-
3
-
-
0036424344
-
-
van Gunsteren, W. F.; Daura, X.; Mark, A. E. Helv. Chim. Acta 2002, 85, 3113.
-
(2002)
Helv. Chim. Acta
, vol.85
, pp. 3113
-
-
Van Gunsteren, W.F.1
Daura, X.2
Mark, A.E.3
-
9
-
-
0023106632
-
-
Bash, P. A.; Singh, U. C.; Brown, F. K.; Langridge, R.; Kollman, P. A. Science 1987, 235, 574.
-
(1987)
Science
, vol.235
, pp. 574
-
-
Bash, P.A.1
Singh, U.C.2
Brown, F.K.3
Langridge, R.4
Kollman, P.A.5
-
10
-
-
0031058541
-
-
Gilson, M. K.; Given, J. A.; Bush, B. L.; McCammon, J. A. Biophys. J. 1997, 72, 1047.
-
(1997)
Biophys. J.
, vol.72
, pp. 1047
-
-
Gilson, M.K.1
Given, J.A.2
Bush, B.L.3
McCammon, J.A.4
-
11
-
-
0035895423
-
-
Archontis, G.; Simonson, T.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 2001, 306, 307.
-
(2001)
J. Mol. Biol.
, vol.306
, pp. 307
-
-
Archontis, G.1
Simonson, T.2
Karplus, M.3
-
19
-
-
0030987036
-
-
Izrailev, S.; Stepaniants, S.; Baisera, M.; Oono, Y.; Schulten, K. Biophys. J. 1997, 72, 1568.
-
(1997)
Biophys. J.
, vol.72
, pp. 1568
-
-
Izrailev, S.1
Stepaniants, S.2
Baisera, M.3
Oono, Y.4
Schulten, K.5
-
22
-
-
0029757992
-
-
Roux, B.; Nina, M.; Pomes, R.; Smith, J. C. Biophys J. 1996, 71, 670.
-
(1996)
Biophys J.
, vol.71
, pp. 670
-
-
Roux, B.1
Nina, M.2
Pomes, R.3
Smith, J.C.4
-
24
-
-
0030887944
-
-
Hermans, J.; Wang, L. J. Am, Chem. Soc. 1997, 119, 2707.
-
(1997)
J. Am, Chem. Soc.
, vol.119
, pp. 2707
-
-
Hermans, J.1
Wang, L.2
-
25
-
-
0141682863
-
-
Boresch, S.; Tettinger, F.; Leitgeb, M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9535.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 9535
-
-
Boresch, S.1
Tettinger, F.2
Leitgeb, M.3
Karplus, M.4
-
26
-
-
0000997465
-
-
Strajbl, M.; Sham, Y. Y.; Villa, J.; Chu, Z.-T.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4578.
-
(2000)
J. Phys. Chem. B
, vol.104
, pp. 4578
-
-
Strajbl, M.1
Sham, Y.Y.2
Villa, J.3
Chu, Z.-T.4
Warshel, A.5
-
28
-
-
13444279887
-
-
Richardson, J. M.; Lopez, M. M.; Makhatadze, G. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 1413.
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.102
, pp. 1413
-
-
Richardson, J.M.1
Lopez, M.M.2
Makhatadze, G.I.3
-
29
-
-
0033529946
-
-
Dinner, A. R.; Lazaridis, T.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9068.
-
(1999)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.96
, pp. 9068
-
-
Dinner, A.R.1
Lazaridis, T.2
Karplus, M.3
-
32
-
-
0037397987
-
-
Gnanakaran, S.; Nymeyer, H.; Portman, J.; Sanbonmatsu, K. Y.; Garcia, A. E. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 168.
-
(2003)
Curr. Opin. Struct. Biol.
, vol.13
, pp. 168
-
-
Gnanakaran, S.1
Nymeyer, H.2
Portman, J.3
Sanbonmatsu, K.Y.4
Garcia, A.E.5
-
34
-
-
0033729617
-
-
Ma, B.; Tsai, C.; Nussinov, R. Biophys. J. 2000, 79, 2739.
-
(2000)
Biophys. J.
, vol.79
, pp. 2739
-
-
Ma, B.1
Tsai, C.2
Nussinov, R.3
-
36
-
-
0000961995
-
-
Levy, R. M.; Karplus, M.; Kushick, J.; Perahia, D. Macromolecules 1984, 17, 1370.
-
(1984)
Macromolecules
, vol.17
, pp. 1370
-
-
Levy, R.M.1
Karplus, M.2
Kushick, J.3
Perahia, D.4
-
40
-
-
0034323089
-
-
Schafer, H.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 2000, 113, 7809.
-
(2000)
J. Chem. Phys.
, vol.113
, pp. 7809
-
-
Schafer, H.1
Mark, A.E.2
Van Gunsteren, W.F.3
-
43
-
-
0034710867
-
-
Villa, J.; Strajbl, M.; Glennon, T. M.; Sham, Y. Y.; Chu, Z.-T.; Warshel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11899.
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 11899
-
-
Villa, J.1
Strajbl, M.2
Glennon, T.M.3
Sham, Y.Y.4
Chu, Z.-T.5
Warshel, A.6
-
46
-
-
0242663237
-
-
Duan, Y.; Wu, C.; Chowdhury, S.; Lee, M. C.; Xiong, G.; Zhang, W.; Yang, R.; Cieplak, P.; Luo, R.; Lee, T.; Caldwell, J.; Wang, J.; Kollman, P. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1999.
