Theoretical studies on the excited states, DNA photocleavage, and spectral properties of complex [Ru(phen)2(6-OH-dppz)]2+

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 111, Issue 2, 2007, Pages 273-280

  Xu, Lian Cai ^a   Li, Jun ^a   Shen, Yong ^a   Zheng, Kang Cheng ^a   Ji, Liang Nian ^a  

^a SUN YAT SEN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CONFIGURATION INTERACTION SINGLES (CIS) METHODS; EXCITED STATES; PHOTOCLEAVAGES; SPECTRAL PROPERTIES;

COMPLEXATION; COMPUTER SIMULATION; DNA; ELECTRON ABSORPTION; ELECTRON ENERGY LEVELS; MOLECULAR STRUCTURE; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; SPECTRUM ANALYSIS;

RUTHENIUM COMPOUNDS;

DNA; HYDROXIDE; HYDROXIDE ION; INTERCALATING AGENT; ION; LIGAND; PHENANTHROLINE DERIVATIVE; PHENAZINE DERIVATIVE; RUTHENIUM; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER PROGRAM; CONFORMATION; DNA DENATURATION; LIGHT; RADIATION EXPOSURE; THEORETICAL MODEL;

DNA; HYDROXIDES; INTERCALATING AGENTS; IONS; LIGANDS; LIGHT; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; MODELS, THEORETICAL; NUCLEIC ACID CONFORMATION; NUCLEIC ACID DENATURATION; PHENANTHROLINES; PHENAZINES; RUTHENIUM; SOFTWARE;

EID: 33847106420     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064189y     Document Type: Article

References (55)

