Preparation of 20-μm-i.d. silica-based monolithic columns and their performance for proteomics analyses

Analytical Chemistry

Volumn 77, Issue 15, 2005, Pages 5028-5035

  Luo, Quanzhou ^a   Shen, Yufeng ^a   Hixson, Kim K ^a   Zhao, Rui ^a   Yang, Feng ^a   Moore, Ronald J ^a   Mottaz, Heather M ^a   Smith, Richard D ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; PRESSURE EFFECTS; SENSITIVITY ANALYSIS; SEPARATION; SILICA;

MICROSOLIDPHASE EXTRACTION; NANOELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRY; PEPTIDES; PROTEOMIC ANALYSIS;

PROTEINS;

SILICON DIOXIDE;

ARTICLE; CAPILLARY CHROMATOGRAPHY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; FLOW RATE; MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; PEPTIDE ANALYSIS; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY; SENSITIVITY ANALYSIS; SHEWANELLA ONEIDENSIS; SOLID PHASE EXTRACTION; CHEMISTRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METHODOLOGY; NANOTECHNOLOGY; ONLINE SYSTEM; SCANNING ELECTRON MICROSCOPY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

CHROMATOGRAPHY, LIQUID; MICROSCOPY, ELECTRON, SCANNING; NANOTECHNOLOGY; ONLINE SYSTEMS; PROTEOMICS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SILICON DIOXIDE; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 23044510003     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac050454k     Document Type: Article

References (49)

