-
1
-
-
0035859828
-
-
Miranda-Rios, J., Navarror, M. & Soberón, M. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 9736-9741.
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.98
, pp. 9736-9741
-
-
Miranda-Rios, J.1
Navarror, M.2
Soberón, M.3
-
2
-
-
0035955374
-
-
Lagos-Quintana, M., Rauhut, R., Lendeckel, W. & Tuschl, T. (2001) Science 294, 853-858.
-
(2001)
Science
, vol.294
, pp. 853-858
-
-
Lagos-Quintana, M.1
Rauhut, R.2
Lendeckel, W.3
Tuschl, T.4
-
3
-
-
0035955361
-
-
Lau, N. C., Lim, L. P., Weinstein, E. G. & Bartel, D. P. (2001) Science 294, 858-862.
-
(2001)
Science
, vol.294
, pp. 858-862
-
-
Lau, N.C.1
Lim, L.P.2
Weinstein, E.G.3
Bartel, D.P.4
-
6
-
-
0034637161
-
-
Nissen, P., Hansen, J., Ban, N., Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2000) Science 289, 920-930.
-
(2000)
Science
, vol.289
, pp. 920-930
-
-
Nissen, P.1
Hansen, J.2
Ban, N.3
Moore, P.B.4
Steitz, T.A.5
-
7
-
-
0037015037
-
-
Hansen, J. L., Schmeing, T. M., Moore, P. B. & Steitz, T. A. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 11670-11675.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.99
, pp. 11670-11675
-
-
Hansen, J.L.1
Schmeing, T.M.2
Moore, P.B.3
Steitz, T.A.4
-
8
-
-
0033591465
-
-
Mathews, D. H., Sabina, J., Zuker, M. & Turner, D. H. (1999) J. Mol. Biol. 288, 911-940.
-
(1999)
J. Mol. Biol.
, vol.288
, pp. 911-940
-
-
Mathews, D.H.1
Sabina, J.2
Zuker, M.3
Turner, D.H.4
-
9
-
-
0029061125
-
-
Gultyaev, A. P., van Batenburg, F. H. D. & Pleij, C. W. A. (1995) J. Mol. Biol. 250, 37-51.
-
(1995)
J. Mol. Biol.
, vol.250
, pp. 37-51
-
-
Gultyaev, A.P.1
Van Batenburg, F.H.D.2
Pleij, C.W.A.3
-
10
-
-
0005822936
-
-
Tinoco, I., Jr., Borer, P. N., Dengler, B., Levine, M. D., Uhlenbeck, O. C., Crothers, D. M., and Gralla, J. (1973) Nat. New Biol. 246, 40-41.
-
(1973)
Nat. New Biol.
, vol.246
, pp. 40-41
-
-
Tinoco Jr., I.1
Borer, P.N.2
Dengler, B.3
Levine, M.D.4
Uhlenbeck, O.C.5
Crothers, D.M.6
Gralla, J.7
-
12
-
-
0024477261
-
-
Zuker, M. (1989) Science 244, 48-52.
-
(1989)
Science
, vol.244
, pp. 48-52
-
-
Zuker, M.1
-
17
-
-
0033080745
-
-
Wuchty, S., Fontana, W., Hofacker, I. L. & Schuster, P. (1999) Biopolymers 49, 145-165.
-
(1999)
Biopolymers
, vol.49
, pp. 145-165
-
-
Wuchty, S.1
Fontana, W.2
Hofacker, I.L.3
Schuster, P.4
-
19
-
-
0031014702
-
-
Mathews, D. H., Banerjee, A. R., Luan, D. D., Eickbush, T. H. & Turner, D. H. (1997) RNA 3, 1-16.
-
(1997)
RNA
, vol.3
, pp. 1-16
-
-
Mathews, D.H.1
Banerjee, A.R.2
Luan, D.D.3
Eickbush, T.H.4
Turner, D.H.5
-
20
-
-
0035849554
-
-
Diamond, J. M., Turner, D. H. & Mathews, D. H. (2001) Biochemistry 40, 6971-6981.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 6971-6981
-
-
Diamond, J.M.1
Turner, D.H.2
Mathews, D.H.3
-
21
-
-
0032475827
-
-
Pappalardo, L., Kerwood, D. J., Pelczer, I. & Borer, P. N. (1998) J. Mol. Biol. 282, 801-818.
