Bright fluorescent nanotags from bottlebrush polymers with DNATipped bristles

ACS Central Science

Volumn 1, Issue 8, 2015, Pages 431-438

  Fouz, Munira F ^a   Mukumoto, Kosuke ^a,b   Averick, Saadyah ^a,b   Molinar, Olivia ^a   McCartney, Brooke M ^a   Matyjaszewski, Krzysztof ^a,b   Armitage, Bruce A ^a   Das, Subha R ^a  

^a CARNEGIE MELLON UNIVERSITY   (United States)

^b CARNEGIE MELLON UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOMOLECULES; CHROMOPHORES; DNA; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE MICROSCOPY; PROBES; QUENCHING; SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

BOTTLE-BRUSH POLYMERS; CONFOCAL FLUORESCENCE MICROSCOPY; DNA HYBRIDIZATION; EXPRESSION LEVELS; FLUORESCENCE DETECTION; FLUORESCENT DYES; PROTEIN TARGETS; SELF-QUENCHING;

ANTIBODIES;

EID: 85010073531     PISSN: 23747943     EISSN: 23747951     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acscentsci.5b00259     Document Type: Article

References (49)

1. (a) Lichtman, J. W.; Conchello, J. Nat. Methods 2005, 2, 910-919.
2. (b) Evanko, D. Nat. Methods 2005, 2, 901-901.
3. (a) Kherlopian, A. R.; Song, T.; Duan, Q.; Neimark, M. A.; Po, M. J.; Gohagan, J. K.; Laine, A. F. BMC Syst. Biol. 2008, 2, 74.
4. (b) Lesaicherre, M. L.; Uttamchandani, M.; Chen, G. Y. J.; Yao, S. Q. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002, 12, 2085-2088.
5. Gong H., Urlacher T. Anal. Biochem. 2015 469, 1-3.
6. Korb M. L., Hartman Y. E., Kovar J., Zinn K. R., Rosenthal E. L., Bland K. I. J. Surg. Res. 2014 188, 119-128.
7. (a) Giesen, C.; Wang, H. A. O.; Schapiro, D.; Zivanovic, N.; Jacobs, A.; Hattendorf, B.; Schüffler, P. J.; Grolimund, D.; Buhmann, J. M.; Brandt, S.; Varga, Z.; Wild, P. J.; Günther, D.; Bodenmiller, B. Nat. Methods 2014, 11, 417-22.
8. (b) Bendall, S. C.; Simonds, E. F.; Qiu, P.; Amir, E. D.; Krutzik, P. O.; Finck, R.; Bruggner, R. V.; Melamed, R.; Trejo, A.; Ornatsky, O. I.; Balderas, R. S.; Plevritis, S. K.; Sachs, K.; Pe'er, D.; Tanner, S. D.; Nolan, G. P. Science 2011, 332, 687-696.
9. (c) Bandura, D. R.; Baranov, V. I.; Ornatsky, O. I.; Antonov, A.; Kinach, R.; Lou, X.; Pavlov, S.; Vorobiev, S.; Dick, J. E.; Tanner, S. D. Anal. Chem. 2009, 81, 6813-6822.
10. (a) Ohya, T.; Hayashi, T.; Kiyama, E.; Nishii, H.; Miki, H.; Kobayashi, K.; Honda, K.; Omasa, T.; Ohtake, H. Biotechnol. Bioeng. 2008, 100, 317-324.
11. (b) Lobbestael, E.; Reumers, V.; Ibrahimi, A.; Paesen, K.; Thiry, I.; Gijsbers, R.; Van den Haute, C.; Debyser, Z.; Baekelandt, V.; Taymans, J. BMC Biotechnol. 2010, 10, 16.
12. Vora, G. J.; Meador, C. E.; Anderson, G. P.; Taitt, C. R. Mol. Cell. Probes 2008, 22, 294-300.
13. (a) Bobrow, M. N.; Moen, P. T. Curr. Protoc. Cytom. 2001, 11:8.9, 8.9.1-8.9.16.
14. Speel E. J., Hopman A. H., Komminoth P. J. Histochem. Cytochem. 1999, 47, 281-288.
15. Mayer G., Bendayan M. J. Histochem. Cytochem. 1999, 47, 421-430.
16. (d) Clutter, M. R.; Heffner, G. C.; Krutzik, P. O.; Sachen, K. L.; Nolan, G. P. Cytometry, Part A 2010, 77A, 1020-1031.
17. (e) Karkmann, U.; Radbruch, A.; Hölzel, V.; Scheffold, A. J. Immunol. Methods 1999, 230, 113-120.
18. (f) Wang, N.; Gibbons, C. H.; Freeman, R. J. Histochem. Cytochem. 2011, 59, 382-390.
19. (a) Bernardes, G. J. L.; Steiner, M.; Hartmann, I.; Neri, D.; Casi, G. Nat. Protoc. 2013, 8, 2079-2089.
