DFT study of water-assisted intramolecular proton transfer in the tautomers of thymine radical cation

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 27, Issue 7, 2006, Pages 1009-1014

  Nam, Joon Kim ^a  

^a Chungbuk National University   (South Korea)

Author keywords

Hydration; Proton transfer; Tautomer; Thymine radical cation; Thymine water complex

Indexed keywords

AMINES; BAND STRUCTURE; COMPLEXATION; HYDRATION; POSITIVE IONS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

NEUTRAL STATE; PROTON TRANSFER; TAUTOMER; THYMINE RADICAL CATION; THYMINE-WATER COMPLEX;

CHARGED PARTICLES;

EID: 33746375323     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2006.27.7.1009     Document Type: Article

References (35)

1. Watson, J. D.; Crick, F. H. C. Nature 1953, 171, 737.
2. Löwdin, P. O. Adv. Quantum. Chem. 1965, 2, 213;
3. Topal, M. D.; Fresco, J. R. Nature 1976, 263, 285;
4. Lee, G.-Y. Bull. Korean Chem. Soc. 2006, 27, 419.
5. Morsy, M. A.; Al-Somali, A. M.; Suwaiyan, A. J. Phy. Chem. B 1999, 103, 11205.
6. Colarusso, P.; Zhang, K.; Guo, B.; Bernath, P. F. Chem. Phys. Lett. 1997, 269, 39;
7. Civcir, P. Ü. J. Mol. Struct. (Theochem) 2000, 532, 157.
8. Rejnek, J.; Hanus, M.; Kabeláč, M.; Ryjáček, F.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2006.
9. Piacenza, M.; Grimme, S. J. Comput. Chem. 2003, 25, 83.
10. Yekeler, H. J. Mol. Struct. (Theochem) 2005, 713, 201.
11. Cho, K.-H.; Choo, J.; Joo, S.-W. J. Mol. Struct. 2005, 738, 9.
12. Hu, X.; Li, H.; Liang, W.; Han, S. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 5935.
13. Markova, N.; Enchev, V.; Timtcheva, I. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1981.
14. von Sonntag, C. The Chemical Basis of Radiation Biology; Taylor and Francis: London, 1987;
15. Yan, M.; Becker, D.; Summerfield, S.; Renke, P.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1992, 96, 1983.
16. Little, J. B. Carcinogenesis 2000, 21, 397.
17. Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1971, 75, 626.
18. Steenken, S. Free Rad. Res. Comms. 1992, 16, 349.
19. Sevilla, M. D.; Paemel, C. V.; Zorman, G. J. Phys. Chem. 1972, 76, 3577;
20. Wagner, J. R.; van Lier, J. E.; Johnston, L. J. Photochem. Photobiol. 1990, 52, 333;
21. Deeble, D. J.; Schuchmann, M. N.; Steenken, S.; von Sonntag, C. J. Phy. Chem. 1990, 94, 8186.
22. Close, D. M. Radiat. Res. 1993, 135, 1.
23. Geimer, J.; Brede, O.; Beckert, D. Chem. Phys. Lett. 1997, 276, 411.
24. Wetmore, S. D.; Himo, F.; Boyd, R. J.; Eriksson, L. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7484;
25. Close, D.; Forde, G.; Gorb, L.; Leszczynski, J. Struct. Chem. 2003, 14, 451;
26. Naumov, S.; Barthel, A.; Reinhold, J.; Dietz, F.; Geimer, J.; Beckert, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 4207.
27. Hwang, S.; Jang, Y. H.; Chung, D. S. Bull. Korean Chem. Soc. 2005, 26, 585.
28. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503.;
29. Choi, S.-S.; So, H.-Y. Bull. Korean Chem. Soc. 2004, 25, 1538.
30. Kim, N. J.; Kim, H. M.; Kim, S. K. submitted.
31. Kang, Y. K. J. Mol. Struct. (Theochem) 2001, 546, 183.
32. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A. Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
33. Bernhard, W. A.; Barnes, J.; Mercer, K. R.; Mroczka, N. Radiat. Res. 1994, 140, 199.
34. Irikura, K. K.; Johnson III, R. D.; Kacker, R. N. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8430.
35. Gu, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 2744.