Hydropathic interaction analysis of sequence-specific heparin pentasaccharide binding to antithrombin

Medicinal Chemistry Research

Volumn 9, Issue 7-8, 1999, Pages 643-655

  Desai, Umesh R ^a   Gunnarsson, Gunnar T ^a  

^a VIRGINIA COMMONWEALTH UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTITHROMBIN; HEPARIN; PENTASACCHARIDE;

ANTICOAGULATION; ARTICLE; CATALYSIS; CONFORMATIONAL TRANSITION; IONIC STRENGTH; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; RECEPTOR AFFINITY; SEQUENCE ANALYSIS; SITE DIRECTED MUTAGENESIS;

EID: 0033367147     PISSN: 10542523     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (28)

1. 1. Linhardt, R. J.; Loganathan D. In Biomimetic Polymers; Gebelein, C. G., Ed.; Plenum Press: NY, 1990; pp 135-173.
2. 2. Rosenberg, R. D.; Damus, P. S. J. Biol. Chem. 1973, 248, 6490-6505.
3. 3. Björk, I.; Olson, S. T.; Shore, J. D. In Heparin : Chemical and Biological Properties, Clinical Applications; Lane, D. L.; Lindahl, U., Ed.; Edward Arnold: London, 1989; pp. 229 -255.
4. 4. Choay, J.; Petitou, M.; Lormeau, J.-C.; Sinäy, P.; Casu, B.; Gatti, G. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1983, 116, 492-499.
5. 5. Olson, S. T. J. Biol. Chem. 1988, 263, 1698-1708.
6. 6. Olson, S. T.; Shore, J. D. J. Biol. Chem. 1981, 256, 11065-11072.
7. 7. Olson, S. T.; Srinivasan, K. R.; Björk, I.; Shore, J. D. J. Biol. Chem. 1981, 256, 11073-11079.
8. 8. Olson, S. T.; Björk, I. Semin. Thromb. Hemostasis 1994, 20, 373-409.
9. 9. Olson, S. T.; Björk, I.; Sheffer, R.; Craig, P. A.; Shore, J. D.; Choay, J. J. Biol. Chem. 1992, 267, 12528-12538.
10. 10. Desai, U. R.; Petitou, M.; Björk, I.; Olson, S. T. J. Biol. Chem. 1998, 273, 7478-7487.
11. 11. Desai, U. R.; Petitou, M.; Björk, I.; Olson, S. T. Biochemistry 1998, 37, 13033-13041.
12. 12. Gettins, P. G. W.; Patston, P. A.; Olson, S. T. "Serpins: Structure, Function and Biology" 1996, R. G. Landes, Austin, TX pp. 65-79.
13. 13. Carrell, R. W.; Stein, P. E.; Fermi, G.; Wardell, M. R. Structure 1994, 2, 257-270.
14. 14. Jin, L.; Abrahams, J. P.; Skinner, R.; Petitou, M.; Pike, R. N.; Carrell, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 14683-14688.
15. 15. Ersdal-Badju, E.; Lu, A. Q.; Zuo, Y. C.; Picard, V.; Bock, S. C. J. Biol. Chem. 1997, 272, 19393-19400.
16. 16. Gandrille, S.; Aiach, M.; Lane, D. A.; Vidaud, D.; Molho-Sabatier, P.; Caso, R.; de Moerloose, P.; Fiessinger, J.-N.; Clauser, E. J. Biol. Chem. 1990, 265, 18997-19001.
17. 17. Arocas, V.; Bock, S. C.; Olson, S. T.; Björk, I. Biochemistry 1999, 38, 10198-10204.
18. 18. Fan, B.; Turko, I. V.; Gettins, P. G.W. Biochemistry 1994, 33, 14156-14161.
19. 19. Kridel, S. J.; Chan, W. W.; Knauer, D. J. J. Biol. Chem. 1996, 271, 20935-20941.
20. 20. Wireko, F. C.; Kellogg, G. E.; Abraham, D. J. J. Med. Chem. 1991, 34, 758-767.
21. 21. Kellogg, G. E.; Semus, S. F.; Abraham, D. J. J. Comput. Aided Mol. Design 1991, 5, 545-552.
22. 22. Kellogg, G. E.; Joshi, G. S.; Abraham, D. J. Med. Chem. Res. 1992, 1, 444-453.
23. 23. Kellogg, G. E.; Scarsdale, J. N.; Fornari, Jr., F. A. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 4721-4732.
24. 24. Gussio, R.; Pattabiraman, N.; Zaharevitz, D. W.; Kellogg, G. E.; Topol, I. A.; Rice, W. G.; Schaeffer, C. A.; Erickson, J. W.; Burt, S. K. J. Med. Chem. 1996, 39, 1645-1650.
25. 25. Abraham, D. J.; Kellogg, G. E.; Holt, J. M.; Ackers, G. K. J. Mol. Biol. 1997, 272, 613-632.
26. 26. Desai, U. R.; Petitou, M.; Björk, I.; Olson, S. T. J. Biol. Chem. 1999, (submitted).
27. 27. Gettins, P. G. W.; Fan, B.; Crews, B. C.; Turko, I. V.; Olson, S. T.; Streusand, V. J. Biochemistry 1993, 32, 8385-8389.
28. 28. van Boeckel, C. A. A.; Petitou, M. Angew. Chemie. Int. Ed. Engl. 1993, 32, 1671-1818.