Single-molecule dynamics associated with protein folding and deformations of light-harvesting complexes

Springer Series in Chemical Physics

Volumn 67, Issue , 2001, Pages 313-325

  Talaga, D S ^a   Jia, Y ^a   Bopp, M A ^a   Sytnik, A ^a   DeGrado, W A ^a   Cogdell, R J ^a   Hochstrasser, Robin M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION; COMPLEX FORMATION; CONFERENCE PAPER; CRYSTAL STRUCTURE; LIGHT HARVESTING SYSTEM; MATHEMATICAL ANALYSIS; MEASUREMENT; MOLECULAR DYNAMICS; POLARIZATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN STRUCTURE; SPECTROSCOPY;

EID: 0035775807     PISSN: 01726218     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (53)

1. M. Eigen and R. Rigler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 5740-5747 (1994)
2. L. Edman, U. Mets, and R. Rigler, Exp. Tech. Phys. 41, 157-163 (1995)
3. L. Edman, U. Mets, and R. Rigler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 6710-6715 (1996)
4. S. Nie, D. T. Chiu, and R. N. Zare, Science 266, 1018-1021 (1994)
5. S. Nie, D. T. Chiu, and R. N. Zare, Anal. Chem. 67, 2849-2857 (1995)
6. D. T. Chiu and R. N. Zare, J. Am. Chem. Soc. 118, 6512-6513 (1996)
7. T. Funatsu, Y. Harada, M. Tokunaga, K. Saito, and T. Yanagida, Nature 374, 555-559 (1995)
8. R. D. Vale, T. Funatsu, D. W. Pierce, L. Romberg, Y. Harada, and T. Yanagida, Nature 380, 451-453 (1996)
9. K. Kitamura, M. Tokunaga, A. H. Iwane, and T. Yanagida, Nature 397, 129-134. (1999)
10. Q. F. Xue and E. S. Yeung, Nature 373, 681 (1995)
11. W. Tan and E. S. Yeung, Anal. Chem. 69, 4242-4248 (1997)
12. I. Sase, H. Miyata, J. E. T. Corrie, J. S. Craik, and K. Kinosita, Jr., Biophys. J. 69, 323-328 (1995)
13. I. Sase, H. Miyata, S. Ishiwata, and K. Kinosita, Jr., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 5646-5650 (1997)
14. K. Kinosita, Jr., R. Yasuda, H. Noji, S. Ishiwata, and M. Yoshida, Cell 93, 21-24 (1998)
15. X. S. Xie, Acc. Chem. Res. 29, 598-606 (1996)
16. H. P. Lu, L. Y. Xun, and X. S. Xie, Science 282, 1877-1882 (1998)
17. R. M. Dickson, D. J. Norris, Y.-L. Tzeng, and W. E. Moerner, Science 274, 966-969 (1996)
18. R. M. Dickson, A. B. Cubitt, R. Y. Tsien, and W. E. Moerner, Nature 388, 355-358 (1997)
19. T. Ha, Th. Enderle, D. S. Chemla, P. R. Selvin, and S. Weiss, Phys. Rev. Lett. 77, 3979-3982 (1996)
20. T. Ha, Th. Enderle, D. F. Ogletree, D. S. Chemla, P. R. Selvin, and S. Weiss, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 6264-6268 (1996)
21. Th. Schmidt, G. J. Schütz, W. Baumgartner, H. J. Gruber, and H. Schindler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 2926-2929 (1996)
22. G. J. Schütz, W. Trabesinger, and Th. Schmidt, Biophys. J. 74, 2223-2226 (1998)
23. P. M. Goodwin, W. P. Ambrose, and R. A. Keller, Acc. Chem. Res. 29, 607-613 (1996)
24. Y. Jia, A. Sytnik, L. Li, S. Vladimirov, B. S. Cooperman, and R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 7932-7936 (1997)
