In vitro characterization of a novel Isu homologue from Drosophila melanogaster for de novo FeS-cluster formation

Metallomics

Volumn 9, Issue 1, 2017, Pages 48-60

  Dzul, Stephen P ^a   Rocha, Agostinho G ^b   Rawat, Swati ^a   Kandegedara, Ashoka ^a   Kusowski, April ^a   Pain, Jayashree ^c   Murari, Anjaneyulu ^c   Pain, Debkumar ^c   Dancis, Andrew ^b   Stemmler, Timothy L ^a  

^a WAYNE STATE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^c RUTGERS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; DIMERS; MACHINERY; MITOCHONDRIA; PROTEINS; SCAFFOLDS (BIOLOGY); SULFUR;

BIOLOGICAL PATHWAYS; CLUSTER ASSEMBLY; CLUSTER FORMATIONS; CYSTEINE DESULFURASE; DROSOPHILA MELANOGASTER; INHERENT INSTABILITY; IRON-SULFUR CLUSTERS; PRODUCTION PATHWAYS;

YEAST;

DIMER; DROSOPHILA PROTEIN; IRON SULFUR PROTEIN; ISU1 PROTEIN; RECOMBINANT FISCU PROTEIN; RECOMBINANT PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG; IRON; ISU1 PROTEIN, S CEREVISIAE; MITOCHONDRIAL PROTEIN; PROTEIN BINDING; SACCHAROMYCES CEREVISIAE PROTEIN; SULFUR;

ANIMAL EXPERIMENT; ARTICLE; CLUSTER ANALYSIS; CONTROLLED STUDY; DIMERIZATION; DIPTERA; DROSOPHILA MELANOGASTER; FUNGAL STRAIN; GENE DELETION; IN VITRO STUDY; IN VIVO STUDY; MITOCHONDRION; MOLECULAR EVOLUTION; MOLECULAR MECHANICS; NONHUMAN; ORTHOLOGY; PARALOGY; PHENOTYPE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ASSEMBLY; PROTEIN EXPRESSION; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; PROTEIN SYNTHESIS; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SIGNAL TRANSDUCTION; AMINO ACID SEQUENCE; ANIMAL; GROWTH, DEVELOPMENT AND AGING; METABOLISM; MOLECULAR MODEL; SEQUENCE HOMOLOGY;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; DROSOPHILA MELANOGASTER; IN VITRO TECHNIQUES; IRON; IRON-SULFUR PROTEINS; MITOCHONDRIA; MITOCHONDRIAL PROTEINS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN BINDING; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SACCHAROMYCES CEREVISIAE PROTEINS; SEQUENCE HOMOLOGY; SULFUR;

EID: 85011005468     PISSN: 17565901     EISSN: 1756591X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c6mt00163g     Document Type: Article

References (52)

