Prominent roles of the NorR and Fur regulators in the Escherichia coli transcriptional response to reactive nitrogen species

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 101, Issue 3, 2004, Pages 745-750

  Mukhopadhyay, Partha ^a   Zheng, Ming ^b   Bedzyk, Laura A ^b   LaRossa, Robert A ^b   Storz, Gisela ^a  

^a EUNICE KENNEDY SHRIVER NATIONAL INSTITUTE OF CHILD HEALTH AND HUMAN DEVELOPMENT   (United States)

^b DUPONT COMPANY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYSTEINE; GLUTATHIONE; HYDROGEN PEROXIDE; REACTIVE NITROGEN SPECIES; SODIUM NITRITE; TRANSCRIPTION FACTOR;

ARTICLE; ESCHERICHIA COLI; FUR GENE; GENE CONTROL; GENE INDUCTION; IRON TRANSPORT; NONHUMAN; NORR GENE; OXYR GENE; PRIORITY JOURNAL; REGULATOR GENE; SEQUENCE HOMOLOGY; SOXR GENE; TRANSCRIPTION REGULATION; WAUTERSIA EUTROPHA;

BACTERIAL PROTEINS; ESCHERICHIA COLI; ESCHERICHIA COLI PROTEINS; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION, BACTERIAL; GENES, BACTERIAL; GENES, REGULATOR; NITRIC OXIDE DONORS; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; OXIDATION-REDUCTION; REACTIVE NITROGEN SPECIES; REPRESSOR PROTEINS; TRANSCRIPTION FACTORS; TRANSCRIPTION, GENETIC;

ESCHERICHIA COLI; RALSTONIA; WAUTERSIA EUTROPHA;

EID: 1642514907     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0307741100     Document Type: Article

References (51)

