Design of a New Mimochrome with Unique Topology

Chemistry - A European Journal

Volumn 9, Issue 22, 2003, Pages 5643-5654

  Lombardi, Angela ^a   Nastri, Flavia ^a   Marasco, Daniela ^a   Maglio, Ornella ^a,d   De Sanctis, Giampiero ^b   Sinibaldi, Federica ^c   Santucci, Roberto ^c   Coletta, Massimo ^c   Pavone, Vincenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

^b UNIVERSITY OF CAMERINO   (Italy)

^c UNIVERSITY OF ROME TOR VERGATA   (Italy)

^d CNR   (Italy)

Author keywords

Helical structures; Heme proteins; Miniaturized metalloproteins; NMR spectroscopy; Protein design

Indexed keywords

CHARACTERIZATION; COBALT; CONFORMATIONS; ISOMERS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; SPECTROSCOPIC ANALYSIS; STEREOCHEMISTRY; SYNTHESIS (CHEMICAL); TOPOLOGY;

PROTEIN MATRIX;

PROTEINS;

COBALT COMPLEX; HEME; METALLOPROTEIN; PORPHYRIN DERIVATIVE;

ARTICLE; MAGNETISM; MODULATION; MOLECULAR INTERACTION; MOLECULAR MODEL; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN CONFORMATION; STEREOCHEMISTRY; STEREOISOMERISM; STRUCTURE ANALYSIS; SYNTHESIS;

COBALT; ISOMERISM; METALLOPROTEINS; MODELS, MOLECULAR; OXIDATION-REDUCTION; PEPTIDES; PROTEIN CONFORMATION;

EID: 0347088993     PISSN: 09476539     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.200304831     Document Type: Article

References (60)

