Fully automated parallel oligonucleotide synthesizer

Collection of Czechoslovak Chemical Communications

Volumn 66, Issue 8, 2001, Pages 1299-1314

  Lebl, Michal ^a,b,c,d   Burger, Christine ^b   Ellman, Brett ^b   Heiner, David ^b   Ibrahim, Georges ^b   Jones, Aaron ^b   Nibbe, Mark ^b   Thompson, Jaylynn ^b   Mudra, Petr ^c   Pokorný, Vít ^c   Poncar, Pavel ^c   Ženíšek, Karel ^c  

^a Spyder Instruments Inc   (United States)

^b ILLUMINA INC   (United States)

^c INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY   (Czech Republic)

^d UNIVERSITY OF ARIZONA   (United States)

Author keywords

Array based technologies; Automated oligonucleotide synthesizer; Combinatorial chemistry; Genomics; Libraries; Oligonucleotides; Parallel syntheses; Solid phase syntheses

Indexed keywords

EID: 0035542490     PISSN: 00100765     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1135/cccc20011299     Document Type: Article

References (20)

1. Lashkari D. A., Hunickesmith S. P., Norgren R. M., Davis R. W., Brennan T.: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 7912.
2. a) Lander E. S., Linton L. M., Birren B., Nusbaum C., Zody M. C., Baldwin J., Devon K., Dewar K., Doyle M., Fitz Hugh W., Funke R., Gage D., Harris K., Heaford A., Howland J., Kann L., Lehoczky J., LeVine R., McEwan P., McKernan K., Meldrim J., Mesirov J. P., Miranda C., Morris W., Naylor J., Raymond C., Rosetti M., Santos R., Sheridan A., Sougnez C., Stange-Thomann N., Stojanovic N., Subramanian A., Wyman D., Rogers J., Sulston J., Ainscough R., Beck S., Bentley D., Burton J., Clee C., Carter N., Coulson A., Deadman R., Deloukas P., Dunham A., Dunham I., Durbin R., French L., Grafham D., Gregory S., Hubbard T., Humphray S., Hunt A., Jones M., Lloyd C., McMurray A., Matthews L., Mercer S., Milne S., Mullikin J. C., Mungall A., Plumb R., Ross M., Shownkeen R., Sims S., Waterston R. H., Wilson R. K., Hillier L. W., McPherson J. D., Marra M. A., Mardis E. R., Fulton L. A., Chinwalla A. T., Pepin K. H., Gish W. R., Chissoe S. L., Wendl M. C., Delehaunty K. D., Miner T. L., Delehaunty A., Kramer J. B., Cook L. L., Fulton R. S., Johnson D. L., Minx P. J., Clifton S. W., Hawkins T., Branscomb E., Predki P., Richardson P., Wenning S., Slezak T., Doggett N., Cheng J. F., Olsen A., Lucas S., Elkin C., Uberbacher E., Frazier M., Gibbs R. A., Muzny D. M., Scherer S. E., Bouck J. B., Sodergren E. J., Worley K. C., Rives C. M., Gorrell J. H., Metzker M. L., Naylor S. L., Kucherlapati R. S., Nelson D. L., Weinstock G. M., Sakaki Y., Fujiyama A., Hattori M., Yada T., Toyoda A., Itoh T., Kawagoe C., Watanabe H., Totoki Y., Taylor T., Weissenbach J., Heilig R., Saurin W., Artiguenave F., Brottier P., Bruis T., Pelletier E., Robert C., Wincker P., Rosenthal A., Platzer M., Nyakatura G., Taudien S., Rump A., Yang H. M., Yu J., Wang J., Huang G. Y., Gu J., Hood L., Rowen L., Madan A., Qin S. Z., Davis R. W., Federspiel N. A., Abola A. P., Proctor M. J., Myers R. M., Schmutz J., Dickson M., Grimwood J., Cox D. R., Olson M. V., Kaul R., Raymond C., Shimizu N., Kawasaki K., Minoshima S., Evans G. A., Athanasiou M., Schultz R., Roe B. A., Chen F., Pan H. Q., Ramser J., Lehrach H., Reinhardt R., McCombie W. R., de la Bastide M., Dedhia N., Blocker H., Hornischer K., Nordsiek G., Agarwala R., Aravind L., Bailey J. A., Bateman A., Batzoglou S., Birney E., Bork P., Brown D. G., Burge C. B., Cerutti L., Chen H. C., Church D., Clamp M., Copley R. R., Doerks T., Eddy S. R., Eichler E. E., Furey T. S., Galagan