Advances in polymerase chain reaction on microfluidic chips

Analytical Chemistry

Volumn 77, Issue 12, 2005, Pages 3887-3893

  Roper, Michael G ^a   Easley, Christopher J ^a   Landers, James P ^a,b  

^a UNIVERSITY OF VIRGINIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF VIRGINIA HEALTH SYSTEM   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; GENE AMPLIFICATION; GENETIC ANALYSIS; MICROFLUIDICS; POLYMERASE CHAIN REACTION; REAL TIME POLYMERASE CHAIN REACTION; REVIEW;

GENOME, HUMAN; HUMANS; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; POLYMERASE CHAIN REACTION;

EID: 20544478458     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac050756m     Document Type: Review

References (46)

1. Venter, J. C.; Adams, M. D.; Myers, E. W.; Li, P. W.; Mural, R. J.; Sutton, G. G.; Smith, H. O.; Yandell, M.; Evans, C. A.; Holt, R. A.; Gocayne, J. D.; Amanatides, P.; Ballew, R. M.; Huson, D. H.; Wortman, J. R.; Zhang, Q.; Kodira, C. D.; Zheng, X. H.; Chen, L.; Skupski, M.; Subramanian, G.; Thomas, P. D.; Zhang, J.; Gabor Miklos, G. L.; Nelson, C.; Broder, S.; Clark, A. G.; Nadeau, J.; McKusick, V. A.; Zinder, N.; Levine, A. J.; Roberts, R. J.; Simon, M.; Slayman, C.; Hunkapiller, M.; Bolanos, R.; Delcher, A.; Dew, I.; Fasulo, D.; Flanigan, M.; Florea, L.; Halpern, A.; Hannenhalli, S.; Kravitz, S.; Levy, S.; Mobarry, C.; Reinert, K.; Remington, K.; Abu-Threideh, J.; Beasley, E.; Biddick, K.; Bonazzi, V.; Brandon, R.; Cargill, M.; Chandramouliswaran, I.; Charlab, R.; Chaturvedi, K.; Deng, Z.; Di Francesco, V.; Dunn, P.; Eilbeck, K.; Evangelista, C.; Gabrielian, A. E.; Can, W.; Ge, W.; Gong, F.; Gu, Z.; Guan, P.; Heiman, T. J.; Higgins, M. E.; Ji, R. R.; Ke, Z.; Ketchum, K. A.; Lai, Z.; Lei, Y.; Li, Z.; Li, J.; Liang, Y.; Lin, X.; Lu, F.; Merkulov, G. V.; Milshina, N.; Moore, H. M.; Naik, A. K.; Narayan, V. A.; Neelam, B.; Nusskern, D.; Rusch, D. B.; Salzberg, S.; Shao, W.; Shue, B.; Sun, J.; Wang, Z.; Wang, A.; Wang, X.; Wang, J.; Wei, M.; Wides, R.; Xiao, C.; Yan, C.; Yao, A.; Ye, J.; Zhan, M.; Zhang, W.; Zhang, H.; Zhao, Q.; Zheng, L.; Zhong, F.; Zhong, W.; Zhu, S.; Zhao, S.; Gilbert, D.; Baumhueter, S.; Spier, G.; Carter, C.; Cravchik, A.; Woodage, T.; Ali, F.; An, H.; Awe, A.; Baldwin, D.; Baden, H.; Barnstead, M.; Barrow, I.; Beeson, K.; Busam, D.; Carver, A.; Center, A.; Cheng, M. L.; Curry, L.; Danaher, S.; Davenport, L.; Desilets, R.; Dietz, S.; Dodson, K.; Doup, L.; Ferriera, S.; Garg, N.; Gluecksmann, A.; Hart, B.; Haynes, J.; Haynes, C.; Heiner, C.; Hladun, S.; Hostin, D.; Houck, J.; Rowland, T.; Ibegwam, C.; Johnson, J.; Kalush, F.; Kline, L.; Koduru, S.; Love, A.; Mann, F.; May, D.; McCawley, S.; McIntosh, T.; McMullen, L.; Moy, M.; Moy, L.; Murphy, B.; Nelson, K.; Pfannkoch, C.; Pratts, E.; Puri, V.; Qureshi, H.; Reardon, M.; Rodriguez, R.; Rogers, Y. H.; Romblad, D.; Ruhfel, B.; Scott, R.; Sitter, C.; Smallwood, M.; Stewart, E.; Strong, R.; Suh, E.; Thomas, R.; Tint, N. N.; Tse, S.; Vech, C.; Wang, G.; Wetter, J.; Williams