1. Wickware, P.; Smaglik, P. Nature 2001, 413, 869-875.
2. Anderson, N. G.; Matheson, A.; Anderson, N. L. Proteomics 2001, 1, 3-12.
3. Harry, J. L.; Wilkins, M. R.; Herbert, B. R.; Packer, N. H.; Gooley, A. A.; Williams, K. L. Electrophoresis 2000, 21, 1071-1081.
4. Brown, R. S.; Lennon, J. J. Anal. Chem. 1995, 67, 3990-3999.
5. Yates, J. R.; McCormack, A. L.; Eng, J. Anal. Chem. 1996, 68, A534-A540.
6. Henzel, W. J.; Billeci, T. M.; Stults, J. T.; Wong, S. C.; Grimley, C.; Watanabe, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5011-5015.
7. Alam, S. L.; Atkins, J. F.; Gesteland, R. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 14177-14179.
8. Gygi, S. P.; Corthals, G. L.; Zhang, Y.; Rochon, Y.; Aebersold, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 9390-9395.
9. Shen, Y.; Tolic, N.; Zhao, R.; Pasa-Tolic, L.; Li, L. J.; Berger, S. J.; Harkewicz, R; Anderson, G. A; Belov, M. E.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2001, 75, 3011-3021.
10. Shen, Y.; Zhao, R.; Belov, M. E.; Conrads, T. P.; Anderson, G. A.; Tang, K. Q.; Pasa-Tolic, L.; Veenstra, T. D.; Lipton, M. S.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2001, 73, 1766-1775.
11. Shen, Y.; Zhao, R.; Berger, S. J.; Anderson, G. A.; Rodriguez, N.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2002, 74, 4235-4249.
12. Florens, L.; Washburn, M. P.; Raine, J. D.; Anthony, R. M.; Grainger, M.; Haynes, J. D.; Moch, J. K.; Muster, N.; Sacci, J. B.; Tabb, D. L.; Witney, A A.; Wolters, D.; Wu, Y. M.; Gardner, M. J.; Holder, A. A.; Sinden, R. E.; Yates, J. R.; Carucci, D. J. Nature 2002, 419, 520-526.
13. Shen, Y.; Smith, R. D. Electrophoresis 2002, 23, 3106-3124.
14. Shen, Y.; Moore, R. J.; Zhao, R.; Blonder, J.; Auberry, D. L.; Masselon, C.; Pasa-Tolic, L.; Hixson, K. K.; Auberry, K. J.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2003, 75, 3596-3605.
15. Shen, Y.; Tolic, N.; Masselon, C.; Pasa-Tolic, L.; Camp, D. G., II; Hixson, K. K.; Zhao, R.; Anderson, G. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2004, 76, 144-154.
16. Smith, R. D.; Anderson, G. A; Lipton, M. S.; Masselon, C.; Pasa-Tolic, L.; Udseth, H.; Belov, M.; Shen, Y.; Veenstra, T. D. Adv. Protein Chem. 2003, 65, 85-131.
17. Smith, R. D.; Shen, Y.; Tang, K. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 269-278.
18. Wolters, D. A.; Washburn, M. P.; Yates, J. R. Anal. Chem. 2001, 73, 5683-5690.
19. Bonner, R. F.; EmmertBuck, M.; Cole, K.; Pohida, T.; Chuaqui, R.; Goldstein, S.; Liotta, L. A. Science 1997, 278, 1481-1483.
20. Hopfgartner, G.; Bean, K.; Henion, J.; Henry, R. J. Chromatogr. 1993, 647, 51-61.
21. Huang, X. A.; Zhang, S.; Schultz, G. A.; Henion, J. Anal. Chem. 2002, 74, 2336-2344.
22. Ivanov, A. R.; Horvath, C.; Karger, B. L. Electrophoresis 2003, 24, 3663-3673.
23. Ivanov, A. R.; Zang, L.; Karger, B. L. Anal Chem. 2003, 75, 5306-5316.
24. Li, Y. M.; Brostedt, P.; Hjerten, S.; Nyberg, F.; Silberring, J. J. Chromatogr., B 1995, 664, 426-430.
25. Luo, Q. Z.; Zou, H. F.; Xiao, X. Z.; Guo, Z.; Kong, L.; Mao, X. Q. J. Chromatogr., A 2001, 926, 255-264.
26. Peters, E. C.; Petro, M.; Svec, F.; Frechet, J. M. J. Anal. Chem. 1997, 69, 3646-3649.
27. Premstaller, A.; Oberacher, H.; Huber, C. G. Anal. Chem. 2000, 72, 4386-4393.
28. Premstaller, A.; Oberacher, H.; Walcher, W.; Timperio, A. M.; Zolla, L.; Chervet, J. P.; Cavusoglu, N.; van Dorsselaer, A.; Huber, C. G. Anal. Chem. 2001, 73, 2390-2396.
29. Svec, F.; Frechet, J. M. J. Anal. Chem. 1992, 64, 820-822.
30. Svec, F.; Frechet, J. M. J. Science 1996, 273, 205-211.
31. Walcher, W.; Oberacher, H.; Troiani, S.; Holzl, G.; Oefner, P.; Zolla, L.; Huber, C. G. J. Chromatogr., B 2002, 782, 111-125.
32. Viklund, C.; Ponten, E.; Glad, B.; Irgum, K.; Horstedt, P.; Svec, F. Chem. Mater. 1997, 9, 463-471.
33. Viklund, C.; Svec, F.; Frechet, J. M. J.; Irgum, K. Chem. Mater. 1996, 8, 744-750.
34. Svec, F.; Frechet, J. M. J. Chem. Mater. 1995, 7, 707-715.
35. Pretorius, V.; Davidtz, J. C.; Desty, D. H. J. High Resolut. Chromatogr. Chromatogr. Commun. 1979, 2, 583-584.
36. Cortes, H. J.; Pfeiffer, C. D.; Richter, B. E.; Stevens, T. S. J. High Resolut. Chromatogr. Chromatogr. Commun. 1987, 10, 446-448.
37. Minakuchi, H.; Nakanishi, K.; Soga, N.; Ishizuka, N.;Tanaka, N. Anal Chem. 1996, 68, 3498-3501.
38. Ishizuka, N.; Minakuchi, H.; Nakanishi, K.; Soga, N.; Nagayama, H.; Hosoya, K.; Tanaka, N. Anal. Chem. 2000, 72, 1275-1280.
39. Ishizuka, N.; Kobayashi, H.; Minakuchi, H.; Nakanishi, K.; Hirao, K.; Hosoya, K.; Ikegami, T.; Tanaka, N. J. Chromatogr., A 2002, 960, 85-96.
40. Minakuchi, H.; Nakanishi, K.; Soga, N.; Ishizuka, N.; Tanaka, N. J. Chromatogr., A 1997, 762, 135-146.
41. Nakanishi, K.; Shikata, H.; Ishizuka, N.; Koheiya, N.; Soga, N. HRC-J. High Resolut. Chromatogr. 2000, 23, 106-110.
42. Barroso, B.; Lubda, D.; Bischoff, R. J. Proteome Res. 2003, 2, 633-642.
43. Shen, Y.; Zhang, R.; Moore, R. J.; Kim, J.; Metz, T. O.; Hixson, K. K.; Zhao, R.; Livesay, E. A.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2005, 77, 3090-3100.
44. Tolstikov, V. V.; Lommen, A.; Nakanishi, K.; Tanaka, N.; Fiehn, O. Anal. Chem. 2003, 75, 6737-6740.
45. Tanaka, N.; Kimura, H.; Tokuda, D.; Hosoya, K.; Ikagami, T.; Ishizuka, N.; Minakuchi, H.; Nakanishi, K.; Shitani, Y.; Furuno, M.; Cabrera, K. Anal. Chem. 2004, 76, 1273-1281.
46. Wienkoop, S.; Glinski, M.; Tanaka, N.; Tolstikov, V.; Fiehn, O.; Weckwerth, W. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 643-650.
47. Hench, L. L.; West, J. K. Chem. Rev. 1990, 90, 33-72.
48. Giddings, J. C. Anal. Chem. 1967, 39, 1027-1028.
49. Grushka, E. Anal. Chem. 1970, 42, 1142-1147.