Conformation of highly-charged gas-phase lysozyme revealed by energetic surface imprinting

Journal of the American Chemical Society

Volumn 120, Issue 30, 1998, Pages 7608-7616

  Reimann, C T ^a   Sullivan, P A ^b   Axelsson, J ^c   Quist, A P ^d   Altmann, S ^e   Roepstorff, P ^f   Velazquez I ^a   Tapia, O ^a  

^a UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

^b Vapor Technologies Inc   (United States)

^c MANNE SIEGBAHN LABORATORY   (Sweden)

^d UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^e EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY   (Germany)

^f UNIVERSITY OF SOUTHERN DENMARK   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

LYSOZYME;

ARTICLE; ENZYME STRUCTURE; GAS; IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR DYNAMICS; SCANNING FORCE MICROSCOPY; THEORY;

EID: 0032486762     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja980178+     Document Type: Article

References (75)

1. Karas, M.; Hillenkamp, F. Anal. Chem. 1988, 60, 2299-2301.
2. Fenn, J. B.; Mann, M.; Meng, C. K.; Wong, S. F.; Whitehouse, C. M. Science 1989, 246, 64-71.
3. Chen, R.; Cheng, X.; Mitchell, D. W.; Hofstadler, S. A.; Wu, Q.; Rockwood, A. L.; Sherman, M. G.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1995, 67, 1159-1163.
4. Smith, R. D.; Cheng, X.; Bruce, J. E.; Hofstadler, S. A.; Anderson, G. A. Nature 1994, 369, 137-139.
5. Jones, J. L.; Dongré, A. R.; Somogyi, A.; Wysocki, V. H. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 8368-8369.
6. Covey, T.; Douglas, D. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1993, 4, 616-623.
7. Cox, K. A.; Julian, R. K.; Cooks, R. G.; Kaiser, R. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 127-136.
8. Collings, B. A.; Douglas, D. J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 4488-4489.
9. von Helden, G.; Wyttenbach, T.; Bowers, M. T. Science 1995, 267, 1483-1485.
10. Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F.J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10141-10142.
11. Shelimov, K. B.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 10313-10314.
12. Shelimov, K. B.; Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2240-2248.
13. Shelimov, K. B.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2987-2994.
14. Valentine, S. J,; Anderson, J. G.; Ellington, A. D.; Clemmer, D. E. J. Phvs. Chem. 1997, 101, 3891-3900.
15. McLuckey, S. A.; van Berkel, G. J.; Glish, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 5668-5670.
16. Loo, R. R. O.; Winger, B. E.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 1064-1071.
17. Winger, B. E.; Light-Wahl, K. J.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom, 1992, 3, 624-630.
18. Hunter, A. P.; Severs, J. C.; Harris, F. M.; Games, D. E. Rap. Comm. Mass Spectrom. 1994, 8, 417-422.
19. Wood, T. D.; Chorush, R. A.; Wampler, F. M. III; Little, D. P.; O'Connor, P. B.; McLafferty, F. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 2451-2454.
20. Gross, D. S.; Schnier, P. D.; Rodriguez-Cruz, S. E.; Fagerquist, C. K.; Williams, E. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 3143-3148.
21. Schnier, P. D.; Gross, D. S.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6747-6757.
22. Cassady, C. J.; Carr, S. R. J. Mass Spectrom. 1996, 31, 247-254.
23. Kaltashov, I. A.; Fenselau, C. Proteins: Struct., Funct. Gen. 1997, 27, 165-170.
24. Przybylski, M.; Glocker, M. O. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1996, 35, 806-826.
25. Loo, J, A. Bioconjugate Chem. 1995, 6, 644-665.
26. Lazaridis, T.; Karplus, M. Science 1997, 278, 1928-1931.
27. Dill, K. A.; Bromberg, S.; Yue, K. Z.; Fiebig, K. M.; Yee, D. P.; Thomas, P. D.; Chan, H. S. Protein Science 1995, 4, 561 -602.
28. Dill, K. A. Biochem. 1990, 29, 7133-7155.
29. Ladbury, J. E. Chem. Bio. 1996, 3, 973-980.
30. Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 2426-2427.
31. Adams, J.; Strobel, F. H.; Reiter, A.; Sullards, M. C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 30-41.
32. Kaltashov, I. A.; Fenselau, C. C. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9906-9910.
33. Szilágyi, Z.; Drahos, L.; Vékey, K. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 689-696.
34. Håkansson, P.; Della-Negra, S.; Mouffron, J. P.; Waast, B.; Sullivan, P. A. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1996, 112, 39-47.
35. Axelsson, J.; Parilis, E. S.; Reimann, C. T.; Sullivan, P.; Sundqvist, B. U. R. Nucl. Iustrum. Methods Phys. Res. B 1995, 101, 343-356.
