Intrinsic time- and wavelength-resolved fluorescence of oligonucleotides: A systematic investigation using a novel picosecond laser approach

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 15, 2000, Pages 3695-3704

  Plessow, Regina ^a   Brockhinke, Andreas ^a   Eimer, Wolfgang ^a   Kohse Höinghaus, Katharina ^a  

^a BIELEFELD UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANISOTROPY; FLUORESCENCE; LASER APPLICATIONS; MONOMERS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

BIOMOLECULES; OLIGONUCLEOTIDES;

DNA;

EID: 20644449036     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp994132u     Document Type: Article

References (56)

1. Georghiou, S.; Bradrick, T. D.; Philippetis, A.; Beechem, J. M. Biophys. J. 1996, 70, 1909.
2. Cain, R. J.; Click, G. D. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 836.
3. Guest, C. R.; Hochstrasser, R. A.; Sowers, L. C.; Millar, D. P. Biochemistry 1991, 30, 3271.
4. Winter, S.; Kirschstein, S.; Lober, G. Nudeosides Nucleotides 1997, 16, 531.
5. Genest, D.; Wahl, P. Biochim. Biophys. Acta 1978, 521, 502.
6. CoIIini, M.; Chirico, G.; Baldini, G.; Bianchi, M. E. Macromolecules 1998, 31, 695.
7. Barone, F.; Chirico, G.; Matzeu, M.; Mazzei, F.; Pedone, F. Eur. Biophys. J. 1998, 27, 137.
8. Manoharan, M.; Tivel, K. L.; Zhao, M.; Nafisi, K.; Netzel, T. L. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17461.
9. Yguerabide, J.; Talavera, E.; Alvarez, J. M.; Aflcir, M. Anal. Biochem. 1996, 241, 238.
10. Kumke, M. U.; Li. G.; McGown, L. B.; Walker, G. T.; Linn, C. P. Anal Chem. 1995, 67, 3945.
11. Ellouze, C.; Piot, F.; Takahashi, M. J. Biochem. 1997, 727, 521.
12. Várnosi, G.; Gohlke, C.; Clegg, R. M. Biophys. J. 1996, 71, 972.
13. Müller, R.; Herten, D. P.; Lieberwirth, U.; Neumann, M.; Sauer, M.; Schulz, A.; Siebert, S.; Drexhage, K. H.; Wolfrum, J. Chem. Phys. Lett. 1997, 279, 282.
14. Nunnally, B. K.; He, H.; Li, L. C.; Tucker, S. A.; McGown, L. B. Anal. Chem. 1997, 69, 2392.
15. Hawkins, M. E.; Pfleiderer, W.; Baus, F. M.; Porter, D.; Knutson, J. R. Anal. Biochem. 1997, 244, 86.
16. Lakowicz, J. R.; Gryczynski, I.; Malak, H.; Schrader, M.; Engelhardt, P.; Kano, H.; Hell, S. W. Biophys. J. 1997, 72, 567.
17. Dunkak, K. S.; Otto, M. R.; Beechem, J. M. Anal. Biochem. 1996, 243, 234.
18. Buist, A. H.; Muller, M.; Gijsbers, E. J.; Brakenhoff, G. J.; Sosnowski, T. S.; Norris, T. B.; Squier, J. J. Microsc..Oxford 1997, 186, 212.
19. Li, L. C.; He, H.; Nunnally, B. K.; McGown, L. B. J. Chromatogr. B 1997, 695, 85.
20. Deka, C.; Steinkamp, J. A. Appl. Opt. 1996, 55, 4481.
21. Keji, J. F.; Bell-Prince, C.; Steinkamp, J. A. Cytometry 1999, 35, 48.
22. Carlsson, C.; Larsson, A.; Björkman, M.; Jonsson, M.; Albinsson, B. Biopolymers 1997, 41, 481.
