Kotova E.A. // FEBS Lett. 1993. V. 329. P. 332-335.
48. Rokitskaya T.I., Antonenko Y.N., Kotova E.A. // Biochim. et biophys. acta. 1996. V. 1275. P. 221-226.
49. Kunz L., Zeidler U., Haegele K., Przybylski M., Stark G. // Biochemistry. 1995. V. 34. P. 11895-11903.
50. Rokitskaya T.I., Block M., Antonenko Y.N., Kotova E.A., Pohl P. // Biophys. J. 2000. V. 78. P. 2572-2580.
51. Sokolov V.S., Block M., Stozhkova I.N., Pohl P. // Biophys. J. 2000. V. 79. P. 2121-2131.
52. Shapovalov V.L., Rokitskaya T.I., Kotova E.A., Krokhin O.V., Antonenko Y.N. // Photochem. and Photobiol. 2001. V. 74. P. 1-7.
53. Rosenthal I., Shafrovich V.Y., Geacintov N.E., BenHur E., Horowitz B. // Photochem. and Photobiol. 1994. V. 60. P. 215-220.
54. Bishop S.M., Beeby A., Meunier H., Parker A.W., Foley M.S.C., Phillips D. // J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1996. V. 92. P. 2689-2695.
55. Rokitskaya T. I., Antonenko Y. N., Kotova E. A. // Biophys. J. 1997. V. 73. P. 850-854.
56. Rokitskaya T. I., Kotova E. A., Antonenko Y. N. // Biophys. J. 2002. V. 82. P. 865-873.
57. Bamberg E., Lauger P. // J. Membr. Biol. 1973. V. 11. P. 177-194.
58. Bamberg E., Lauger P. // Biochim. et biophys acta. 1974. V. 367. P. 127-133.
59. Russian source
60. Krylov A.V., Rokitskaya T.I., Kotova E.A., Yaroslavov A.A., Antonenko Y.N. // J. Membr. Biol. 2002. V. 189. P. 119-130.
61. Zingsheim H.P., Neher E. // Biophys. Chem. 1974. V. 2. P. 197-207.
62. Bamberg E., Benz R. // Biochim. et biophys. acta. 1976. V. 426. P. 570-580.
63. Hickok N.J., Kustin K., Veatch W. // Biochim. et biophys. acta. 1986. V. 858. P. 99-106.
64. Stark G., Straessle M., Takacz Z. // J. Membr. Biol. 1986. V. 89. P. 23-37.
65. Fairbanks T.G., Andrus C.L., Busath D.D. // Novartis Found. Symp. 1999. V. 225. P. 74-87.
66. Kolb H.A., Lauger P., Bamberg E. // J. Membr. Biol. 1975. V. 20. P. 133-154.
67. Kolb H.A., Bamberg E. // Biochim. et biophys. acta. 1977. V. 464. P. 127-141.
68. Russian source
69. Sigworth F.J., Urry D.W., Prasad K.U. // Biophys. J. 1987. V. 52. P. 1055-1064.
70. Busath D.D. // Annu. Rev. Physiol. 1993. V. 55, P. 473-501.
71. Apell H.J., Bamberg E., Alpes H., Lauger P. // J. Membr. Biol. 1977. V. 31. P. 171-188.
72. Cifu A.S., Koeppe R.E., Andersen O.S. // Biophys. J. 1992. V. 61. P. 189-203.
73. Antonenko Y.N., Borisenko V., Melik-Nubarov N.S., Kotova E.A., Woolley GA. // Biophys. J. 2002. V. 82. P. 1308-1318.
74. Krylov A.V., Kotova E.A., Yaroslavov A.A., Antonenko Y.N. // Biochim. et biophys. acta. 2000. V. 1509. P. 373-384.
75. Laver D.R., Gage P.W. // Prog. Biophys. Mol. Biol. 1997. V. 67. P. 99-140.
76. Colledge M., Froehner S.C. // Curr. Opin. Neurobiol. 1998. V. 8. P. 357-363.
77. Swillens S., Dupont G., Combettes L., Champeil P. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1999. V. 96. P. 13750-13755.
78. Garner C.C., Nash J., Huganir RL. // Trends Cell Biol. 2000. V. 10. P. 274-280.
79. Neumann E. // Bioelectrochemistry. 2000. V. 52. P. 43-49.
80. Westenbroek R.E., Ahlijanian M.K., Catterall W. A. // Nature. 1990. V. 347. P. 281-284.
81. Wang S., Yue H., Derin R.B., Guggino W.B., Li M. // Cell. 2000. V. 103. P. 169-179.
82. Bukauskas F.F., Jordan K., Bukauskiene A., Bennett M. V., Lampe P.D., Laird D.W., Verselis V.K. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. P. 2556-2561.
