Nucleotide analog interference mapping

Methods: A Companion to Methods in Enzymology

Volumn 18, Issue 1, 1999, Pages 38-50

  Ryder, Sean P ^a   Strobel, Scott A ^a  

^a YALE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

IODINE; NUCLEOTIDE DERIVATIVE; PHOSPHOROTHIOIC ACID DERIVATIVE; RNA;

ARTICLE; CHEMICAL MODIFICATION; GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; RNA ANALYSIS; RNA STRUCTURE; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; TECHNIQUE;

EID: 0032860382     PISSN: 10462023     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/meth.1999.0755     Document Type: Article

References (37)

1. Bevilacqua P. C., Turner D. H. Biochemistry. 30:1991;10632-10640.
2. Pieken W. A., Olsen D. B., Benseler F., Aurup H., Eckstein F. Science. 253:1991;314-317.
3. Pyle A. M., Cech T. R. Nature. 350:1991;628-631.
4. Strobel S. A., Cech T. R. Biochemistry. 32:1993;13593-13604.
5. Abramovitz D. L., Friedman R. A., Pyle A. M. Science. 271:1996;1410-1403.
6. Moore M. J., Sharp P. A. Science. 256:1992;992-997.
7. Strobel S. A., Shetty K. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;2903-2908.
8. Strobel S. A., Ortoleva-Donnelly L., Ryder S. P., Cate J. H., Moncoeur E. Nature Struct. Biol. 5:1998;60-66.
9. Orteleva-Donnelly L., Szewczak A. A., Gutell R. R., Strobel S. A. RNA. 4:1998;498-519.
10. Orteleva-Donnelly L., Kronman M., Strobel S. A. Biochemistry. 37:1998;12933-12942.
11. Conrad F., Hanne A., Gaur R. K., Krupp G. Nucleic Acids Res. 23:1995;1845-1853.
12. Gaur R. K., Krupp G. Nucleic Acids Res. 21:1993;21-26.
13. Hardt W. D., Erdmann V. A., Hartmann R. L. RNA. 2:1996;1189-1198.
14. Kazanstev A. V., Pace N. R. RNA. 4:1998;937-947.
15. Arabshahi A., Frey P. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 204:1994;150-155.
16. Eckstein F. Annu. Rev. Biochem. 54:1985;367-402.
17. Christian E. L., Yarus M. J. Mol. Biol. 228:1992;743-758.
18. Milligan J. F., Uhlenbeck O. C. Methods Enzymol. 180:1989;51-62.
19. Gish G., Eckstein F. Science. 240:1988;1520-1522.
20. Cech T. R. Annu. Rev. Biochem. 59:1990;543-568.
21. Green R., Ellington A. D., Szostak J. W. Nature. 347:1990;406-408.
22. Beaudry A. A., Joyce G. F. Science. 257:1992;635-641.
23. Mei R., Herschlag D. Biochemistry. 35:1996;5796-5809.
24. Cech T. R., Zaug A. J., Grabowski P. J. Cell. 27:1981;487-496.
25. Been M. D., Cech T. R. Cell. 50:1987;951-961.
26. Lingner J., Keller W. Nucleic Acids Res. 21:1993;2917-2920.
27. Engel J. D., von Hippel P. H. Biochemistry. 13:1974;4143-4158.
28. Sousa R., Padilla R. EMBO J. 14:1995;4609-4621.
29. Uesugi S., Miki H., Ikehara M., Iwahashi H., Kyogoku Y. Tetrahedron Lett. 42:1979;4073-4076.
30. Cate J. H., Gooding A. R., Podell E., Zhou K., Golden B. L., Kundrot C. E., Cech T. R., Doudna J. A. Science. 273:1996;1678-1685.
31. Steitz T. A., Beese L., Freemont P. S., Friedman J. M., Sanderson M. R. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 52:1987;465-471.
32. Huang Y., Eckstein F., Padilla R., Sousa R. Biochemistry. 36:1997;8231-8242.
33. Rife J. P., Cheng C. S., Moore P. B., Strobel S. A. Nucleic Acids Res. 26:1998;3640-3644.
34. Wang J.-F., Downs W. D., Cech T. R. Science. 260:1993;504-508.
35. Basu S., Rambo R. P., Strauss-Soukup J., Cate J. H., Ferre-D'Amare A. R., Strobel S. A., Doudna J. A. Nat. Struct. Biol. 5:1998;986-992.
36. Orteleva-Donnelly, L. Moncoeur, E. Basu, S. Strobel, S. A.
37. Basu, S. Strobel, S. A.