-
6
-
-
0242407184
-
-
Valle, M., Zavialov, A., Li, W., Stagg, S. M., Sengupta, J., Nielsen, R. C., Nissen, P., Harvey, S. C., Ehrenberg, M. & Frank, J. (2003) Nat. Struct. Biol. 10,899-906.
-
(2003)
Nat. Struct. Biol.
, vol.10
, pp. 899-906
-
-
Valle, M.1
Zavialov, A.2
Li, W.3
Stagg, S.M.4
Sengupta, J.5
Nielsen, R.C.6
Nissen, P.7
Harvey, S.C.8
Ehrenberg, M.9
Frank, J.10
-
7
-
-
14544282086
-
-
Frank, J., Sengupta, J., Gao, H., Li, W., Valle, M., Zavialov, A. & Ehrenberg, M. (2005) FEBS Lett. 579, 959-962.
-
(2005)
FEBS Lett.
, vol.579
, pp. 959-962
-
-
Frank, J.1
Sengupta, J.2
Gao, H.3
Li, W.4
Valle, M.5
Zavialov, A.6
Ehrenberg, M.7
-
10
-
-
0035805213
-
-
Yusupov, M. M., Yusupova, G. Z., Baucom, A., Lieberman, K., Earnest, T. N., Cate, J. H. D. & Noller, H. F. (2001) Science 292, 883-896.
-
(2001)
Science
, vol.292
, pp. 883-896
-
-
Yusupov, M.M.1
Yusupova, G.Z.2
Baucom, A.3
Lieberman, K.4
Earnest, T.N.5
Cate, J.H.D.6
Noller, H.F.7
-
11
-
-
0042307441
-
-
Vila-Sanjurjo, A., Ridgeway, W. K., Seymaner, V., Zhang, W., Santoso, S., Yu, K. & Cate-Doudna, J. H. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 8682-8687.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 8682-8687
-
-
Vila-Sanjurjo, A.1
Ridgeway, W.K.2
Seymaner, V.3
Zhang, W.4
Santoso, S.5
Yu, K.6
Cate-Doudna, J.H.7
-
12
-
-
0030770467
-
-
Stark, H., Rodnina, M. V., RinkeAppel, J., Brimacombe, R., Wintermeyer, W. & vanHeel, M. (1997) Nature 389, 403-406.
-
(1997)
Nature
, vol.389
, pp. 403-406
-
-
Stark, H.1
Rodnina, M.V.2
Rinkeappel, J.3
Brimacombe, R.4
Wintermeyer, W.5
Vanheel, M.6
-
13
-
-
0033397413
-
-
Frank, J., Heagle, A. B. & Agrawal, R. K. (1999) J. Struct. Biol. 128, 15-18.
-
(1999)
J. Struct. Biol.
, vol.128
, pp. 15-18
-
-
Frank, J.1
Heagle, A.B.2
Agrawal, R.K.3
-
14
-
-
0035805229
-
-
Ogle, J. M., Brodersen, D. E., Clemons, W. M., Tarry, M. J., Carter, A. P. & Ramakrishnan, V. (2001) Science 292, 897-902.
-
(2001)
Science
, vol.292
, pp. 897-902
-
-
Ogle, J.M.1
Brodersen, D.E.2
Clemons, W.M.3
Tarry, M.J.4
Carter, A.P.5
Ramakrishnan, V.6
-
15
-
-
0036177483
-
-
Schmeing, T. M., Seila, A. C., Hansen, J. L., Freeborn, B., Soukup, J. K., Scaringe, S. A., Strobel, S. A., Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2002) Nat. Struct. Biol. 9, 225-230.
-
(2002)
Nat. Struct. Biol.
, vol.9
, pp. 225-230
-
-
Schmeing, T.M.1
Seila, A.C.2
Hansen, J.L.3
Freeborn, B.4
Soukup, J.K.5
Scaringe, S.A.6
Strobel, S.A.7
Moore, P.B.8
Steitz, T.A.9
-
16
-
-
0037015037
-
-
Hansen, J. L., Schmeing, T. M., Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 11670-11675.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.99
, pp. 11670-11675
-
-
Hansen, J.L.1
Schmeing, T.M.2
Moore, P.B.3
Steitz, T.A.4
-
17
-
-
0037249473
-
-
Bashan, A., Agmon, I., Zarivach, R., Schluenzen, F., Harms, J., Berisio, R., Bartels, H., Franceschi, F., Auerbach, T., Hansen, H. A., et al. (2003) Mol. Cell 11, 91-102.
-
(2003)
Mol. Cell
, vol.11
, pp. 91-102
-
-
Bashan, A.1
Agmon, I.2
Zarivach, R.3
Schluenzen, F.4
Harms, J.5
Berisio, R.6
Bartels, H.7
Franceschi, F.8
Auerbach, T.9
Hansen, H.A.10
-
18
-
-
0036646535
-
-
Valle, M., Sengupta, J., Swami, N. K., Grassucci, R. A., Burkhardt, N., Nierhaus, K. H., Agrawal, R. & Frank, J. (2002) EMBO J. 21, 3557-3567.
