Mechanistic implications of a linear free-energy correlation of rate constants for the reduction of active- and Met-R2 forms of E. coli ribonucleotide reductase with eight organic radicals

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 10, 2000, Pages 2206-2212

  Dobbing, A Mark ^a   Borman, Christopher D ^a   Twitchett, Mark B ^a   Leese, David N ^a   Salmon, G Arthur ^b   Sykes, A Geoffrey ^a  

^a NEWCASTLE UNIVERSITY   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF LEEDS   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BENZYLVIOLOGEN; INDOPHENOL; METHYLENE BLUE; PARAQUAT; RESORUFIN; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE; RIBOSE; TOLONIUM CHLORIDE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; ELECTRON TRANSPORT; ENERGY; ENZYME ACTIVE SITE; ESCHERICHIA COLI; HYDROGEN BOND; NONHUMAN; REACTION ANALYSIS; REDUCTION;

EID: 0039246539     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja993412k     Document Type: Article

References (50)

1. Sjöberg, B.-M. Struct. Bonding 1997, 88, 139-173.
2. Gräslund, A.; Sahlin, M. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1996, 25, 259-286.
3. Wallar, B. J.; Lipscomb, J. D. Chem. Rev. 1996, 96, 2625-2657.
4. Andersson, K. K.; Gräslund, A. Adv. Inorg. Chem. 1995, 43, 359-408.
5. Sjöberg, B.-M. Structure 1994, 2, 793.
6. Fontecave, M.; Nordlund, R.; Eklund, H.; Reichard, P. Adv. Enzymol. 1992, 65, 147-183.
7. Nilsson, O.; Lundqvisl, T.; Hahne, S.; Sjöberg, B.-M. Biochem. Soc. Trans. 1988, 16, 91.
8. Uhlin, U.; Eklund, H. Nature (London) 1994, 70, 533.
9. Nordlund, P.; Eklund, H. J. Mol. Biol. 1993, 232, 123.
10. Logan, D. T.; Su, X.-D.; Åberg, A.; Regnström, K.; Hajdu, J.; Eklund, H.; Nordlund, P. Structure 1996, 4, 1053.
11. Ravi, N.; Bollinger, J. M., Jr.; Huynh, B. H.; Edmondson, D. E.; Stubbe, J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 8007.
12. Han, J.-Y.; Gräslund, A.; Thelander, L.; Sykes, A. G. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 287.
13. Dobbing, A. M.; Han, J.-Y.; Sykes, A. G. J. Biol. Inorg. Chem. 1998, 3, 480.
14. Han, J.-Y.; Swarts, J. C.; Sykes, A. G. Inorg. Chem. 1996, 35, 4629.
15. Swarts, J. C.; Aquino M. A. S.; Han, J.-Y.; Lam, K.-Y.; Sykes, A. G. Biochim. Biophys. Acta. 1995, 1247, 215.
16. Davydov, A.; Schmidt, P. P.; Gräslund, A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996, 219, 213-218.
17. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265-322.
18. Lynch, J. B.; Juarez-Garcia, C.; Münck, E.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem. 1989, 264, 8091.
19. Borman, C. D.; Dobbing, A. M.; Salmon, G. A.; Sykes, A. G. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6605.
20. de Oliveira, L. A. A.; Haim, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 3363.
21. Curtis, J. C.; Sullivan, B. P.; Meyer, T. J. Inorg. Chem. 1980, 19, 3833.
22. Tsukahara K.; Wilkins, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 2632.
23. Lam, K.-Y.; Fortier, D. G.; Sykes, A. G. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1990, 1019.
24. Sjöberg, B.-M.; Hahne, S.; Karlsson, M.; Jörnvall, H.; Goransson, M.; Uhlin, B. E. J. Biol. Chem. 1986, 261, 5658.
25. Barlow, T.; Eliasson, R.; Platz, A.; Reichard, P.; Sjöberg, B.-M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 1492.
26. Petersson, L.; Gräslund, A.; Ehrenberg, A.; Sjöberg, B.-M.; Reichard, P. J. Biol. Chem. 1980, 255, 6706.
27. Climent, I.; Sjöberg, B.-M.; Huang, C. Y. Biochemistry 1992, 31, 4801.
28. Zare, R. N. Ber. Bunsen-Ges. Chem. 1974, 78, 153.
29. Bird, C. L.; Kuhn, A. T. Chem. Soc. Rev. 1981, 10, 49-82.
30. Keene, J. P.; Land, E. J.; Swallow, A. J., Ed. Baxendale J.H Academic Press: London, 1965; p 225.
31. Clark, W. M. Oxidation and Reduction Potentials of Organic Systems; Williams and Wilkins: Baltimore, Maryland, 1960.
32. Steihler, R. D.; Chen, T.-T.; Clark, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1933, 55, 891.
33. Salmon, G. A.; Sykes, A. G. Methods Enzymol. 1993, 227, 522.
34. Curtis, A. R.; Sweetenham, W. P. FACSIMILE/CHECKMAT Users Manual, UKAEA, Atomic Energy Research Establishment, Harwell, 1987, R12805.
35. Sellers, R. M. Ph.D. Thesis, University of Leeds, 1972.
36. Ahmed, I.; Cusanovich, M. A.; Tollin, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 6724.
37. Van Leeuwen, J. W.; van Dijk, C.; Veeger, C. Eur. J. Biochem. 1983, 135, 601.
38. Carey, J. G.; Cairns, J. F.; Colchester, J. E. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1969, 1280.
39. Silva, K. E.; Elgren, T. E.; Que, L., Jr.; Stankovich, M. T. Biochemistry 1995, 34, 14093.
40. Atta, M.; Anderson, K. K.; Ingemarson, R.; Thelander, L.; Gräslund, A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 6429.
41. Gerez, C.; Fontecave, M. Biochemistry 1992, 31, 780.
42. Persson, B. O.; Karlsson, M.; Climent, I.; Ling, J. S.; Loehr, J. S.; Sahlin, M.; Sjöberg, B.-M. J. Biol. Inorg. Chem. 1996, 1, 247.
43. Katterle, B.; Sahlin, M.; Schmidt, P. P.; Pötsch, S.; Logan, D. T.; Gräslund, A.; Sjöberg, B.-M. J. Biol. Chem. 1997, 272, 10414.
44. Parkin, S. E.; Chen, S.-X.; Ley, B. A.; Mangravite, L.; Edmondson, D. E.; Huynh, B. H.; Bollinger, J. M. Biochemistry 1998, 37, 1124-1130.
45. Schmidt, P. P.; Rova, U.; Katterle, B.; Thelander, L.; Gräslund, A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 21463.
46. Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A.; Crabtree, R. H. Theor. Chem. Acc. 1997, 97, 289.
47. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N. Photosynth. Res. 1989, 22, 173.
48. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N.; Betts, J. N.; Bowler, B. E.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 7915.
49. Hirst, J.; Duff, J. L. C.; Jameson, G. N. L.; Kemper, M. A.; Burgess, B. K.; Armstrong, F. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7085.
50. + is controlled by the rate of release of the proton.