J., Gilbert J. G. R., Harmon C., Hayashizaki Y., Haussler D., Hermjakob H., Hokamp K., Jang W. H., Johnson L. S., Jones T. A., Kasif S., Kaspryzk A., Kennedy S., Kent W. J., Kitts P., Koonin E. V., Korf I., Kulp D., Lancet D., Lowe T. M., McLysaght A., Mikkelsen T., Moran J. V., Mulder N., Pollara V. J., Ponting C. P., Schuler G., Schultz J. R., Slater G., Smit A. F. A., Stupka E., Szustakowki J., Thierry-Mieg D., Thierry-Mieg J., Wagner L., Wallis J., Wheeler R., Williams A., Wolf Y. I., Wolfe K. H., Yang S. P., Yeh R. F., Collins F., Guyer M. S., Peterson J., Felsenfeld A., Wetterstrand K. A., Patrinos A., Morgan M. J.: Nature 2001, 409, 860;
3. b) Venter J. C., Adams M. D., Myers E. W., Li P. W., Mural R. J., Sutton G. G., Smith H. O., Yandell M., Evans C. A., Holt R. A., Gocayne J. D., Amanatides P., Ballew R. M., Huson D. H., Wortman J. R., Zhang Q., Kodira C. D., Zheng X. Q. H., Chen L., Skupski M., Subramanian G., Thomas P. D., Zhang J. H., Miklos G. L. G., Nelson C., Broder S., Clark A. G., Nadeau C., McKusick V. A., Zinder N., Levine A. J., Roberts R. J., Simon M., Slayman C., Hunkapiller M., Bolanos R., Delcher A., Dew I., Fasulo D., Flanigan M., Florea L., Halpern A., Hannenhalli S., Kravitz S., Levy S., Mobarry C., Reinert K., Remington K., Abu-Threideh J., Beasley E., Biddick K., Bonazzi V., Brandon R., Cargill M., Chandramouliswaran I., Charlab R., Chaturvedi K., Deng Z. M., Di Francesco V., et al.: Science 2001, 291, 1304.
4. http://www.genemachines.com/PolyPlex.html
5. a) Rayner S., Brignac S., Bumeister R., Belosudtsev Y., Ward T., Grant O., O'Brie K., Evans G. A., Garner H. R.: Genome Res. 1998, 8, 741;
6. b) http://pompous.swmed.edu/exptbio/mermade/ home.htm and http://www.bioautomation.com/mermade.html
7. Fodor S. P. A., Leighton R. J., Pirrung M. C., Stryer L., Lu A. T., Solas D.: Science 1991, 251, 767.
8. Cargill J. F., Lebl M.: Curr. Opin. Chem. Biol. 1997, 1, 67.
9. Merrifield R. B.: J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2149.
10. Brennan T., Biddison G., Frauendorf A., Schwarcz L., Keen B., Ecker D. J., Davis P. W., Tinder R., Swayze E. E.: Biotechnol. Bioeny. 1998, 61, 33.
11. Lebl M., Pokorný V., Krchňá;k V.: U.S. 6,045,755.
12. Krchňák V., Weichsel A. S., Lebl M., Felder S.: Bioorg. Med. Chem. Lett. 1997, 7, 1013.
13. Lebl M.: Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 1305.
14. Lebl M., Krchňák V., Ibrahim G., Pires J., Burger C., Ni Y., Chen Y., Podue D., Mudra P., Pokorný V., Poncar P., Ženíšek K.: Synthesis 1999, 1971.
15. Pokorný V., Mudra P., Jehnička J., Ženíšek K., Pavlík M., Voburka Z., Rinnová M., Stierandová A., Lucka A. W., Eichler J., Houghten R. A., Lebl M. in: Innovation and Perspectives in Solid Phase Synthesis (R. Epton, Ed.), p. 643. Mayflower Worldwide Limited, Birmingham 1994.
16. Bolf J., Eichler J., Jehnička J., Kalousek J., Lebl M., Mudra P., Pokorný V., Stierandová A., Ženíšek K.: U.S. 5,202,418; 5,338,831; 5,342,585.
17. Foldes-Papp Z. E., Birch-Hirschfeld R., Rsch M., Hartmann A., Kleinschmidt K., H. Seliger: J. Chromatogr., A 1995, 706, 405.
18. Temsamani J., Kubert M., Agrawal S.: Nucleic Acids Res. 1995, 23, 1841.
19. a) Pon R. T., Hager K. M., Naewe C. W., Niece R. L., Robertson M., Smith A. J.: Multi-Facility Survey of Oligonucleotide Synthesis, 1997, http://www.abrf.org/ABRF/Research Committees/MiscellaneousArticles/pon1996/ponarticle.html;
20. b) Pon R. T., Buck G. A., Hager K. M., Naewe C. W., Niece R. L., Robertson M., Smith A. J.: BioTechniques 1996, 21, 680.