The infrared and ultraviolet spectra of individual conformational isomers of biomolecules: Tryptamine

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 104, Issue 38, 2000, Pages 8677-8688

  Carney, Joel R ^a   Zwier, Timothy S ^a  

^a PURDUE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CONFORMATIONS; ELECTRON TRANSITIONS; INFRARED SPECTROSCOPY; ISOMERS; MOLECULAR ORIENTATION; MOLECULAR SPECTROSCOPY; MOLECULAR STRUCTURE; MOLECULAR VIBRATIONS; ULTRAVIOLET SPECTROSCOPY;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY (DFT); ETHYLAMINE; HOLE BURNING; RESONANT ION-DIP INFRARED (RIDIR) SPECTROSCOPY; TRYPTAMINE;

AMINES;

EID: 0034726898     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp001433r     Document Type: Article

References (52)

1. MacKerell, A. D.; Banavali, N. K. J. Comput. Chem. 2000, 21, 105.
2. Foloppe, N.; MacKerell, A. D. J. Comput. Chem. 2000, 21, 86.
3. Eyrich, V. A.; Standley, D. M.; Felts, A. K.; Friesner, R. A. Proleins: Struct., Fund., Genet. 1999, 35, 41.
4. Eyrich, V. A.; Standley, D. M.; Friesner, R. A. J. Mol. Biol. 1999, 288,125.
5. Fredrichs, M.; Zhou, R.; Edinger, S. R.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3057.
6. Friesner, R. A.; Murphy, R. B.; Beachy, M. D.; Ringnalda, M. N.; Pollard, W. T.; Dunietz, B. D.; Cao, Y. X. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 1913.
7. Rapp, C. S.; Friesner, R. A. Proteins: Struct., Finie!., Genet. 1999, 35, 173.
8. Stern, H. A.; Kaminski, G. A.; Banks, J. L.; Zhou, R.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4730.
9. Friesner, R. A.; Beachy, M. D. Ctirr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 257.
10. Standley, D. M.; Gunn, J. R.; Friesner, R. A.; McDermott, A. E. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1998, 33, 240.
11. Kim, K.; Friesner, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12952.
12. Lindinger, A.; Toennies, J. P.; Vilesov, A. F. J. Chem. Phys. 1999, 110, 1429.
13. Unamuno, L; Fernandez, J. A.; Longarte, A.; Castano, F. Private communication.
14. Dickinson, J. A.; Hockridge, M. R.; Kroemer, R. T.; Robertson, E. G.; Simons, J. P.; McCombie, J.; Walker, M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 720, 2622.
15. Dickinson, J. A.; Joireman, P. W.; Randall, R. W.; Robertson, E. G.; Simons, J. P. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 513.
16. McMahon. L. P.; Yu, H.; Vela, M. A.; Morales, G. A:; Shui, L.; Fronczek, F. R.; McLaughlin, M. L.; Barkley, M. D. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 3269.
17. Martinez, S. J., III.; Alfano, J. C.; Levy, D. H. J. Mol. Spectrosc. 1993, 158, 82.
18. Sipior, J.; Sulkes, M. J. Chem. Phys. 1993, 98, 9389.
19. Martinez, S., J. III; Alfano, J. C.; Levy, D. H. J. Mol. Spectrosc. 1992,756,421.
20. Felker, P. M. J. Phys. Chem. 1992, 96, 7844.
21. Martinez, S. J., III.; Alfano, J. C.; Levy, D. H. J. Mol. Spectrosc. 1991, 145, 100.
22. Connell, L. L.; Corcoran, T. C.; Joireman, P. W.; Felker, P. M. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 510.
23. Wu, Y. R.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1989, 91, 5278.
24. Tubergen, M. J.; Cable, J. R.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1990, 92,51.
25. Cable, J. R.; Tubergen, M. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1989, 7/7, 9032.
26. Philips, L. A.; Webb, S. P.; Martinez, S. J., III.; Fleming, G. R.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1988, 770, 1352.
27. Philips, L. A.; Levy, D. H. /. Chem. Phys. 1988, 89, 85.
28. Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Phys. Chem. 1988, 92, 6554.
29. Park, Y. D.; Rizzo, T, R.; Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1986, 84, 6539.
30. Rizzo, T. R.; Park, Y. D.; Peteanu, L. A.; Levy, D. H. J. Chem. Phys. 1986, 84, 2534.
31. Kim, W.; Schaeffer, M. W.; Lee, S.; Chung, J. S.; Felker, P. M. J. Chem. Phys. 1999, 110, 11264.
32. Hartland, G. V.; Henson, B. F.; Ventura, V. A.; Felker, P. M. J. Phys. Chem. 1992, 96, 1164.
33. Page, R. H.; Shen, Y. R.; Lee, Y. T. J. Chem. Phys. 1988, 88, 4621.
34. Buchhold, K.; Reimann, B.; Djafari, S.; Barth, H. D.; Brutschy, B.; Tarakeshwar, P.; Kim, K. S. J. Chem. Phys. 2000, 112, 1844.
35. Carney, J. R.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9943.
36. Graham, R. J.; Kroemer, R. T.; Mons, M.; Robertson, E. G.; Snoek, L.; Simons, J. P. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9706.
37. Guchhait, N.; Ebata, T.; Mikami, N. J. Chem. Phys. 1999, 111, 8438.
38. Matsumoto, Y.; Ebata, T.; Mikami, N. J. Chem. Phys. 1998,109, 6303.
39. Gruenloh, C. J.; Carney, J. R.; Hagemeister, F. C.; Arrington, C. A.; Zwier, T. S.; Fredericks, S. Y.; Wood, J. T.; Jordan, K. D. J. Chem. Phys. 1998, 709, 6601.
40. Gruenloh, C. J.; Carney, J. R.; Arrington, C. A.; Zwier, T. S.; Fredericks, S. Y.; Jordan, K. D. Science 1997, 276, 1678.
41. Pauwels, P. J.; John, G. W. Clin. Neuropharmacol. 1999, 22, 123.
42. Gruenloh, C. J.; Florio, G. M.; Carney, J. R.; Hagemeister, F. C.; Zwier, T. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 496.
43. Gotch, A. J.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 1992, 96, 3388.
44. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, A. L.; Piskorz, P.; Komaromi, L; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. .Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Gonzalez, C.; HeadGordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, Revision A.7; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
45. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
46. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
47. Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.
48. Woon, D. E.; Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1358.
49. Sun, S.; Bernstein, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 5086.
50. -1 eclipsed). However, the magnitude of A″ has more effect on relative intensities than positions in the spectrum of this near-prolate asymmetric top. Thus, the conformational assignments presented in this paper are consistent with the high-resolution data from Philips et al. (ref 27).
51. Smolyar, A.; Wong, C. F. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1999,488, 51.
52. Lami, H.; Classer, N. J. Chem. Phys. 1986, 84, 597.