-
(2002)
EMBO J.
, vol.21
, pp. 3557-3567
-
-
Valle, M.1
Sengupta, J.2
Swami, N.K.3
Grassucci, R.A.4
Burkhardt, N.5
Nierhaus, K.H.6
Agrawal, R.7
Frank, J.8
-
19
-
-
4744365694
-
-
Blanchard, S. C., Gonzalez, R. L., Kim, H. D., Chu, S. & Puglisi, J. D. (2004) Nat. Struct. Mol. Biol. 11, 1008-1014.
-
(2004)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.11
, pp. 1008-1014
-
-
Blanchard, S.C.1
Gonzalez, R.L.2
Kim, H.D.3
Chu, S.4
Puglisi, J.D.5
-
20
-
-
0034637111
-
-
Ban, N., Nissen, P., Hansen, J., Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2000) Science 289, 905-920.
-
(2000)
Science
, vol.289
, pp. 905-920
-
-
Ban, N.1
Nissen, P.2
Hansen, J.3
Moore, P.B.4
Steitz, T.A.5
-
23
-
-
0034624039
-
-
VanLoock, M. S., Agrawal, R. K., Gabashvili, I. S., Qi, L., Frank, J. & Harvey, S. C. (2000) J. Mol. Biol. 304, 507-515.
-
(2000)
J. Mol. Biol.
, vol.304
, pp. 507-515
-
-
Vanloock, M.S.1
Agrawal, R.K.2
Gabashvili, I.S.3
Qi, L.4
Frank, J.5
Harvey, S.C.6
-
24
-
-
0033525065
-
-
VanLoock, M. S., Easterwood, T. R. & Harvey, S. C. (1999) J. Mol. Biol. 285, 2069-2078.
-
(1999)
J. Mol. Biol.
, vol.285
, pp. 2069-2078
-
-
Vanloock, M.S.1
Easterwood, T.R.2
Harvey, S.C.3
-
25
-
-
0032907143
-
-
Auffinger, P., LouiseMay, S. & Westhof, E. (1999) Biophys. J. 76, 50-64.
-
(1999)
Biophys. J.
, vol.76
, pp. 50-64
-
-
Auffinger, P.1
Louisemay, S.2
Westhof, E.3
-
26
-
-
0037440163
-
-
Li, W., Ma, B. & Shapiro, B. (2003) Nucleic Acids Res. 31, 629-638.
-
(2003)
Nucleic Acids Res.
, vol.31
, pp. 629-638
-
-
Li, W.1
Ma, B.2
Shapiro, B.3
-
27
-
-
0036382768
-
-
Mears, J. A., Cannone, J. J., Stagg, S. M., Gutell, R. R., Agrawal, R. K. & Harvey, S. C. (2002) J. Mol. Biol. 321, 215-234.
-
(2002)
J. Mol. Biol.
, vol.321
, pp. 215-234
-
-
Mears, J.A.1
Cannone, J.J.2
Stagg, S.M.3
Gutell, R.R.4
Agrawal, R.K.5
Harvey, S.C.6
-
28
-
-
4344715419
-
-
Trylska, J., Konecny, R., Tama, F., Brooks, C. L., 3rd & McCammon, J. A. (2004) Biopolymers 74, 423-431.
-
(2004)
Biopolymers
, vol.74
, pp. 423-431
-
-
Trylska, J.1
Konecny, R.2
Tama, F.3
Brooks III, C.L.4
McCammon, J.A.5
-
29
-
-
0037436340
-
-
Chacon, P., Tama, F. & Wriggers, W. (2003) J. Mol. Biol. 326, 485-492.
-
(2003)
J. Mol. Biol.
, vol.326
, pp. 485-492
-
-
Chacon, P.1
Tama, F.2
Wriggers, W.3
-
30
-
-
0042424707
-
-
Tama, F., Valle, M., Frank, J. & Brooks, C. L., 3rd (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 9319-9323.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 9319-9323
-
-
Tama, F.1
Valle, M.2
Frank, J.3
Brooks III, C.L.4
-
31
-
-
24144478280
-
-
Trylska, J., Tozzini, V. & McCammon, J. A. (2005) Biophys. J. 89,1455-1463.
-
(2005)
Biophys. J.
, vol.89
, pp. 1455-1463
-
-
Trylska, J.1
Tozzini, V.2
McCammon, J.A.3
-
32
-
-
0038275890
-
-
Gao, H., Sengupta, J., Valle, M., Korostelev, A., Eswar, N., Stagg, S. M., Van Roey, P., Agrawal, R. K., Harvey, S. C., Sali, A., et al. (2003) Cell 113, 789-801.
