Label-free electrochemical hybridization genosensor for the detection of hepatitis B virus genotype on the development of lamivudine resistance

Analytical Chemistry

Volumn 77, Issue 15, 2005, Pages 4908-4917

  Ariksoysal, Dilsat Ozkan ^a   Karadeniz, Hakan ^a   Erdem, Arzum ^a   Sengonul, Aylin ^b   Sayiner, A Arzu ^b   Ozsoz, Mehmet ^a  

^a EGE UNIVERSITY   (Turkey)

^b DOKUZ EYLUL UNIVERSITY   (Turkey)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GENOTYPING; HEPATITIS B VIRUS (HBV); LABEL-FREE DETECTION METHOD; RESISTANCE ANALYSIS;

ADSORPTION; ASSAYS; DNA; ELECTROCHEMISTRY; OXIDATION; PATIENT TREATMENT; VIRUSES;

GENES;

DNA; GUANINE; LAMIVUDINE; OLIGONUCLEOTIDE;

ARTICLE; CONTROLLED STUDY; ELECTROCHEMISTRY; ELECTRODE; GENOTYPE; HEPATITIS B VIRUS; HYBRIDIZATION; NONHUMAN; OLIGONUCLEOTIDE PROBE; OXIDATION; POLYMERASE CHAIN REACTION; POTENTIOMETRY; SENSOR; ULTRAVIOLET SPECTROSCOPY;

BIOSENSING TECHNIQUES; DRUG RESISTANCE, VIRAL; ELECTROCHEMISTRY; GENOTYPE; GUANINE; HEPATITIS B VIRUS; LAMIVUDINE; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; OXIDATION-REDUCTION;

EID: 23044481629     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac050022+     Document Type: Article

References (60)