20. Lefevre, C.; Kang, H. C.; Haugland, R. P.; Malekzadeh, N.; Arttamangkul, S.; Haugland, R. P. Bioconjug. Chem. 1996, 7, 482-489.
21. Ogawa, M.; Kosaka, N.; Choyke, P. L.; Kobayashi, H. ACS Chem. Biol. 2009, 4, 535-546.
22. Siiman, O.; Wilkinson, J.; Burshteyn, A.; Roth, P.; Ledis, S. Bioconjugate Chem. 1999, 10, 1090-1106.
23. (a) Yan, X.; Schielke, E. G.; Grace, K. M.; Hassell, C.; Marrone, B. L.; Nolan, J. P. J. Immunol. Methods 2004, 284, 27-38.
24. (b) Dasso, J.; Lee, J.; Bach, H.; Mage, R. G. J. Immunol. Methods 2002, 263, 23-33.
25. Yan X., Tang A., Schielke E. G., Hang W., Nolan J. P. Int. Congr. Ser. 2004, 1263, 342-345.
26. (a) Sheiko, S. S.; Sumerlin, B. S.; Matyjaszewski, K. Prog. Polym. Sci. 2008, 33, 759-785.
27. (b) Lee, H. il; Pietrasik, J.; Sheiko, S. S.; Matyjaszewski. Prog. Polym. Sci. 2010, 35, 24-44.
28. Kwak, M.; Herrmann. Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49, 8574-8587.
29. Jiang H., Xu F.-J. Chem. Soc. Rev. 2013 42, 3394.
30. Bracha D., Bar-Ziv R. H. J. Am. Chem. Soc. 2014 136, 4945-4953.
31. Liu K., Zheng L., Liu Q., de Vries J. W., Gerasimov J. Y., Herrmann A. J. Am. Chem. Soc. 2014 136, 14255.
32. Krishnamoorthy M., Hakobyan S., Ramstedt M., Gautrot J. E. Chem. Rev. 2014 114, 10976-11026.
33. Barbey R., Lavanant L., Paripovic D., Schüwer N., Sugnaux C., Tugulu S., Klok H. A. Chem. Rev. 2009, 109, 5437-5527.
34. (a) Benvin, A. L.; Creeger, Y.; Fisher, G. W.; Ballou, B.; Waggoner, A. S.; Armitage, B. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 2025-2034.
35. (b) Özhalici-Ünal, H.; Armitage, B. A. ACS Nano 2009, 3, 425-433. 15 (c)
36. Stadler, A. L.; Delos Santos, J. O.; Stensrud, E. S.; Dembska, A.; Silva, G. L.; Liu, S.; Shank, N. I.; Kunttas-Tatli, E.; Sobers, C. J.; Gramlich, P. M. E.; Carell, T.; Peteanu, L. A.; McCartney, B. M.; Armitage, B. A. Bioconjugate Chem. 2011, 22, 1491-1502.
37. (a) Matyjaszewski, K.; Xia, J. Chem. Rev. 2001, 101, 2921-2990.
38. (b) Matyjaszewski, K. Macromolecules 2012, 45, 4015-4039.
39. Matyjaszewski K., Tsarevsky N. V. J. Am. Chem. Soc. 2014 136, 6513-6533.
40. (d) Averick, S.; Mehl, R. A.; Das, S. R.; Matyjaszewski, K. J. Controlled Release 2015, 205, 45-57.
41. Beers, K. L.; Gaynor, S. G.; Matyjaszewski, K.; Sheiko, S. S.; Möller, M. Macromolecules 1998, 31, 9413-9415.
42. Mukumoto, K.; Li, Y.; Nese, A.; Sheiko, S. S.; Matyjaszewski, K. Macromolecules 2012, 45, 9243-9219.
43. Johnson, J. a.; Lu, Y. Y.; Burts, A. O.; Lim, Y. H.; Finn, M. G.; Koberstein, J. T.; Turro, N. J.; Tirrell, D. A.; Grubbs, R. H. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 559-566.
44. (a) Paredes, E.; Das, S. R. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2012, 22, 5313-5316.
45. Averick S. E., Paredes E., Dey S. K., Snyder K. M., Tapinos N., Matyjaszewski K., Das S. R. J. Am. Chem. Soc. 2013 135, 12508-12511.
46. Glazer, A. N.; Rye, H. S. Nature 1992, 359, 859-861.
47. Averick, S. E.; Paredes, E.; Grahacharya, D.; Woodman, B. F.; Miyake-Stoner, S. J.; Mehl, R. A.; Matyjaszewski, K.; Das, S. R. Langmuir 2012, 28, 1954-1958.
48. Ouellet, J.; Schorr, S.; Iqbal, A.; Wilson, T. J.; Lilley, D. M. J. Biophys. J. 2011, 101, 1148-1154.
49. Rosen, C. B.; Kodal, A. L. B.; Nielsen, J. S.; Schaffert, D. H.; Scavenius, C.; Okholm, A. H.; Voigt, N. V.; Enghild, J. J.; Kjems, J.; Tørring, T.; Gothelf, K. V. Nat. Chem. 2014, 6, 804-9.