36. Axelsson, J.; Reimann, C. T.; Sundqvist, B. U. R. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1994, 88, 131-137.
37. Axelsson, J.; Reimann, C. T.; Sundqvist, B. U. R. Int. J. Mass Spectrom. Ion Proc. 1994, 133, 141-155.
38. Zubarev, R. A.; Bitensky, I. S.; Demirev, P. A.; Sundqvist, B. U. R. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1994, 88, 143-148.
39. Sullivan, P. A.; Axelsson, J.; Sundqvist, B. U. R. Rapid Comm. Mass Spectrom. 1995, 9, 377-382.
40. Sullivan, P. A.; Reimann, C. T.; Axelsson, J.; Altmann, S.; Quist, A. P.; Sundqvist, B. U. R. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1996, 7, 329-341.
41. Reimann, C. T.; Sullivan, P. A.; Türpitz, A.; Altmann. S.; Quist, A. P.; Bergman, A.; Oscarsson, S. O.; Sundqvist, B. U. R.; Håkansson, P. Surf. Sci. Lett. 1995, 341, L1019-L1024.
42. Reimann, C. T.; Quist, A. P.; Kopniczky, J.; Sundqvist, B. U. R.; Erlandsson, R.; Tengvall, P. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1994, 88, 29-34.
43. Quist, A. P.; Ahlbom, J.; Reimann, C. T.; Sundqvist, B. U. R. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1994, 88, 164-169.
44. Quate, C. F. Surf. Sci. 1994, 299/300, 980-995.
45. Rohrer, H. Surf. Sci. 1994, 299/300, 956-964.
46. Sullivan, P. A.; Reimann, C. T.; Axelsson, J.; Quist, A. P.; Håkansson, P.; Sundqvist, B. U. R. In 44th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics; Portland, OR, 1996: pp 775-776.
47. van Gunsteren, W. F.; Berendsen, H. J. C. Groningen Molecular Simulation (GROMOS) Library Manual; Biomos: Nijenborgh 16, 9747 AG Groningen, The Netherlands, 1987.
48. Reimann, C. T.; Velázquez, I.; Tapia, O. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2277-2283.
49. Thomsen, J.; Bayne, S. J. Protein Chem. 1988, 7, 295-296.
50. Allen, M. H.; Vestel, M. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992, 3, 18.
51. Bondarenko, P. V.; Grant, P. G.; Macfarlane, R. D. Int. J. Mass Spectrom. Ion Proc. 1994, 131, 181.
52. Xu, Y.; Bae, Y. K.; Beuhler, R. J.; Friedman, L. J. Phys. Chem. 1993, 97, 11883-11886.
53. Matthew, M. W.; Beuhler, R. J.; Ledbetter, M.; Friedman, L. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1986, 14, 448-460.
54. Marton, D.; Bu, H.; Boyd, K. J.; Todorov, S. S.; Al-Bayati, A. H.; Rabalais, J. W. Surf. Sci. 1995, 326, L489-L493.
55. Li, T.; King, B. V.; MacDonald, R. J.; Cotterill, G. F.; O'Connor, D. J.; Yang. Q. Suif. Sci. 1994, 312, 399-410.
56. Bräuchle, G.; Richard-Schneider, S.; Illia, D.; Rockenberger, J.; Beck, R. D.; Kappes, M. M. Appl. Phys. Lett. 1995, 67, 52-54.
57. Reimann, C. T.; Andersson, S.; Brühwiler, P.; Märtensson, N.; Olsson, L.; Erlandsson, R.; Henkel, M.; Urbassek, H. M. Nucl. Instrum. Methods Phvs. Res. B 1998, 140, 159-170.
58. Baba, S.; Katakuse, L.; Ikeya, M. Solid State Phys. 1991, 26, 317-322.
59. Katakuse, I.; Baha, S.; Ichihara, T.; Ikeya, M. Japan. J. Appl. Phys. Part 1 1992, 31, 1245-1247.
60. Seki, T.; Kaneko, T.; Takeuchi, D.; Aoki, T.; Matsuo, J.; Insepov, Z.; Yamada, I. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 1997, 121, 498-502.
61. Odin, C.; Aimé, J. P.; Kaakour, Z. E.; Bouhacina, T. Surf. Sci. 1994, 317, 321-340.
62. Insepov, Z.; Yamada, I. Mail. Sci. Eng. A 1996, 217-218, 89-93.
63. Szenes, G. Phys. Rev: B 1995, 51, 8026-8029.
64. Agranat, M. B.; Ashitkov, S. I.; Kirillin, A. V.; Kostanovskii, A. V.; Fonov, V. E.; Anisimov, S. I.; Kondratenko, P. S. JETP-Lett. 1997, 66, 699-703.
65. Dresselhaus, M. S.; Kalish, R. Ion Implantation in Diamond, Graphite and Related Materials; Springer-Verlag: Berlin, 1992.
66. Brauchte, G.; Richard-Schneider, S.; Illig, D.; Beck, R. D.; Schreiber, H.; Kappes, M. M. Nucl. Instrum. Methods Phys. B 1996, 112, 105-108.
67. Wilson, K. P.; Malcolm, B. A.; Matthews, B. W. J. Biol Chem. 1992, 267, 10842.
68. Åqvist, J.; van Gunsteren, W. F.; Leijonmarck, M.; Tapia, O. J. Mol. Biol. 1985, 183, 461-477.
69. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Nola, A. D.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
70. Lemak, A. S.; Balabaev, N. K. Mol. Sim. 1994, 13, 177-187.
71. Radford, S. E.; Dobson, C. M.; Evans, P. A. Nature 1992, 358, 302-307.
72. Daggett, V.; Levitt, M. J. Mol. biol. 1992, 223, 1121 -1138.
73. Monoi, H. Biophys. J. 1995, 69, 1130-1141.
74. McCammon, J. A.; Gelin, B. R.; Karplus, M.; Wolynes, P. G. Nature 1976, 262, 325-326.
75. Hünenberger, P. H.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. Proteins: Struct., Funct. Gen. 1995, 21, 196-213.