The anharmonic vibrational potential and relaxation pathways of the amide I and II modes of N-methylacetamide

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 38, 2006, Pages 18973-18980

  DeFlores, Lauren P ^a   Ganim, Ziad ^a   Ackley, Sarah F ^a   Chung, Hoi Sung ^a   Tokmakoff, Andrei ^a  

^a MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DERIVATIVES; ENERGY DISSIPATION; POTENTIAL ENERGY; RELAXATION PROCESSES; SUBSTITUTION REACTIONS; VIBRATION MEASUREMENT;

DIPOLE MOMENT ANGLES; FEMTOSECOND PUMPPROBES; ISOTOPIC SUBSTITUTION; N-METHYLACETAMIDE (NMA);

NITROGEN COMPOUNDS;

EID: 33749615287     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0603334     Document Type: Article

References (49)

1. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123.
2. Nguyen, P. H.; Stock, G. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11350.
3. DeCamp, M. F.; DeFlores, L. P.; McCracken, J. M.; Tokmakoff, A.; Kwac, K.; Cho, M. J. Phys. Chem. B 2005, 709, 11016.
4. Rubtsov, I. V.; Kumar, K.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 2005, 402, 439.
5. Woutersen, S.; Mu, Y.; Stock, G.; Hamm, P. Chem. Phys. 2001, 206, 137.
6. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2247.
7. Schmidt, J. R.; Corcelli, S. A.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 8887.
8. Bour, P.; Keiderling, T. A. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11253.
9. Zanni, M. T.; Asplund, M. C.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 2001, 114, 4579.
10. Besley, N. A. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10794.
11. Woutersen, S.; Hamm, P. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 14, 1035.
12. Rubtsov, I. V.; Wang, J.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 5601.
13. Gregurick, S. K.; Chaban, G. M.; Gerber, R. B. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 8696.
14. Kubelka, J.; Keideling, T. A. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10922.
15. Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Mol. Struct. 1996, 377, 219.
16. Scott, A. P.; Radom, L. J. J. Phys. Chem. A 1996, 100, 16502.
17. Pulay, P.; Fogarasi, G.; Pongor, G.; Boggs, J. E.; Vargha, A. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 7037.
18. Allen, W. D.; Csaszar, A. G.; Horner, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 6834.
19. Mix, G.; Schweitzer-Stenner, R.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9028.
20. Chen, X. G.; Schweitzer-Stenner, R.; Asher, S. A.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Phys. Chem. 1995, 99, 3074.
21. Torii, H.; Tatsumi, T.; Kanazawa, T.; Tasumi, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 309.
22. Mayne, L. C.; Hudson, B. J. Phys. Chem. 1991, 95, 2962.
23. Roitberg, A.; Gerber, R. B.; Elber, R.; Ratner, M. A. Science 1995, 268, 1319.
24. Gerber, R. B.; Brauer, B.; Gregurick, S. K.; Chaban, G. M. PhysChemComm 2002, 21, 142.
25. Hayashi, T.; Jansen, T. I. C.; Zhuang, W.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 64.
26. Golonzka, O.; Khalil, M.; Demirdöven, N.; Tokmakoff, A. Phys. Rev. Lett. 2001, 86, 2154.
27. Khalil, M.; Demirdoven, N.; Tokmakoff, A. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5258.
28. Khalil, M.; Demirdöven, N.; Tokmakoff, A. J. Chem. Phys. 2004, 121, 362.
29. Demirdöven, N.; Khalil, M.; Tokmakoff, A. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 237401.
30. Khalil, M.; Tokmakoff, A. Chem. Phys. 2001, 266, 213.
31. Sung, J.; Silbey, R. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 9266.
32. Golonzka, O.; Tokmakoff, A. J. Chem. Phys. 2001, 115, 297.
33. Wang, J.; Hochstrasser, R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3798.
34. Hayashi, T.; Zhuang, W.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9747.
35. Roitberg, A.; Gerber, R. B.; Elber, R.; Ratner, M. A. Science 1995, 268, 1319.
36. Golonzka, O.; Khalil, M.; Demirdöven, N.; Tokmakoff, A. J. Chem. Phys. 2001, 115, 10814.
37. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Mill J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Lah M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
38. (a) Kuczera, K.; Wiorkiewicz, J. K.; Karplus, M. MOLVIB: Program for the Analysis of Molecular Vibrations; CHARMM; Harvard University, 1993.
39. (b) MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
40. Pulay, P.; Fogarasi, G.; Pang, F.; Boggs, J. E. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 2550.
41. Moore, W. H.; Krimm, S. Biopolymers 1976, 15, 2439.
42. Bour, P. J. Chem. Phys. 2004, 121, 7545.
43. Kwac, K.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1477.
44. Jansen, T. L. C.; Knoester, J. J. Chem. Phys., in press.
45. Guo, H.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1992, 96, 7273.
46. Torii, H.; Tasumi, M. J. Raman Spectrosc. 1998, 29, 81.
47. Cha, S.; Ham, S.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2002, 117, 740.
48. Mikhonin, A. V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 109, 3047.
49. Moran, A.; Mukamel, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 506.