UV resonance Raman characterization of model compounds of Tyr244 of Bovine cytochrome c oxidase in its neutral, deprotonated anionic, and deprotonated neutral radical forms: Effects of covalent binding between tyrosine and histidine

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 106, Issue 14, 2002, Pages 3436-3444

  Aki, M ^a   Ogura, T ^b,c   Naruta, Y ^d   Le, T H ^d   Sato, T ^d   Kitagawa, T ^a,e  

^a GRADUATE UNIVERSITY FOR ADVANCED STUDIES   (Japan)

^b UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

^c JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

^d KYUSHU UNIVERSITY   (Japan)

^e NATIONAL INSTITUTES OF NATURAL SCIENCES   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BOVINE CYTOCHROME OXIDASE; COVALENT LINKAGE; DEPROTONATION; IMIDAZOLE; ULTRAVIOLET RESONANCE RAMAN SPECTROSCOPY;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; CONFORMATIONS; ELECTRONS; NEGATIVE IONS; PH; PHENOLS; TITRATION;

ENZYMES;

EID: 0037061951     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp012492n     Document Type: Article

References (48)

1. Tsukihara, T.; Aoyama, H.; Yamashita, E.; Tomizaki, T.; Yamaguchi, H.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yoshikawa, S. Science 1996, 272, 1136-1144.
2. Iwata, S.; Ostermeier, C.; Ludwig, B.; Michel, H. Nature 1995, 376, 660-669.
3. Yoshikawa, S.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yamashita, E.; Inoue, N.; Yao, M.; Fei, M. J.; Libeu, C. P.; Mizushima, T.; Yamaguchi, H.; Tomiazaki, T.; Tukihara, T. Science 1998, 280, 1723-1729.
4. Iwata S. Biochemistry 1998, 123, 369-375.
5. (a) Thomas, J. W.; Puustinen, A.; Alben, J. O.; Gennis, R. B.; Wilkstrom, M. Biochemistry 1993, 32, 10923-10928.
6. (b) Fetter, J. R.; Qian, J.; Shapleigh, J.; Thomas, J. W.; Garcia-Horsman, A.; Schmidt, E.; Hosler, J.; Babcock, G. T.; Gennis, R. B.; Ferguson-Miller, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 1604-1608.
7. (c) Garcia-Horsman, A.; Puustinen, A.; Gennis, R. B.; Wikstrom, M. Biochemistry 1995, 34, 4428-4433.
8. (d) Gennis, R. B. Biochim. Biophys. Acta, 1998, 1365, 241-248.
9. Uchida, T.; Mogi, T.; Kitagawa, T. Biochemistry 2000, 39, 6669-6678.
10. Proshlyakov, D. A.; Pressler, M. A.; DeMaso, C.; Leykam, J. F.; DeWitt, D. L.; Babcock, G. T. Science 2000, 290, 1588-1591.
11. (a) Sjöberg, B. M.; Larson, A. EMBO J. 1986, 5, 2037-2040.
12. (b) Bollinger, J. M. Jr.; Edmondson, D. E.; Huynh, B. H.; Filley, J.; Norton, J. R.; Stubbe, J. Science 1991, 253, 292-298.
13. (a) Karthein, R.; Dietz, R.; Nastainczyk, W.; Ruf, H. H. Eur. J. Biochem. 1998, 171, 313-320.
14. (b) Smith, W. L.; Eling, T. E.; Kulmacz, R. J.; Marnett, L. J.; Tsai, A. Biochemistry 1992, 31, 3-7.
15. (a) Barry, B. A.; El-Deeb, M. K.; Sandusky, P. O.; Babcock, G. T. J. Biol. Chem. 1990, 265, 20139-20143.
16. (b) Hoganson, C. W.; Babcock, G. T. Biochemistry 1992, 31, 11874-11880.
17. (a) Ito, N.; Phillips, S. E. V.; Yadav, K. D. S.; Knowles, P. F. J. Mol. Biol. 1994, 238, 794.
18. (b) Whittaker, M. M.; Ballou, D. P.; Whittaker, J. W. Biochemistry 1998, 37, 8426.