1. Lee, W. M. N. Engl. J. Med. 1997, 337, 1733.
2. Dusheiko, G. In Oxford Textbook of Clinical Hepatology; McIntyre, N., Ed.; Oxford University Press: New York 1991; p 571.
3. Purcell, R. H. Gastroenterelogy 1993, 104, 955.
4. Mast, E. E.; Alter, M. J.; Margolis, H. S. Vaccine 1999, 1730.
5. Regev, A.; Shift, E. R. Adv. Intern. Med. 2001, 46, 107.
6. Fattovich, G.; Brollo, L.; Aliberti, A.; Pontisso, P.; Giustina, G.; Realdi, G. Hepatology 1998, 8, 1651.
7. Lai, C. L.; Chien, R. N.; Leung, N. W. Y.; Chang, T. T.; Guan, R.; Tai, D. I.; Ng, K. Y.; Wu, P. C.; Dent, J. C.; Barber, J.; Stephenson, S. L.; Gray, D. F. A. N. Engl. J. Med. 1998, 339, 61.
8. Dienstag, J. L.; Schiff, E. R.; Wright, T. L.; Perillo, R. P.; Hann, H. L.; Goodman, Z.; Crowther, L. D.; Woessner, M.; Rubin, M.; Brown, N. A. N. Engl. J. Med. 1999, 341, 1256.
9. Merle, P.; Trepo, C. J. Viral Hepatol. 1994, 8, 391.
10. Tipples, G. A.; Ma, M. M.; Fischer, K. P.; Bain, V. G.; Kneteman, N. M.; Tyrell, D. L. J. Hepatol. 1996, 24, 714.
11. Leung, N. W.; Lai, C. L.; Chang, T. T.; Guan, R.; Lee, C. M., NG, K. Y.; Lim, S. G.; Wu, P. C.; Dent, J. C.; Edmundson, S.; Condreay, L. D.; Chien, R. N. Hepatology 2001, 33, 1527.
12. Kao, J. H.; Chen, P. J.; Lai, M. Y.; Chen, D. S. Gastroenterology 2000, 118, 554.
13. Kidd-Ljunggren, K.; Miyakawa, Y.; Kidd, A. H. J. Gen. Virol. 2002, 83, 1267.
14. Allen, M. I.; Deslauriers, M.; Andrews, C. W.; Tipples, G. A.; Walters, K. A.; Tyrrell, D. L. J.; Brown, N.; Condreay, L. D. Hepatology 1998, 27, 1670.
15. Han, J. H.; Hwang, S. G.; Chung, K W.; Oh, S. W.; Hong, S. P.; Park, P. W.; Rim, K. S.; Oh, D.; Kim, N. K. Korean J. Genet. 2002, 24, 219.
16. Stuyver, L. J.; Locarnini, S. A.; Lok, A.; Richman, D. D.; Carman, W. F.; Dienstag, J. L.; Schinazi, R. F. Hepatology 2001, 33, 751.
17. Kobayashi, S.; Shimada, K.; Suzuki, H.; Tanikawa, K.; Sata, M. Hepatol. Res. 2000, 17, 31.
18. Hong, S. P.; Kim, N. K.; Hwang, S. G.; Chung, H. J.; Kim, S.; Han, J. H.; Kim, H. T.; Rim, K. S.; Kang, M. S.; Yoo, W.; Kim, S. O. J. Hepatol. 2004, 40, 837.
19. Novoa, S. R.; Tato, A. G.; Guirao, A. A.; Castroagudin, J.; Quintela, A. G.; Riestra, C. G.; Regueiro, B. J. J. Virol. Methods 2004, 115, 9.
20. Maddrey, W. C. Clin. Lab. 2001, 47, 51.
21. Bozdayi, A. M.; Uzunalimoglu, O.; Turkyilmaz, A. R.; Asian, N.; Sezgin, O.; Sahin, T.; Bozdayi, G.; Cinar, K.; Pai, S. B.; Pai, R.; Bozkaya, H.; Karayalcin, S.; Yurdaydin, C.; Schinazi, R. F. J. Viral Hepat. 2003, 10(4), 256.
22. Niesters, H. G. M.; De Man R. A.; Pas, S. D.; Fries, E.; Osterhaus, A. D. M. F. J. Med. Microbiol. 2002, 51, 695.
23. Pas, S. D.; De Man, R. A.; Fries, F.; Osterhaus, A. D. M. F.; Niesters, H. G. M. J. Clin. Virol. 2002, 25, 63.
24. Allen, M. I.; Gauthier, J.; Deslauriers, M.; Bourne, E. J.; Carrick, K M.; Baldani, F.; Ross, L. L.; Lutz, M. W.; Condreay, L. D. J. Clin. Microbiol. 1999, 37, 3338.
25. Stuyver, L.; Van, Geyt C.; De Gendt, S.; Van Reybroeck, G.; Zoulim, F.; Leroux-Roels, G.; Rossau, R. J. Clin. Microbiol. 2000, 35, 702-7.
26. Cane, P. A.; Cook, P.; Ratcliffe, D.; Mutimer, D.; Pillay, D. Antimkrob. Agents Chemother. 1999, 43, 1600.