25. M. A. Bopp, Y. Jia, L. Li, R. J. Cogdell, and R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 10630-10635 (1997)
26. A. Sytnik, S. Vladimirov, Y. Jia, L. Li, B. S. Cooperman, and R. M. Hochstrasser, J. Mol. Biol. 285, 49-54 (1999)
27. M. Bopp, A. Sytnik, T. Howard, R. J. Cogdell, and R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 11271-11276 (1999)
28. Y. Jia, D. S. Talaga, W. L. Lau, H. S. M. Lu, W. F. DeGrado, and R. M. Hochstrasser, Chem. Phys. 247, 69-83 (1999)
29. G. McDermott, S. M. Prince, A. A. Freer, A. M. Hawthornthwaite-Lawless, M. Z. Papiz, R. J. Cogdell, and N. W. Isaacs, Nature (London) 374, 517-521 (1995)
30. V. Sundström, T. Pullerits, and R. J. Van Grondelle, Phys. Chem. B 103, 2327-2346 (1999)
31. A. S. Davydov, Theory of Molecular Excitons (Plenum, New York, 1971)
32. X. S. Xie and J. K. Trautman, Ann. Rev. Phys. Chem. 49, 441-480 (1998)
33. A. M. van Oljen, M. Ketelaars, J. Kohler, T. J. Aartsma, and J. J. Schmidt, Phys. Chem. B 102, 9363-9366 (1998)
34. A. A. Freer, S. M. Prince, K. Sauer, M. Papiz, A. M. Hawthornthwite-Lawless, G. McDermott, R. J. Cogdell, and N. W. Isaacs, Structure 4, 44-462
35. R. Kumble and R. M. Hochstrasser, J. Chem. Phys. 109, 855-865 (1998)
36. D. Talaga, W. Lau, Y. Jia, H. Roder, W. Degrado, and R. M. Hochstrasser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 13021-13026 (2000)
37. E. K. O'Shea, J. D. Klemm, P. D. Kim, and T. Alber, Science 254, 539 (1991)
38. T. E. Ellenberger, C. J. Brandl, K. Struhl, and S. C. Harrison, Cell 71, 122-1237 (1992)
39. K. J. Lumb, C. M. Carr, and P. S. Kim, Biochemistry 33, 7361 (1994)
40. T. R. Sosnick, S. Jackson, R. R. Wilk, S. W. Englander, and W. F. Degrado, Proteins 24, 427-432 (1996)
41. H. Wendt, L. Leder, H. Harma, I. Jelesarov, A. Baici, and H. R. Bosshard, Biochemistry 36, 204-213 (1997)
42. H. Wendt, C. Berger, A. Baici, R. M. Thomas, and H. R. Bosshard, Biochemistry 34, 4097-4107 (1995)
43. H. Wendt, A. Baici, and H. R. Bosshard, J. Amer. Chem. Soc. 116, 6973-6974 (1994)
44. J. A. Zitzewitz, O. Bilsel, J. Luo, B. E. Jones, and C. R. Matthews, Biochemistry 34, 12812-12819 (1995)
45. I. Jelesarov, E. Durr, R. M. Thomas, and H. R. Bosshard, Biochemistry 34, 7539-7550 (1998)
46. E. Durr, I. Jelesarov, and H. R. Bosshard, Biochemstry 38, 870-880 (1999)
47. S. Ozeki, T. Kato, M. E. Holtzer, and A. Holtzer, Biopolymers 31, 957-966 (1991)
48. E. K. O'Shea, R. Rutkowski, and P. S. Kim, Science 243, 538-542 (1989)
49. J. K. Trautman, J. J. Macklin, L. E. Brus, and E. Betzig, Nature 369, 40 (1994)
50. H. P. Lu and X.S. Xie, Nature 385, 143 (1997)
51. T. Basche, S. Kummer, and C. Brauchle, Nature: 373, 132 (1995)
52. T. Ha, T, Enderle, D. S. Chemla, P. R. Selvin, and S, Weiss, Chem. Phys. Lett. 271, 1 (1997)
53. L. Streyer, Ann. Rev. Biochem. 47, 819-846 (1978)