Electrochemical detection of short DNA oligomer hybridization using the combiMatrix electraSense microarray reader

Electroanalysis

Volumn 18, Issue 19-20, 2006, Pages 1982-1988

  Roth, Kristian M ^a   Peyvan, Kia ^a   Schwarzkopf, Kevin R ^a   Ghindilis, Andrei ^a  

^a Combimatrix Corp ^*  (United States)

Author keywords

DNA microarray; Electrochemical detection; Enzyme amplified biosensor; Mutation detection

Indexed keywords

BIOSENSORS; CHEMICAL DETECTION; DNA; ELECTROCHEMICAL ELECTRODES; QUALITY CONTROL;

DNA MICROARRAY; DNA OLIGOMERS; DNA TARGETS; ELECTROCHEMICAL DETECTION; ELECTROCHEMICAL REDUCTIONS; ENZYME AMPLIFIED BIOSENSOR; HORSE-RADISH PEROXIDASE; HYBRIDISATION; MUTATION DETECTION; OXIDIZATION;

ELECTROLYTIC REDUCTION;

EID: 33750477623     PISSN: 10400397     EISSN: 15214109     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elan.200603603     Document Type: Article

References (17)

1. R. B. Stoughton, Ann. Rev. Biochem. 2005, 74, 53.
2. J. E. Larkin, B. C Frank, H. Gavras, R. Sultana, J. Quackenbush, Nat. Methods 2005, 2, 337.
3. R. A. Irizarry, D. Warren, F. Spencer, I. F. Kim, S. Biswal, B. C. Frank, E. Gabrielson, J. G. Garcia, J. Geoghegan, G. Germino, C. Griffin, S. C. Hilmer, E. Hoffman, A. E. Jedlicka, E. Kawasaki, F. Martinez-Murillo, L. Morsberger, H. Lee, D. Petersen, J. Quackenbush, A. Scott, M. Wilson, Y. Yang, Nat. Methods 2005, 2, 345.
4. K. Y. Kwong, G. C. Bloom, I. Yang, D. Boulware, D. Coppola, J. Haseman, E. Chen, A. McGrath, A. J. Makusky, J. Taylor, S. Steiner, J. Zhou, T. J. Yeatman, J. Quackenbush, Genomics 2005, 86, 142.
5. T. R. Hughes, M. Mao, A. R. Jones, J. Burchard, M. J. Marton, K. W. Shannon, S. M. Lefkowitz, M. Ziman, J. M. Schelter, M. R. Meyer, S. Kobayashi, C. Davis, H. Dai, Y. D. He, S. B. Stephaniants, G. Cavet, W. L. Walker, A. West, E, Coffey, D. D. Shoemaker, R. Stoughton, A. P. Blanchard, S. H. Friend, P. S. Linsley, Nat. Biotechnol. 2001, 19, 342.
6. P. K. Tan, T. J. Downey, E. L. Spitznagel, P. Xu, D. Fu, D. S. Dimitro, R. A. Lempicki, B. M. Raaka, M. C. Cam, Nucleic Acid Res. 2003, 31, 5676.
7. M. J. Lodes, D. Suici, M. Elliott, A. G. Stover, M. Ros, M. C Araballo, K. Dix, J. Crye, R. J. Webby, W. J. Lyon, D. L. Danley, A. McShea, J. Clin. Microbiol. 2006, 44, 1209.
8. L. Shi, W. Tong, Z. Su, T. Han, J. Han, R. K. Puri, H. Fang, F. W. Frueh, F. M. Goodsaid, L. Guo, W. S. Branham, J. J. Chen, Z. A. Xu, S. C. Harris, H. Hong, Q. Xie, R. G. Perkins, J. C. Fuscoe, BMC Bioinformatics 2005, 6 Suppl., S11.
9. C. A. Wells, A. M. Chalk, A. Forrest, D. Taylor, N. Waddell, K. Schroder, S. R. Himes, G. Faulkner, S. Lo, H. Kasukawa, C. Kai, J. Kawai, S. Katayama, P. Carninci, Y. Hayashizaki, D. A. Hume, S. M. Grimmond, Genome Biol. 2006, 7, R10.
10. M. P. Nittler, D. Hocking-Murray, F. C. K., Mol. Biol. Cell 2005, 16, 4792.
11. R. H. Liu, M. J. Lodes, T. Nguyen, T. Siuda, M. Slota, H. S. Fuji, A. McShea, Anal. Chem. 2006, 78, 4184.
12. R. H. Liu, T. Nguyen, K. R. Schwarzkopf, H.S. Fuji, A. Petrova, T. Siuda, K. Peyvan, M. Bizak, D. L. Danley, A. McShea, Anal. Chem. 2006, 78, 1980.
13. K. Dill, A. Ghindilis, K. R. Schwarzkopf, Lab on a Chip 2006, 6, 1.
14. K. Dill, D. D. Montgomery, A. Ghindilis, K. R. Schwarzkopf, J. Biochem. Biophys. Methods 2004, 59, 181.
15. A. L. Ghindilis, M. W. Smith, K. R. Schwarzkopf, K. R. Roth, K. Peyvan, S. B. Munro, M. J. Lodes. A. G. Stover, K. Bernards, K. Dill, A. McShea, Biosens. Bioelectron. 2006, in press.
16. J. Korimbocus, N. Scaramozzino, B. Lacroix, J. M. Crance, D. Garin, G. Vernet, J. Clin. Microbiol. 2005, 43, 3779.
17. J. S. Ellis, M. C. Zambon, Rev. Med. Virol. 2002, 12, 375.