Preparation and characterization of self-assembled double-stranded DNA (dsDNA) microarrays for protein:dsDNA screening using atomic force microscopy

Langmuir

Volumn 16, Issue 24, 2000, Pages 9559-9567

  O'Brien, Janese C ^a   Stickney, John T ^b   Porter, Marc D ^a  

^a IOWA STATE UNIVERSITY   (United States)

^b IOWA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CHARACTERIZATION; ENZYME IMMOBILIZATION; FLOW INTERACTIONS; FLUORESCENCE; MONOLAYERS; OLIGOMERS; PROTEINS; SCREENING; SPATIAL VARIABLES CONTROL; SYNTHESIS (CHEMICAL); X RAY DIFFRACTION ANALYSIS;

IMMOBILIZED OLIGONUCLEOTIDES; PACKING DENSITY;

DNA SEQUENCES;

EID: 0034317171     PISSN: 07437463     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la000570c     Document Type: Article

References (31)

1. D. E. Bassett, J.; Eisen, M. B.; Boguski, M. S. Nat. Genet. 1999, 21 (Suppl), 51-55.
2. Wang, K.; Gan, L.; Jeffery, E.; Gayle, M.; Gown, A. M.; Skelly, M.; Nelson, P. S.; Ng, W. V.; Schummer, M.; Hood, L.; Mulligan, J. Gene 1999, 229, 101-108.
3. Hacia, J. G. Nat. Genet. 1999, 21 (Suppl), 42-47.
4. Bulyk, M. L.; Gentalen, E.; Lockhart, D. J.; Church, G. M. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 573-577.
5. Fodor, S. P. A.; Read, J. L.; Pirrung, M. C.; Stryer, L.; Lu, A. T.; Solas, D. Science 1991, 251, 767-773.
6. McGall, G. H.; Barone, A. D.; Diggelmann, M.; Fodor, S. P. A.; Gentalen, E.; Ngo, N. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5081-5090.
7. Southern, E.; Mir, K.; Shchepinov, M. Nat. Genet. 1999, 21 (Suppl), 5-9.
8. Carlson, R.; Brent, R. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 536-537.
9. O'Brien, J. C.; Stickney, J. T.; Porter, M. D. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5004-5005.
10. Herne, T. M.; Tarlov, M. J. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8916-8920.
11. Peterlinz, K. A.; Georgiadis, R. M.; Herne, T. M.; Tarlov, M. J. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3401-3402.
12. Frutos, A. G.; Smith, L. M.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10 277-10 282.
13. Brockman, J. M.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8044-8051.
14. Frutos, A. G.; Brockman, J. M.; Corn, R. M. Langmuir 2000, 16, 2192-2197.
15. Jones, V. W.; Kenseth, J. R.; Porter, M. D.; Mosher, C. L.; Henderson, E. Anal. Chem. 1998, 70, 1233-1241.
16. O'Brien, J. C.; Jones, V. W.; Porter, M. D.; Mosher, C. L.; Henderson, E. Anal. Chem. 2000, 72, 703-710.
17. Voet, D.; Voet, J. G. In Biochemistry; John Wiley and Sons: New York, 1995; p 853.
18. Tarlov, M. J.; Burgess, D. R. F., Jr.; Gillen, G. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 5305-5306.
19. Lewis, M.; Tarlov, M.; Carron, K. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9574-9575.
20. Castner, D. G.; Hinds, K.; Grainger, D. W. Langmuir 1996, 12, 5083-5086.
21. Levicky, R.; Herne, T. M.; Tarlov, M. J.; Satija, S. K. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9787-9792.
22. Nuzzo, R. G.; Zegarski, B. R.; Dubois, L. H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 733-740.
23. Biebuyck, H. A.; Whitesides, G. M. Langmuir 1993, 9, 1766-1770.
24. Lewis, M.; Tarlov, M.; Carron, K. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9574.
25. Nuzzo, R. G.; Fusco, F. A.; Allara, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2358-2368.
26. Brown, T.; Brown, D. J. S. In Oligonucleotides and Analogues: A Practical Approach; Eckstein, F., Ed.; IRL Press: Oxford, 1991; pp 1-24.
27. Yokota, H.; Johnson, F.; Lu, H.; Robinson, R. M.; Belu, A. M.; Garrison, M. D.; Ratner, B. D.; Trask, B. J.; Miller, D. L. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 1064-1070.
28. Rosenberg, J. M.; McClarin, J. A.; Frederick, C. A.; Grable, J.; Boyer, H. W.; Greene, P. J. Gene Amplif. Anal. 1987, 5, 119-145.
29. Walczak, M. M.; Alves, C. A.; Lamp, B. D.; Porter, M. D. J. Electroanal. Chem. 1995, 396, 103-114.
30. Ishida, T.; Yamamoto, S.; Mizutani, W.; Motomatsu, M.; Tokumoto, H.; Hokari, H.; Azehara, H.; Fujihara, M. Langmuir 1997, 13, 3261-3265.
31. Ulman, A.; Eilers, J. E.; Tillman, N. Langmuir 1989, 5, 1147-1152.