1. V. Campuzano L. Montermini M. D. Molto L. Pianese M. Cossee F. Cavalcanti E. Monros F. Rodius F. Duclos A. Monticelli F. Zara J. Canizares H. Koutnikova S. I. Bidichandani C. Gellera A. Brice P. Trouillas G. De Michele A. Filla R. De Frutos F. Palau P. I. Patel S. Di Donato J. L. Mandel S. Cocozza M. Koenig M. Pandolfo Science 1996 271 1423 1427
2. R. Lodi C. Tonon V. Calabrese A. H. Schapira Antioxid. Redox Signaling 2006 8 438 443
3. F. Mochel and R. G. Haller, Myopathy with Deficiency of ISCU, in GeneReviews(R), ed., R. A. Pagon, M. P. Adam, H. H. Ardinger, S. E. Wallace, A. Amemiya, L. J. H. Bean, T. D. Bird, C. R. Dolan, C. T. Fong, R. J. H. Smith, and, K. Stephens, Seattle, WA, 1993
4. F. Mochel M. A. Knight W. H. Tong D. Hernandez K. Ayyad T. Taivassalo P. M. Andersen A. Singleton T. A. Rouault K. H. Fischbeck R. G. Haller Am. J. Hum. Genet. 2008 82 652 660
5. R. Lill V. Srinivasan U. Muhlenhoff Curr. Opin. Microbiol. 2014 22 111 119
6. R. Lill Nature 2009 460 831 838
7. J. N. Agar C. Krebs J. Frazzon B. H. Huynh D. R. Dean M. K. Johnson Biochemistry 2000 39 7856 7862
8. J. Gerber K. Neumann C. Prohl U. Muhlenhoff R. Lill Mol. Cell. Biol. 2004 24 4848 4857
9. H. D. Urbina J. J. Silberg K. G. Hoff L. E. Vickery J. Biol. Chem. 2001 276 44521 44526
10. N. Wiedemann E. Urzica B. Guiard H. Muller C. Lohaus H. E. Meyer M. T. Ryan C. Meisinger U. Muhlenhoff R. Lill N. Pfanner EMBO J. 2006 25 184 195
11. H. Webert S. A. Freibert A. Gallo T. Heidenreich U. Linne S. Amlacher E. Hurt U. Muhlenhoff L. Banci R. Lill Nat. Commun. 2014 5 5013
12. J. Bridwell-Rabb N. G. Fox C. L. Tsai A. M. Winn D. P. Barondeau Biochemistry 2014 53 4904 4913
13. A. Pandey D. M. Gordon J. Pain T. L. Stemmler A. Dancis D. Pain J. Biol. Chem. 2013 288 36773 36786
14. A. Parent X. Elduque D. Cornu L. Belot J.-P. LeCaer A. Grandas M. B. Toledano B. D'Autreaus Nat. Commun. 2015 6 5686
15. J. D. Cook K. C. Kondapalli S. Rawat W. C. Childs Y. Murugesan A. Dancis T. L. Stemmler Biochemistry 2010 49 8756 8765
16. K. C. Kondapalli N. M. Kok A. Dancis T. L. Stemmler Biochemistry 2008 47 6917 6927
17. W. Delewski B. Paterkiewicz M. Manicki B. Schilke B. Tomiczek S. J. Ciesielski L. Nierzwicki J. Czub R. Dutkiewicz E. A. Craig J. Marszalek Mol. Biol. Evol. 2016 33 643 656
18. P. Shakamuri B. Zhang M. K. Johnson J. Am. Chem. Soc. 2012 134 15213 15216
19. D. T. Mapolelo B. Zhang S. Randeniya A. N. Albetel H. Li J. Couturier C. E. Outten N. Rouhier M. K. Johnson Dalton Trans. 2013 42 3107 3115
20. J. Bridwell-Rabb C. Iannuzzi A. Pastore D. P. Barondeau Biochemistry 2012 51 2506 2514
21. S. Tan Protein Expression Purif. 2001 21 224 234
22. T. Kleber-Janke W. M. Becker Protein Expression Purif. 2000 19 419 424
23. F. W. Studier Protein Expression Purif. 2005 41 207 234
24. I. Strug C. Utzat A. Cappione 3rd S. Gutierrez R. Amara J. Lento F. Capito R. Skudas E. Chernokalskaya T. Nadler J. Anal. Methods Chem. 2014 2014 657079
25. N. Sreerama R. W. Woody Anal. Biochem. 2000 287 252 260
26. W. C. Johnson Proteins 1999 35 307 312
27. S. W. Provencher J. Glockner Biochemistry 1981 20 33 37
28. A. V. Rodrigues A. Kandegedara J. A. Rotondo A. Dancis T. L. Stemmler Biometals 2015 28 567 576
29. P. Kuzmic Methods Enzymol. 2009 467 247 280
30. G. N. George, S. J. George and I. J. Pickering, EXAFSPAK, Menlo Park, CA, 2001, http://www-ssrl.slac.stanford.edu/∼george/exafspak/exafs.htm
31. J. D. Cook K. Z. Bencze A. D. Jankovic A. K. Crater C. N. Busch P. B. Bradley A. J. Stemmler M. R. Spaller T. L. Stemmler Biochemistry 2006 45 7767 7777
32. G. N. George B. Hedman K. O. Hodgson Nat. Struct. Biol. 1998 5 645 647
33. J. J. Cotelesage M. J. Pushie P. Grochulski I. J. Pickering G. N. George J. Inorg. Biochem. 2012 115 127 137
34. N. G. Fox M. Chakrabarti S. P. McCormick P. A. Lindahl D. P. Barondeau Biochemistry 2015 54 3871 3879
35. P. J. Stephens A. J. Thomson J. B. Dunn T. A. Keiderling J. Rawlings K. K. Rao D. O. Hall Biochemistry 1978 17 4770 4778
36. H. Yoon S. A. Knight A. Pandey J. Pain S. Turkarslan D. Pain A. Dancis PLoS Genet. 2015 11 e1005135
37. A. Seguin R. Santos D. Pain A. Dancis J. M. Camadro E. Lesuisse J. Biol. Chem. 2011 286 6071 6079
38. B. Amutha D. M. Gordon A. Dancis D. Pain Methods Enzymol. 2009 456 247 266
39. Y. Shimomura H. Kamikubo Y. Nishi T. Masako M. Kataoka Y. Kobayashi K. Fukuyama Y. Takahashi J. Biochem. 2007 142 577 586
40. J. H. Kim M. Tonelli T. Kim J. L. Markley Biochemistry 2012 51 5557 5563
41. C. R. Randall Y. Zang A. E. True L. Que, Jr. J. M. Charnock C. D. Garner Y. Fujishima C. J. Schofield J. E. Baldwin Biochemistry 1993 32 6664 6673
42. C. J. Chen Y. H. Lin Y. C. Huang M. Y. Liu Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006 349 79 90
43. N. P. Mena A. L. Bulteau J. Salazar E. C. Hirsch M. T. Nunez Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011 409 241 246
44. G. J. Colpas M. J. Maroney C. Bagyinka M. Kumar W. S. Willis S. L. Suib N. Baidya P. K. Mascharak Inorg. Chem. 1991 30 920 928
45. R. Dutkiewicz J. Marszalek B. Schilke E. A. Craig R. Lill U. Muhlenhoff J. Biol. Chem. 2006 281 7801 7808
46. U. Muhlenhoff B. Hoffmann N. Richter N. Rietzschel F. Spantgar O. Stehling M. A. Uzarska R. Lill Eur. J. Cell Biol. 2015 94 292 308
47. J. Li M. Kogan S. A. Knight D. Pain A. Dancis J. Biol. Chem. 1999 274 33025 33034
48. A. D. Sheftel C. Wilbrecht O. Stehling B. Niggemeyer H. P. Elsasser U. Muhlenhoff R. Lill Mol. Biol. Cell 2012 23 1157 1166
49. W. Qi J. A. Cowan Coord. Chem. Rev. 2011 255 688 699
50. M. H. Sazinsky B. LeMoine M. Orofino R. Davydov K. Z. Bencze T. L. Stemmler B. M. Hoffman J. M. Arguello A. C. Rosenzweig J. Biol. Chem. 2007 282 25950 25959
51. M. E. Traverso P. Subramanian R. Davydov B. M. Hoffman T. L. Stemmler A. C. Rosenzweig Biochemistry 2010 49 7060 7068
52. A. Seguin A. Bayot A. Dancis A. Rogowska-Wrzesinska F. Auchere J. M. Camadro A. L. Bulteau E. Lesuisse Mitochondrion 2009 9 130 138