Label-free detection of proteins in crude cell lysate with antibody arrays by a surface plasmon resonance imaging technique

Analytical Chemistry

Volumn 77, Issue 22, 2005, Pages 7115-7121

  Kyo, Motoki ^a   Usui Aoki, Kazue ^b   Koga, Hisashi ^b,c  

^a TOYOBO CO LTD   (Japan)

^b Chiba Industry Advancement Center   (Japan)

^c KAZUSA DNA RESEARCH INSTITUTE   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIBODY ARRAYS; BULK EFFECT; CELL LYSATE; LABEL-FREE DETECTION;

ANTIBODIES; ARRAYS; CELLS; CYTOLOGY; HYDROPHILICITY; IMAGING SYSTEMS; SURFACE PLASMON RESONANCE;

PROTEINS;

ACTIN; BOVINE SERUM ALBUMIN; MACROGOL; MONOCLONAL ANTIBODY; POLYCLONAL ANTIBODY; PROTEIN; STREPTAVIDIN; TUBULIN;

ANIMAL TISSUE; ANTIGEN ANTIBODY REACTION; ARTICLE; BRAIN; CELL LYSATE; IMAGING SYSTEM; MALE; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MOUSE; NONHUMAN; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN EXPRESSION; SURFACE PLASMON RESONANCE; WESTERN BLOTTING;

ANIMALS; ANTIBODIES; CELL EXTRACTS; MALE; MICE; MOLECULAR STRUCTURE; POLYETHYLENE GLYCOLS; PROTEIN ARRAY ANALYSIS; PROTEINS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SURFACE PLASMON RESONANCE;

EID: 27944501164     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac050884a     Document Type: Article

References (43)