27. Millan, K. M.; Saraullo, A.; Mikkelsen, S. R. Anal. Chem. 1994, 66, 2943.
28. Hashimoto, K.; Ito, K.; Ishimori, Y. Anal. Chem. 1994, 66, 3830.
29. Wang, J.; Cai, X.; Rivas, G.; Shiraishi, H.; Farias, P. A. M.; Dontha, N. Anal. Chem. 1996, 65, 2629.
30. Wang, J.; Paleèek, E.; Nielsen, P.; Rivas, G.; Cai, X.; Shiraishi, H.; Dontha, H.; Luo, D.; Farias, P. A. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7667.
31. Erdem, A.; Ozsoz, M. Electroanalysis 2002, 14(14), 965.
32. Wang, J.; Kawde, A. N.; Erdem, A.; Salazar, M. Analyst 2001, 126 (11), 2020.
33. Kobayashi, M.; Mizukami, T.; Morita, Y.; Murakami, Y.; Yokoyama, K.; Tamiya, E. Electrochemistry 2001, 69, 1013.
34. Pividori, M. I.; Merkoçi, A.; Alegret, S. Biosen. Bioelectron. 2000, 15, 291.
35. Palecek, E.; Fojta, M. Anal. Chem. 2001, 73, 75A.
36. Wang, J.; Rivas, G.; Fernandas, J. R.; Paz, J. L. L.; Jiang, M.; Waymire, R. Anal. Chim. Acta 1998, 375, 197.
37. Erdem, A.; Pividori, M.; del Vale, M.; Alegret, S. J. Electroanal. Chem. 2004, 567, 29.
38. Ozkan, D.; Erdem, A.; Kara, P.; Kerman, K.; Meric, B.; Hassmann, J.; Ozsoz, M. Anal. Chem. 2002, 74, 5931.
39. Wong, E. L. S.; Gooding, J. J. Anal. Chem. 2003, 75, 3845.
40. Kelley, S. O.; Boon, E. M.; Barton, J. K.; Jackson, N. M.; Hill, M. G. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 4830.
41. Boon, E. M.; Ceres, D. M.; Drummond, T. G.; Hill, M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1096.
42. Long, Y. T.; Li, C. Z.; Sutherland, T. C.; Kraatz, H. B.; Lee, J. S. Anal. Chem. 2004, 76, 4059.
43. Ozkan, D.; Erdem, A.; Kara, P.; Kerman, K; Gooding, J. J.; Nielsen, P. E.; Ozsoz, M. Electrochem. Commun. 2002, 4 (10), 796.
44. Ozsoz, M.; Erdem, A.; Kerman, K.; Ozkan, D.; Tugrul, B.; Topcuoglu, N.; Erken, H.; Taylan, M. Anal. Chem. 2003, 75, 2181.
45. Marrazza, G.; Chianella, I.; Macsini, M. Anal. Chim. Acta 1999, 387, 297.
46. Wang, J. Chem. Eur. J. 1999, 5 (6), 1681.
47. Thorp, H. H. TIBTECH 1998, 16, 117.
48. Wang, J.; Kawde, A.-N. Anal. Chim. Acta 2001, 431 (2), 219.
49. Marrazza, G.; Chiti, G.; Macsini, M.; Anichini, M. Clin. Chem. 2000, 46, 31.
50. Napier, M. E.; Thorp, H. H. Langmuir 1997, 13, 6342.
51. Minunni, M.; Tombelli, S.; Mariotti, E.; Macsini, M. Fresenius J. Anal. Chem. 2001, 369, 589.
52. Umek, R. M.; Lin, S. W.; Vielmetter, J.; Terbrueggen, R. H.; Irvine, B.; Yu, C. J.; Kayyem, J. F.; Yowanto, H.; Blackburn, G. F.; Farkas, D. H.; Chen, Y.-P. J. Mol. Diagn. 2001, 3, 74.
53. Erdem, A.; Kerman, K.; Meric, B.; Akarca, U. S.; Ozsoz, M. Anal. Chim. Acta 2000, 422 (2), 139.
54. Erdem, A.; Kerman, K.; Meric, B.; Akarca, U. S.; Ozsoz, M. Electroanalysis 1999, 11 (8), 586.
55. Meric, B.; Kerman, K.; Ozkan, D.; Kara, P.; Erensoy, S.; Akarca, U. S.; Mascini, M.; Ozsoz, M. Talanta 2002, 56, 837.
56. Ye, Y. K; Zhao, J. H.; Yan, F.; Zhu, Y. L.; Ju, X. H. Biosens. Bioelectron. 2003, 18, 1501.
57. Ju, H. X.; Ye, Y. K.; Zhao, J. H.; Zhu, Y. L. Anal. Biochem. 2003, 313, 255.
58. Ono, Y.; Onda, H.; Sasada, R.; Igarashi, K.; Sugino, Y.; Nishioka, K. subtype adr adw Nucleic Acids Res. 1983; p 1747.
59. Wang, J. Anal. Chim. Acta 2002, 469, 63.
60. Palecek, E.; Fojta, M. Anal. Chem. 1994, 66, 1566.