19. (c) Wachter, R. M.; Montague-Smith, M. P.; Branchaud, B. P. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7743.
20. (d) McGlashen M. L.; Eads, D. D.; Spiro, T. G.; Whittaker, J. W. J. Phys. Chem. 1995, 99, 4918-4922.
21. Whittaker, M. M.; Kersten, P. J.; Nakamura, N.; Sanders-Loehr, J.; Schweizer, E. S.; Whittaker, J. W. J. Biol. Chem. 1996, 271, 681.
22. (a) Itoh. S.; Taki, M.; Kumei, H.; Takayama, S.; Nagatomo, S.; Kitagawa, T.; Sakurada, N.; Arakawa, R.; Fukuzumi, S. Inorg. Chem. 2000, 39, 3708-3711.
23. (b) Halfen, J. A.; Jazdzewski, B. A.; Mahapatra, S.; Berreau, L. M.; Wilkinson, E. C.; Que, L. Jr.; Tolman, W. B.; J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8217.
24. (c) Wang, Y.; DuBois, J. L.; Hedman, B.; Hodgson, K. O., Stack, T. D. P. Science 1998, 279, 537.
25. (d) Chaudhuri, P.; Hess, M.; Muller, J.; Hildenbrand, K.; Bill, E.; Weyhermuller, T.; Wieghardt, K. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9599.
26. (e) Sokolowski, A.; Müller, J.; Weyher-müller, T.; Schnepf, R.; Hildebrandt, P., Hildenbrand, K.; Bothe, E.; Wieghardt, K. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8889-8900.
27. Schnepf, R.; Sokolowski, A.; Müller, J.; Bachler, V.; Wieghardt, K.; Hildebrandt, P. J. Am. Chem. Soc. 1988, 120, 2352-2364.
28. McCauley, K. M.; Vrtis, J. M.; Dupout, J.; van der Donk, W. A., J. Am. Chem Soc. 2000, 122, 2403-2404.
29. (a) Collman, J. P.; Zhong, M.; Wang, Z. Org. Lett. 1999, 1(6), 949-951.
30. (b) Elliott, G. I.; Konopelski, J. P. Org. Lett. 2000, 2(20), 3055-3057.
31. (c) Collman, J. P.; Wang, Z.; Zhong, M.; Zeng, L. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2000, 1, 1217-1221.
32. Kaminaka, S.; Kitagawa, T. Appl. Spectrosc. 1992, 46, 1804.
33. Aki, M.; Ogura, T.; Shinzawa-Itoh, K.; Yoshikawa, S.; Kitagawa, T., J. Phys. Chem. B. 2000, 104, 10765.
34. Johnson, C. R.; Ludwig, M.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 905-912.
35. Fodor, S. P. A.; Rava, R. P.; Hays, T. R.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1520.
36. Strehlke, P. Eur. J. Med. Chem. 1979, 14, 227.
37. Takeuchi, H.; Harada, I. J. Raman Spectosc. 1990, 21, 509.
38. Tripathi, G. N. R.; Schuler, R. H. J. Chem. Phys. 1984, 81, 113-121.
39. Mukherjee, A.; McGlashen, M. L.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1995, 99, 4912.
40. (a) Tripathi, G. N. R.; Schuler, R. H. J. Phys. Chem. 1988, 92, 5129-5133.
41. Tripathi, G. N. R. Time-Resolved Spectroscopy; Clark R. J. H., Hester, R. E., Eds.; John Wiley & Sons: Chichester, Adv. Spectrosc. 1989, 18, 175-192.
42. Triphati, G. N. R.; Schuler, R. H. J. Phys. Chem. 1987, 91, 5881.
43. Tripathi, G. N. R.; Schuler, R. H. J. Phys. Chem. 1984, 88, 1706.
44. Neta, P.; Fessenden, R. W. J. Phys. Chem. 1974, 78, 523.
45. Pauling, L. The Nature of the Chemical Bond; Cornell University Press: Ithaca, New York, 1960; p 357.
46. Rava, R. P.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1985, 89, 1856-1861.
47. Nagai, M.; Aki, M.; Li, R.; Jin, Y.; Sakai, H.; Nagatomo, S. Kitagawa, T. Biochemistry 2000, 39, 13093-13105.
48. Naruta, Y.; Tachi, Y.; Chishiro, T.; Shimazaki, Y.; Tani, F. Acta Crystallogr. 2001, Sect. E 57, 550-552.