Energy transfer dynamics in LH2 complexes of Rhodopseudomonas acidophila containing only one B800 molecule

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 105, Issue 29, 2001, Pages 7049-7056

  Matsuzaki, S ^a   Zazubovich, V ^a   Fraser, N J ^b   Cogdell, R J ^b   Small, G J ^a  

^a IOWA STATE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF GLASGOW   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NONPHOTOCHEMICAL HOLE BURNING (NPHB);

BACTERIA; BAND STRUCTURE; COMPLEXATION; ELECTRONIC STRUCTURE; HAMILTONIANS; LIGHT ABSORPTION; PHONONS;

ENERGY TRANSFER;

EID: 0035954952     PISSN: 10895647     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0037347     Document Type: Article

References (53)

1. van Grondelle, R.; Dekku, J.P.; Gillbro, T.; Sundström, V. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1187, 1.
2. Pullerits, T.; Sundström, V. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 381.
3. Sundström, V.; van Grondelle, R. In Anoxygenic Photosynthetic Bacteria; Blankenship, R.E., Madigan, M.T., Baller, C.E., Eds.; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, 1995; p 349.
4. Freer, A.A.; Prince, S.M.; Saner, K.; Papiz, M.Z.; Hawthornewaite-Lawless, A.M.; McDermott, G.; Cogdell, R.J.; Isaacs, N.W. Structure 1996, 4, 449.
5. Koepke, J.; Xu, X.; Muenke, C.; Schulten, K.; Michl, H. Structure 1996, 4, 561.
6. Sauer, K.; Cogdell, R.J.; Prince, S.M.; Freer, A.A.; Isaacs, N.W.; Scheer, H. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 564.
7. Alden, R.G.; Johnson, E.; Nagarajan, V.; Parson, W.W.; Law, C.; Cogdell, R.J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4667.
8. Karrasch, S.; Bullough, P.A.; Ghosh, R. EMBO J. 1995, 14, 631.
9. Sundström, V.; Pullerits, T.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2327.
10. Book, L.D.; Ostatin, A.E.; Ponomarenko, N.; Norris, J.R.; Scherer, N.F. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 8295.
11. Shreve, A.P.; Trautman, J.K.; Frank, H.A.; Owens, T.J.; Albrecht, A.C. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1058, 280.
12. Hess, S.; Felschtein, F.; Babin, A.; Nurgaleev, I.; Pullerits, T.; Sergeev, A.; Sundström, V. Chem. Phys. Lett. 1993, 216, 247.
13. Pullerits, T.; Hess, S.; Herek, J.L.; Sundström, V. J. Phys. Chem. 1997, 101, 10560.
14. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Jonas, D.M.; Fleming, G.R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2399.
15. Jiminez, R.; Dikshit, S.N.; Bradforth, S.E.; Fleming, G.R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6825.
16. Ma, Y.-Z.; Cogdell, R.J.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1087.
17. Ma, Y.-Z.; Cogdell, R.J.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 881.
18. Wu, H.-M.; Savikhin S.; Reddy, N.R.S.; Jankowiak, R.; Cogdell, R.J.; Struve, W.S.; Small, G.J. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12022.
19. van der Laan, H.; Schmidt, Th.; Visschers, R.W.; Visschers, K.J.; van Grondelle, R.; Völker, S. Chem. Phys. Lett. 1990, 170, 231.
20. Reddy, N.R.S.; Small, G.J.; Seibert, M.; Picorel, R. Chem. Phys. Lett. 1991, 181, 391.
21. Reddy, N.R.S.; Small, G.J. J. Chem. Phys. 1991, 94, 7545.
22. De Caro, C.; Visschers, R.W.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. 1994, 98, 10584.
23. Reddy, N.R.S.; Cogdell, R.J.; Zhao, L.; Small, G.J. J. Photochem. Photobiol. 1993, 57, 35.
24. van Oijen, A.M.; Ketelaars, M.; Köhler, J.; Aartsma, T.J.; Schmidt, J. Biophys. J. 2000, 78, 1570.
25. Wu, H.-M.; Rätsep, M.; Lee, I.-J.; Cogdell, R.J.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7654.
26. Cogdell, R.J.; Hawthornewaite, A.M. In The Photosynthetic Reaction Center; Deisenhofer, J., Norris. J.R., Eds.; Academic Press: San Diego, 1993; Vol. 1, p 23.
27. Gall, G.; Fraser, N.J.; Bellissent-Funel, M.-C.; Scheer, H.; Robert, B.; Cogdell, R.J. FEBS Lett. 1999, 449, 269. Fraser, N.J. Ph.D. Thesis 1999, University of Glasgow, Glasgow.
28. Gall, G.; Fraser, N.J.; Bellissent-Funel, M.-C.; Scheer, H.; Robert, B.; Cogdell, R.J. FEBS Lett. 1999, 449, 269. Fraser, N.J. Ph.D. Thesis 1999, University of Glasgow, Glasgow.
29. Chang, H.-C.; Jankowiak, R.; Reddy, N.R.S.; Small, G.J. Chem. Phys. 1995, 197, 307.
30. Wu, H.-M.; Reddy, N.R.S.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 651.