-
(1998)
J. Mol. Biol.
, vol.282
, pp. 801-818
-
-
Pappalardo, L.1
Kerwood, D.J.2
Pelczer, I.3
Borer, P.N.4
-
22
-
-
0023665268
-
-
Ehresmann, C., Baudin, F., Mougel, M., Romby, P., Ebel, J. & Ehresmann, B. (1987) Nucleic Acids Res. 15, 9109-9128.
-
(1987)
Nucleic Acids Res.
, vol.15
, pp. 9109-9128
-
-
Ehresmann, C.1
Baudin, F.2
Mougel, M.3
Romby, P.4
Ebel, J.5
Ehresmann, B.6
-
24
-
-
0020582965
-
-
Miura, K., Tsuda, S., Ueda, T., Harada, F. & Kato, N. (1983) Biochim. Biophys. Acta 739, 281-285.
-
(1983)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.739
, pp. 281-285
-
-
Miura, K.1
Tsuda, S.2
Ueda, T.3
Harada, F.4
Kato, N.5
-
25
-
-
0022470564
-
-
Moazed, D., Stern, S. & Noller, H. F. (1986) J. Mol. Biol. 187, 399-416.
-
(1986)
J. Mol. Biol.
, vol.187
, pp. 399-416
-
-
Moazed, D.1
Stern, S.2
Noller, H.F.3
-
26
-
-
0023645139
-
-
Egebjerg, J., Leffers, H., Christensen, A., Andersen, H. & Garrett, R. A. (1987) J. Mol. Biol. 196, 125-136.
-
(1987)
J. Mol. Biol.
, vol.196
, pp. 125-136
-
-
Egebjerg, J.1
Leffers, H.2
Christensen, A.3
Andersen, H.4
Garrett, R.A.5
-
27
-
-
0025165413
-
-
Kwakman, J. H. J. M., Konings, D. A. M., Hogweg, P., Patel, H. J. & Grivell, L. A. (1990) J. Biomol. Struct. Dyn. 8, 413-430.
-
(1990)
J. Biomol. Struct. Dyn.
, vol.8
, pp. 413-430
-
-
Kwakman, J.H.J.M.1
Konings, D.A.M.2
Hogweg, P.3
Patel, H.J.4
Grivell, L.A.5
-
29
-
-
0025771080
-
-
Brunel, C., Romby, P., Westhof, E., Ehresmann, C. & Ehresmann, B. (1991) J. Mol. Biol. 221, 293-308.
-
(1991)
J. Mol. Biol.
, vol.221
, pp. 293-308
-
-
Brunel, C.1
Romby, P.2
Westhof, E.3
Ehresmann, C.4
Ehresmann, B.5
-
30
-
-
0028223292
-
-
Tranguch, A. J., Kinderberger, D. W., Rohlman, C. E., Lee, J. & Engelke, D. R. (1994) Biochemistry 33, 1778-1787.
-
(1994)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 1778-1787
-
-
Tranguch, A.J.1
Kinderberger, D.W.2
Rohlman, C.E.3
Lee, J.4
Engelke, D.R.5
-
31
-
-
0032529473
-
-
Odell, L., Huang, V., Jakacka, M. & Pan, T. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 3717-3723.
-
(1998)
Nucleic Acids Res.
, vol.26
, pp. 3717-3723
-
-
Odell, L.1
Huang, V.2
Jakacka, M.3
Pan, T.4
-
32
-
-
0028146083
-
-
LaGrandeur, T. E., Hüttenhofer, A., Noller, H. F. & Pace, N. R. (1994) EMBO J. 17, 3945-3952.
-
(1994)
EMBO J.
, vol.17
, pp. 3945-3952
-
-
LaGrandeur, T.E.1
Hüttenhofer, A.2
Noller, H.F.3
Pace, N.R.4
-
33
-
-
0037126592
-
-
Matsuura, M., Noah, J. W. & Lambowitz, A. M. (2001) EMBO J. 20, 7259-7270.
-
(2001)
EMBO J.
, vol.20
, pp. 7259-7270
-
-
Matsuura, M.1
Noah, J.W.2
Lambowitz, A.M.3
-
34
-
-
0024331948
-
-
Wakao, H., Romby, P., Westhof, E., Laalami, S., Grunberg-Manago, M., Ebel, J., Ehresmann, C. & Ehresmann, B. (1989) J. Biol. Chem. 264, 20363-20371.
