Probing molecular interfaces using 2D magic-angle-spinning NMR on protein mixtures with different uniform labeling

Journal of the American Chemical Society

Volumn 126, Issue 45, 2004, Pages 14746-14751

  Etzkorn, Manuel ^a   Böckmann, Anja ^b   Lange, Adam ^a   Baldus, Marc ^a  

^a MAX PLANCK INSTITUTE FOR BIOPHYSICAL CHEMISTRY   (Germany)

^b INSTITUT DE BIOLOGIE ET CHIMIE DES PROTÉINES   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CRYSTALLINE MATERIALS; MIXTURES; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTEINS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

MAGIC-ANGLE-SPINNING; MICROCRYSTALLINE STATE; MOLECULAR INTERFACES; MOLECULAR MIXTURES;

INTERFACES (MATERIALS);

AMINO ACID; MONOMER; PROTEIN;

ARTICLE; CELL HETEROGENEITY; CHEMICAL INTERACTION; CRYSTAL STRUCTURE; DIMERIZATION; MAGIC ANGLE SPINNING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; SPECTROSCOPY; SPIN LABELING;

AMINO ACID SEQUENCE; BACTERIAL PROTEINS; CARBON ISOTOPES; DIMERIZATION; GLUCOSE; GLYCINE; ISOTOPE LABELING; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NITROGEN ISOTOPES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PHOSPHOPROTEINS; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY;

EID: 8844247837     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja0479181     Document Type: Article

References (36)