-
(2003)
Cell
, vol.113
, pp. 789-801
-
-
Gao, H.1
Sengupta, J.2
Valle, M.3
Korostelev, A.4
Eswar, N.5
Stagg, S.M.6
Van Roey, P.7
Agrawal, R.K.8
Harvey, S.C.9
Sali, A.10
-
35
-
-
0035815288
-
-
Young, M. A., Gonfloni, S., Superti-Furga, G., Roux, B. & Kuriyan, J. (2001) Cell 105, 115-126.
-
(2001)
Cell
, vol.105
, pp. 115-126
-
-
Young, M.A.1
Gonfloni, S.2
Superti-Furga, G.3
Roux, B.4
Kuriyan, J.5
-
37
-
-
0017776823
-
-
McCammon, J. A., Gelin, B. R. & Karplus, M. (1977) Nature 267, 585-590.
-
(1977)
Nature
, vol.267
, pp. 585-590
-
-
McCammon, J.A.1
Gelin, B.R.2
Karplus, M.3
-
38
-
-
0037134267
-
-
Tajkhorshid, E., Nollert, P., Jensen, M. O., Miercke, L. J., O'Connell, J., Stroud, R. M. & Schulten, K. (2002) Science 296, 525-530.
-
(2002)
Science
, vol.296
, pp. 525-530
-
-
Tajkhorshid, E.1
Nollert, P.2
Jensen, M.O.3
Miercke, L.J.4
O'Connell, J.5
Stroud, R.M.6
Schulten, K.7
-
39
-
-
0037062505
-
-
Sporlein, S., Carstens, H., Satzger, H., Renner, C., Behrendt, R., Moroder, L., Tavan, P., Zinth, W. & Wachtveitl, J. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 7998-8002.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.99
, pp. 7998-8002
-
-
Sporlein, S.1
Carstens, H.2
Satzger, H.3
Renner, C.4
Behrendt, R.5
Moroder, L.6
Tavan, P.7
Zinth, W.8
Wachtveitl, J.9
-
40
-
-
0042415783
-
-
Kale, L., Skeel, R., Bhandarkar, M., Brunner, R., Gursoy, A., Krawetz, N., Phillips, J., Shinozaki, A., Varadarajan, K. & Schulten, K (1999) J. Comput. Phys. 151, 283-312.
-
(1999)
J. Comput. Phys.
, vol.151
, pp. 283-312
-
-
Kale, L.1
Skeel, R.2
Bhandarkar, M.3
Brunner, R.4
Gursoy, A.5
Krawetz, N.6
Phillips, J.7
Shinozaki, A.8
Varadarajan, K.9
Schulten, K.10
-
43
-
-
17044401714
-
-
Sotomayor, M., Corey, D. P. & Schulten, K. (2005) Structure (London) 13, 669-682.
-
(2005)
Structure (London)
, vol.13
, pp. 669-682
-
-
Sotomayor, M.1
Corey, D.P.2
Schulten, K.3
-
44
-
-
0034665864
-
-
Ma, J., Sigler, P. B., Xu, Z. & Karplus, M. (2000) J. Mol. Biol. 302, 303-313.
-
(2000)
J. Mol. Biol.
, vol.302
, pp. 303-313
-
-
Ma, J.1
Sigler, P.B.2
Xu, Z.3
Karplus, M.4
-
45
-
-
0028455053
-
-
Schlitter, J., Engels, M. & Kruger, P. (1994) J. Mol. Graphics 12, 84-89.
-
(1994)
J. Mol. Graphics
, vol.12
, pp. 84-89
-
-
Schlitter, J.1
Engels, M.2
Kruger, P.3
-
47
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W., Dalke, A. & Schulten, K. (1996) J. Mol. Graphics 14, 33-38.
-
(1996)
J. Mol. Graphics
, vol.14
, pp. 33-38
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
-
48
-
-
2942571539
-
-
Cannone, J. J., Subramanian, S., Schnare, M. N., Collett, J. R., D'Souza, L. M., Du, Y., Feng, B., Lin, N., Madabusi, L. V., Muller, K. M., et al. (2002) BMC Bioinformatics 3, 2.
-
(2002)
BMC Bioinformatics
, vol.3
, pp. 2
-
-
Cannone, J.J.1
Subramanian, S.2
Schnare, M.N.3
Collett, J.R.4
D'Souza, L.M.5
Du, Y.6
Feng, B.7
Lin, N.8
Madabusi, L.V.9
Muller, K.M.10
-
52
-
-
0037378170
-
-
Yarus, M., Valle, M. & Frank, J. (2003) RNA 9, 384-385.
-
(2003)
RNA
, vol.9
, pp. 384-385
-
-
Yarus, M.1
Valle, M.2
Frank, J.3
-
53
-
-
0037184536
-
-
Ogle, J. M., Murphy, F. V., Tarry, M. J. & Ramakrishnan, V. (2002) Cell 111, 721-732.
-
(2002)
Cell
, vol.111
, pp. 721-732
-
-
Ogle, J.M.1
Murphy, F.V.2
Tarry, M.J.3
Ramakrishnan, V.4
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