Molecular Dynamics Simulations of the Charge-Induced Unfolding and Refolding of Unsolvated Cytochrome c

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 103, Issue 45, 1999, Pages 10017-10021

  Mao, Yi ^a   Ratner, Mark A ^a   Jarrold, Martin F ^a  

^a NORTHWESTERN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000011119     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp991093d     Document Type: Article

References (38)

1. Linderstrøm-Lang, K. C. R. Trav. Lab. Carlsberg 1924, 75, 1.
2. Tanford, C.; Kirkwood, J. G. J. Am. Chem. Soc. 1957, 79, 5333.
3. Tanford, C.; Roxby, R. Biochemistry 1972, 77, 2192.
4. Bashford, D.; Karplus, M. Biochemistry 1990, 29, 10219.
5. Schaefer, M.; Sommer, M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1997, 101, 1663.
6. Sternberg, M. J. E.; Hayes, F. R. F.; Russell, A. J. Thomas, P. G.; Fersht, A. R. Nature 1987, 330, 84.
7. Warshel, A.; Russell, S. Q. Rev. Biophys. 1984, 17, 283.
8. Sharp, K. A.; Honig, B. Annu. Rev. Biophys. Chem. 1990,19, 301.
9. Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10141.
10. Shelimov, K. B.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1996,118,10313.
11. Shelimov, K. B.; Jarrold, M. F. /. Am. Chem. Soc. 1997,119,2987.
12. Shelimov, K. B.; Clemmer, D. E.; Hudgins, R. R.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2240.
13. Hudgins, R. R.; Woenckhaus, J.; Jarrold, M. F. Int J. Mass Spectrom. Ion Processes 1997, 165, 497.
14. Mao, Y.; Woenckhaus, J.; Kolafa, J.; Ratner, M. A.; Jarrold, M. F. J. Am. Chem. Soc., in press.
15. Valentine, S. J.; Clemmer, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1997, 779, 3558.
16. Valentine, S. J.; Anderson, J. G.; Ellington, A. D.; Clemmer, D. E. J. Phys. Chem. B 1997, 707, 3891.
17. Valentine, S. J.; Counterman, A. E.; Clemmer, D. E. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 954.
18. Clemmer, D. E.; Jarrold, M. F. J. Mass Spectrom. 1997, 32, 577-592.
19. Suckau, D.; Shi, Y.; Beu, S. C.\ Senko, M. W.; Quinn, J. P.; Wampler, F. M.; McLafferty, F. W. Proc. Nall. Acad. Sei. U.S.A. 1993, 90, 790.
20. Wood, T. D.; Chorush, R. A.; Wampler, F. M.; Little, D. P.; O'Connor, P. B.; McLafferty, F. W. Proc. Natl. Acad. Sei. U.S.A. 1995, 92, 2451.
21. McLafferty, F. W.; Guan, Z.; Haupts, U.; Wood, T. D.; Kelleher, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 720, 4732.
22. Reimann, C. T.; Velazquez, L; Tapia, O. J. Phys. Chem. 1998,102, 9344.
23. Theorell, H.; Akesson, A. J. Am. Chem. Soc. 1941, 63, 1818.
24. Robinson, J. B., Jr.; Strottmann, J. M.; Stelhvagen, E. J. Biol. Chem. 1983, 258, 6772.
25. Myer, Y. P.; Saturno, A. F. J. Protein Chem. 1991, 5, 481.
26. Goto, Y.; Nishikiori, S. J. Mol. Biol. 1991, 222, 679.
27. Tsong, T. Y. Biochem. 1973, 12, 2209.
28. Dyson, H. J.; Beattie, J. K. J. Biol. Chem. 1982, 257, 2267.
29. Pryse, K. M.; Bruckman, T. G.; Maxfield, B. W.; Elson, E. L. Biochemistry 1992, 31, 5127.
30. Ohgushi, M.; Wada, A. FEBS Lett. 1983, 164, 21.
31. (31) Kolafa, J. Unpublished (http://www.icpf.cas.cz/jiri).
32. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 2, 187.
33. Van Gunsteren, W. F.; Berendsen, H. J. C. Mol. Phys. 1977, 34, 1311.
34. Schnier, P. D.; Gross, D. S.; Williams, E. R. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6747.
35. Bushnell, G. W.; Louie, G. V.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1990, 214, 585.
36. Shvartsberg, A. A.; Jarrold, M. F. Chem. Phys. Lett. 1996, 267, 86.
37. Mesleh, M. F.; Hunter, J. M.; Shvartsberg. A. A.; Schatz, G. C.; Jarrold, M. F. J. Phys. Chem. 1996, 700, 16028.
38. Alonso, D. O. V.; Daggett, V. Protein Sei. 1998, 7, 860.