1. Christensen, A. M.; Schaefer, J. Biochemistry 1993, 32, 2868-2873.
2. Hirsh, D. J.; Hammer, J.; Maloy, W. L.; Blazyk, J.; Schaefer, J. Biochemistry 1996, 35, 12733-12741. Fu, R. Q.; Gotten, M.; Cross, T. A. J. Biomol. NMR 2000, 16, 261-268. Smith, S. O.; Smith, C.; Shekar, S.; Peersen, O.; Ziliox, M.; Aimoto, S. Biochemistry 2002, 41, 9321-9332.
3. Hirsh, D. J.; Hammer, J.; Maloy, W. L.; Blazyk, J.; Schaefer, J. Biochemistry 1996, 35, 12733-12741. Fu, R. Q.; Gotten, M.; Cross, T. A. J. Biomol. NMR 2000, 16, 261-268. Smith, S. O.; Smith, C.; Shekar, S.; Peersen, O.; Ziliox, M.; Aimoto, S. Biochemistry 2002, 41, 9321-9332.
4. Hirsh, D. J.; Hammer, J.; Maloy, W. L.; Blazyk, J.; Schaefer, J. Biochemistry 1996, 35, 12733-12741. Fu, R. Q.; Gotten, M.; Cross, T. A. J. Biomol. NMR 2000, 16, 261-268. Smith, S. O.; Smith, C.; Shekar, S.; Peersen, O.; Ziliox, M.; Aimoto, S. Biochemistry 2002, 41, 9321-9332.
5. Benzinger, T. L. S.; Gregory, D. M.; Burkoth, T. S.; Miller-Auer, H.; Lynn, D. G.; Botto, R. E.; Meredith, S. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13407-13412. Antzutkin, O. N.; Balbach, J. J.; Leapman, R. D.; Rizzo, N. W.; Reed, J.; Tycko, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13045-13050.
6. Benzinger, T. L. S.; Gregory, D. M.; Burkoth, T. S.; Miller-Auer, H.; Lynn, D. G.; Botto, R. E.; Meredith, S. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 13407-13412. Antzutkin, O. N.; Balbach, J. J.; Leapman, R. D.; Rizzo, N. W.; Reed, J.; Tycko, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13045-13050.
7. McDowell, L. M.; Schaefer, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1996, 6, 624-629. Griffin, R. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 508-512. Dusold, S.; Sebald, A. Annu. Rep. NMR Spectrosc. 2000, 41, 185-264.
8. McDowell, L. M.; Schaefer, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1996, 6, 624-629. Griffin, R. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 508-512. Dusold, S.; Sebald, A. Annu. Rep. NMR Spectrosc. 2000, 41, 185-264.
9. McDowell, L. M.; Schaefer, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1996, 6, 624-629. Griffin, R. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 508-512. Dusold, S.; Sebald, A. Annu. Rep. NMR Spectrosc. 2000, 41, 185-264.
10. Andrew, E. R.; Bradbury, A.; Eades, R. G. Nature 1958, 182, 1659.
11. Kaustov, L.; Kababya, S.; Du, S. C.; Baasov, T.; Cropper, S.; Shoham, Y.; Schmidt, A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 2649-2650.
12. Pauli, J.; Baldus, M.; van Rossum, B.; de Groot, H.; Oschkinat, H. Chembiochem 2001, 2, 272-281. Igumenova, T. I.; Wand, A. J.; McDermott, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5323-5331. Igumenova, T. I.; McDermott, A. E.; Zilm, K. W.; Martin, R. W.; Paulson, E. K.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6720-6727.
13. Pauli, J.; Baldus, M.; van Rossum, B.; de Groot, H.; Oschkinat, H. Chembiochem 2001, 2, 272-281. Igumenova, T. I.; Wand, A. J.; McDermott, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5323-5331. Igumenova, T. I.; McDermott, A. E.; Zilm, K. W.; Martin, R. W.; Paulson, E. K.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6720-6727.
14. Pauli, J.; Baldus, M.; van Rossum, B.; de Groot, H.; Oschkinat, H. Chembiochem 2001, 2, 272-281. Igumenova, T. I.; Wand, A. J.; McDermott, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5323-5331. Igumenova, T. I.; McDermott, A. E.; Zilm, K. W.; Martin, R. W.; Paulson, E. K.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6720-6727.
15. Böckmann, A.; Lange, A.; Galinier, A.; Luca, S.; Giraud, N.; Heise, H.; Juy, M.; Montserret, R.; Penin, F.; Baldus, M. J. Biomol. NMR 2003, 27, 323-339.
16. Tycko, R.; Ishii, Y. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6606-6607. de Boer, I.; Matysik, J.; Amakawa, M.; Yagai, S.; Tamiaki, H.; Holzwarth, A. R.; de Groot, H. J. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13374-13375.
17. Tycko, R.; Ishii, Y. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6606-6607. de Boer, I.; Matysik, J.; Amakawa, M.; Yagai, S.; Tamiaki, H.; Holzwarth, A. R.; de Groot, H. J. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13374-13375.
18. Baldus, M. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2002, 41, 1-47.
19. Juy, M.; Penin, F.; Favier, A.; Galinier, A.; Montserret, R.; Haser, R.; Deutscher, J.; Böckmann. A. J. Mol. Biol. 2003, 332, 767-776.
20. Penin, F.; Favier, A.; Montserret, R.; Brutscher, B.; Deutscher, J.; Marion, D.; Galinier, A. J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2001, 3, 429-432.
21. Hartmann, S. R.; Hahn, E. L. Phys. Rev. 1962, 128, 2042-2053.
22. Baldus, M.; Petkova, A. T.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. Mol. Phys. 1998, 95, 1197-1207.
23. Baldus, M.; Geurts, D. G.; Hediger, S.; Meier, B. H. J. Magn. Reson., Ser. A 1996, 118, 140-144.
24. Bennett, A. E.; Rienstra, C. M.; Auger, M.; Lakshmi, K. V.; Griffin, R. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 6951-6958.
25. Lange, A. Diploma thesis, University Goettingen, 2002.
26. Lange, A.; Luca, S.; Baldus, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9704-9705.
27. Lange, A.; Seidel, K.; Verdier, L.; Luca, S.; Baldus, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12640-12648.
28. Smith, S. A.; Levante, T. O.; Meier, B. H.; Ernst, R. R. J. Magn. Reson., Ser: A 1994, 106, 75-105.
29. Baldus, M.; Levante, T. O.; Meier, B. H. Z. Naturforsch., A: Phys. Sci. 1994, 49, 80-88.
30. Alkaraghouli, A. R.; Cole, F. E.; Lehmann, M. S.; Miskell, C. F.; Verbist, J. J.; Koetzle, T. F. J. Chem. Phys. 1975, 63, 1360-1366.
31. Lee, M.; Goldburg, W. I. Phys. Rev. 1965, 140, 1261-1271.
32. Favier, A.; Brutscher, B.; Blackledge, M.; Galinier, A.; Deutscher, J.; Penin, F.; Marion, D. J. Mol. Biol. 2002, 317, 131-144.
33. Lesage, A.; Böckmann, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13336-13337.
34. LeMaster, D. M.; Kushlan, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 9255-9264.
35. Russell, R. B.; Alber, F.; Aloy, P.; Davis, F. P.; Korkin, D.; Pichaud, M.; Topf, M.; Sali, A. Curr. Opin. Struct. Biol. 2004, 14, 313-324.
36. Pickford, A. R.; Campbell, I. D. Chem. Rev. 2004, 104, 3557-3565.