31. Wu, H.-M.; Rätsep, M.; Jankowiak, R.; Cogdell, R.J.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7641.
32. Herck, J.L.; Fraser, N.J.; Pullerits, T.; Martinsson, P.; Polivka, T.; Scheer, H.; Cogdell, R.J.; Sundström, V. Biophys. J. 2000, 78, 2590.
33. Koolhaas, M.H.C.; Frese, R.N.; Fowler, G.J.S.; Bibby, T.S.; Georgakopoulu, S.; van der Zwan, G.; Hunter, C.N.; van Grondelle, R. Biochemistry 1998, 37, 4693.
34. Reddy, N.R.S.; Wu, H.-M.; Jankowiak, R.; Picorel, R.; Cogdell, R.J.; Small, G.J. Photosynth. Res. 1996, 48, 277.
35. Fowler, G.J.S.; Hess, S.; Pullerits, T.; Sundström, V.; Hunter, C.N. Biochemistry 1997, 36, 11282.
36. Kühn, O.; Sundström, V. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3432.
37. Mukai, K.; Abe, S.; Sumi, H. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6096.
38. Scholes, G.D.; Fleming, G.R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 1854.
39. 2.
40. Kolaczkowski, S.V.; Hayes, J.M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 13418.
41. See ref 16 and references therein.
42. Wu, H.-M.; Rätsep, M.; Jankowiak, R.; Cogdell, R.J.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4023.
43. Wu., H.-M.; Small, G.J. Chem. Phys. 1997, 218, 225.
44. See Linnanto, J.; Korppi-Tommola, J.E.I.; Helenius, V.M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8739.
45. Wending, M.; Pullerits, T.; Przjalgowski, M.A.; Vulto, S.I.E.; Aartsma, T.J.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 5825.
46. Rätsep, M.; Wu, H.-M.; Hayes, J.M.; Small, G.J. Spectrochim. Acta A 1998, 54, 1279.
47. See Lathrop, E.J.P.; Friesner, R.A. J. Phys. Chem. 1994, 98, 3050 and references therein.
48. Reddy, N.R.S.; Picorel, R.; Small, G.J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 6458.
49. See, for example, den Hartog, F.T.H.; Dekker, J.P.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 11007. Jankowiak, R.; Rätsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759. den Hartog, F.T.H.; Vacha, F.; Lock, A.J.; Barber, J.; Dekker, J.P.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9174. Fetisova, Z.G.; Mauring, K. FEBS Lett. 1993, 323, 159. Psencik, J.; Polivka, T.; Nemec, P.; Dian, J.; Kudrna J.; Maly, P.; Hala, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4392.
50. See, for example, den Hartog, F.T.H.; Dekker, J.P.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 11007. Jankowiak, R.; Rätsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759. den Hartog, F.T.H.; Vacha, F.; Lock, A.J.; Barber, J.; Dekker, J.P.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9174. Fetisova, Z.G.; Mauring, K. FEBS Lett. 1993, 323, 159. Psencik, J.; Polivka, T.; Nemec, P.; Dian, J.; Kudrna J.; Maly, P.; Hala, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4392.
51. See, for example, den Hartog, F.T.H.; Dekker, J.P.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 11007. Jankowiak, R.; Rätsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759. den Hartog, F.T.H.; Vacha, F.; Lock, A.J.; Barber, J.; Dekker, J.P.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9174. Fetisova, Z.G.; Mauring, K. FEBS Lett. 1993, 323, 159. Psencik, J.; Polivka, T.; Nemec, P.; Dian, J.; Kudrna J.; Maly, P.; Hala, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4392.
52. See, for example, den Hartog, F.T.H.; Dekker, J.P.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 11007. Jankowiak, R.; Rätsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759. den Hartog, F.T.H.; Vacha, F.; Lock, A.J.; Barber, J.; Dekker, J.P.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9174. Fetisova, Z.G.; Mauring, K. FEBS Lett. 1993, 323, 159. Psencik, J.; Polivka, T.; Nemec, P.; Dian, J.; Kudrna J.; Maly, P.; Hala, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4392.
53. See, for example, den Hartog, F.T.H.; Dekker, J.P.; van Grondelle, R.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 11007. Jankowiak, R.; Rätsep, M.; Picorel, R.; Seibert, M.; Small, G.J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 9759. den Hartog, F.T.H.; Vacha, F.; Lock, A.J.; Barber, J.; Dekker, J.P.; Völker, S. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9174. Fetisova, Z.G.; Mauring, K. FEBS Lett. 1993, 323, 159. Psencik, J.; Polivka, T.; Nemec, P.; Dian, J.; Kudrna J.; Maly, P.; Hala, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4392.