, S.; Williams, M.; Windsor, S.; Winn-Deen, E.; Wolfe, K.; Zaveri, J.; Zaveri, K.; Abril, J. F.; Guigo, R.; Campbell, M. J.; Sjolander, K. V.; Karlak, B.; Kejariwal, A.; Mi, H.; Lazareva, B.; Hatton, T.; Narechania, A.; Diemer, K.; Muruganujan, A.; Guo, N.; Sato, S.; Bafna, V.; Istrail, S.; Lippert, R.; Schwartz, R.; Walenz, B.; Yooseph, S.; Allen, D.; Basu, A.; Baxendale, J.; Blick, L.; Caminha, M.; Carnes-Stine, J.; Caulk, P.; Chiang, Y. H.; Coyne, M.; Dahlke, C.; Mays, A.; Dombroski, M.; Donnelly, M.; Ely, D.; Esparham, S.; Fosler, C.; Gire, H.; Glanowski, S.; Classer, K.; Glodek, A.; Gorokhov, M.; Graham, K.; Gropman, B.; Harris, M.; Heil, J.; Henderson, S.; Hoover, J.; Jennings, D.; Jordan, C.; Jordan, J.; Kasha, J.; Kagan, L.; Kraft, C.; Levitsky, A.; Lewis, M.; Liu, X.; Lopez, J.; Ma, D.; Majores, W.; McDaniel, J.; Murphy, S.; Newman, M.; Nguyen, T.; Nguyen, N.; Nodell, M.; Pan, S.; Peck, J.; Peterson, M.; Rowe, W.; Sanders, R.; Scott, J.; Simpson, M.; Smith, T.; Sprague, A.; Stockwell, T.; Turner, R.; Venter, E.; Wang, M.; Wen, M.; Wu, D.; Wu, M.; Xia, A.; Zandieh, A.; Zhu, X. Science 2001, 291, 1304-1351.
2. Dovichi, N. Science 1999, 285, 1013.
3. Paegel, B. M.; Blazej, R. G.; Mathies, R. A. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 42-50.
4. Yeung, S. H. I.; Greenspoon, S. A.; Ban, J. D.; McGuckian, A.; Grouse, C.; Mathies, R. A. In preparation.
5. Saiki, R. K.; Scharf, S.; Faloona, F.; Mullis, K. B.; Horn, G. T.; Erlich, H. A.; Arnheim, N. Science 1985, 230, 1350-1354.
6. Millar, B. C.; Moore, J. E. Methods Mol. Biol. 2004, 266, 139-166.
7. (a) Oda, R. P.; Strausbauch, M. A.; Huhmer, A. F.; Borson, N.; Jurrens, S. R.; Craighead, J.; Wettstein, P. J.; Eckloff, B.; Kline, B.; Landers, J. P. Anal. Chem. 1998, 70, 4361-4368.
8. (b) Huhmer, A. F. R.; Landers, J. P. Anal. Chem. 2000, 72, 5507-5512.
9. (c) Giordano, B. C.; Copeland, E. R.; Landers, J. P. Electrophoresis 2001, 22, 334-340.
10. (d) Legendre, L. A.; Bienvenue, J. M.; Roper, M. G.; Ferrance, J.; Landers, J. P. In preparation.
11. (e) Giordano, B. C.; Ferrance, J.; Swedberg, S.; Huhmer, A. F.; Landers, J. P. Anal. Biochem. 2001, 291, 124-132.
12. Liu, R. H.; Grodzinski, P. A. J. Microlithogr., Microfabr., Microsyst. 2003, 2, 340-455.
13. Bilitewski, U.; Genrich, M.; Kadow, S.; Mersal, G. Anal. Bioanal. Chem. 2003, 377, 556-569.
14. Kricka, L. J.; Wilding, P. Anal. Bioanal. Chem. 2003, 377, 820-825.
15. Auroux, P. A.; Koc, Y.; deMello, A.; Manz, A.; Day, P. J. Lab Chip 2004, 4, 534-546.
16. Kelly, R. T.; Woolley, A. T. Anal. Chem. 2005, 77, 96A-102A.
17. Wilding, P. J.; Bau, H. H.; Zemel, J. N.; Shaffner, A. M.; Kricka, L. J. Clin. Chem. 1994, 40, 1815-1818.
18. Wilding, P.; Shoffner, M. A.; Cheng, J.; Huichia, G.; Kricka, L. J. Clin. Chem. (Washington, D. C.) 1995, 41, 1367-1368.
19. Burns, M. A.; Johnson, B. N.; Brahmasandra, S. N.; Handique, K.; Webster, J. R.; Krishnan, M.; Sammarco, T. S.; Man, P. M.; Jones, D.; Heldsinger, D.; Mastrangelo, C. H.; Burke, D. T. Science 1998, 282, 484-487.
