Conformational dynamics of the isoalloxazine in substrate-free p-Hydroxybenzoate hydroxylase: Single-molecule studies

Journal of the American Chemical Society

Volumn 127, Issue 51, 2005, Pages 18171-18178

  Brender, Jeffrey R ^a   Dertouzos, Joe ^a   Ballou, David P ^a,b   Massey, Vincent ^a,b   Palfey, Bruce A ^a,b   Entsch, Barrie ^b   Steel, Duncan G ^a   Gafni, Ari ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

^b UNIVERSITY OF MICHIGAN MEDICAL SCHOOL   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CONFORMATIONS; ENZYMES; FLUORESCENCE; MOLECULES; REACTION KINETICS; SUBSTRATES;

FLAVOENZYMES; HOMODIMERIC ENZYMES; SUBSTRATE BINDING;

NITROGEN COMPOUNDS;

4 HYDROXYBENZOATE HYDROXYLASE; FLAVINE ADENINE NUCLEOTIDE; FLAVOPROTEIN; ISOALLOXAZINE; OXYGEN; OXYGENASE; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME BINDING; ENZYME CONFORMATION; ENZYME SUBSTRATE; FLUORESCENCE; MODEL; MOTION; MUTANT;

4-HYDROXYBENZOATE-3-MONOOXYGENASE; DIMERIZATION; FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 29844457049     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja055171o     Document Type: Article

References (31)

1. Entsch B.; Cole, L. C.; Ballou, D. P. Arch. Biochem. Biophys. 2005, 433, 297.
2. Palfey, B. A.; Moran, G. R.; Entsch, B.; Ballou, D. P.; Massey, V. Biochemistry 1999, 38, 1153.
3. Schreuder, H. A.; Prick, P. A. J.; Wierenga, R. K.; Vriend, G.; Wilson, K. S.; Hol, W. G. J.; Drenth, J. J. Mol. Biol. 1989, 208, 679.
4. Gatti, D. L.; Palfey, B. A.; Lah, M. S.; Entsch, B.; Massey, V.; Ballou, D. P.; Ludwig, M. L. Science 1994, 266, 110.
5. Schreuder, H. A.; Mattevi, A.; Obmolova, G.; Kalk, K. H.; Hol, W. G. J.; Van der Bolt, F. J. T.; Van Berkel, W. J. H. Biochemistry 1994, 33, 10161.
6. Wang, J.; Ortiz-Maldonado, M.; Entsch, B.; Massey, V.; Ballou, D.; Gatti, D. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 608.
7. Frederick, K. K.; Ballou, D. P.; Palfey, B. A. Biochemistry 2001, 40, 3891.
8. Palfey, B. A.; Ballou, D. P.; Massey, V. Biochemistry 1997, 36, 15713.
9. Palfey, B. A.; Basu, R.; Frederick, K. K.; Entsch, B.; Ballou, D. P. Biochemistry 2002, 41, 8438.
10. Lu, H. P.; Xun, L. Y.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877.
11. Shi, J.; Palfey, B. A.; Dertouzos, J.; Jensen, K. F.; Gafni, A.; Steel, D. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6914.
12. Palfey, B. A.; Entsch, B.; Ballou, D. P.; Massey, V. Biochemistry 1994, 33, 1545.
13. Moran, G. R.; Entsch, B. Protein Express. Purif. 1995, 6, 164.
14. Husain, M.; Massey, V. J. Biol. Chem. 1979, 254, 6657.
15. Van den Berg, P. A. W.; Van Hoek, A.; Visser, A. J. W. G. Biophysical J. 2004, 87, 2577.
16. Van den Berg, P. A. W.; Van Hoek, A.; Walentas, C. D.; Perham, R. N.; Visser, A. J. W. G. Biophysical. J. 1998, 74, 2046.
17. Visser, A. J. W. G.; Van Hoek, A.; Kulinski, T.; Le Gall, J. FEBS Lett. 1987, 224, 406.
18. Van der Bolt, F. J. T.; Vervoort, J.; Van Berkel, W. J. H. Eur. J. Biochem. 1996, 237, 592.
19. Cole, L. J.; Gatti, D. L.; Entsch, B.; Ballou, D. P. Biochemistry 2005, 44, 8047.
20. Boukobza, E.; Sonnenfeld, A.; Haran, G. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 12165.
21. Deniz, A. A.; Dahan, M.; Grunwell, J. R.; Ha, T. J.; Faulhaber, A. E.; Chemla, D. S.; Weiss, S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3670.
22. Ha, T.; Zhuang, X. W.; Kim, H. D.; Orr, J. W.; Williamson, J. R.; Chu, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9077.
23. Ha, T. J.; Ting, A. Y.; Liang, J.; Caldwell, W. B.; Deniz, A. A.; Chemla, D. S.; Schultz, P. G.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 893.
24. Wennmalm, S.; Edman, L.; Rigler, R. Chem. Phys. 1999, 247, 61.
25. Edman, L.; Foldes-Papp, Z.; Wenmnalm, S.; Rigler, R. Chem. Phys. 1999, 247, 11.
26. Craig, D. B.; Nachtigall, J. T.; Ash, H. L.; Shoemaker, G. K.; Dyck, A. C.; Wawrykow, T. M. J.; Gudbjartson, H. L. J. Protein Chem. 2003, 22, 555.
27. Wazawa, T.; Ishii, Y.; Funatsu, T.; Yanagida, T. Biophys. J. 2000, 78, 1561.
28. Zhuang, X. W.; Bartley, L. E.; Babcock, H. P.; Russell, R.; Ha, T. J.; Herschlag, D.; Chu, S. Science 2000, 288, 2048.
29. Zhuang, X. W.; Kim, H.; Pereira, M. J. B.; Babcock, H. P.; Walter, N. G.; Chu, S. Science 2002, 296, 1473.
30. Xie, Z.; Srividya, N.; Sosnick, T. R.; Pan, T.; Scherer, N. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 534.
31. Rothwell, P. J.; Berger, S.; Kensch, O.; Felekyan, S.; Antonik, M.; Wohrl, B. M.; Restle, T.; Goody, R. S.; Seidel, C. A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1655.