Proteome of Haemophilus ducreyi by 2-D SDS-PAGE and Mass Spectrometry: Strain Variation, Virulence, and Carbohydrate Expression

Journal of Proteome Research

Volumn 2, Issue 5, 2003, Pages 523-533

  Scheffler, N Karoline ^a   Falick, Arnold M ^b   Hall, Steven C ^b   Ray, William C ^c   Post, Deborah M ^a   Munson Jr , Robert S ^c   Gibson, Bradford W ^a  

^a BUCK INSTITUTE FOR RESEARCH ON AGING   (United States)

^b APPLIED BIOSYSTEMS   (United States)

^c OHIO STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Blast search; Carbohydrates; Genomes; Haemophilus ducreyi; Haemophilus influenzae; Lipooligosaccharide; Mass spectrometry; Proteome; Virulence

Indexed keywords

PROTEOME;

ARTICLE; BACTERIAL GENOME; BACTERIAL VIRULENCE; BACTERIUM CULTURE; BACTERIUM MUTANT; GENE EXPRESSION; HAEMOPHILUS DUCREYI; HAEMOPHILUS INFLUENZAE; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEOMICS; STRAIN DIFFERENCE; TWO DIMENSIONAL GEL ELECTROPHORESIS;

CARBOHYDRATE METABOLISM; CARBOHYDRATE SEQUENCE; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; DATABASES, PROTEIN; ELECTROPHORESIS, POLYACRYLAMIDE GEL; GENE DELETION; GENES, BACTERIAL; GENOME, BACTERIAL; HAEMOPHILUS DUCREYI; HAEMOPHILUS INFLUENZAE; LIPOPOLYSACCHARIDES; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDE MAPPING; PROTEOME; VARIATION (GENETICS); VIRULENCE;

BACTERIA (MICROORGANISMS); HAEMOPHILUS; HAEMOPHILUS DUCREYI; HAEMOPHILUS INFLUENZAE;

EID: 0242401990     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr0340025     Document Type: Article

References (61)