83. Rietveld A., Simons K. // Biochim. et biophys. acta. 1998. V. 1376. P. 467-479.
84. Arbuzova A., Murray D., Mclaughlin S. // Biochim. et biophys. acta. 1998. V. 1376. P. 369-379.
85. Rokitskaya T.I., Kotova E.A., Antonenko Y.N. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003. V. 302. P. 865-868.
86. May S., Harries D., Ben Shaul A. // Biophys. J. 2000. V. 79. P. 1747-1760.
87. Partenskii M.B., Miloshevsky G.V., Jordan P.C. // J. Phys. Chem. 2003. V. 118. P. 10306-10311.
88. Harroun T.A., Heller W.T., Weiss T.M., Yang L., Huang H.W. // Biophys. J. 1999. V. 76. P. 3176-3185.
89. Nielsen C., Andersen O.S. // Biophys. J. 2000. V. 79. P. 2583-2604.
90. Goforth R.L., Chi A.K., Greathouse D.V., Providence L.L., Koeppe R.E., Andersen O.S. // J. Gen. Physiol. 2003. V. 121. P. 477-493.
91. Suarez E., Emmanuelle E.D., Molle G., Lazaro R., Viallefont P. // J. Pept. Sci. 1998. V. 4. P. 371-377.
92. Rokitskaya T.I., Antonenko Y.N., Kotova E. A., Anastasiadis A., Separovic F. // Biochemistry. 2000. V. 39. P. 13053-13058.
93. Futaki S., Youjun Z., Sugiura Y. // Tetrahedron Lett. 2001. V. 42. P. 1563-1565.
94. Swamy M. J., Marsh D. // Biochemistry. 2001. V. 40. P. 14869-14877.
95. Andersen O.S., Nielsen C., Maer A.M., Lundbaek J.A., Goulian M., Koeppe R.E. // Methods Enzymol. 1999. V. 294. P. 208-224.
96. Bayley H., Cremer P.S. // Nature. 2001. V. 413. P. 226-230.
97. Bezrukov S.M. // J. Membr. Biol. 2000. V. 174. P. 1-13.
98. Gu L.Q., Braha O., Conlan S., Cheley S., Bayley H. // Nature. 1999. V. 398. P. 686-690.
99. Kasianowicz J.J., Brandin E., Branton D., Deamer D.W. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1996. V. 93. P. 13770-13773.
100. Akeson M., Branton D., Kasianowicz J.J., Brandin E., Deamer D.W. // Biophys. J. 1999. V. 77. P. 3227-3233.
101. Okazaki T., Sakoh M., Nagaoka Y., Asami K. // Biophys. J. 2003. V. 85. P. 267-273.
102. Nestorovich E. M., Danelon C., Winterhalter M., Bezrukov S. M. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002. V. 99. P. 9789-9794.
103. Gokel G.W., Leevy W.M., Weber M.E. // Chem. Rev. 2004. V. 104. P. 2723-2750.
104. Das G., Matile S. // Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 2002. V. 99. P. 5183-5188.
105. Das G., Talukdar P., Matile S. // Science. 2002. V. 298. P. 1600-1602.
106. Matile S. // Chem. Rec. 2001. V. 1. P. 162-172.
107. Gokel G.W., Mukhopadhyay A. // Chem. Soc. Rev. 2001. V. 30. P. 274-286.
108. Hall A.C., Suarez C., Hom-Choudhury A., Manu A.N., Hall C.D., Kirkovits G.J., Ghiriviga I. // Org. Biomol. Chem. 2003. V. 1. P. 2973-2982.
109. Russian source
110. Allen T.W., Andersen O.S., Roux B. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 2004. V. 101. P. 117-122.
111. Schumaker M.F. // Front. Biosci. 2003. V. 8. P. 982-991.
112. Kukreja R.C., Kearns A.A., Zweier J.L., Kuppusamy P., Hess M.L. // Circ. Res. 1991. V. 69. P. 1003-1014.
113. Coetzee W.A., Ichikawa H., Hearse DJ. // Amer. J. Physiol. 1994. V. 266. P. H909-H919.
114. Vinnikova A.K.,Kukreja R.C., Hess M.L. // J. Mol. Cell. Cardiol. 1992. V. 24. P. 465-470.
115. Spires S., Begenisich T. // J. Gen. Physiol. 1990. V. 96. P. 757-775.
116. Killig F., Stark G. // Biochim. et biophys. acta. 2002. V. 1564. P. 207-213.
117. Kourie J.I. // Amer. J. Physiol. 1998. V. 275. P. C1-24.
118. Russian source