Excited state properties of the chromophore of the asFP595 chromoprotein: 2D and 3D theoretical analyses

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 106, Issue 4, 2006, Pages 1020-1026

  Sun, Mengtao ^a  

^a LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

AsFP595 chromoprotein; Electron hole coherence; Intramolecular charge and energy transfer

Indexed keywords

BOND STRENGTH (CHEMICAL); CHARGE TRANSFER; ENERGY TRANSFER; MOLECULAR ORIENTATION; PROTEINS; QUANTUM THEORY;

ASFP595 CHROMOPROTEIN; ELECTRON-HOLE COHERENCE; INTRAMOLECULAR CHARGE AND ENERGY TRANSFER; MULLIKEN CHARGE DISTRIBUTIONS;

CHROMOPHORES;

EID: 32044460503     PISSN: 00207608     EISSN: 1097461X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.20815     Document Type: Article

References (35)

1. Tsien, R. Y. Annu Rev Biochem 1998, 67, 509.
2. Lippincott-Schwartz, J.; Patterson, G. H. Science 2003, 300, 87.
3. Heim, R.; Prasher, D. C.; Tsien, R. Y. Proc Natl Acad Sci USA 1994, 91, 12501.
4. Labas, Y. A.; Gurskaya, N. G.; Yanushevich, Y. G.; Fradkov, A. F.; Lukyanov, K. A.; Lukyanov, S. A.; Matz, M. V. Proc Natl Acad Sci USA 2002, 99, 4256.
5. Yampolsky, I. V.; James Remington, S.; Martynov, V. I.; Potapov, V. K.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Biochemistry 2005, 44, 5788.
6. Shimomura, O. FEBS Lett 1979, 104, 220.
7. Cody, C. W.; Prasher, D. C.; Wastler, W. M.; Prendergast, F. G.; Ward, W. W. Biochemistry 1993, 32, 1212.
8. Ormo, M.; Cubitt, A. B.; Kallio, K.; Gross, L. A.; Tsien, R. Y.; Remington, S. J. Science 1996, 273, 1392.
9. Yang, F.; Moss, L. G.; Phillips, G. N., Jr. Nat Biotechnol 1996, 4, 1246.
10. Bredas, J. L.; Beljonne, D.; Coropceanu, V.; Cornil, J. Chem Rev 2004, 104, 4971.
11. Tretiak, S.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J Am Chem Soc 1997, 119, 11408.
12. Mukamel, S.; Tretiak, S.; Wagersreiter, T.; Chernyak, V. Science 1997, 277, 781.
13. Tretiak, S.; Mukamel, S. Chem Rev 2002, 102, 3171.
14. Niwa, H.; Inouye, S.; Hirano, T.; Matsuno, T.; Kojima, S.; Kubota, M.; Ohashi, M.; Tsuji, F. I. Proc Natl Acad Sci USA 1996, 93, 13617.
15. Tretiak, S.; Saxena, A.; Martin, R. L.; Bishop, A. R. Phys Rev Lett 2002, 89, 097402.
16. Tretiak, S.; Saxena, A.; Martin, R. L.; Bishop, A. R. Proc Natl Acad Sci USA 2003, 100, 2185.
17. Zojer, E.; Buchacher, P.; Wudl, F.; Cornil, J.; Calbert, J. P.; Bredas, J. L.; Leising, G. J Chem Phys 2000, 113, 10002.
18. Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Fleming, G. R. J Phys Chem B 1998, 102, 5378.
19. Beenken, W. J. D.; Pullerits, T. J Phys Chem B 2004, 108, 6164.
20. Beenken, W. J. D.; Pullerits, T. J Chem Phys 2004, 120, 2490.
21. Jespersen, K. G.; Beenken, W. J. D.; Zausjitsyn, Y.; Yartsev, A.; Andersson, M.; Pullerits, T.; Sundström, V. J Chem Phys 2004, 121, 12613.
22. Sun, M. T.; Kjellberg, P.; Ma, F. C.; Pullerits, T. Chem Phys Lett 2005, 401, 558.
23. Sun, M. T. Chem Phys Lett 2005, 408, 128.
24. Dreizler, M. R.; Gross, E. K. U. Density Functional Theory; Springer-Verlag: Heidelberg, 1990.
25. Becke, A. D. J Chem Phys 1993, 98, 5648.
26. Petersson, G. A.; Al-Laham, M. A. J Chem Phys 1991, 94, 6081.
27. Casida, M. E.; Jamorski, C.; Casida, K. C.; Salahub, D. R. J Chem Phys 1998, 108, 4439.
28. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, Jr., T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Ketih, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Revision B.05; Gaussian: Pittsburgh, PA, 2003.
29. Ahlrichs, R.; Bär, M.; Baron, H-P.; Bauernschmitt, R.; Böcker, S.; Deglmann, P.; Ehrig, M.; Eichkorn, K.; Elliott, S.; Furche, F.; Haase, F.; Häser, M.; Hörn, H.; Hättig, C.; Huber, C.; Huniar, U.; Kattannek, M.; Köhn, A.; Kölmel, C.; Kollwitz, M.; May, K.; Ochsenfeld, C.; Öhm, H.; Patzelt, H.; Rubner, O.; Schäfer, A.; Schneider, U.; Sierka, M.; Treutler, O.; Unterreiner, B.; von Arnim, M.; Weigend, F.; Weis, P.; Weiss, H. Turblemore 5.71; Quantum Chemistry Group; University of Karlsruhe: Karlsruhe, Germany, 2005.
30. Sun, M. T.; Kjellberg, P.; Beenken, W. J. D.; Pullerits, T. J Chem Theory Comput (revision).
31. Bredas, J. L.; Cornil, J.; Beljonne, D.; dos Santos, D.; Shuai, Z. G. Ace Chem Res 1999, 32, 267.
32. Marder, S. R.; Gorman, C. B.; Meyers, F.; Perry, J. W.; Bourhill, G.; Bredas, J. L.; Pierce, B. M. Science 1994, 265, 632.
33. Tretiak, S.; Igumenshchev, K.; Chernyak, V. Phys Rev B 2005, 71, 033201.
34. Cornil, J.; Gueli, I.; Dkhissi, A.; Sancho-Garcia, J. C.; Hennebicq, E.; Calbert, J. P.; Lemaur, V.; Belijonne, D.; Bredas, J. L. J Chem Phys 2003, 118, 6615.
35. Sun, M. T. Chem Phys (in press).