1. Maheswari, P. U.; Palaniandavar, M. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 219.
2. Friedman, A. E.; Chambron, J. C.; Sauvage, J. P.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4960.
3. Barton, J. K.; Danishefsky, A. T.; Goldeberg, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 2172.
4. Mei, H. Y.; Barton, J. K. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988, 85, 1339.
5. Guerzo, A. D.; Mesmaeker, A. K. D.; Demeunynck, M.; Lhomme, J. J. Chem. Soc. Dalton Trans. 2000, 1173.
6. Arounaguiri, S.; Maiya, B. G. Inorg. Chem. 1999, 38, 842.
7. Liu, X. W.; Li, J.; Li, H.; Zheng, K. C.; Chao, H.; Ji, L. N. J. Inorg. Biochem. 2005, 99, 2372.
8. Zhang, Q. L.; Liu, J. G.; Liu, J. Z.; Li, H.; Yang, Y.; Xu, H.; Chao, H.; Ji, L. N. Inorg. Chim. Acta 2002, 339, 34.
9. Zhang, Q. L.; Liu, J. H.; Liu, J. Z.; Zhang, P. X.; Ren, X. Z.; Liu, Y.; Huang, Y.; Ji, L. N. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 1405.
10. Angeles-Boza, A. M.; Bradley, P. M.; Pu, P. K. L., Wicke, S. E.; Bacsa, J.; Dunbar, K. R.; Turro, C. Inorg. Chem. 2004, 43, 8510.
11. Armitage, B. Chem. Rev. 1998, 98, 1171.
12. Hergueta-Bravo, A.; Jiménez-Hernández, M. E.; Montera, F.; Oliveros, E.; Orellana, G. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 4010.
13. Fleisher, M. B.; Waterman, K. C.; Turro, N. J.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1986, 25, 3349.
14. Fu, P. K. L.; Bradley, P. M.; van Loyen, D.; Durr, H.; Bossmann, S. H.; Turro, C. Inorg. Chem. 2002, 41, 3808.
15. Lecomte, J. P.; Mesmaeker, A. K. D.; Feeney, M. M.; Kelly, J. M. Inorg. Chem. 1995, 34, 6481.
16. Jacquet, L.; Davies, R. J. H.; Mesmaeker, A. K. D.; Kelly, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 11763.
17. Stemp, E. D. A.; Arkin, M. R.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2921.
18. Schoch, T. K.; Hubbard, J. L.; Zoch, C. R.; Yi, G. B.; Sørlie, M. Inorg. Chem. 1996, 35, 4383.
19. Arounaguiri, S.; Easwaramoorthy, D.; Ashokkumar, A.; Dattagupta, A.; Maiya, B. H. Proc. Indian Acad. Sci. 2000, 112, 1.
20. Yang, L.; Ren. A. M; Feng, J. K.; Liu, X. J.; Ma, Y. G.; Zhang, M; Liu, X. D.; Shen, J. C; Zhang, H. X. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6797.
21. Fantacci, S.; De Angelis, F.; Sgamellotti, A.; Re, N. Chem. Phys. Lett. 2004, 396, 43.
22. Fantacci, S; De Angelis, F.; Sgamellotti, A.; Marrone, A.; Re, N. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14144.
23. Batista, E. R.; Martin, R. L. J. Phys. Chem. A. 2005, 109, 3128.
24. Guillemoles, J. F.; Barone, V.; Joubert, L.; Adamo, C. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 11354.
25. Stoyanov, S. R.; Villegas, J. M.; Rillema, D. P. Inorg. Chem. Commun. 2004, 7, 838.
26. Hertwig, R. H.; Koch, W. Chem. Phys. Lett. 1997, 268, 345.
27. Beck, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
28. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
29. Lee, C.; Yang, W. T.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
30. Petersilka, M.; Gossmann, U. J.; Gross, E. K. U. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 1212.
31. Kurita, N.; Kobayashi, K. Comput. Chem. 2000, 24, 351.
32. Runge, E.; Gross, E. K. U. Phys. Rev. Lett. 1984, 52, 997.
33. Xu, L. C.; Li, Z. Y.; He, T. J.; Liu, F. C.; Chen, D. M. Chem. Phys. Lett. 2004, 305, 165.
34. Sundholm, D. Chem. Phys. Lett. 1999, 302, 480.
35. Xie, Z. Z.; Fang, W. H. THEOCHEM 2005, 717, 179.
36. Li, J.; Xu, L. C.; Chen, J. C.; Zheng, K. C.; Ji, L. N. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8174.
37. Dreuw, A.; Head-Gordon, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4007.
38. Dreuw, A.; Head-Gordon, M. Chem. Rev. 2005, 105, 4009.
39. Yavin, E.; Stemp, E. D. A.; Weiner, L.; Sagi, I.; Arad-yellin, R.; Shanzer, A. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 1750.
40. Brennaman, M. K.; Alstrum-Acevedo, J. H.; Heming, C. N.; Jang, P; Meyer, T. J.; Papanikolas, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 15094.
41. Pourtois. G.; Beljonne, D.; Moucheron, C.; Schumm, S.; Mesmaeker, A. K. D.; Lazzaroni, R.; Brédas, J. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 683.
42. Moller, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 618.
43. Head-Gordon, M.; Pople, J. A.; Frisch, M. J. Chem. Phys. Lett. 1988, 153, 503.
44. Head-Gordon, M.; Head-Gordon, T. Chem. Phys. Lett. 1994, 220, 122.
45. Foresman, J. B.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 135.
46. Barone, V.; Cossi, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1955.
47. Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comp. Chem. 2003, 24, 669.
48. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270.
49. Wadt, W. R.; Hay, P. J. J. Chem. Phys. 1985, 82, 284.
50. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, Jr., T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; lyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; and Pople, J. A. Gaussian 03, Revision D.01; Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2005.
51. Schaftenaar, G.; Noordik, J. H. J. Comput.-Aid. Mol. Des. 2000, 14, 123.
52. Liu, J. G.; Zhang, Q. L.; Shi, X. F.; Ji, L. N. Inorg. Chem. 2001, 40, 5045.
53. Reha, D.; Kabeláč, M.; Ryjáček, F.; Šponer, J.; Šponer, J. E.; Elstner, M. Suhai, S.; Hobza, P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3366.
54. Westerlund, F.; Pierard, F.; Eng, M. P.; Nordén, Bengt.; Lincoln, P. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 17327.
55. Yang, I. V.; Thorp, H. H. Inorg. Chem. 2001, 40, 1690.