1. Trees, D. L.; Morse, S. A. Clin. Microbiol. Rev. 1995, 8, 357-375.
2. Mertz, K. J.; Trees, D.; Levine, W. C.; Lewis, J. S.; Litchfield, B.; Pettus, K. S.; Morse, S. A.; St Louis, M. E.; Weiss, J. B.; Schwebke, J.; Dickes, J.; Kee, R.; Reynolds, J.; Hutcheson, D.; Green, D.; Dyer, I.; Richwald, G. A.; Novotny, J.; Weisfuse, I.; Goldberg, M.; O'Donnell, J. A.; Knaup, R. J. Infect. Dis. 1998, 178, 1795-1798.
3. Flood, J. M.; Sarafian, S. K.; Bolan, G. A.; Lammel, C.; Engelman, J.; Greenblatt, R. M.; Brooks, G. F.; Back, A.; Morse, S. A. J. Infect. Dis. 1993, 167, 1106-1111.
4. Schulte, J. M.; Martich, F. A.; Schmid, G. P. Mor. Mortal Wkly. Rep. CDC Surveill. Summ. 1992, 41, 57-61.
5. Spinola, S. M.; Bauer, M. E.; Munson, Jr., R. S. Infect. Immun. 2002, 70, 1667-1676.
6. Elkins, C.; Morrow, K. J., Jr.; Olsen, B. Infect. Immun. 2000, 68, 1608-1619.
7. Spinola, S. M.; Hiltke, T. J.; Fortney, K.; Shanks, K. L. Infect. Immun. 1996, 64, 1950-1955.
8. Elkins, C. Infect. Immun. 1995, 63, 1241-1245.
9. Stevens, M. K.; Porcella, S.; Klesney, T. J.; Lumbley, S.; Thomas, S. E. ; Norgard, M. V.; Radolf, J. D.; Hansen, E. J. Infect. Immun. 1996, 64, 1724-1735.
10. Cope, L. D.; Lumbley, S.; Latimer, J. L.; Klesney-Tait, J.; Stevens, M. K.; Johnson, L. S.; Purven, M.; Munson, R. S., Jr.; Lagergard, T.; Radolf, J. D.; Hansen, E. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997, 94, 4056-4061.
11. Cortes-Bratti, X.; Chaves-Olarte, E.; Lagergard, T.; Thelestam, M. J. Clin. Invest. 1999, 103, 107-115.
12. Frisk, A.; Ison, C. A.; Lagergard, T. Infect. Immun. 1998, 66, 1252-1257.
13. Ward, C. K.; Lumbley, S. R.; Latimer, J. L.; Cope, L. D.; Hansen, E. J. J. Bacteriol. 1998, 180, 6013-6022.
14. Alfa, M. J.; DeGagne, P.; Totten, P. A. Infect. Immun. 1996, 64, 2349-2352.
15. Palmer, K. L.; Munson, R. S., Jr. Mol. Microbiol. 1995, 18, 821-830.
16. Palmer, K. L.; Thornton, A. C.; Fortney, K. R.; Hood, A. F.; Munson, R. S., Jr.; Spinola, S. M. J. Infect. Dis. 1998, 178, 191-199.
17. Alfa, M. J. J. Med. Microbiol. 1992, 37, 43-50.
18. Campagnari, A. A.; Wild, L. M.; Griffiths, G. E.; Karalus, R. J.; Wirth, M. A.; Spinola, S. M. Infect. Immun. 1991, 59, 2601-2608.
19. Hobbs, M. M.; Paul, T. R.; Wyrick, P. B.; Kawula, T. H. Infect. Immun. 1998, 66, 2914-2921.
20. Alfa, M. J.; DeGagne, P. Microb. Pathog. 1997, 22, 39-46.
21. Brentjens, R. J.; Spinola, S. M.; Campagnari, A. A. Microb. Pathog. 1994, 16, 243-247.
22. Frisk, A.; Lagergard, T. Apmis 1998, 106, 539-546.
23. Lammel, C. J.; Dekker: N. P.; Palefsky, J.; Brooks, G. F. J. Infect. Dis. 1993, 167, 642-650.
24. Melaugh, W.; Phillips, N. J.; Campagnari, A. A.; Karalus, R.; Gibson, B. W. J. Biol. Chem. 1992, 267, 13 434-13 439.
25. Melaugh, W.; Phillips, N. J.; Campagnari, A. A.; Tullius, M. V.; Gibson, B. W. Biochemistry 1994, 33, 13 070-13 078.
26. Schweda, E. K.; Jonasson, J. A.; Jansson, P. E. J. Bacteriol. 1995, 177, 5316-5321.
27. Hood, D. W.; Makepeace, K.; Deadman, M. E.; Rest, R. F.; Thibault, P.; Martin, A.; Richards, J. C.; Moxon, E. R. Mol. Microbiol. 1999, 33, 679-692.
28. Kim, J. J.; Zhou, D.; Mandrell, R. E.; Griffiss, J. M. Infect. Immun. 1992, 60, 4439-4442.
29. VanBoegelen, R, A.; Abshire, K. Z.; Pertsemlidis, A.; Clark, R. L.; Neidhardt, F. C.; Curtiss, R. I.; Gross, C. A.; Ingraham, J. L.; Lin, E. C.; Low, K. B.; Magasanki, B.; Reznikoff, W.; Schaechter, M.; Umbarger, H. E.; Riley, M. Escherichia coli and Salmonella typhimurium Cellular and Molecular Biology; ASM Press: Washington DC, 1996.