1. Anderson, L.; Seilhamer, J. Electrophoresis 1997, 18, 533-537.
2. Gygi, S. P.; Rochon, Y.; Frenza, B. R.; Aebersold, R. Mol. Cell. Biol. 1999, 19, 1720-1730.
3. Pattern, W. F. Electrophoresis 2000, 21, 1123-1144.
4. Tsugita, A.; Kawakami, T.; Uchida, T.; Sakai, T.; Kamo, M.; Matsui, T.; Watanabe, Y.; Morimasa, T.; Hosokawa, K.; Toda, T. Electrophoresis 2000, 21, 1853-1871.
5. Gygi, S. P.; Rist, B.; Gerber, S. A.; Turecek, F.; Gelb, M. H.; Aebersold, R. Nat. Biotechnol 1999, 17, 994-999.
6. Gygi, S. P.; Rist, B.; Griffin, T. J.; Eng, J.; Aebersold, R. J. Proteome Res. 2002, 1, 47-54.
7. Lee, H.; Griffin, T. J.; Gygi, S. P.; Rist, B.; Aebersold, R. Anal. Chem. 2002, 74, 4353-4360.
8. de Wildt, R. M.; Mundy, C. R.; Gorick, B. D.; Tomlinson, I. M. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 989-994.
9. Sreekumar, A.; Nyati, M. K.; Varambally, S.; Barrette, T. R.; Ghosh, D.; Lawrence, T. S.; Chinnaiyan, A. M. Cancer Res. 2001, 61, 7585-7593.
10. Wiese, R.; Belosludtsev, Y.; Powdrill, T.; Thompson, P.; Hogan, M. Clin. Chem. 2001, 47, 1451-1457.
11. Huang, R. P.; Huang, R.; Fan, Y.; Lin, Y. Anal. Biochem. 2001, 294, 55-62.
12. Knezevic, V.; Leethanakul, C.; Bichsel, V. E.; Worth, J. M.; Prabhu, V. V.; Gutkind, J. S.; Liotta, L. A.; Munson, P. J.; Petricoin, E. F.; Krizman, D. B. Proteomics 2001, 1, 1271-1278.
13. Angenendt, P.; Glokler, J.; Murphy, D.; Lehrach, H.; Cahill, D. J. Anal. Biochem. 2002, 76, 2916-2921.
14. Miller, J. C.; Zhou, H.; Kwekel, J.; Cavallo, R.; Burke, J.; Butler, E. B.; Teh, B. S.; Haab, B. B. Proteomics 2003, 3, 56-63.
15. Anderson, K.; Potter, A.; Baban, D.; Davies, K. E. Brain 2003, 126, 2052-2064.
16. Angenendt, P.; Wilde, J.; Kijanka, G.; Baars, S.; Cahill, D. J.; Kreutzberger, J.; Lehrach, H.; Konthur, Z.; Glokler, J. Anal. Chem. 2004, 76, 2916-2921.
17. Hara, Y.; Shimada, K.; Kohga, H.; Ohara, O.; Koga, H. DNA Res. 2003, 10, 129-136.
18. Koga, H.; Shimada, K.; Hara, Y.; Nagano, M.; Kohga, H.; Yokoyama, R.; Kimura, Y.; Yuasa, S.; Magae, J.; Inamoto, S.; Okazaki, N.; Ohara, O. Proteomics 2004, 4, 1412-1416.
19. Tam, S. W.; Wiese, R.; Lee, S.; Gilmore, J.; Kumble, K. D. J. Immunol. Methods 2002, 261, 157-165.
20. Wang, C. C.; Huang, R. P.; Sommer, M.; Lisoukov, H.; Huang, R.; Lin, Y.; Miller, T.; Burke, J. J. Proteome Res. 2002, 1, 337-343.
21. Lin, Y.; Huang, R.; Santanam, N.; Liu, Y. G.; Parthasarathy, S.; Huang, R. P. Cancer Lett. 2002, 187, 17-24.
22. Lin, Y.; Huang, R.; Cao, X.; Wang, S. M.; Shi, Q.; Huang, R. P. Clin. Chem. Lab. Med. 2003, 41, 139-145.
23. Turtinen, L. W.; Prall, D. N.; Bremer, L. A.; Nauss, R. E.; Hartsel, S. C. Antimicrob. Agents Chemother. 2004, 48, 396-403.
24. Jordan, C. E.; Corn, R. M. Anal. Chem. 1997, 69, 1449-1456.
25. Nelson, B. P.; Frutos, A. G.; Brockman, J. M.; Corn, R. M. Anal Chem. 1999, 71, 3928-3934.
26. Baird, C. L.; Myszka, D. G. J. Mol. Recognit. 2001, 14, 261-268.
27. Shumaker-Parry, J. S.; Zareie, M. H.; Aebersold, R.; Campbell, C. T. Anal. Chem. 2004, 76, 918-929.
28. Usui-Aoki, K.; Shimada, K.; Nagano, M.; Kawai, M.; Koga, H. Proteomics 2005, 5, 2396-2401.
29. Indyk, H. E.; Filonzi, E. L. J. AOAC Int. 2003, 86, 386-393.
30. O'Brien, M. J., II; Brueck, S. R. J.; Perez-Luna, V. H.; Tender, L. M.; Lopez, G. P. Biosens. Bioelectron. 1999, 14, 145-154.
31. Siegel, R. R.; Harder, P.; Dahint, R.; Grunze, M.; Josse, F.; Mrksich, M.; Whitesides, G. M. Anal. Chem. 1997, 69, 3321-3328.
32. Kikuno, R.; Nagase, T.; Nakayama, M.; Koga, H.; Okazaki, N.; Nakajima, D.; Ohara, O. Nucleic Acids Res. 2004, 32, D502-504.
33. Brockman, J. M.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8044-8051.
34. Kyo, M.; Yamamoto, T.; Motohashi, H.; Kamiya, T.; Kuroita, T.; Tanaka, T.; Engel, J. D.; Kawakami, B.; Yamamoto, M. Genes Cells 2004, 9, 153-164.
35. Inamori, K.; Kyo, M.; Nishiya, Y.; Inoue, Y.; Sonoda, T.; Kinoshita, E.; Koike, T.; Katayama, Y. Anal. Chem. 2005, 77, 3979-3985.
36. Johnsson, B.; Lofas, S.; Lindquist, G. Anal. Biochem. 1991, 198, 268-277.
37. Ritter, G.; Cohen, L. S.; Williams, C.; Richards, E. C.; Old, L. J.; Welt, S. Cancer Res. 2001, 61, 6851-6859.
38. Campagnolo, C.; Meyers, K. J.; Ryan, T.; Atkinson, R. C.; Chen, Y. T.; Scanlan, M. J.; Ritter, G.; Old, L. J.; Batt, C. A J. Biochem. Biophys. Method 2004, 61, 283-298.
39. Uchida, K.; Otsuka, H.; Kaneko, M.; Kataoka, K.; Nagasaki, Y. Anal. Chem. 2005, 77, 1075-1080.
40. Okumura, A.; Sato, Y.; Kyo, M.; Kawaguchi, H. Anal. Biochem. 2005, 339, 328-337.
41. Belov, L.; de la Vega, O.; dos Remedios, C. G.; Mulligan, S. P.; Christopherson, R. I. Cancer Res. 2001, 61, 4483-4489.
42. Belov, L.; Huang, P.; Barber, N.; Mulligan, S. P.; Christopherson, R. I. Proteomics 2003, 3, 2147-2154.
43. Ko, I. K.; Kato, K.; Iwata, H. Biomaterials 2005, 26, 687-696.