20. Kopp, M. U.; Mello, A. J.; Manz, A. Science 1998, 280, 1046-1048.
21. Waters, L. C.; Jacobson, S. C.; Kroutchinina, N.; Khandurina, J.; Foote, R. S.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1998, 70, 158-162.
22. Lagally, E. T.; Emrich, C. A.; Mathies, R. A. Lab Chip 2001, 1, 102-107.
23. Liu, J.; Hansen, C.; Quake, S. R. Anal. Chem. 2003, 75, 4718-4723.
24. Koh, C. G.; Tan, W.; Zhao, M. Q.; Ricco, A. J.; Fan, Z. H. Anal. Chem. 2003, 75, 4591-4598.
25. Matsubara, Y.; Kerman, K.; Kobayashi, M.; Yamamura, S.; Morita, Y.; Takamura, Y.; Tamiya, E. Anal. Chem. 2004, 76, 6434-6439.
26. Lagally, E. T.; Scherer, J. R.; Blazej, R. G.; Toriello, N. M.; Diep, B. A.; Ramchandani, M.; Sensabaugh, G. F.; Riley, L. W.; Mathies, R. A. Anal. Chem. 2004, 76, 3162-3170.
27. Lee, D. S.; Park, S. H.; Yang, H.; Chung, K. H.; Yoon, T. H.; Kim, S. J.; Kim, K.; Kim, Y. T. Lab Chip 2004, 4, 401-407.
28. Guttenberg, Z.; Muller, H.; Habermuller, H.; Geisbauer, A.; Pipper, J.; Felbel, J.; Kielpinski, M.; Scriba, J.; Wixforth, A. Lab Chip 2005, 5, 308-317.
29. Pal, R.; Yang, M.; Johnson, B. N.; Burke, D. T.; Burns, M. A. Anal. Chem. 2004, 76, 3740-3748.
30. Hashimoto, M.; Chen, P. C.; Mitchell, M. W.; Nikitopoulos, D. E.; Soper, S. A.; Murphy, M. C. Lab Chip 2004, 4, 638-645.
31. Obeid, P. J.; Christopoulos, T. K.; Crabtree, H. J.; Backhouse, C. J. Anal. Chem. 2003, 75, 288-295.
32. Chen, J.; Wabuyele, M.; Chen, H.; Patterson, D.; Hupert, M.; Shadpour, H.; Nikitopoulos, D.; Soper, S. A. Anal. Chem. 2005, 77, 658-666.
33. Krishnan, M.; Agrawal, N.; Burns, M. A.; Ugaz, V. M. Anal. Chem. 2004, 76, 6254-6265.
34. Chen, Z.; Qian, S.; Abrams, W. R.; Malamud, D.; Bau, H. H. Anal. Chem. 2004, 76, 3707-3715.
35. Guijt, R. M.; Dodge, A.; van Dedem, G. W.; de Rooij, N. F.; Verpoorte, E. Lab Chip 2003, 3, 1-4.
36. Park, T.; Lee, S.; Seong, G. H.; Choo, J.; Lee, E. K.; Kim, Y. S.; Ji, W. H.; Hwang, S. Y.; Gweon, D. G. Lab Chip 2005, 5, 437-442.
37. Legally, E. T.; Medintz, I.; Mathies, R. A. Anal. Chem. 2001, 73, 565-570.
38. Hughesab, S.; Arnesona, N.; Donea, S.; Squirea, J. J. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2005, 88, 173-189.
39. Lasken, R. S.; Egholm, M. Trends Biotechnol. 2003, 21, 531-535.
40. Obeid, P. J.; Christopoulos, T. K. Anal. Chim. Acta 2003, 494, 1-9.
41. Liu, R. H.; Yang, J.; Lenigk, R.; Bonanno, J.; Grodzinski, P. Anal. Chem. 2004, 76, 1824-1831.
42. Panano, N. J.; Lou, X. J.; Fortina, P.; Kricka, L. J.; Wilding, P. Biomol. Eng. 2005, 21, 157-162.
43. Zhou, X.; Liu, D.; Zhong, R.; Dai, Z.; Wu, D.; Wang, H.; Du, Y.; Xia, Z.; Zhang, L.; Mei, X.; Lin, B. Electrophoresis 2004, 25, 3032-3039.
44. Rodriguez, I.; Lesaicherre, M.; Tie, Y.; Zou, Q.; Yu, C.; Singh, J.; Meng, L. T.; Uppili, S.; Li, S. F.; Gopalakrishnakone, P.; Selvanayagam, Z. E. Electrophoresis 2003, 24, 172-178.
45. Lee, T. M.; Carles, M. C.; Hsing, I. M. Lab Chip 2003, 3, 100-105.
46. Liu, J.; Enzelberger, M.; Quake, S. Electrophoresis 2002, 23, 1531-1536.