30. Pasquali, C.; Frutiger, S.; Wilkins, M. R.; Hughes, G. J.; Appel, R. D.; Bairoch, A.; Schaller, D.; Sanchez, J.-C.; Hochstrasser, D, F. Electrophoresis 1996, 17, 547-555.
31. Link, A. J.; Robison, K.; Church, G. M. Electrophoresis 1997, 18, 1259-1313.
32. Fountoulakis, M.; Takacs, M.-F.; Berndt, P.; Langen, H.; Takacs, B. Electrophoresis 1999, 20, 2181-2195.
33. Tonella, L.; Walsh, B. J.; Sanchez, J. C.; IOu, K.; Wilkins, M. R.; Tyler, M.; Frutiger, S.; Gooley, A. A.; Pescaru, I.; Appel, R. D.; Yan, J. X.; Bairoch, A.; Hoogland, C.; Morch, F. S.; Hughes, G. J.; Williams, K. L.; Hochstrasser, D. F. Electrophoresis 1998, 19, 1960-1971.
34. Langen, H.; Gray, C.; Roder, D.; Juranville, J. F.; Takacs, B.; Fountoulakis, M. Electrophoresis 1997, 18, 1184-1192.
35. Langen, H.; Takacs, B.; Evers, S.; Berndt, P.; Lahm, H. W.; Wipf, B.; Gray, C.; Fountoulakis, M. Electrophoresis 2000, 21, 411-429.
36. Munson, R. S., Jr., to be published, 2003.
37. Alfa, M. J.; Degagne, P.; Hollyer, T. Infect. Immun. 1993, 61, 1735-1742.
38. Alfa, M. J.; Stevens, M. K.; DeGagne, P.; Klesney, T. J.; Radolf, J. D.; Hansen, E. J. Infect. Immun. 1995, 63, 1754-1761.
39. Lagergard, T.; Frisk, A.; Purven, M.; Nilsson, L. A. Microb. Pathog. 1995, 18, 37-51.
40. Odumeru, J. A.; Wiseman, G. M.; Ronald, A. R. Infect. Immun. 1985, 50, 495-499.
41. Gibson, B. W.; Campagnari, A. A.; Melaugh, W.; Phillips, N. J.; Apicella, M. A.; Grass, S.; Wang, J.; Palmer, K. L.; Munson, R. S., Jr. J. Bacteriol. 1997, 179, 5062-5071.
42. Bozue, J. A.; Tullius, M. V.; Wang, J.; Gibson, B. W.; Munson, R. S., Jr. J. Biol. Chem. 1999, 274, 4106-4114.
43. Palmer, K. L.; Goldman, W. E.; Munson Jr., R. S. Mol. Microbiol. 1996, 21, 13-19.
44. Shevchenko, A.; Wilm, M.; Vorm, O.; Mann, M. Anal. Chem. 1996, 68, 850-858.
45. Hartinger, J.; Stenius, K.; Hogemann, D.; Jahn, R. Anal. Biochem. 1996, 35, 126-133.
46. Macfarlane, D. E. Anal. Biochem. 1989, 28, 457-463.
47. Matsui, N. M.; Smith, D. M.; Clauser, K. R.; Fichmann, J.; Andrews, L. E.; Sullivan, C. M.; Burlingame, A. L.; Epstein, L. B. Electrophoresis 1997, 18, 409-417.
48. Vestal, M. L.; Juhasz, P.; Martin, S. A. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1995, 9, 1044-1050.
49. Spengler, B.; Kirsch, D.; Kaufmann, R. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1992, 6, 105-108.
50. Campagnari, A. A.; Karalus, R.; Apicella, M.; Melaugh, W.; Lesse, A. J.; Gibson, B. W. Infect. Immun. 1994, 62, 2379-2386.
51. Filiatrault, M. J.; Gibson, B. W.; Schilling, B.; Sun, S.; Munson, R. S., Jr.; Campagnari, A. A. Infect. Immun. 2000, 68, 3352-3361.
52. Melaugh, W.; Gibson, B. W.; Campagnari, A. A. J. Bacteriol. 1996, 178, 564-570.
53. Adessi, C.; Miege, C.; Albrieux, C.; Rabilloud, T. Electrophoresis 1997, 18, 127-135.
54. Rabilloud, T.; Valette, C.; Lawrence, J. J. Electrophoresis 1994, 15, 1552-1558.
55. Molloy, M. P.; Herbert, B. R.; Walsh, B. J.; Tyler, M. I.; Traini, M.; Sanchez, J. C.; Hochstrasser, D. F.; Williams, K. L.; Gooley, A. A. Electrophoresis 1998, 19, 837-844.
56. Rabilloud, T. Electrophoresis 1998, 19, 758-760.
57. Santoni, V.; Rabilloud, T.; Doumas, P.; Rouquie, D.; Mansion, M.; Kieffer, S.; Garin, J.; Rossignol, M. Electrophoresis 1999, 20, 705-711.
58. Spinola, S. M.; Griffiths, G. E.; Shanks, K. L.; Blake, M. S. Infection and Immunity 1993, 61, 1346-1351.
59. Hiltke, T. J.; Campagnari, A. A.; Spinola, S. M. Infect. Immun. 1996, 64, 5047-5052.
60. Steinberg, T. H.; Jones, L. J.; Haugland, R. P.; Singer, V. L. Anal. Biochem. 1996, 35, 223-237.
61. Sun, S.; Schilling, B.; Tarantino, L.; Tullius, M. V.; Gibson, B. W.; Munson, R. S., Jr. J. Bacteriol. 2000, 182, 2292-2298.