-
(1989)
J. Biol. Chem.
, vol.264
, pp. 20363-20371
-
-
Wakao, H.1
Romby, P.2
Westhof, E.3
Laalami, S.4
Grunberg-Manago, M.5
Ebel, J.6
Ehresmann, C.7
Ehresmann, B.8
-
35
-
-
0031031672
-
-
Melander, Y., Holmberg, L. & Nygård, O. (1997) J. Biol. Chem. 272, 3254-3258.
-
(1997)
J. Biol. Chem.
, vol.272
, pp. 3254-3258
-
-
Melander, Y.1
Holmberg, L.2
Nygård, O.3
-
37
-
-
0027434244
-
-
Banerjee, A. R., Jaeger, J. A. & Turner, D. H. (1993) Biochemistry 32, 153-163.
-
(1993)
Biochemistry
, vol.32
, pp. 153-163
-
-
Banerjee, A.R.1
Jaeger, J.A.2
Turner, D.H.3
-
38
-
-
0027171312
-
-
Powers, T., Daubresse, G. & Noller, H. F. (1993) J. Mol. Biol. 232, 362-374.
-
(1993)
J. Mol. Biol.
, vol.232
, pp. 362-374
-
-
Powers, T.1
Daubresse, G.2
Noller, H.F.3
-
39
-
-
0029312147
-
-
Harris, K. A., Jr., Crothers, D. M. & Ullu, E. (1995) RNA 1, 351-362.
-
(1995)
RNA
, vol.1
, pp. 351-362
-
-
Harris Jr., K.A.1
Crothers, D.M.2
Ullu, E.3
-
40
-
-
0032428502
-
-
Doktycz, M. J., Larimer, F. W., Pastrnak, M. & Stevens, A. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 14614-14621.
-
(1998)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.95
, pp. 14614-14621
-
-
Doktycz, M.J.1
Larimer, F.W.2
Pastrnak, M.3
Stevens, A.4
-
41
-
-
0033648805
-
-
Wells, S. E., Hughes, J. M. X., Igel, A. H. & Ares, M., Jr. (2000) Methods Enzymol. 318, 479-492.
-
(2000)
Methods Enzymol.
, vol.318
, pp. 479-492
-
-
Wells, S.E.1
Hughes, J.M.X.2
Igel, A.H.3
Ares Jr., M.4
-
42
-
-
0037452674
-
-
Disney, M. D., Haidaris, C. G. & Turner, D. H. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 1530-1534.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.100
, pp. 1530-1534
-
-
Disney, M.D.1
Haidaris, C.G.2
Turner, D.H.3
-
44
-
-
0032552882
-
-
Xia, T., SantaLucia, J., Jr., Burkard, M. E., Kierzek, R., Schroeder, S. J., Jiao, X., Cox, C. & Turner, D. H. (1998) Biochemistry 37, 14719-14735.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 14719-14735
-
-
Xia, T.1
SantaLucia Jr., J.2
Burkard, M.E.3
Kierzek, R.4
Schroeder, S.J.5
Jiao, X.6
Cox, C.7
Turner, D.H.8
-
45
-
-
0002635816
-
-
eds. Bloomfield, V. A. Crothers, D. M. & Tinoco, I. (University Science Books, Sausalito, CA)
-
Turner, D. H. (2000) in Nucleic Acids, eds. Bloomfield, V. A. Crothers, D. M. & Tinoco, I. (University Science Books, Sausalito, CA), pp. 259-334.
-
(2000)
Nucleic Acids
, pp. 259-334
-
-
Turner, D.H.1
-
46
-
-
2442627183
-
-
eds. Söll, D. G., Nishimura, S. & Moore, P. B. (Elsevier, New York)
-
Xia, T., Mathews, D. H. & Turner, D. H. (2001) in RNA, eds. Söll, D. G., Nishimura, S. & Moore, P. B. (Elsevier, New York), pp. 21-48.
-
(2001)
RNA
, pp. 21-48
-
-
Xia, T.1
Mathews, D.H.2
Turner, D.H.3
-
47
-
-
0034002687
-
-
Dale, T., Smith, R. & Serra, M. (2000) RNA 6, 608-615.
