Designing protein α-sheet surfaces by Z-score optimization

Physical Review Letters

Volumn 84, Issue 21, 2000, Pages 5010-5013

  Street, Arthur G ^a   Datta, Deepshikha ^a   Gordon, D Benjamin ^b   Mayo, Stephen L ^a  

^a CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^b NONE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN;

CHEMICAL MODEL; CHEMISTRY; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; THERMODYNAMICS;

MODELS, CHEMICAL; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; PROTEINS; THERMODYNAMICS;

EID: 0034701709     PISSN: 00319007     EISSN: 10797114     Source Type: Journal    
DOI: 10.1103/PhysRevLett.84.5010     Document Type: Article

References (32)

1. D. B. Gordon, S. A. Marshall, and S. L. Mayo, Curr. Opin. Struct. Biol., 9, 509 (1999).
2. A. G. Street and S. L. Mayo, Structure, 7, R105 (1999).
3. B. I. Dahiyat and S. L. Mayo, Protein Sci., 5, 895 (1996).
4. B. I. Dahiyat and S. L. Mayo, Science, 278, 82 (1997).
5. S. M. Malakauskas and S. L. Mayo, Nat. Struct. Biol., 5, 470 (1998).
6. K. F. Lau and K. A. Dill, Macromolecules, 22, 3986 (1989).
7. H. W. Hellinga, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 94, 10 015 (1997).
8. E. I. Shakhnovich and A. M. Gutin, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 90, 7195 (1993).
9. K. Yue, K. M. Fiebig, P. D. Thomas, H. S. Chan, E. I. Shakhnovich, and K. A. Dill, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 92, 325 (1995).
10. E. I. Shakhnovich, Phys. Rev. Lett., 72, 3907 (1994).
11. C. Micheletti, F. Seno, A. Maritan, and J. R. Banavar, Phys. Rev. Lett., 80, 2237 (1998).
12. F. Seno, C. Micheletti, A. Maritan, and J. R. Banavar, Phys. Rev. Lett., 81, 2172 (1998).
13. J. M. Deutsch and T. Kurosky, Phys. Rev. Lett., 76, 323 (1996).
14. T. Kurosky and J. M. Deutsch, J. Phys. A, 27, L387 (1995).
15. S. Sun, R. Brem, H. S. Chan, and K. A. Dill, Protein Eng., 8, 1205 (1995).
16. G. M. Crippen, Proteins, 26, 167 (1996).
17. C. Micheletti, F. Seno, A. Maritan, and J. R. Banavar, Proteins, 32, 80 (1998).
18. P. B. Harbury, T. Zhang, P. S. Kim, and T. Alber, Science, 262, 1401 (1993).
19. B. I. Dahiyat and S. L. Mayo, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 94, 10 172 (1997).
20. T. L. Chiu and R. A. Goldstein, Protein Eng., 11, 749 (1998).
21. Y. Isogai, M. Ota, T. Fujisawa, H. Izuno, M. Mukai, H. Nakamura, T. Iizuka, and K. Nishikawa, Biochemistry, 38, 7431 (1999).
22. B. I. Dahiyat, D. B. Gordon, and S. L. Mayo, Protein Sci., 6, 1333 (1997).
23. M. H. Hecht, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 91, 8729 (1994).
24. S. L. Mayo, B. D. Olafson, and W. A. Goddard III, J. Phys. Chem., 94, 8897 (1990).
25. A. G. Street and S. L. Mayo, Folding & Des., 3, 253 (1998).
26. J. Desmet, M. De Maeyer, B. Hazes, and I. Lasters, Nature (London), 356, 539 (1992).
27. R. F. Goldstein, Biophys. J., 66, 1335 (1994).
28. D. B. Gordon and S. L. Mayo, J. Comput. Chem., 19, 1505 (1998).
29. R. L. Dunbrack and M. Karplus, J. Mol. Biol., 230, 543 (1993).
30. D. B. Gordon and S. L. Mayo, Structure, 7, 1089 (1999).
31. A. H. Elcock, J. Mol. Biol., 284, 489 (1998).
32. M. H. J. Cordes, A. R. Davidson, and R. T. Sauer, Curr. Opin. Struct. Biol., 6, 3 (1996).