1. a) S. J. Lippard, J. M. Berg, Principles of Bioinorganic Chemistry, University Science Books, Mill Valley, CA, 1994;
2. b) R. H. Holm, P. Kennepohl, E. I. Solomon, Chem. Rev. 1996, 96, 2239-2314.
3. a) K. D. Karlin, Science 1993, 261, 701-708;
4. b) Y. Lu, S. M. Berry, T. D. Pfisterand, Chem. Rev. 2001, 101, 3047-3080.
5. a) H. W. Hellinga, Folding Des. 1998, 3, R1-R8;
6. b) W. F. DeGrado, C. M. Summa, V. Pavone, F. Nastri, A. Lombardi, Annu. Rev. Biochem. 1999, 68, 779-819;
7. c) L. Regan, Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 280-285;
8. d) L. Baltzer, Top. Curr. Chem. 1999, 202, 39-75;
9. e) D. A. Moffet, M. H. Hecht, Chem. Rev. 2001, 101, 3191-3203.
10. a) F. Nastri, A. Lombardi, L. D. D'Andrea, M. Sanseverino, O. Maglio, V. Pavone, Biopolymers 1998, 47, 5-22;
11. b) A. Lombardi, F. Nastri, V. Pavone, Chem. Rev. 2001, 101, 3165-3189.
12. a) F. Nastri, A. Lombardi, G. Morelli, O. Maglio, G. D'Auria, C. Pedone, V. Pavone, Chem. Eur. J. 1997, 3, 340-349;
13. b) G. D'Auria, O. Maglio, F. Nastri, A. Lombardi, M. Mazzeo, G. Morelli, L. Paolillo, C. Pedone, V. Pavone, Chem. Eur. J. 1997, 3, 350-362;
14. c) F. Nastri, A. Lombardi, G. Morelli, C. Pedone, V. Pavone, G. Chottard, P. Battioni, D. J. Mansuy, J. Biol. Inorg. Chem. 1998, 3, 671-681;
15. d) A. Lombardi, F. Nastri, M. Sanseverino, O. Maglio, C. Pedone, V. Pavone, Inorg. Chim. Acta 1998, 275-276, 301-313.
16. a) A. Lombardi, C. M. Summa, S. Geremia, L. Randaccio, V. Pavone, W. F. DeGrado, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 6298-6305;
17. b) A. Lombardi, D. Marasco, O. Maglio, L. Di Costanzo, F. Nastri, V. Pavone, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 11922-11927.
18. a) D. R. Benson, B. R. Hart, X. Zhu, M. B. Doughty, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8502-8510;
19. b) D. Liu, D. A. Williamson, M. L. Kennedy, T. D. Williams, M. M. Morton, D. R. Benson, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11798-11812;
20. c) P. A. Arnold, D. R. Benson, D. J. Brink, M. P. Hendrich, G. S. Jas, M. L. Kennedy, D. T. Petasis, M. Wang, Inorg. Chem. 1997, 36, 5306-5315.
21. a) P. A. Arnold, W. R. Shelton, D. R. Benson, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3181-3182;
22. b) S. Sakamoto, A. Ueno, H. Mihara, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1998, 2395-2404;
23. c) S. Sakamoto, I. Obataya, A. Ueno, H. Mihara, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1999, 2059-2069;
24. d) M. M. Rosenblatt, D. L. Huffman, X. Wang, H. A. Remmer, K. S. Suslick, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12394-12395.
25. a) H. K. Rau, W. Haehnel, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 468-476;
26. b) H. K. Rau, N. DeJonge, W. Haehnel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 11526-11531;
27. c) H. K. Rau, N. DeJonge, W. Haehnel, Angew. Chem. 2000, 112, 256-259; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 250-253.
28. c) H. K. Rau, N. DeJonge, W. Haehnel, Angew. Chem. 2000, 112, 256-259; Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 250-253.
29. a) D. E. Robertson, R. S. Farid, C. C. Moser, J. L. Urbauer, S. E. Mulholland, R. Pidikiti, J. D. Lear, A. J. Wand, W. F. DeGrado, P. L. Dutton, Nature 1994, 368, 425-432;
30. b) J. M. Shifman, C. C. Moser, W. A. Kalsbeck, D. F. Bocian, P. L. Dutton, Biochemistry 1998, 37, 16815-16827;
31. c) J. M. Shifman, B. R. Gibney, R. E. Sharp, P. L. Dutton, Biochemistry 2000, 39, 14813-14821;
32. d) B. R. Gibney, P. L. Dutton, Protein Sci. 1999, 8, 1888-1898.
33. J. W. Bryson, S. F. Betz, H. S. Lu, D. J. Suich, H. X. Zhou, K. T. O'Neil, W. F. DeGrado, Science 1995, 270, 935-940.
34. J. W. Buchler in The Porphyrin, Vol. 1 (Ed.: D. Dolphin), Academic Press, New York, 1979, pp. 389-483.
35. a) A. W. Johnson, I. T. Kay, J. Chem. Soc. 1960, 2979-2983;
36. b) M. Momenteau, D. Lexa, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1974, 58, 940-944;
37. c) R. Bonnet, M. J. Dimsdale, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1 1972, 2540-2548.
38. M. L. Kennedy, S. Silchenko, N. Houndonougbo, B. R. Gibney, P. L. Dutton, K. R. Rodgers, D. R. Benson, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4635-4636.
39. P. Luo, R. L. Baldwin, Biochemistry 1997, 36, 8413-8421.
40. J. Jeener, B. H. Meier, P. Backman, R. R. Ernst, J. Chem. Phys. 1979, 71, 4546-4553.
41. A. Bax, D. G. Davis, J. Magn. Reson. 1985, 65, 355-360.
42. U. Piantini, O. W. Sorensen, R. R. Ernst, J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 6800-6801.
43. K. Wüthrich, NMR of Proteins and Nucleic Acids, Wiley, New York, 1986.
44. D. S. Wishart, B. D. Sikes, F. M. Richards, J. Mol. Biol. 1991, 222, 311-333.
45. R. D. Guiles, J. Altman, I. D. Kuntz, L. Waskell, Biochemistry 1990, 29, 1276-1289.
46. R. Santucci, C. Bongiovanni, S. Marini, R. Del Conte, M. Tien, L. Banci, M. Coletta, Biochem. J. 2000, 349, 85-90.
47. a) V. Palaniappan, D. F. Bocian, Biochemistry 1994, 33, 14264-14274;
48. b) M. Coletta, H. Costa, G. De Sanctis, F. Neri, G. Smulevich, D. L. Turner, H. Santos, J. Biol. Chem. 1997, 272, 24800-24804.
49. S. Vuilleumier, M. Mutter, Biopolymers 1993, 33, 389-400.
50. M. Nakano, H. Iwamaru, T. Tobita, Biopolymers 1982, 21, 805-815.
51. J. S. Valentine, R. P. Sheridan, L. C. Allen, P. C. Kahn, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1979, 76, 1009-1013.
52. a) H. Bang, J. O. Edwards, J. Kim, R. G. Lawler, K. Reynolds, W. J. Ryan, D. A. Sweigart, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 2843-2852;
53. b) M. Nakamura, A. Ikezaki, Chem. Lett. 1995, 733-734;
54. c) C. J. Medforth, C. M. Muzzi, K. M. Shea, K. M. Smith, R. J. Abraham, S. Jia, J. A. Shelnutt, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1997, 833-837.
55. A. Feis, M. P. Marzocchi, M. Paoli, G. Smulevich, Biochemistry 1994, 33, 4577-4583.
56. J. D. Winefordner, A Practical Guide to Graphite Furnace Atomic Absorption Spectrometry, Chemical Analysis, Vol. 149, Wiley, NY, 1998.
57. D. Marion, K. Wüthrich, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1983, 113, 967-974.
58. F. Delaglio, S. Grzesiek, G. W. Vuister, G. Zhu, J. Pfeifer, A. Bax, J. Biomol. NMR 1995, 6, 277-293.
59. C. Bartels, T. Xia, M. Billeter, P. Guntert, K. Wüthrich, J. Biomol. NMR 1995, 5, 1-10.
60. S. Barlow, A. L. Rohl, S. Shi, C. M. Freeman, D. O'Hare, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7578-7592.