-
(2000)
RNA
, vol.6
, pp. 608-615
-
-
Dale, T.1
Smith, R.2
Serra, M.3
-
48
-
-
0037044315
-
-
Proctor, D. J., Schaak, J. E., Bevilacqua, J. M., Falzone, C. J. & Bevilacqua, P. C. (2002) Biochemistry 41, 12062-12075.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 12062-12075
-
-
Proctor, D.J.1
Schaak, J.E.2
Bevilacqua, J.M.3
Falzone, C.J.4
Bevilacqua, P.C.5
-
49
-
-
0025942059
-
-
Antao, V. P., Lai, S. Y. & Tinoco, I., Jr. (1991) Nucleic Acids Res. 19, 5901-5905.
-
(1991)
Nucleic Acids Res.
, vol.19
, pp. 5901-5905
-
-
Antao, V.P.1
Lai, S.Y.2
Tinoco Jr., I.3
-
51
-
-
0032570280
-
-
Giese, M. R., Betschart, K., Dale, T., Riley, C. K., Rowan, C., Sprouse, K. J. & Serra, M. J. (1998) Biochemistry 37, 1094-1100.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 1094-1100
-
-
Giese, M.R.1
Betschart, K.2
Dale, T.3
Riley, C.K.4
Rowan, C.5
Sprouse, K.J.6
Serra, M.J.7
-
53
-
-
0027247971
-
-
Serra, M. J., Lyttle, M. H., Axenson, T. J., Schadt, C. A. & Turner, D. H. (1993) Nucleic Acids Res. 21, 3845-3849.
-
(1993)
Nucleic Acids Res.
, vol.21
, pp. 3845-3849
-
-
Serra, M.J.1
Lyttle, M.H.2
Axenson, T.J.3
Schadt, C.A.4
Turner, D.H.5
-
54
-
-
0030890755
-
-
Serra, M. J., Barnes, T. W., Betschart, K., Gutierrez, M. J., Sprouse, K. J., Riley, C. K., Stewart, L. & Temel, R. E. (1997) Biochemistry 36, 4844-4851.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 4844-4851
-
-
Serra, M.J.1
Barnes, T.W.2
Betschart, K.3
Gutierrez, M.J.4
Sprouse, K.J.5
Riley, C.K.6
Stewart, L.7
Temel, R.E.8
-
55
-
-
0027992843
-
-
Serra, M. J., Axenson, T. J. & Turner, D. H. (1994) Biochemistry 33, 14289-14296.
-
(1994)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 14289-14296
-
-
Serra, M.J.1
Axenson, T.J.2
Turner, D.H.3
-
56
-
-
0037143573
-
-
Znosko, B. M., Silvestri, S. B., Volkman, H., Boswell, B. & Serra, M. J. (2002) Biochemistry 41, 10406-10417.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 10406-10417
-
-
Znosko, B.M.1
Silvestri, S.B.2
Volkman, H.3
Boswell, B.4
Serra, M.J.5
-
58
-
-
0035957084
-
-
Burkard, M. E., Xia, T. & Turner, D. H. (2001) Biochemistry 40, 2478-2483.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 2478-2483
-
-
Burkard, M.E.1
Xia, T.2
Turner, D.H.3
-
61
-
-
0344198177
-
-
Schroeder, S. J., Fountain, M. A., Kennedy, S. D., Lukavsky, P. J., Krugh, T. R., and Turner, D. H. (2003) Biochemistry, 42, 14184-14196.
-
(2003)
Biochemistry
, vol.42
, pp. 14184-14196
-
-
Schroeder, S.J.1
Fountain, M.A.2
Kennedy, S.D.3
Lukavsky, P.J.4
Krugh, T.R.5
Turner, D.H.6
-
62
-
-
0025900996
-
-
Peritz, A. E., Kierzek, R., Sugimoto, N. & Turner, D. H. (1991) Biochemistry 30, 6428-6436.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 6428-6436
-
-
Peritz, A.E.1
Kierzek, R.2
Sugimoto, N.3
Turner, D.H.4
-
63
-
-
0030299990
-
-
Schroeder, S., Kim, J. & Turner, D. H. (1996) Biochemistry 35, 16105-16109.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 16105-16109
-
-
Schroeder, S.1
Kim, J.2
Turner, D.H.3
-
64
-
-
0028917227
-
-
Wu, M., McDowell, J. A. & Turner, D. H. (1995) Biochemistry 34, 3204-3211.
-
(1995)
Biochemistry
, vol.34
, pp. 3204-3211
-
-
Wu, M.1
McDowell, J.A.2
Turner, D.H.3
-
65
-
-
0028085964
-
-
Walter, A. E., Wu, M. & Turner, D. H. (1994) Biochemistry 33, 11349-11354.