23. Broo, A. J. Phys. Chem. A 1998, 702, 526.
24. Ye, J. Y.; Yamauchi, M.; Yogi, O.; Ishikawa, M. J. Phys. Chem. 1999, 103, 2812.
25. Albinsson, B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 779, 6369.
26. Eisinger, J.; Guéron, M.; Shulman, R. G.; Yamane, T. Proc. Natl. Acad. Sci. 1966,55, 1015.
27. Eisinger, J.; Shulman, R. G. Science 1968,161, 1311.
28. Aoki, T. I.; Callis, P. R. Chem. Phys. Lett. 1982, 92, 327.
29. Callis, P. R. Annu. Rev. Phys. Chem. 1983, 34, 329.
30. Gömer, H. J. Photochem. Photobiol. B 1994, 26, 117.
31. Nikogosyan, D. N.; Angelov, D.; Soep, B.; Lindqvist, L. Chem. Phys. Lett. 1996, 252, 322.
32. Guéron, M.; Shulman, R. G.; Eisinger, J. Proc. Natl. Acad. Sci. 1966, 56, 814.
33. Guéron, M.; Eisinger, J.; Shulman, R. G. J. Chem. Phys. 1967,47, 4077.
34. Wilson, R. W.; Morgan, J. P.; Callis, P. R. Chem. Phys. Lett. 1975, 36, 618.
35. Hauswirth, W.; Daniels, M. Photochem. Photobiol. 1971,13, 157.
36. Vigny, P.; Favre, A. Photochem. Photobiol. 1974, 20, 345.
37. Morgan, J. P.; Daniels, M. Photochem. Photobiol. 1980, 31, 101.
38. Morgan, J. P.; Daniels, M. Photochem. Photobiol. 1980, 31, 207.
39. Wilson, R. W.; Callis, P. R. Photochem. Photobiol. J980,31, 323.
40. Kobayashi, S.; Yamashita, M.; Sato, T.; Muramatsu, S. IEEE J. Quantum Electron. 1984, QE-20, 1383.
41. Häupl, T.; Windolph, C.; Jochum, T.; Brede, O.; Hermann, R. Chem. Phys. Lett. 1997, 280, 520.
42. Reuther, A.; Nikogosyan, D. N.; Laubereau, A. / Phys. Chem. 1996, 700, 5570.
43. Press, W. H.; Flannery, B. P.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T. Numerical Recipes in C; Cambridge University Press: Cambridge, 1988.
44. Lakowicz, J. R. Topics in Fluorescence Spectroscopy; Plenum Press: New York, 1991; vol. 2: Principles.
45. Brand, L. Numerical Computer Methods. In Methods in Enzymology; Academic Press: New York, 1992; pp 36-54.
46. Jasuja, R.; Jameson, D. M.; Nishijo, C. K.; Larsen, R. W. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 1444.
47. Hof, M. Biochim. Biophys. Ada 1998, 1388, 143.
48. Dijkstra, D. S.; Broos, J.; Visser, A. J. W.; van Hoek, A.; Robillard, G. T. Biochemistry 1997, 36, 4860.
49. Hof, M.; Fleming, G. R.; Fidler, V. Proteins Struct. Func. Genet. 1996, 24, 485.
50. Roy, M.; Periasamy, N. Photochem. Photobiol. 1995, 67, 292.
51. Vincent, M.; Gallay, J.; Demchenko, A. P. J. Phys. Chem. 1995, 99, 14931.
52. Das, T. K.; Mazumdar, S. J. Phys. Chem. 1995, 99, 13283.
53. Livesey, A. K.; Brochon, A. K. Biophys. J. 1987, 52, 693.
54. Eisinger, J. Photochem. Photobiol. 1968, 7, 597.
55. Ge, G.; Georghiou, S. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 301; Ge, G.; Georghiou, S. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 477.
56. Georghiou, S.; Kubala, S. M.; Large, C. C. Photochem. Photobiol. 1998, 67, 526.