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 1999
-
-
Duan, Y.1
Wu, C.2
Chowdhury, S.3
Lee, M.C.4
Xiong, G.5
Zhang, W.6
Yang, R.7
Cieplak, P.8
Luo, R.9
Lee, T.10
Caldwell, J.11
Wang, J.12
Kollman, P.13
-
48
-
-
0001176785
-
-
Lee, J.; Scheraga, H. A.; Rackovsky, S. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1222.
-
(1997)
J. Comput. Chem.
, vol.18
, pp. 1222
-
-
Lee, J.1
Scheraga, H.A.2
Rackovsky, S.3
-
51
-
-
0034489543
-
-
Zerella, R.; Chen, P. Y.; Evans, P. A.; Raine, A.; Williams, D. H. Protein Sci. 2000, 9, 2142.
-
(2000)
Protein Sci.
, vol.9
, pp. 2142
-
-
Zerella, R.1
Chen, P.Y.2
Evans, P.A.3
Raine, A.4
Williams, D.H.5
-
52
-
-
0344778061
-
-
Still, W. C.; Tempczyk, A.; Hawley, R. C.; Hendrickson, T. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 6127.
-
(1990)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.112
, pp. 6127
-
-
Still, W.C.1
Tempczyk, A.2
Hawley, R.C.3
Hendrickson, T.4
-
53
-
-
4043171970
-
-
Qiu, D.; Shenkin, P. S.; Hoffinger, F. P.; Still, W. C. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3005.
-
(1997)
J. Phys. Chem. A
, vol.101
, pp. 3005
-
-
Qiu, D.1
Shenkin, P.S.2
Hoffinger, F.P.3
Still, W.C.4
-
54
-
-
0043197126
-
-
Zhang, W.; Hou, T.; Qiao, X.; Xu, X. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9071.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 9071
-
-
Zhang, W.1
Hou, T.2
Qiao, X.3
Xu, X.4
-
55
-
-
0042208326
-
-
Levy, R. M.; Zhang, L. Y.; Gallicchio, E.; Felts, A. K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9523.
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 9523
-
-
Levy, R.M.1
Zhang, L.Y.2
Gallicchio, E.3
Felts, A.K.4
-
57
-
-
0032538302
-
-
Qian, Y.; Bystroff, C.; Rajagopal, P.; Klevit, R. E.; Baker, D. J. Mol. Biol. 1998, 283, 293.
-
(1998)
J. Mol. Biol.
, vol.283
, pp. 293
-
-
Qian, Y.1
Bystroff, C.2
Rajagopal, P.3
Klevit, R.E.4
Baker, D.5
-
58
-
-
0036467064
-
-
Schafer, H.; Smith, L. J.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. Proteins 2002, 46, 215.
-
(2002)
Proteins
, vol.46
, pp. 215
-
-
Schafer, H.1
Smith, L.J.2
Mark, A.E.3
Van Gunsteren, W.F.4
-
60
-
-
0842334823
-
-
Czaplewski, C.; Oldziej, S.; Liwo, A.; Scheraga, H. A. Protein. Eng., Des. Sel. 2004, 17, 29.
-
(2004)
Protein. Eng., Des. Sel.
, vol.17
, pp. 29
-
-
Czaplewski, C.1
Oldziej, S.2
Liwo, A.3
Scheraga, H.A.4
-
61
-
-
3142681595
-
-
Liwo, A.; Oldziej, S.; Czaplewski, C.; Kozlowska, U.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 9421.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 9421
-
-
Liwo, A.1
Oldziej, S.2
Czaplewski, C.3
Kozlowska, U.4
Scheraga, H.A.5
-
62
-
-
0035342435
-
-
Gibbs, N.; Clarke, A. R.; Sessions, R. B. Proteins 2001, 43, 186.
-
(2001)
Proteins
, vol.43
, pp. 186
-
-
Gibbs, N.1
Clarke, A.R.2
Sessions, R.B.3
-
66
-
-
0031872292
-
-
Vorobjev, Y. N.; Almagro, J. C.; Hermans, J. Proteins 1998, 32, 399.
-
(1998)
Proteins
, vol.32
, pp. 399
-
-
Vorobjev, Y.N.1
Almagro, J.C.2
Hermans, J.3
-
67
-
-
0034212858
-
-
Lee, M. R.; Duan, Y.; Kollman, P. A. Proteins 2000, 39, 309.
-
(2000)
Proteins
, vol.39
, pp. 309
-
-
Lee, M.R.1
Duan, Y.2
Kollman, P.A.3
-
68
-
-
0000538967
-
-
van Gunsteren, W. F., Weiner, P. K., Wilkinson, A. J., Eds.; Klewer Academic Publishers: Dordrecht
-
Abagyan, A. R. In Computer Simulation of Biomolecular Systems: Theoretical and Experimental Applications; van Gunsteren, W. F., Weiner, P. K., Wilkinson, A. J., Eds.; Klewer Academic Publishers: Dordrecht, 1997; Vol. 3; p 363.
-
(1997)
Computer Simulation of Biomolecular Systems: Theoretical and Experimental Applications
, vol.3
, pp. 363
-
-
Abagyan, A.R.1
-
70
-
-
25144472137
-
-
Ravindranathan, K. P.; Gallicchio, E.; Levy, R. M. J. Mol. Biol. 2005, 353, 196.
-
(2005)
J. Mol. Biol.
, vol.353
, pp. 196
-
-
Ravindranathan, K.P.1
Gallicchio, E.2
Levy, R.M.3
|