-
(1994)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 11349-11354
-
-
Walter, A.E.1
Wu, M.2
Turner, D.H.3
-
66
-
-
12044257509
-
-
SantaLucia, J., Jr., Kierzek, R. & Turner, D. H. (1991) J. Am. Chem. Soc. 113, 4313-4322.
-
(1991)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.113
, pp. 4313-4322
-
-
SantaLucia Jr., J.1
Kierzek, R.2
Turner, D.H.3
-
67
-
-
0025925206
-
-
SantaLucia, J., Jr., Kierzek, R. & Turner, D. H. (1991) Biochemistry 30, 8242-8251.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 8242-8251
-
-
SantaLucia Jr., J.1
Kierzek, R.2
Turner, D.H.3
-
68
-
-
0030815643
-
-
Xia, T., McDowell, J. A. & Turner, D. H. (1997) Biochemistry 36, 12486-12497.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 12486-12497
-
-
Xia, T.1
McDowell, J.A.2
Turner, D.H.3
-
69
-
-
0033607261
-
-
Kierzek, R., Burkard, M. & Turner, D. H. (1999) Biochemistry 38, 14214-14223.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 14214-14223
-
-
Kierzek, R.1
Burkard, M.2
Turner, D.H.3
-
71
-
-
0037143606
-
-
Childs, J. L., Disney, M. D. & Turner, D. H. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 11091-11096.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.99
, pp. 11091-11096
-
-
Childs, J.L.1
Disney, M.D.2
Turner, D.H.3
-
72
-
-
0000731487
-
-
Schroeder, S. J., Burkard, M. E. & Turner, D. H. (1999) Biopolymers 52, 157-167.
-
(1999)
Biopolymers
, vol.52
, pp. 157-167
-
-
Schroeder, S.J.1
Burkard, M.E.2
Turner, D.H.3
-
73
-
-
0028000994
-
-
Walter, A. E., Turner, D. H., Kim, J., Lyttle, M. H., Müller, P., Mathews, D. H. & Zuker, M. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 9218-9222.
-
(1994)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.91
, pp. 9218-9222
-
-
Walter, A.E.1
Turner, D.H.2
Kim, J.3
Lyttle, M.H.4
Müller, P.5
Mathews, D.H.6
Zuker, M.7
-
76
-
-
0033985046
-
-
Szymanski, M., Barciszewska, M. Z., Barciszewski, J. & Erdmann, V. A. (2000) Nucleic Acids Res. 28, 166-167.
-
(2000)
Nucleic Acids Res.
, vol.28
, pp. 166-167
-
-
Szymanski, M.1
Barciszewska, M.Z.2
Barciszewski, J.3
Erdmann, V.A.4
-
78
-
-
2942571539
-
-
Cannone, J. J., Subramanian, S., Schnare, M. N., Collett, J. R., D'Souza, L. M., Du, Y., Feng, B., Lin, N., Madabusi, L. V., Muller, K. M., et al. (2002) BMC Bioinformatics 3, Available at www.biomedcentral.com/bmcbioinformatics. Accessed January 17, 2002.
-
(2002)
BMC Bioinformatics
, vol.3
-
-
Cannone, J.J.1
Subramanian, S.2
Schnare, M.N.3
Collett, J.R.4
D'Souza, L.M.5
Du, Y.6
Feng, B.7
Lin, N.8
Madabusi, L.V.9
Muller, K.M.10
-
79
-
-
0024428420
-
-
Michel, F., Umesono, K. & Ozeki, H. (1989) Gene 82, 5-30.
-
(1989)
Gene
, vol.82
, pp. 5-30
-
-
Michel, F.1
Umesono, K.2
Ozeki, H.3
-
81
-
-
0035162595
-
-
Gorodkin, J., Knudsen, B., Zwieb, C. & Samuelsson, T. (2001) Nucleic Acids Res. 29, 169-170.
-
(2001)
Nucleic Acids Res.
, vol.29
, pp. 169-170
-
-
Gorodkin, J.1
Knudsen, B.2
Zwieb, C.3
Samuelsson, T.4
-
90
-
-
0031662075
-
-
Costa, M., Christian, E. L. & Michel, F. (1998) RNA 4, 1055-1068.
-
(1998)
RNA
, vol.4
, pp. 1055-1068
-
-
Costa, M.1
Christian, E.L.2
Michel, F.3
|