1. Alderton, W. K., Cooper, C. E. & Knowles, R. G. (2001) Biochem. J. 357, 593-615.
2. Nathan, C. (2003) J. Clin. Invest. 111, 769-778.
3. Nathan, C. & Shiloh, M. U. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 8841-8848.
4. Ignarro, L. J. (1999) Biosci. Rep. 19, 51-71.
5. Poole, R. K. & Hughes, M. N. (2000) Mol. Microbiol. 36, 775-783.
6. Wink, D. A. & Mitchell, J. B. (1998) Free Radical Biol. Med. 25, 434-456.
7. De Groote, M. A., Testerman, T., Xu, Y., Stauffer, G. & Fang, F. C. (1996) Science 272, 414-417.
8. Crawford, M. J. & Goldberg, D. E. (1998) J. Biol. Chem. 273, 12543-12547.
9. Gardner, P. R., Gardner, A. M., Martin, L. A. & Salzman, A. L. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 10378-10383.
10. Hausladen, A., Gow, A. J. & Stamler, J. S. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 14100-14105.
11. Membrillo-Hernandez, J., Coopamah, M. D., Anjum, M. F., Stevanin, T. M., Kelly, A., Hughes, M. N. & Poole, R. K. (1999) J. Biol. Chem. 274, 748-754.
12. Kim, S. O.; Orii, Y., Lloyd, D., Hughes, M. N. & Poole, R. K. (1999) FEBS Lett. 445, 389-394.
13. Hausladen, A., Gow, A. & Stamler, J. S. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 10108-10112.
14. Gardner, A. M. & Gardner, P. R. (2002) J. Biol. Chem. 277, 8166-8171.
15. Gardner, A. M., Helmick, R. A. & Gardner, P. R. (2002) J. Biol. Chem. 277, 8172-8177.
16. Hutchings, M. I., Mandhana, N. & Spiro, S. (2002) J. Bacteriol. 184, 4640-4643.
17. Poock, S. R., Leach, E. R., Moir, J. W., Cole, J. A. & Richardson, D. J. (2002) J. Biol. Chem. 277, 23664-23669.
18. Liu, L., Hausladen, A., Zeng, M., Que, L., Heitman, J. & Stamler, J. S. (2001) Nature 410, 490-494.
19. Bryk, R., Griffin, P. & Nathan, C. (2000) Nature 407, 211-215.
20. St. John, G., Brot, N., Ruan, J., Erdjument-Bromage, H., Tempst, P., Weissbach, H. & Nathan, C. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 9901-9906.
21. Pohlmann, A., Cramm, R., Schmelz, K. & Friedrich, B. (2000) Mol. Microbiol. 38, 626-638.
22. Gardner, A. M., Gessner, C. R. & Gardner, P. R. (2003) J. Biol. Chem. 278, 10081-10086.
23. Membrillo-Hernandez, J., Coopamah, M. D., Channa, A., Hughes, M. N. & Poole, R. K. (1998) Mol. Microbiol. 29, 1101-1112.
24. Cruz-Ramos, H., Crack, J., Wu, G., Hughes, M. N., Scott, C., Thomson, A. J., Green, J. & Poole, R. K. (2002) EMBO J. 21, 3235-3244.
25. Crawford, M. J. & Goldberg, D. E. (1998) J. Biol. Chem. 273, 34028-34032.
26. Nunoshiba, T., DeRojas-Walker, T., Wishnok, J. S., Tannenbaum, S. R. & Demple, B. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 9993-9997.
27. Hausladen, A., Privalle, C. T., Keng, T., DeAngelo, J. & Stamler, J. S. (1996) Cell 86, 719-729.
28. Zheng, M., Aslund, F. & Storz, G. (1998) Science 279, 1718-1721.
29. Choi, H., Kim, S., Mukhopadhyay, P., Cho, S., Woo, J., Storz, G. & Ryu, S. (2001) Cell 105, 103-113.
30. Kim, S. O., Merchant, K., Nudelman, R., Beyer, W. F., Jr., Keng, T., DeAngelo, J., Hausladen, A. & Stamler, J. S. (2002) Cell 109, 383-396.
31. Rhodius, V., Van Dyk, T. K., Gross, C. & LaRossa, R. A. (2002) Annu. Rev. Microbiol. 56, 599-624.
32. Zheng, M., Wang, X., Templeton, L. J., Smulski, D. R., LaRossa, R. A. & Storz, G. (2001) J. Bacteriol. 183, 4562-4570.
33. Touati, D., Jacques, M., Tardat, B., Bouchard, L. & Despied, S. (1995) J. Bacteriol. 177, 2305-2314.
34. Greenberg, J. T., Monach, P., Chou, J. H., Josephy, P. D. & Demple, B. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 6181-6185.
35. Yu, D., Ellis, H. M., Lee, E. C., Jenkins, N. A., Copeland, N. G. & Court, D. L. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 5978-5983.
36. Datsenko, K. A. & Wanner, B. L. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 6640-6645.
37. Stamler, J. S. & Loscalzo, J. (1992) Anal. Chem. 64, 779-785.
38. Smulski, D. R., Huang, L. L., McCluskey, M. P., Reeve, M. J., Vollmer, A. C., Van Dyk, T. K. & LaRossa, R. A. (2001) J. Bacteriol. 183, 3353-3364.
39. Wei, Y., Lee, J. M., Richmond, C., Blattner, F. R., Rafalski, J. A. & LaRossa, R. A. (2001) J. Bacteriol. 183, 545-556.
40. Zhang, A., Altuvia, S., Tiwari, A., Argaman, L., Hengge-Aronis, R. & Storz, G. (1998) EMBO J. 17, 6061-6068.
41. Wassarman, K. M. & Storz, G. (2000) Cell 101, 613-623.
42. Poole, R. K., Anjum, M. F., Membrillo-Hernandez, J., Kim, S. O., Hughes, M. N. & Stewart, V. (1996) J. Bacteriol. 178, 5487-5492.
43. Voskuil, M. I., Schnappinger, D., Visconti, K. C., Harrell, M. I., Dolganov, G. M., Sherman, D. R. & Schoolnik, G. K. (2003) J. Exp. Med. 198, 705-713.
44. McHugh, J. P., Rodriguez-Quinones, F., Abdul-Tehrani, H., Svistunenko, D. A., Poole, R. K., Cooper, C. E. & Andrews, S. C. (2003) J. Biol. Chem. 278, 29478-29486.
45. Zheng, M., Doan, B., Schneider, T. D. & Storz, G. (1999) J. Bacteriol. 181, 4639-4643.
46. Elowitz, M. B. & Leibler, S. (2000) Nature 403, 335-338.
47. Hoffmann, A., Levchenko, A., Scott, M. L. & Baltimore, D. (2002) Science 298, 1241-1245.
48. Atkinson, M. R., Savageau, M. A., Myers, J. T. & Ninfa, A. J. (2003) Cell 113, 597-607.
49. Hemish, J., Nakaya, N., Mittal, V. & Enikolopov, G. (2003) J. Biol. Chem. 273, 42321-42329.
50. D'Autreaux, B., Touati, D., Bersch, B., Latour, J. M. & Michaud-Soret, I. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 16619-16624.
51. Ding, H. & Demple, B. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 5146-5150.