CoMFA 3D-QSAR analysis of epothilones based on docking conformation and alignment

Chinese Journal of Chemistry

Volumn 25, Issue 4, 2007, Pages 453-460

  Yuan, Wei ^a   Luan, Lin Bo ^b   Li, Yan Ni ^b  

^a NANKAI UNIVERSITY   (China)

^b TIANJIN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

3D QSAR; CoMFA; Docking; Epothilone

Indexed keywords

EID: 34247125590     PISSN: 1001604X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cjoc.200790086     Document Type: Article

References (18)

1. Gerth, K.; Bedorf, N.; Hofle, G.; Irschik, H.; Reichenbach, H. J. Antibiot. 1997, 49, 560.
2. Dirk, W. H.; Schubert, W. D.; Gerhard, H. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2005, 44, 1298.
3. Wartmann, M.; Altmann, K. H. Curr. Med. Chem. Anti-Cancer Agents 2002, 2, 123.
4. He, L. F.; Prakash, G. J.; David, G. I.; Shen, H. J.; George, A. O.; Susan, B. H. Biochemistry 2000, 39, 3972.
5. Su, D. S.; Balog, A.; Meng, D.; Bertinato, P.; Danishefsky, S. J.; Zheng, Y. H.; Chou, T. C.; He, L.; Horwitz, S. B. Angew. Chem., Int. Ed. 1997, 36, 2093.
6. Fabrizio, M.; Stefano, F.; Laura, M.; Federico, C.; Maurizio, B. IL Farmaco. 2003, 58, 357.
7. Lee, K. W.; James, M. B. J. Comput. Aided Mol. Des. 2001, 15, 41.
8. Teresa, C.; Marcel, J. J.; Jens, M.; Wolfgang, J.; Thomas, S.; Frank, P.; Dieter, S.; Altmann, K. H.; Christian, G. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2511.
9. Annalen, B.; Jens, M. QSAR Comb. Sci. 2003, 22, 722.
10. James, H.; Li, H. L.; Ben, C.; Joseph, M. K.; James, P. S.; Kenneth, H. D. Science 2004, 305, 866.
11. Zou, X. J.; Lai, L. H.; Jin, G. Y. Chin. J. Chem. 2005, 23, 1121.
12. John, K. B.; Haregewe, A. J. Med. Chem. 2002, 45, 841.
13. Zhou, Z. G.; Jeffry, D. M. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2167.
14. Cui, M.; Huang, X. Q.; Luo, X. M.; James, M. B.; Ji, R. Y.; Chen, K. X.; Shen, J. H.; Jiang, H. L. J. Med. Chem. 2002, 45, 5249.
15. Rino, R.; Marino, A.; Gabriella, D. M.; Giuseppe, L. R.; Antonio, C.; Alessandra, D. P.; Romano, S. J. Med. Chem. 2005, 48, 213.
16. Nicolaou, K. C.; Frank, R.; Dionisios, V. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 2014.
17. Nicolaou, K. C.; Finlay, M. R. V.; Ninkovic, S.; King, N. P.; He, Y.; Li, T. H.; Francisco, S.; Dionisios, V. Chem. Biol. 1998, 5, 365.
18. Nicolaou, K. C.; Andreas, R.; Kenji, N. Chem. Commun. 2001, 1523.