Quantifying the Role of Water in Protein - Carbohydrate Interactions

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 107, Issue 43, 2003, Pages 9175-9181

  Tschampel, Sarah M ^a   Woods, Robert J ^a  

^a UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

LIGANDS;

AMINO ACIDS; BINDING ENERGY; HYDROGEN BONDS; METHANOL; PROTEINS; QUANTUM THEORY; SOLVENTS; X RAY DIFFRACTION ANALYSIS;

CARBOHYDRATES;

EID: 0242524430     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp035027u     Document Type: Article

References (53)

1. Swaminathan, C. P.; Surolia, N.; Surolia, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5153-5159.
2. Clarke, C.; Woods, R. J.; Gluska, J.; et al. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12238-12247.
3. Safo, M. K.; Moure, C. M.; Burnett, J. C.; et al. Protein Sci. 2001, 10, 951-957.
4. Brandi, M.; Meyer, M.; Suhnel, J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11177-11187.
5. Loris, R.; Maes, D.; Poortmans, F.; et al. J. Biol. Chem. 1996, 271, 30614-30618.
6. Naismith, J. H.; Field, R. A. J. Biol Chem. 1996, 271, 972-976.
7. Viant, M. R.; Cruzan, J. D.; Lucas, D. D.; et al. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 9032-9041.
8. Keutsch, F. N.; Saykally, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10533-10540.
9. Cruzan, J. D.; Viant, M. R.; Brown, M. G.; et al. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 9022-9031.
10. Cruzan, J. D.; Braly, L. B.; Liu, K.; et al. Science 1996, 271, 59-62.
11. Wales, D. J.; Walsh, R. R. J. Chem. Phys. 106, 106, 7193-7207.
12. Graf, S.; Leutwyler, S. J. Chem. Phys. 1998, 709, 5393-5403.
13. Xantheas, S. S.; Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1993, 98, 8037-8040.
14. Lee, H. M.; Suh, S. B.; Lee, J. Y.; et al. J. Chem. Phys. 2000, 112, 9759-9772.
15. Nielsen, I. M. B.; Seidl, E. T.; Janssen, C. L. J. Chem. Phys. 1999, 110, 9435-9442.
16. Xantheas, S. S.; Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1993, 99, 8774-8792.
17. Klopper, W.; van Duijneveldt-van de Rijdt, J. G. C. M.; van Duijneveldt, F. B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 2227-2234.
18. Khan, A. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5537-5540.
19. Kirschner, K. N.; Woods, R. J. J. Phys. Chem. A 2001, 705, 4150-4155.
20. Peterson, K. A.; Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1995, 702, 2032-2041.
21. Gonzalez, L.; Mo, O.; Yanez, M. 7. Chem. Phys. 1998, 709, 139-150.
22. Mo, O.; Yanez, M.; Elguero, J. J. Chem. Phys. 1992, 97, 6628-6638.
23. Xantheas, S. S.; Burnham, C. J.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 2002, 776, 1493-1499.
24. Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 1994, 700, 7523-7534.
25. Del Bene, J. E.; Jordan, M. J. T. J. Mol. Struct. 2001, 573, 11-23.
26. Lozynski, M.; Rusinska-Roszak, D.; Mack, H.-G. J. Phys. Chem. A 1998, 702, 2899-2903.
27. Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 1995, 102, 4505-4517.
28. Dkhissi, A.; Ramaekers, R.; Houben, L.; et al. Chem. Phys. Lett. 2000, 331, 553-560.
29. Milet, A.; Korona, T.; Moszynski, R.; et al. J. Chem. Phys. 1999, 111, 7727-7735.
30. Wang, Y. S.; Chang, H. C.; Jiang, J. C.; et al. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8777-8788.
31. Del Bene, J. E.; Person, W. B.; Szczepaniak, K. J. Phys. Chem. 1995, 99, 10705-10707.
32. Smith, E. E.; Goldstein, I. J. Arch. Biochem. Biophys. 1967, 121, 88.
33. Bradbrook, G. M.; Gleichmann, T.; Harrop, S. J.; et al. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1998, 94, 1603-1611.
34. Naismith, J. H.; Emmerich, C.; Habash, J.; et al. Acta Crystallogr. D 1994, 50, 847-858.
35. Mandai, D. K.; Kishore, N.; Brewer, C. F. Biochemistry 1994, 33, 1149-1156.
36. Bryce, R. A.; Hillier, I. H.; Naismith, J. H. Biophys. J. 2001, 81, 1373-1388.
37. Mandai, D. K.; Bhattacharyya, L.; Koenig, S. H.; et al. Biochemistry 1994, 33, 1157-1162.
38. Schwarz, F. P.; Puri, K. D.; Bhat, R. G.; et al. J. Biol. Chem. 1993, 268, 7668-7677.
39. Soper, A. K.; Finney, J. L. Phys. Rev. Lett. 1993, 71, 4346-4349.
40. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.
41. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
42. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; et al. Gaussian 98, (Revision A.9); Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
43. Carney, J. R.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9943-9957.
44. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553-566.
45. Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8821-8824.
46. Xantheas, S. S. Chem. Phys. 2000, 258, 225-231.
47. Parra, R. D.; Furukawa, M.; Gong, B.; et al. J. Chem. Phys. 2001, 115, 6030-6035.
48. Kim, K.-Y.; Cho, U.-I.; Boo, D. W. Bull. Korean Chem. Soc. 2001, 22, 597-604.
49. Chaudhuri, C.; Wang, Y. S.; Jiang, J. C.; et al. Mol. Phys. 2001, 99, 1161-1173.
50. Jiang, J. C.; Wang, Y. S.; Chang, H. C.; et al. J. Am. Chem. Soc. 2000, 722, 1398-1410.
51. Garcia-Hernandez, E.; Hernandez-Arana, A. Protein Sci. 1999, 8, 1075-1086.
52. Scheiner, S. Basis Set Superposition. In Hydrogen bonding a theoretical perspective; Truhlar, D. G., Ed.; Oxford University Press: New York, 1997; pp 23-26.
53. Curtiss, L. A.; Blander, M. Chem. Rev. 1988, 88, 827-841.